MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_011832	CAG	2	6	2086917	2086922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852560
38503	NC_011832	GAC	2	6	2086992	2086997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852560
38504	NC_011832	CTT	2	6	2087004	2087009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852560
38505	NC_011832	TTC	3	9	2087035	2087043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852560
38506	NC_011832	CCA	2	6	2087162	2087167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852560
38507	NC_011832	GAA	2	6	2087193	2087198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852560
38508	NC_011832	CCG	2	6	2087200	2087205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852560
38509	NC_011832	AGC	2	6	2087236	2087241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852560
38510	NC_011832	GAT	2	6	2087259	2087264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852560
38511	NC_011832	CCT	2	6	2087348	2087353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852560
38512	NC_011832	GGC	2	6	2087361	2087366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852560
38513	NC_011832	GCC	2	6	2087376	2087381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852560
38514	NC_011832	AGTG	2	8	2087417	2087424	25 %	25 %	50 %	0 %	219852560
38515	NC_011832	GAA	2	6	2087427	2087432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852560
38516	NC_011832	CCG	2	6	2087525	2087530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852560
38517	NC_011832	GAA	2	6	2087559	2087564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852560
38518	NC_011832	TCG	2	6	2087603	2087608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852560
38519	NC_011832	AGA	2	6	2087675	2087680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852560
38520	NC_011832	AG	3	6	2087734	2087739	50 %	0 %	50 %	0 %	219852561
38521	NC_011832	ATG	2	6	2087807	2087812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852561
38522	NC_011832	TCG	2	6	2087864	2087869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852561
38523	NC_011832	TCGA	2	8	2087909	2087916	25 %	25 %	25 %	25 %	219852561
38524	NC_011832	ATCG	2	8	2087930	2087937	25 %	25 %	25 %	25 %	219852561
38525	NC_011832	CAG	2	6	2087949	2087954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852561
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38527	NC_011832	CAT	2	6	2088072	2088077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852561
38528	NC_011832	TCA	2	6	2088231	2088236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852561
38529	NC_011832	CAA	2	6	2088261	2088266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852561
38530	NC_011832	AAT	2	6	2088634	2088639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852562
38531	NC_011832	GATC	2	8	2088672	2088679	25 %	25 %	25 %	25 %	219852562
38532	NC_011832	GGCGAT	2	12	2088697	2088708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852562
38533	NC_011832	TCT	2	6	2088729	2088734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852562
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38536	NC_011832	CACC	2	8	2088952	2088959	25 %	0 %	0 %	75 %	219852562
38537	NC_011832	CCA	2	6	2088964	2088969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852562
38538	NC_011832	CGC	2	6	2089021	2089026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852562
38539	NC_011832	GCA	3	9	2089047	2089055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852562
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38541	NC_011832	GCA	2	6	2089193	2089198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852562
38542	NC_011832	GAT	2	6	2089351	2089356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852562
38543	NC_011832	CTCA	2	8	2089382	2089389	25 %	25 %	0 %	50 %	219852562
38544	NC_011832	TCCC	2	8	2089403	2089410	0 %	25 %	0 %	75 %	219852562
38545	NC_011832	CGTG	2	8	2089438	2089445	0 %	25 %	50 %	25 %	219852562
38546	NC_011832	TGC	2	6	2089450	2089455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852562
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38551	NC_011832	CGG	2	6	2089834	2089839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852563
38552	NC_011832	TCA	2	6	2089842	2089847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
38553	NC_011832	GGATC	2	10	2089851	2089860	20 %	20 %	40 %	20 %	219852563
38554	NC_011832	GCAG	2	8	2089867	2089874	25 %	0 %	50 %	25 %	219852563
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38557	NC_011832	CAT	2	6	2089939	2089944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
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38559	NC_011832	ATC	2	6	2089979	2089984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
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38562	NC_011832	TGT	2	6	2090230	2090235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852563
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38570	NC_011832	ATC	2	6	2090714	2090719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
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38583	NC_011832	CCGA	2	8	2091323	2091330	25 %	0 %	25 %	50 %	219852563
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38588	NC_011832	TTC	2	6	2091958	2091963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852564
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38600	NC_011832	CAA	2	6	2092500	2092505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
38601	NC_011832	CAT	2	6	2092578	2092583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
38602	NC_011832	CGG	2	6	2092584	2092589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852564
38603	NC_011832	G	7	7	2092598	2092604	0 %	0 %	100 %	0 %	219852564
38604	NC_011832	AGA	2	6	2092643	2092648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852564
38605	NC_011832	CGG	2	6	2092649	2092654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852564
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38607	NC_011832	CCT	2	6	2092727	2092732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852564
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38612	NC_011832	ACCG	2	8	2092842	2092849	25 %	0 %	25 %	50 %	219852564
38613	NC_011832	CGTC	2	8	2092937	2092944	0 %	25 %	25 %	50 %	219852564
38614	NC_011832	TGC	2	6	2092953	2092958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852564
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38616	NC_011832	GGA	2	6	2093023	2093028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852564
38617	NC_011832	GCA	2	6	2093171	2093176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
38618	NC_011832	CGC	2	6	2093196	2093201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852564
38619	NC_011832	CAA	2	6	2093223	2093228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
38620	NC_011832	CAA	2	6	2093235	2093240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
38621	NC_011832	CAG	2	6	2093303	2093308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
38622	NC_011832	CAT	2	6	2093316	2093321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
38623	NC_011832	GGC	2	6	2093338	2093343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852564
38624	NC_011832	G	6	6	2093351	2093356	0 %	0 %	100 %	0 %	219852564
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38628	NC_011832	GAC	2	6	2093505	2093510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
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38630	NC_011832	ACC	2	6	2093524	2093529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
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38632	NC_011832	GAC	2	6	2093577	2093582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
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38634	NC_011832	ACCG	2	8	2093604	2093611	25 %	0 %	25 %	50 %	219852564
38635	NC_011832	ACC	2	6	2093632	2093637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
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38639	NC_011832	CAC	2	6	2093679	2093684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
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38643	NC_011832	CACCTT	2	12	2093823	2093834	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219852564
38644	NC_011832	ATG	2	6	2093942	2093947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852564
38645	NC_011832	CT	3	6	2093958	2093963	0 %	50 %	0 %	50 %	219852564
38646	NC_011832	C	6	6	2093997	2094002	0 %	0 %	0 %	100 %	219852564
38647	NC_011832	CGA	2	6	2094065	2094070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
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38731	NC_011832	CGA	2	6	2097179	2097184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
38732	NC_011832	GCC	2	6	2097214	2097219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852564
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38735	NC_011832	ACC	4	12	2097358	2097369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
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38846	NC_011832	GTTC	2	8	2102704	2102711	0 %	50 %	25 %	25 %	219852570
38847	NC_011832	GCTGCC	2	12	2102784	2102795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219852570
38848	NC_011832	AGC	2	6	2102798	2102803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852570
38849	NC_011832	ACC	2	6	2102844	2102849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852570
38850	NC_011832	GGA	2	6	2102867	2102872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852570
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38853	NC_011832	GCCC	2	8	2102988	2102995	0 %	0 %	25 %	75 %	219852570
38854	NC_011832	CCA	2	6	2103027	2103032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852570
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38858	NC_011832	GAG	2	6	2103297	2103302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852571
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38862	NC_011832	CCTC	2	8	2103556	2103563	0 %	25 %	0 %	75 %	219852571
38863	NC_011832	TCGG	2	8	2103564	2103571	0 %	25 %	50 %	25 %	219852571
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38952	NC_011832	GGT	3	9	2110145	2110153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852575
38953	NC_011832	G	6	6	2110192	2110197	0 %	0 %	100 %	0 %	219852575
38954	NC_011832	TGC	2	6	2110226	2110231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852575
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38958	NC_011832	GAC	2	6	2110461	2110466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852576
38959	NC_011832	GTT	3	9	2110500	2110508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852576
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38961	NC_011832	TCA	2	6	2110603	2110608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852576
38962	NC_011832	CCG	2	6	2110627	2110632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852576
38963	NC_011832	CGC	2	6	2110652	2110657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852576
38964	NC_011832	GTT	2	6	2110698	2110703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852576
38965	NC_011832	TAG	2	6	2110705	2110710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852576
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