MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011832	GCCG	2	8	144753	144760	0 %	0 %	50 %	50 %	219850805
3002	NC_011832	TCG	2	6	144817	144822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850805
3003	NC_011832	TGC	2	6	144838	144843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850805
3004	NC_011832	CTG	2	6	144855	144860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850805
3005	NC_011832	GAT	2	6	145061	145066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850806
3006	NC_011832	ATT	2	6	145104	145109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850806
3007	NC_011832	GAGG	2	8	145136	145143	25 %	0 %	75 %	0 %	219850806
3008	NC_011832	ACC	2	6	145167	145172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850806
3009	NC_011832	GAC	2	6	145326	145331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850806
3010	NC_011832	AGG	2	6	145450	145455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850806
3011	NC_011832	ACATCG	2	12	145462	145473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219850806
3012	NC_011832	GCAG	2	8	145507	145514	25 %	0 %	50 %	25 %	219850806
3013	NC_011832	CGT	2	6	145583	145588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850806
3014	NC_011832	TCA	2	6	145675	145680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850806
3015	NC_011832	AGG	2	6	145681	145686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850806
3016	NC_011832	TCC	2	6	145723	145728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850806
3017	NC_011832	CT	3	6	145729	145734	0 %	50 %	0 %	50 %	219850806
3018	NC_011832	CCG	2	6	145779	145784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850806
3019	NC_011832	GAT	2	6	145797	145802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850806
3020	NC_011832	ACT	2	6	145855	145860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850806
3021	NC_011832	GGT	2	6	145892	145897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850806
3022	NC_011832	C	6	6	145898	145903	0 %	0 %	0 %	100 %	219850806
3023	NC_011832	GTC	2	6	145920	145925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850806
3024	NC_011832	AAC	2	6	145932	145937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850806
3025	NC_011832	GTTC	2	8	145981	145988	0 %	50 %	25 %	25 %	219850806
3026	NC_011832	GAA	2	6	146024	146029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850806
3027	NC_011832	AGC	2	6	146062	146067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850806
3028	NC_011832	AGC	2	6	146092	146097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850806
3029	NC_011832	CCT	2	6	146113	146118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850806
3030	NC_011832	CTC	2	6	146836	146841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850807
3031	NC_011832	C	6	6	146917	146922	0 %	0 %	0 %	100 %	219850807
3032	NC_011832	CGAT	2	8	147028	147035	25 %	25 %	25 %	25 %	219850807
3033	NC_011832	GCC	2	6	147084	147089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850807
3034	NC_011832	GAC	2	6	147130	147135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850807
3035	NC_011832	GCTC	2	8	147164	147171	0 %	25 %	25 %	50 %	219850807
3036	NC_011832	TC	3	6	147179	147184	0 %	50 %	0 %	50 %	219850807
3037	NC_011832	TC	3	6	147189	147194	0 %	50 %	0 %	50 %	219850807
3038	NC_011832	G	6	6	147246	147251	0 %	0 %	100 %	0 %	219850807
3039	NC_011832	TC	3	6	147313	147318	0 %	50 %	0 %	50 %	219850808
3040	NC_011832	GGC	2	6	147326	147331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850808
3041	NC_011832	ACT	2	6	147346	147351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850808
3042	NC_011832	CGA	2	6	147371	147376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850808
3043	NC_011832	GA	3	6	147390	147395	50 %	0 %	50 %	0 %	219850808
3044	NC_011832	CCA	2	6	147433	147438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850808
3045	NC_011832	G	6	6	147451	147456	0 %	0 %	100 %	0 %	219850808
3046	NC_011832	GCT	2	6	147470	147475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850808
3047	NC_011832	CAG	2	6	147499	147504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850808
3048	NC_011832	CGGT	2	8	147516	147523	0 %	25 %	50 %	25 %	219850808
3049	NC_011832	ACGCC	2	10	147598	147607	20 %	0 %	20 %	60 %	219850808
3050	NC_011832	ACG	2	6	147615	147620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850808
3051	NC_011832	GCC	2	6	147627	147632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850808
3052	NC_011832	TGG	2	6	147642	147647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850808
3053	NC_011832	TCA	2	6	147661	147666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850808
3054	NC_011832	GAG	2	6	147706	147711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850808
3055	NC_011832	CCT	2	6	147872	147877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850809
3056	NC_011832	GTCA	2	8	147906	147913	25 %	25 %	25 %	25 %	219850809
3057	NC_011832	GGA	2	6	147951	147956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850809
3058	NC_011832	CAAC	2	8	148010	148017	50 %	0 %	0 %	50 %	219850809
3059	NC_011832	ACC	2	6	148021	148026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850809
3060	NC_011832	CG	3	6	148048	148053	0 %	0 %	50 %	50 %	219850809
3061	NC_011832	TCA	2	6	148067	148072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850809
3062	NC_011832	TC	3	6	148110	148115	0 %	50 %	0 %	50 %	219850809
3063	NC_011832	TCGA	2	8	148161	148168	25 %	25 %	25 %	25 %	219850809
3064	NC_011832	CGAAT	2	10	148276	148285	40 %	20 %	20 %	20 %	219850809
3065	NC_011832	TGA	2	6	148358	148363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850809
3066	NC_011832	TGG	2	6	148378	148383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850809
3067	NC_011832	CTT	2	6	148394	148399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850809
3068	NC_011832	A	7	7	148446	148452	100 %	0 %	0 %	0 %	219850809
3069	NC_011832	TAAA	2	8	148456	148463	75 %	25 %	0 %	0 %	219850809
3070	NC_011832	TCG	2	6	148483	148488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850809
3071	NC_011832	CAC	2	6	148508	148513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850809
3072	NC_011832	ACC	2	6	148536	148541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850809
3073	NC_011832	TCC	2	6	148546	148551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850809
3074	NC_011832	GTG	2	6	148630	148635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850809
3075	NC_011832	GAG	2	6	148641	148646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850809
3076	NC_011832	ATT	2	6	148733	148738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850810
3077	NC_011832	TGC	2	6	148761	148766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3078	NC_011832	GAA	2	6	148791	148796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3079	NC_011832	CTT	2	6	148879	148884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3080	NC_011832	CT	3	6	148906	148911	0 %	50 %	0 %	50 %	219850810
3081	NC_011832	CCA	2	6	148959	148964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850810
3082	NC_011832	ATCG	2	8	148969	148976	25 %	25 %	25 %	25 %	219850810
3083	NC_011832	GGCC	2	8	149181	149188	0 %	0 %	50 %	50 %	219850810
3084	NC_011832	CAC	2	6	149205	149210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850810
3085	NC_011832	ATGG	2	8	149322	149329	25 %	25 %	50 %	0 %	219850810
3086	NC_011832	CTC	2	6	149350	149355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3087	NC_011832	ATG	2	6	149390	149395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850810
3088	NC_011832	TGC	2	6	149472	149477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3089	NC_011832	CGG	2	6	149540	149545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850810
3090	NC_011832	CCT	2	6	149552	149557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3091	NC_011832	TCT	2	6	149558	149563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3092	NC_011832	GAA	2	6	149625	149630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3093	NC_011832	GATCGA	2	12	149637	149648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850810
3094	NC_011832	TGG	2	6	149651	149656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850810
3095	NC_011832	CCCT	2	8	149659	149666	0 %	25 %	0 %	75 %	219850810
3096	NC_011832	GCA	2	6	149694	149699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3097	NC_011832	CCG	2	6	149701	149706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850810
3098	NC_011832	GGCCA	2	10	149758	149767	20 %	0 %	40 %	40 %	219850810
3099	NC_011832	GT	3	6	149791	149796	0 %	50 %	50 %	0 %	219850810
3100	NC_011832	AGA	2	6	149816	149821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3101	NC_011832	TCGA	2	8	149884	149891	25 %	25 %	25 %	25 %	219850810
3102	NC_011832	AGG	2	6	149939	149944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850810
3103	NC_011832	ATC	2	6	150019	150024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850810
3104	NC_011832	CGAC	2	8	150056	150063	25 %	0 %	25 %	50 %	219850810
3105	NC_011832	CGA	2	6	150096	150101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3106	NC_011832	ACC	2	6	150137	150142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850810
3107	NC_011832	CAT	2	6	150154	150159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850810
3108	NC_011832	G	6	6	150166	150171	0 %	0 %	100 %	0 %	219850810
3109	NC_011832	CTG	2	6	150205	150210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3110	NC_011832	CGTT	2	8	150228	150235	0 %	50 %	25 %	25 %	219850810
3111	NC_011832	TC	3	6	150294	150299	0 %	50 %	0 %	50 %	219850810
3112	NC_011832	CTC	2	6	150364	150369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3113	NC_011832	GAACCT	2	12	150384	150395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219850810
3114	NC_011832	GAG	2	6	150505	150510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850810
3115	NC_011832	TTCTCG	2	12	150544	150555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219850810
3116	NC_011832	GAGCC	2	10	150575	150584	20 %	0 %	40 %	40 %	219850810
3117	NC_011832	GGTCGA	2	12	150606	150617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850810
3118	NC_011832	CCA	2	6	150639	150644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850810
3119	NC_011832	GCCCTG	2	12	150772	150783	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219850810
3120	NC_011832	TTC	2	6	150832	150837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3121	NC_011832	GCG	2	6	150845	150850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850810
3122	NC_011832	TC	3	6	150856	150861	0 %	50 %	0 %	50 %	219850810
3123	NC_011832	AAG	2	6	150931	150936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
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3242	NC_011832	TCC	2	6	156796	156801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850814
3243	NC_011832	GAA	2	6	157047	157052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850814
3244	NC_011832	GCC	2	6	157062	157067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850814
3245	NC_011832	TGGT	2	8	157129	157136	0 %	50 %	50 %	0 %	219850814
3246	NC_011832	AAG	2	6	157144	157149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850814
3247	NC_011832	CAC	2	6	157157	157162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850814
3248	NC_011832	CTG	2	6	157194	157199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850814
3249	NC_011832	GTC	2	6	157246	157251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850814
3250	NC_011832	CCAG	2	8	157299	157306	25 %	0 %	25 %	50 %	219850814
3251	NC_011832	CCG	2	6	157349	157354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850814
3252	NC_011832	GGC	2	6	157416	157421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850814
3253	NC_011832	CTG	3	9	157445	157453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850814
3254	NC_011832	ACG	2	6	157456	157461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850814
3255	NC_011832	TCG	2	6	157463	157468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850814
3256	NC_011832	CAGA	2	8	157491	157498	50 %	0 %	25 %	25 %	219850814
3257	NC_011832	CAA	2	6	157500	157505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850814
3258	NC_011832	GAT	2	6	157515	157520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850814
3259	NC_011832	GCT	2	6	157812	157817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850815
3260	NC_011832	GAT	2	6	157860	157865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850815
3261	NC_011832	TCA	2	6	157899	157904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850815
3262	NC_011832	CGA	2	6	157958	157963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850815
3263	NC_011832	TGG	2	6	157968	157973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850815
3264	NC_011832	CTT	2	6	157980	157985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850815
3265	NC_011832	TTC	2	6	158038	158043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850815
3266	NC_011832	AGA	2	6	158054	158059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850815
3267	NC_011832	CT	3	6	158125	158130	0 %	50 %	0 %	50 %	219850815
3268	NC_011832	TCC	2	6	158201	158206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850815
3269	NC_011832	GTC	2	6	158233	158238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850815
3270	NC_011832	C	7	7	158268	158274	0 %	0 %	0 %	100 %	219850815
3271	NC_011832	CGG	2	6	158286	158291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850815
3272	NC_011832	CGAT	2	8	158434	158441	25 %	25 %	25 %	25 %	219850816
3273	NC_011832	CTA	2	6	158507	158512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850816
3274	NC_011832	AAG	2	6	158532	158537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850816
3275	NC_011832	CCCGG	2	10	158552	158561	0 %	0 %	40 %	60 %	219850816
3276	NC_011832	CTC	2	6	158754	158759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850817
3277	NC_011832	TC	3	6	158758	158763	0 %	50 %	0 %	50 %	219850817
3278	NC_011832	TGC	2	6	158799	158804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850817
3279	NC_011832	GGT	2	6	158818	158823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850817
3280	NC_011832	ATC	2	6	158829	158834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850817
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3283	NC_011832	CAG	2	6	158930	158935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850817
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3310	NC_011832	CTG	2	6	160026	160031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850819
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3350	NC_011832	CGA	2	6	161802	161807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850821
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3354	NC_011832	ACC	2	6	162009	162014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850821
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3356	NC_011832	GGTC	2	8	162132	162139	0 %	25 %	50 %	25 %	219850821
3357	NC_011832	GCT	2	6	162144	162149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850821
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3360	NC_011832	ATG	2	6	162218	162223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850821
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3362	NC_011832	CAG	2	6	162355	162360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850821
3363	NC_011832	GAT	2	6	162541	162546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850821
3364	NC_011832	GATC	2	8	162564	162571	25 %	25 %	25 %	25 %	219850821
3365	NC_011832	GGC	2	6	162577	162582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850821
3366	NC_011832	CTG	2	6	162583	162588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850821
3367	NC_011832	TTG	2	6	162598	162603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850821
3368	NC_011832	GCT	2	6	162663	162668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850821
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3381	NC_011832	GAT	2	6	163024	163029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850821
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3401	NC_011832	TCG	2	6	164028	164033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850823
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3433	NC_011832	GAT	2	6	165612	165617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850825
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3451	NC_011832	TGA	2	6	166463	166468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850825
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3470	NC_011832	GAC	2	6	167460	167465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850825
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3475	NC_011832	CCT	2	6	167645	167650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850825
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3477	NC_011832	CCT	2	6	167795	167800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850825
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3479	NC_011832	CCTTCT	2	12	168148	168159	0 %	50 %	0 %	50 %	219850826
3480	NC_011832	TCG	2	6	168181	168186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850826
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3482	NC_011832	GGTATC	2	12	168269	168280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219850826
3483	NC_011832	CTG	2	6	168323	168328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850826
3484	NC_011832	ATC	2	6	168410	168415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850827
3485	NC_011832	TGA	2	6	168434	168439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850827
3486	NC_011832	TCG	2	6	168452	168457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3487	NC_011832	GAG	2	6	168468	168473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850827
3488	NC_011832	CGC	2	6	168480	168485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850827
3489	NC_011832	GAT	2	6	168501	168506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850827
3490	NC_011832	AGC	2	6	168667	168672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3491	NC_011832	CAG	2	6	168675	168680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3492	NC_011832	GATCCC	2	12	168726	168737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219850827
3493	NC_011832	GCA	2	6	168746	168751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3494	NC_011832	CAGG	2	8	168789	168796	25 %	0 %	50 %	25 %	219850827
3495	NC_011832	AGC	2	6	168844	168849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3496	NC_011832	CTC	2	6	168873	168878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850827
3497	NC_011832	GAT	2	6	168891	168896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850827
3498	NC_011832	CGA	2	6	168903	168908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3499	NC_011832	GAT	2	6	168909	168914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850827
3500	NC_011832	CAG	2	6	168930	168935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827

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