MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011832	TC	3	6	71293	71298	0 %	50 %	0 %	50 %	219850752
1502	NC_011832	GCC	2	6	71321	71326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850752
1503	NC_011832	CGG	2	6	71331	71336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850752
1504	NC_011832	CGA	2	6	71347	71352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1505	NC_011832	CCAG	2	8	71394	71401	25 %	0 %	25 %	50 %	219850752
1506	NC_011832	GGCC	2	8	71430	71437	0 %	0 %	50 %	50 %	219850752
1507	NC_011832	GAT	2	6	71467	71472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850752
1508	NC_011832	GCGG	2	8	71496	71503	0 %	0 %	75 %	25 %	219850752
1509	NC_011832	GTC	2	6	71506	71511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1510	NC_011832	CGT	2	6	71593	71598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1511	NC_011832	GTT	2	6	71614	71619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850752
1512	NC_011832	TCC	2	6	71690	71695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850752
1513	NC_011832	CGA	2	6	71712	71717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1514	NC_011832	GCG	2	6	71735	71740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850752
1515	NC_011832	GAC	3	9	71770	71778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1516	NC_011832	GGA	2	6	71805	71810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850752
1517	NC_011832	GAT	2	6	71818	71823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850752
1518	NC_011832	CGA	3	9	71841	71849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1519	NC_011832	GTC	2	6	71902	71907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1520	NC_011832	GCA	2	6	71936	71941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1521	NC_011832	GCT	2	6	71954	71959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850752
1522	NC_011832	CGG	2	6	71965	71970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850752
1523	NC_011832	GAGGC	2	10	71987	71996	20 %	0 %	60 %	20 %	219850752
1524	NC_011832	TCC	2	6	72117	72122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850753
1525	NC_011832	GCG	2	6	72136	72141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850753
1526	NC_011832	CT	3	6	72191	72196	0 %	50 %	0 %	50 %	219850753
1527	NC_011832	ATC	2	6	72243	72248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850753
1528	NC_011832	TGG	2	6	72343	72348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850753
1529	NC_011832	CTT	2	6	72404	72409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850753
1530	NC_011832	CGA	2	6	72430	72435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850753
1531	NC_011832	TCG	2	6	72552	72557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850753
1532	NC_011832	ATC	2	6	72561	72566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850753
1533	NC_011832	CGT	2	6	72571	72576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850753
1534	NC_011832	GCA	2	6	72584	72589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850753
1535	NC_011832	GAA	2	6	72605	72610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850753
1536	NC_011832	CGA	2	6	72655	72660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850753
1537	NC_011832	ATC	2	6	72677	72682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850753
1538	NC_011832	CCG	2	6	72685	72690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850753
1539	NC_011832	TCC	2	6	72799	72804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850753
1540	NC_011832	CTT	3	9	72833	72841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850753
1541	NC_011832	GAA	2	6	72902	72907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850753
1542	NC_011832	GTC	2	6	73097	73102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850753
1543	NC_011832	CAT	2	6	73133	73138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850753
1544	NC_011832	GGCA	2	8	73151	73158	25 %	0 %	50 %	25 %	219850753
1545	NC_011832	TAG	2	6	73161	73166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850753
1546	NC_011832	ATC	2	6	73197	73202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850753
1547	NC_011832	CGT	2	6	73262	73267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850754
1548	NC_011832	CGG	2	6	73352	73357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850754
1549	NC_011832	GCC	2	6	73450	73455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850754
1550	NC_011832	CTC	2	6	73476	73481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850754
1551	NC_011832	TCC	2	6	73489	73494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850754
1552	NC_011832	GAT	2	6	73551	73556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850754
1553	NC_011832	CCCGGG	2	12	73570	73581	0 %	0 %	50 %	50 %	219850754
1554	NC_011832	CCG	2	6	73705	73710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850754
1555	NC_011832	TGG	2	6	73717	73722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850754
1556	NC_011832	TCGG	2	8	73749	73756	0 %	25 %	50 %	25 %	219850754
1557	NC_011832	GCA	3	9	73772	73780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850754
1558	NC_011832	TCT	2	6	73793	73798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850754
1559	NC_011832	TGA	2	6	73820	73825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850754
1560	NC_011832	GAT	2	6	73836	73841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850754
1561	NC_011832	CGA	2	6	73904	73909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850754
1562	NC_011832	CGGT	2	8	73945	73952	0 %	25 %	50 %	25 %	219850754
1563	NC_011832	GAG	2	6	74038	74043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850754
1564	NC_011832	TC	3	6	74124	74129	0 %	50 %	0 %	50 %	219850754
1565	NC_011832	TTCT	2	8	74177	74184	0 %	75 %	0 %	25 %	219850755
1566	NC_011832	GCAC	2	8	74185	74192	25 %	0 %	25 %	50 %	219850755
1567	NC_011832	CGCCGG	2	12	74209	74220	0 %	0 %	50 %	50 %	219850755
1568	NC_011832	AGA	2	6	74265	74270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850755
1569	NC_011832	CTC	2	6	74356	74361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850755
1570	NC_011832	CCGGTG	2	12	74377	74388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219850755
1571	NC_011832	CCG	2	6	74407	74412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850755
1572	NC_011832	GTT	2	6	74418	74423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850755
1573	NC_011832	GTC	2	6	74485	74490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850755
1574	NC_011832	CCGT	2	8	74527	74534	0 %	25 %	25 %	50 %	219850755
1575	NC_011832	C	6	6	74695	74700	0 %	0 %	0 %	100 %	219850755
1576	NC_011832	CCAG	2	8	74757	74764	25 %	0 %	25 %	50 %	219850755
1577	NC_011832	CCT	2	6	74811	74816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850755
1578	NC_011832	TCC	2	6	74909	74914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850755
1579	NC_011832	CCG	2	6	74923	74928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850755
1580	NC_011832	AGGTGC	2	12	74933	74944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850755
1581	NC_011832	GTG	2	6	74945	74950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850755
1582	NC_011832	CCT	2	6	74967	74972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850755
1583	NC_011832	GGT	2	6	75010	75015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850755
1584	NC_011832	GCG	2	6	75035	75040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850755
1585	NC_011832	GCTC	2	8	75090	75097	0 %	25 %	25 %	50 %	219850755
1586	NC_011832	CGA	2	6	75102	75107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850755
1587	NC_011832	GGCC	2	8	75123	75130	0 %	0 %	50 %	50 %	219850755
1588	NC_011832	CGC	2	6	75240	75245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850755
1589	NC_011832	TCGAT	2	10	75276	75285	20 %	40 %	20 %	20 %	219850755
1590	NC_011832	CAGA	2	8	75313	75320	50 %	0 %	25 %	25 %	219850755
1591	NC_011832	GCC	2	6	75326	75331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850755
1592	NC_011832	GGC	2	6	75352	75357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850755
1593	NC_011832	GAT	2	6	75397	75402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850755
1594	NC_011832	TGT	2	6	75477	75482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850755
1595	NC_011832	AGGTCC	2	12	75527	75538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219850755
1596	NC_011832	TGC	2	6	75575	75580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850755
1597	NC_011832	GATC	2	8	75618	75625	25 %	25 %	25 %	25 %	219850755
1598	NC_011832	TTC	2	6	75653	75658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850755
1599	NC_011832	GATG	2	8	75670	75677	25 %	25 %	50 %	0 %	219850755
1600	NC_011832	TCA	2	6	75705	75710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850755
1601	NC_011832	CCG	2	6	75713	75718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850755
1602	NC_011832	ATG	2	6	75725	75730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850755
1603	NC_011832	CAG	2	6	75814	75819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850756
1604	NC_011832	GGT	2	6	75848	75853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850756
1605	NC_011832	TTCC	2	8	75912	75919	0 %	50 %	0 %	50 %	219850756
1606	NC_011832	GAA	2	6	75971	75976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850756
1607	NC_011832	GGT	2	6	75980	75985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850756
1608	NC_011832	TCCCT	2	10	76003	76012	0 %	40 %	0 %	60 %	219850756
1609	NC_011832	ACC	2	6	76116	76121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850756
1610	NC_011832	TCC	2	6	76143	76148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850756
1611	NC_011832	CGA	2	6	76153	76158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850756
1612	NC_011832	GAA	2	6	76178	76183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850756
1613	NC_011832	CTG	2	6	76202	76207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850756
1614	NC_011832	CAGTA	2	10	76216	76225	40 %	20 %	20 %	20 %	219850756
1615	NC_011832	CTC	2	6	76394	76399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850757
1616	NC_011832	TCC	2	6	76405	76410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850757
1617	NC_011832	AGG	2	6	76414	76419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850757
1618	NC_011832	AG	3	6	76437	76442	50 %	0 %	50 %	0 %	219850757
1619	NC_011832	TCG	2	6	76477	76482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850757
1620	NC_011832	TGG	2	6	76681	76686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850758
1621	NC_011832	GAGC	2	8	76689	76696	25 %	0 %	50 %	25 %	219850758
1622	NC_011832	GGT	2	6	76703	76708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850758
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1624	NC_011832	TTC	2	6	76738	76743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850758
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1995	NC_011832	GCCAAG	2	12	94482	94493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850769
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1997	NC_011832	CGG	2	6	94595	94600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850769
1998	NC_011832	AGC	2	6	94677	94682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850769
1999	NC_011832	CGA	2	6	94766	94771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850769
2000	NC_011832	CGG	2	6	94790	94795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850769

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