MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011832	TGA	2	6	122978	122983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850787
2502	NC_011832	AAG	2	6	123023	123028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850787
2503	NC_011832	TGT	2	6	123086	123091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850787
2504	NC_011832	CAC	2	6	123135	123140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850787
2505	NC_011832	TCA	2	6	123160	123165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850787
2506	NC_011832	ACC	2	6	123213	123218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850787
2507	NC_011832	ACT	2	6	123258	123263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850787
2508	NC_011832	GTG	2	6	123295	123300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850787
2509	NC_011832	CTGA	2	8	123311	123318	25 %	25 %	25 %	25 %	219850787
2510	NC_011832	CGG	2	6	123378	123383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850787
2511	NC_011832	CTG	2	6	123396	123401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850787
2512	NC_011832	GAA	2	6	123474	123479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850787
2513	NC_011832	CCT	2	6	123487	123492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850787
2514	NC_011832	GTG	2	6	123625	123630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850787
2515	NC_011832	CCG	2	6	123632	123637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850787
2516	NC_011832	TTG	3	9	123649	123657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850787
2517	NC_011832	CCG	2	6	123844	123849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850787
2518	NC_011832	CGA	3	9	123851	123859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850787
2519	NC_011832	CAG	2	6	123867	123872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850787
2520	NC_011832	GAT	2	6	123882	123887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850787
2521	NC_011832	CGT	2	6	123902	123907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850787
2522	NC_011832	CCGG	2	8	123922	123929	0 %	0 %	50 %	50 %	219850787
2523	NC_011832	CGG	2	6	124026	124031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850788
2524	NC_011832	GTT	2	6	124084	124089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850788
2525	NC_011832	CCA	2	6	124097	124102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850788
2526	NC_011832	GA	3	6	124104	124109	50 %	0 %	50 %	0 %	219850788
2527	NC_011832	TAT	3	9	124119	124127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850788
2528	NC_011832	TTGT	2	8	124228	124235	0 %	75 %	25 %	0 %	219850788
2529	NC_011832	TGG	2	6	124236	124241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850788
2530	NC_011832	CGA	2	6	124245	124250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850788
2531	NC_011832	CGAT	2	8	124296	124303	25 %	25 %	25 %	25 %	219850788
2532	NC_011832	AT	3	6	124349	124354	50 %	50 %	0 %	0 %	219850788
2533	NC_011832	TGG	2	6	124356	124361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850788
2534	NC_011832	CTGA	2	8	124428	124435	25 %	25 %	25 %	25 %	219850788
2535	NC_011832	GTA	3	9	124459	124467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850788
2536	NC_011832	CTG	2	6	124471	124476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850788
2537	NC_011832	AGT	2	6	124482	124487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850788
2538	NC_011832	CGTCC	2	10	124588	124597	0 %	20 %	20 %	60 %	219850788
2539	NC_011832	CGAC	2	8	124611	124618	25 %	0 %	25 %	50 %	219850788
2540	NC_011832	ATGA	2	8	124646	124653	50 %	25 %	25 %	0 %	219850788
2541	NC_011832	CCG	2	6	124664	124669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850788
2542	NC_011832	C	7	7	124681	124687	0 %	0 %	0 %	100 %	219850788
2543	NC_011832	ATC	2	6	124715	124720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850788
2544	NC_011832	GAC	2	6	124855	124860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850788
2545	NC_011832	CCA	2	6	124884	124889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850788
2546	NC_011832	GAT	2	6	124918	124923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850788
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2548	NC_011832	CCTT	2	8	125427	125434	0 %	50 %	0 %	50 %	219850789
2549	NC_011832	TCC	2	6	125453	125458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850789
2550	NC_011832	GTG	3	9	125463	125471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850789
2551	NC_011832	ACC	2	6	125524	125529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850789
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2553	NC_011832	CGA	2	6	125603	125608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850789
2554	NC_011832	GCAGT	2	10	125640	125649	20 %	20 %	40 %	20 %	219850789
2555	NC_011832	GAC	3	9	125667	125675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850789
2556	NC_011832	CCAG	2	8	125683	125690	25 %	0 %	25 %	50 %	219850789
2557	NC_011832	ATCG	2	8	125716	125723	25 %	25 %	25 %	25 %	219850789
2558	NC_011832	AAT	2	6	125830	125835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850789
2559	NC_011832	GTT	2	6	125861	125866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850789
2560	NC_011832	GTC	2	6	125933	125938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850789
2561	NC_011832	GTT	2	6	125978	125983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850789
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2563	NC_011832	CGGT	2	8	126144	126151	0 %	25 %	50 %	25 %	219850789
2564	NC_011832	GTGG	2	8	126176	126183	0 %	25 %	75 %	0 %	219850789
2565	NC_011832	TGA	2	6	126231	126236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850789
2566	NC_011832	GAA	2	6	126248	126253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850789
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2568	NC_011832	TGGC	2	8	126330	126337	0 %	25 %	50 %	25 %	219850789
2569	NC_011832	ATG	2	6	126345	126350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850789
2570	NC_011832	TTC	2	6	126432	126437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850789
2571	NC_011832	GAT	2	6	126443	126448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850789
2572	NC_011832	CCCGGC	2	12	126461	126472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850789
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2574	NC_011832	GTC	2	6	126578	126583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850789
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2577	NC_011832	TGGG	2	8	126750	126757	0 %	25 %	75 %	0 %	219850789
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2581	NC_011832	GAT	2	6	126884	126889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850789
2582	NC_011832	CAT	2	6	126890	126895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850789
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2584	NC_011832	TTC	2	6	126945	126950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850789
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2587	NC_011832	GAAC	2	8	126980	126987	50 %	0 %	25 %	25 %	219850789
2588	NC_011832	ACG	2	6	127060	127065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850789
2589	NC_011832	CAGC	2	8	127114	127121	25 %	0 %	25 %	50 %	219850789
2590	NC_011832	CACGGC	2	12	127130	127141	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219850789
2591	NC_011832	G	7	7	127163	127169	0 %	0 %	100 %	0 %	219850789
2592	NC_011832	CTG	2	6	127177	127182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850789
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2597	NC_011832	GGAC	2	8	127477	127484	25 %	0 %	50 %	25 %	219850790
2598	NC_011832	CAG	2	6	127511	127516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850790
2599	NC_011832	TGA	3	9	127543	127551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850790
2600	NC_011832	CGG	2	6	127574	127579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850790
2601	NC_011832	GCT	2	6	127586	127591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850790
2602	NC_011832	GGT	2	6	127604	127609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850790
2603	NC_011832	CCTC	2	8	127618	127625	0 %	25 %	0 %	75 %	219850790
2604	NC_011832	AGG	2	6	127630	127635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850790
2605	NC_011832	CCGA	2	8	127680	127687	25 %	0 %	25 %	50 %	219850790
2606	NC_011832	TCG	2	6	127714	127719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850790
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2608	NC_011832	GGC	2	6	127859	127864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850790
2609	NC_011832	CTG	2	6	127866	127871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850790
2610	NC_011832	TCGGG	2	10	127981	127990	0 %	20 %	60 %	20 %	219850790
2611	NC_011832	GCC	2	6	128001	128006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850790
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2615	NC_011832	CCTG	2	8	128185	128192	0 %	25 %	25 %	50 %	219850790
2616	NC_011832	TGG	2	6	128238	128243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850790
2617	NC_011832	TCG	2	6	128287	128292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850790
2618	NC_011832	TCG	2	6	128317	128322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850790
2619	NC_011832	CGC	2	6	128329	128334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850790
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2621	NC_011832	CCG	2	6	128434	128439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850791
2622	NC_011832	CGGT	2	8	128469	128476	0 %	25 %	50 %	25 %	219850791
2623	NC_011832	GCA	2	6	128536	128541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850791
2624	NC_011832	GAAC	2	8	128644	128651	50 %	0 %	25 %	25 %	219850791
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2742	NC_011832	GCA	2	6	133440	133445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850796
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2750	NC_011832	CTG	2	6	133670	133675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850796
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2862	NC_011832	GGA	2	6	138289	138294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850801
2863	NC_011832	CTCGG	2	10	138332	138341	0 %	20 %	40 %	40 %	219850801
2864	NC_011832	CTT	2	6	138412	138417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850801
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2867	NC_011832	GGC	2	6	138506	138511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850801
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2964	NC_011832	GA	3	6	142957	142962	50 %	0 %	50 %	0 %	219850804
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2981	NC_011832	CCT	2	6	143900	143905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850804
2982	NC_011832	CT	4	8	143904	143911	0 %	50 %	0 %	50 %	219850804
2983	NC_011832	GGT	2	6	143922	143927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850804
2984	NC_011832	CTG	3	9	143934	143942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850804
2985	NC_011832	AAC	2	6	143955	143960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850804
2986	NC_011832	AGC	2	6	144115	144120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850805
2987	NC_011832	GGT	2	6	144128	144133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850805
2988	NC_011832	GCT	2	6	144243	144248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850805
2989	NC_011832	ATC	2	6	144267	144272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850805
2990	NC_011832	GGC	2	6	144314	144319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850805
2991	NC_011832	GTG	2	6	144342	144347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850805
2992	NC_011832	GCT	2	6	144356	144361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850805
2993	NC_011832	TCC	2	6	144481	144486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850805
2994	NC_011832	GCAGCC	2	12	144492	144503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219850805
2995	NC_011832	ACCG	2	8	144530	144537	25 %	0 %	25 %	50 %	219850805
2996	NC_011832	TGG	2	6	144556	144561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850805
2997	NC_011832	CGA	2	6	144596	144601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850805
2998	NC_011832	CTT	2	6	144677	144682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850805
2999	NC_011832	CCT	2	6	144737	144742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850805
3000	NC_011832	CT	3	6	144747	144752	0 %	50 %	0 %	50 %	219850805

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