MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011832	TCG	2	6	682055	682060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851344
13502	NC_011832	GTT	2	6	682065	682070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851344
13503	NC_011832	GGT	2	6	682110	682115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851344
13504	NC_011832	CACCAG	2	12	682155	682166	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219851344
13505	NC_011832	ATG	2	6	682238	682243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851344
13506	NC_011832	ACT	2	6	682391	682396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851344
13507	NC_011832	CCT	2	6	682478	682483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851344
13508	NC_011832	GAC	2	6	682491	682496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851344
13509	NC_011832	CAA	2	6	682572	682577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851344
13510	NC_011832	TGAAC	2	10	682578	682587	40 %	20 %	20 %	20 %	219851344
13511	NC_011832	TCG	2	6	682607	682612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851344
13512	NC_011832	GGAT	2	8	682713	682720	25 %	25 %	50 %	0 %	219851344
13513	NC_011832	AC	3	6	682772	682777	50 %	0 %	0 %	50 %	219851344
13514	NC_011832	ACC	2	6	682873	682878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851344
13515	NC_011832	TC	3	6	682889	682894	0 %	50 %	0 %	50 %	219851344
13516	NC_011832	TCA	2	6	682915	682920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851344
13517	NC_011832	GTG	2	6	682991	682996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851344
13518	NC_011832	GGGGT	2	10	682999	683008	0 %	20 %	80 %	0 %	219851344
13519	NC_011832	ACT	2	6	683012	683017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851344
13520	NC_011832	CAA	2	6	683028	683033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851344
13521	NC_011832	TGG	2	6	683052	683057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851344
13522	NC_011832	CTA	2	6	683091	683096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851344
13523	NC_011832	GCG	2	6	683182	683187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851344
13524	NC_011832	GTC	2	6	683209	683214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851344
13525	NC_011832	GAT	2	6	683218	683223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851344
13526	NC_011832	CAG	2	6	683294	683299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851344
13527	NC_011832	TCT	2	6	683339	683344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851344
13528	NC_011832	ATG	2	6	683518	683523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851345
13529	NC_011832	GCT	2	6	683565	683570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851345
13530	NC_011832	CTG	2	6	683648	683653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851345
13531	NC_011832	TCT	2	6	683660	683665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851345
13532	NC_011832	TCT	2	6	683732	683737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851345
13533	NC_011832	CGG	2	6	683763	683768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851345
13534	NC_011832	CTT	2	6	683853	683858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851345
13535	NC_011832	TCA	2	6	683921	683926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851345
13536	NC_011832	GGA	2	6	684021	684026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851345
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13538	NC_011832	GAG	2	6	684154	684159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851345
13539	NC_011832	GTT	2	6	684273	684278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851345
13540	NC_011832	GAT	2	6	684285	684290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851345
13541	NC_011832	GGT	2	6	684340	684345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851346
13542	NC_011832	AGA	2	6	684357	684362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851346
13543	NC_011832	ACT	2	6	684435	684440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851346
13544	NC_011832	CAG	2	6	684442	684447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851346
13545	NC_011832	GCAG	2	8	684450	684457	25 %	0 %	50 %	25 %	219851346
13546	NC_011832	A	6	6	684467	684472	100 %	0 %	0 %	0 %	219851346
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13549	NC_011832	TGG	2	6	684513	684518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851346
13550	NC_011832	T	6	6	684592	684597	0 %	100 %	0 %	0 %	219851346
13551	NC_011832	TAA	2	6	684658	684663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851346
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13553	NC_011832	CGT	2	6	684720	684725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851347
13554	NC_011832	A	6	6	684753	684758	100 %	0 %	0 %	0 %	219851347
13555	NC_011832	AAT	3	9	684780	684788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851347
13556	NC_011832	GGT	2	6	684798	684803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851347
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13558	NC_011832	GCAGA	2	10	684886	684895	40 %	0 %	40 %	20 %	219851347
13559	NC_011832	GTG	2	6	684956	684961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851347
13560	NC_011832	GA	3	6	684962	684967	50 %	0 %	50 %	0 %	219851347
13561	NC_011832	TCA	2	6	685013	685018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851347
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13563	NC_011832	C	6	6	685100	685105	0 %	0 %	0 %	100 %	219851347
13564	NC_011832	C	7	7	685164	685170	0 %	0 %	0 %	100 %	219851347
13565	NC_011832	GATC	2	8	685184	685191	25 %	25 %	25 %	25 %	219851347
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13567	NC_011832	TCGC	2	8	685358	685365	0 %	25 %	25 %	50 %	219851347
13568	NC_011832	GATGG	2	10	685378	685387	20 %	20 %	60 %	0 %	219851347
13569	NC_011832	CGG	2	6	685394	685399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851347
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13571	NC_011832	TAC	2	6	685484	685489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851347
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13573	NC_011832	CCTGA	2	10	685603	685612	20 %	20 %	20 %	40 %	219851347
13574	NC_011832	TGC	2	6	685667	685672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851347
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13580	NC_011832	TGG	2	6	685980	685985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851347
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13584	NC_011832	CGGTT	2	10	686211	686220	0 %	40 %	40 %	20 %	219851347
13585	NC_011832	GAT	2	6	686229	686234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851347
13586	NC_011832	CGT	2	6	686250	686255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851347
13587	NC_011832	GCG	2	6	686281	686286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851347
13588	NC_011832	CTGA	2	8	686356	686363	25 %	25 %	25 %	25 %	219851347
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13590	NC_011832	GAGG	2	8	686407	686414	25 %	0 %	75 %	0 %	219851347
13591	NC_011832	GATCCG	2	12	686415	686426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851347
13592	NC_011832	ATC	2	6	686449	686454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851347
13593	NC_011832	TCG	2	6	686477	686482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851347
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13597	NC_011832	ATGA	2	8	686635	686642	50 %	25 %	25 %	0 %	219851348
13598	NC_011832	CATG	2	8	686767	686774	25 %	25 %	25 %	25 %	219851348
13599	NC_011832	TCGC	2	8	686904	686911	0 %	25 %	25 %	50 %	219851348
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13602	NC_011832	TCGA	2	8	687050	687057	25 %	25 %	25 %	25 %	219851348
13603	NC_011832	GGC	3	9	687060	687068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851348
13604	NC_011832	ACG	2	6	687132	687137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
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13608	NC_011832	GA	3	6	687444	687449	50 %	0 %	50 %	0 %	219851348
13609	NC_011832	CAGGT	2	10	687495	687504	20 %	20 %	40 %	20 %	219851348
13610	NC_011832	TCG	2	6	687525	687530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
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13619	NC_011832	CTA	2	6	688162	688167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851348
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