MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_011832	GAT	2	6	2062313	2062318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852541
38002	NC_011832	CACCTG	2	12	2062319	2062330	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219852541
38003	NC_011832	GAG	2	6	2062343	2062348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852541
38004	NC_011832	CCG	2	6	2062386	2062391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852541
38005	NC_011832	ATA	2	6	2062421	2062426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852541
38006	NC_011832	ACC	2	6	2062473	2062478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852541
38007	NC_011832	TGC	2	6	2062515	2062520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852541
38008	NC_011832	GCC	2	6	2062570	2062575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852541
38009	NC_011832	GTC	2	6	2062586	2062591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852541
38010	NC_011832	GAT	2	6	2062592	2062597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852541
38011	NC_011832	C	6	6	2062621	2062626	0 %	0 %	0 %	100 %	219852541
38012	NC_011832	TTG	3	9	2062671	2062679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852541
38013	NC_011832	TGA	2	6	2062699	2062704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852541
38014	NC_011832	TCA	2	6	2062768	2062773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852541
38015	NC_011832	CCG	2	6	2062790	2062795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852541
38016	NC_011832	GAG	2	6	2062806	2062811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852541
38017	NC_011832	CCG	2	6	2062839	2062844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852541
38018	NC_011832	GCT	2	6	2062924	2062929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852541
38019	NC_011832	CGTC	2	8	2062967	2062974	0 %	25 %	25 %	50 %	219852541
38020	NC_011832	GGTC	2	8	2062981	2062988	0 %	25 %	50 %	25 %	219852541
38021	NC_011832	CTG	2	6	2063005	2063010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852541
38022	NC_011832	CCG	2	6	2063028	2063033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852541
38023	NC_011832	GCC	2	6	2063045	2063050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852541
38024	NC_011832	ACC	2	6	2063073	2063078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852541
38025	NC_011832	CGG	2	6	2063083	2063088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852541
38026	NC_011832	CATG	2	8	2063195	2063202	25 %	25 %	25 %	25 %	219852541
38027	NC_011832	CTG	2	6	2063315	2063320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852542
38028	NC_011832	CCA	2	6	2063337	2063342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852542
38029	NC_011832	GC	3	6	2063343	2063348	0 %	0 %	50 %	50 %	219852542
38030	NC_011832	GGCA	2	8	2063427	2063434	25 %	0 %	50 %	25 %	219852542
38031	NC_011832	CAG	2	6	2063461	2063466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852542
38032	NC_011832	CTG	2	6	2063566	2063571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852542
38033	NC_011832	TCG	2	6	2063573	2063578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852542
38034	NC_011832	GAC	2	6	2063581	2063586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852542
38035	NC_011832	GCCCC	2	10	2063600	2063609	0 %	0 %	20 %	80 %	219852542
38036	NC_011832	CGA	2	6	2063676	2063681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852542
38037	NC_011832	GAT	2	6	2063695	2063700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852542
38038	NC_011832	CGG	2	6	2063802	2063807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852543
38039	NC_011832	CAG	2	6	2063850	2063855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852543
38040	NC_011832	GATC	2	8	2063873	2063880	25 %	25 %	25 %	25 %	219852543
38041	NC_011832	TTC	2	6	2063905	2063910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852543
38042	NC_011832	GCAC	2	8	2063935	2063942	25 %	0 %	25 %	50 %	219852543
38043	NC_011832	ATGA	2	8	2063947	2063954	50 %	25 %	25 %	0 %	219852543
38044	NC_011832	GGT	2	6	2064012	2064017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852543
38045	NC_011832	CGT	2	6	2064096	2064101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852543
38046	NC_011832	GTC	2	6	2064124	2064129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852543
38047	NC_011832	C	6	6	2064141	2064146	0 %	0 %	0 %	100 %	219852543
38048	NC_011832	GTT	2	6	2064165	2064170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852543
38049	NC_011832	ACC	2	6	2064178	2064183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852543
38050	NC_011832	CCG	2	6	2064198	2064203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852543
38051	NC_011832	GGC	2	6	2064234	2064239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852543
38052	NC_011832	TCGCCG	2	12	2064244	2064255	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219852543
38053	NC_011832	GTGG	2	8	2064324	2064331	0 %	25 %	75 %	0 %	219852543
38054	NC_011832	AGC	2	6	2064374	2064379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852543
38055	NC_011832	TCC	2	6	2064403	2064408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852543
38056	NC_011832	TTC	2	6	2064409	2064414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852543
38057	NC_011832	TGA	2	6	2064449	2064454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852543
38058	NC_011832	TCC	2	6	2064531	2064536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852544
38059	NC_011832	TGC	2	6	2064539	2064544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852544
38060	NC_011832	CCG	2	6	2064585	2064590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852544
38061	NC_011832	GACA	2	8	2064616	2064623	50 %	0 %	25 %	25 %	219852544
38062	NC_011832	ATC	2	6	2064750	2064755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852544
38063	NC_011832	ACC	2	6	2064819	2064824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852544
38064	NC_011832	ATGG	2	8	2064911	2064918	25 %	25 %	50 %	0 %	219852544
38065	NC_011832	TCA	2	6	2064948	2064953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852544
38066	NC_011832	TCT	2	6	2065015	2065020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852544
38067	NC_011832	CCG	2	6	2065045	2065050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852544
38068	NC_011832	TCG	2	6	2065122	2065127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852544
38069	NC_011832	CTC	2	6	2065154	2065159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852544
38070	NC_011832	GAT	2	6	2065223	2065228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852544
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38072	NC_011832	CAT	2	6	2065262	2065267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852544
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38074	NC_011832	GCC	2	6	2065307	2065312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852544
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38080	NC_011832	CGAGC	2	10	2065454	2065463	20 %	0 %	40 %	40 %	219852544
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38087	NC_011832	TCT	2	6	2065740	2065745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852545
38088	NC_011832	C	6	6	2065797	2065802	0 %	0 %	0 %	100 %	219852545
38089	NC_011832	CTT	2	6	2065813	2065818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852545
38090	NC_011832	GATC	2	8	2065884	2065891	25 %	25 %	25 %	25 %	219852545
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38098	NC_011832	GAG	2	6	2066274	2066279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852546
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38100	NC_011832	GCG	2	6	2066323	2066328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852546
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38102	NC_011832	TCG	2	6	2066425	2066430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852546
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38106	NC_011832	GGCA	2	8	2066602	2066609	25 %	0 %	50 %	25 %	219852547
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38109	NC_011832	GCA	2	6	2066731	2066736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852547
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38116	NC_011832	ACG	2	6	2066841	2066846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852547
38117	NC_011832	CTC	2	6	2066849	2066854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852547
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38144	NC_011832	GCATC	2	10	2068279	2068288	20 %	20 %	20 %	40 %	219852549
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38230	NC_011832	CAC	2	6	2072331	2072336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852551
38231	NC_011832	CGC	2	6	2072392	2072397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852551
38232	NC_011832	CAG	2	6	2072438	2072443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852551
38233	NC_011832	TCC	2	6	2072455	2072460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852551
38234	NC_011832	TGG	2	6	2072463	2072468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852551
38235	NC_011832	AGGG	2	8	2072469	2072476	25 %	0 %	75 %	0 %	219852551
38236	NC_011832	CAG	2	6	2072492	2072497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852551
38237	NC_011832	CGGTGA	2	12	2072504	2072515	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852551
38238	NC_011832	AG	3	6	2072546	2072551	50 %	0 %	50 %	0 %	219852551
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38242	NC_011832	CGG	2	6	2072625	2072630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852551
38243	NC_011832	TTGA	2	8	2072637	2072644	25 %	50 %	25 %	0 %	219852551
38244	NC_011832	GCTG	2	8	2072658	2072665	0 %	25 %	50 %	25 %	219852551
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38251	NC_011832	CCG	2	6	2073103	2073108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852552
38252	NC_011832	GAT	2	6	2073178	2073183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852552
38253	NC_011832	CAT	2	6	2073250	2073255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852552
38254	NC_011832	ATC	2	6	2073283	2073288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852552
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38259	NC_011832	TCCCGT	2	12	2073524	2073535	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219852552
38260	NC_011832	CGA	2	6	2073557	2073562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852552
38261	NC_011832	CAG	2	6	2073580	2073585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852552
38262	NC_011832	AG	3	6	2073630	2073635	50 %	0 %	50 %	0 %	219852552
38263	NC_011832	CGG	2	6	2073645	2073650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852552
38264	NC_011832	GAT	2	6	2073652	2073657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852552
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38266	NC_011832	CCT	2	6	2073828	2073833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852552
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38282	NC_011832	GGT	2	6	2074492	2074497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852552
38283	NC_011832	CTG	2	6	2074513	2074518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852552
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38292	NC_011832	AGGG	2	8	2075084	2075091	25 %	0 %	75 %	0 %	219852552
38293	NC_011832	GTC	2	6	2075092	2075097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852552
38294	NC_011832	G	7	7	2075104	2075110	0 %	0 %	100 %	0 %	219852552
38295	NC_011832	TGAT	2	8	2075111	2075118	25 %	50 %	25 %	0 %	219852552
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38300	NC_011832	AG	3	6	2075226	2075231	50 %	0 %	50 %	0 %	219852553
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38304	NC_011832	TCC	2	6	2075332	2075337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852553
38305	NC_011832	GAG	2	6	2075367	2075372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852553
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38309	NC_011832	CGA	2	6	2075576	2075581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
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38321	NC_011832	AGG	2	6	2076363	2076368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852553
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38328	NC_011832	CTC	2	6	2076579	2076584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852553
38329	NC_011832	TCA	2	6	2076593	2076598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852553
38330	NC_011832	TCC	2	6	2076613	2076618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852553
38331	NC_011832	GGC	2	6	2076660	2076665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852553
38332	NC_011832	GAC	2	6	2076666	2076671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
38333	NC_011832	AGC	2	6	2076721	2076726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
38334	NC_011832	ATG	2	6	2076732	2076737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852553
38335	NC_011832	C	6	6	2076745	2076750	0 %	0 %	0 %	100 %	219852553
38336	NC_011832	TTC	2	6	2076766	2076771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852553
38337	NC_011832	GACC	2	8	2076803	2076810	25 %	0 %	25 %	50 %	219852553
38338	NC_011832	CTC	2	6	2076840	2076845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852553
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38340	NC_011832	ATGGAT	2	12	2077005	2077016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852553
38341	NC_011832	CAGC	2	8	2077025	2077032	25 %	0 %	25 %	50 %	219852553
38342	NC_011832	CTG	2	6	2077044	2077049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852553
38343	NC_011832	CAG	2	6	2077054	2077059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
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38345	NC_011832	GAA	2	6	2077194	2077199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852553
38346	NC_011832	TCG	2	6	2077201	2077206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852553
38347	NC_011832	GGTT	2	8	2077208	2077215	0 %	50 %	50 %	0 %	219852553
38348	NC_011832	GAG	2	6	2077245	2077250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852553
38349	NC_011832	GGGT	2	8	2077252	2077259	0 %	25 %	75 %	0 %	219852553
38350	NC_011832	CCG	2	6	2077284	2077289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852553
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38352	NC_011832	TCA	2	6	2077339	2077344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852553
38353	NC_011832	CTG	2	6	2077377	2077382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852553
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38357	NC_011832	GTCG	2	8	2077583	2077590	0 %	25 %	50 %	25 %	219852554
38358	NC_011832	GGCC	2	8	2077615	2077622	0 %	0 %	50 %	50 %	219852554
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38372	NC_011832	GTT	2	6	2078747	2078752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852554
38373	NC_011832	TGGT	2	8	2078902	2078909	0 %	50 %	50 %	0 %	219852554
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38448	NC_011832	GATCG	2	10	2084500	2084509	20 %	20 %	40 %	20 %	219852557
38449	NC_011832	C	7	7	2084553	2084559	0 %	0 %	0 %	100 %	219852557
38450	NC_011832	TGACCC	2	12	2084565	2084576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219852557
38451	NC_011832	CCTG	2	8	2084586	2084593	0 %	25 %	25 %	50 %	219852557
38452	NC_011832	G	6	6	2084924	2084929	0 %	0 %	100 %	0 %	219852558
38453	NC_011832	CCCT	2	8	2084942	2084949	0 %	25 %	0 %	75 %	219852558
38454	NC_011832	CAA	2	6	2084956	2084961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852558
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38459	NC_011832	TGA	2	6	2085094	2085099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852558
38460	NC_011832	CTG	2	6	2085134	2085139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852558
38461	NC_011832	CGC	2	6	2085142	2085147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852558
38462	NC_011832	AG	3	6	2085178	2085183	50 %	0 %	50 %	0 %	219852558
38463	NC_011832	GAA	2	6	2085214	2085219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852558
38464	NC_011832	TCG	2	6	2085222	2085227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852558
38465	NC_011832	ACC	2	6	2085254	2085259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852558
38466	NC_011832	CGG	2	6	2085270	2085275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852558
38467	NC_011832	A	6	6	2085350	2085355	100 %	0 %	0 %	0 %	219852558
38468	NC_011832	CTC	2	6	2085398	2085403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852558
38469	NC_011832	ATC	2	6	2085446	2085451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852558
38470	NC_011832	GCC	2	6	2085461	2085466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852558
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38472	NC_011832	TGCA	2	8	2085580	2085587	25 %	25 %	25 %	25 %	219852558
38473	NC_011832	CCGCTC	2	12	2085590	2085601	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219852558
38474	NC_011832	ACC	2	6	2085973	2085978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852559
38475	NC_011832	CCGG	2	8	2085999	2086006	0 %	0 %	50 %	50 %	219852559
38476	NC_011832	CGG	2	6	2086031	2086036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852559
38477	NC_011832	GCC	2	6	2086042	2086047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852559
38478	NC_011832	ATC	2	6	2086072	2086077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852559
38479	NC_011832	CAT	2	6	2086113	2086118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852559
38480	NC_011832	GGA	2	6	2086173	2086178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852559
38481	NC_011832	CTC	2	6	2086183	2086188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852559
38482	NC_011832	CAC	2	6	2086302	2086307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852559
38483	NC_011832	TGA	2	6	2086340	2086345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852559
38484	NC_011832	CTGA	2	8	2086375	2086382	25 %	25 %	25 %	25 %	219852559
38485	NC_011832	CAT	2	6	2086383	2086388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852559
38486	NC_011832	TGC	2	6	2086408	2086413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852559
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38488	NC_011832	ATC	2	6	2086543	2086548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852560
38489	NC_011832	TGA	2	6	2086595	2086600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852560
38490	NC_011832	CGA	2	6	2086610	2086615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852560
38491	NC_011832	TC	3	6	2086616	2086621	0 %	50 %	0 %	50 %	219852560
38492	NC_011832	ACC	2	6	2086624	2086629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852560
38493	NC_011832	C	6	6	2086628	2086633	0 %	0 %	0 %	100 %	219852560
38494	NC_011832	CGA	2	6	2086698	2086703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852560
38495	NC_011832	AGA	2	6	2086730	2086735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852560
38496	NC_011832	CCG	2	6	2086747	2086752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852560
38497	NC_011832	C	6	6	2086824	2086829	0 %	0 %	0 %	100 %	219852560
38498	NC_011832	AAGG	2	8	2086830	2086837	50 %	0 %	50 %	0 %	219852560
38499	NC_011832	CGAG	2	8	2086841	2086848	25 %	0 %	50 %	25 %	219852560
38500	NC_011832	GCA	2	6	2086852	2086857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852560

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