MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011832	CAC	2	6	656251	656256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851321
13002	NC_011832	TG	3	6	656264	656269	0 %	50 %	50 %	0 %	219851321
13003	NC_011832	GAG	2	6	656284	656289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851321
13004	NC_011832	GAA	2	6	656317	656322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851321
13005	NC_011832	GAG	2	6	656323	656328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851321
13006	NC_011832	TC	3	6	656371	656376	0 %	50 %	0 %	50 %	219851321
13007	NC_011832	GGCAC	2	10	656384	656393	20 %	0 %	40 %	40 %	219851321
13008	NC_011832	CCT	2	6	656406	656411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851321
13009	NC_011832	TGA	2	6	656469	656474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851321
13010	NC_011832	CCA	2	6	656570	656575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851322
13011	NC_011832	GTCT	2	8	656662	656669	0 %	50 %	25 %	25 %	219851322
13012	NC_011832	TCG	2	6	656683	656688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13013	NC_011832	CGA	2	6	656723	656728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13014	NC_011832	TGG	2	6	656779	656784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851322
13015	NC_011832	CGT	2	6	656807	656812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13016	NC_011832	GCC	2	6	656856	656861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851322
13017	NC_011832	CAG	2	6	656910	656915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13018	NC_011832	AGG	2	6	656978	656983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851322
13019	NC_011832	GAT	2	6	656997	657002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851322
13020	NC_011832	C	6	6	657072	657077	0 %	0 %	0 %	100 %	219851322
13021	NC_011832	ACG	2	6	657094	657099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13022	NC_011832	GTC	2	6	657108	657113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13023	NC_011832	GCT	2	6	657125	657130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13024	NC_011832	TGG	2	6	657157	657162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851322
13025	NC_011832	AGAC	2	8	657163	657170	50 %	0 %	25 %	25 %	219851322
13026	NC_011832	ACCGA	2	10	657181	657190	40 %	0 %	20 %	40 %	219851322
13027	NC_011832	TCT	2	6	657203	657208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851322
13028	NC_011832	CTT	2	6	657276	657281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851322
13029	NC_011832	CCGG	2	8	657291	657298	0 %	0 %	50 %	50 %	219851322
13030	NC_011832	CAT	2	6	657348	657353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851322
13031	NC_011832	TCG	2	6	657425	657430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851322
13032	NC_011832	GGA	2	6	657441	657446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851322
13033	NC_011832	GTA	2	6	657504	657509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851322
13034	NC_011832	GTA	2	6	657570	657575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851322
13035	NC_011832	G	6	6	657626	657631	0 %	0 %	100 %	0 %	219851322
13036	NC_011832	CCT	2	6	657662	657667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851322
13037	NC_011832	GGT	2	6	657690	657695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851322
13038	NC_011832	CCT	2	6	657698	657703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851322
13039	NC_011832	GA	3	6	657733	657738	50 %	0 %	50 %	0 %	219851322
13040	NC_011832	GCG	2	6	657776	657781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851322
13041	NC_011832	G	6	6	657788	657793	0 %	0 %	100 %	0 %	219851322
13042	NC_011832	CTC	2	6	657837	657842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851322
13043	NC_011832	TCA	2	6	658027	658032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851323
13044	NC_011832	GT	3	6	658051	658056	0 %	50 %	50 %	0 %	219851323
13045	NC_011832	GGTC	2	8	658069	658076	0 %	25 %	50 %	25 %	219851323
13046	NC_011832	GGC	2	6	658232	658237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851323
13047	NC_011832	TGATC	2	10	658289	658298	20 %	40 %	20 %	20 %	219851323
13048	NC_011832	GA	3	6	658438	658443	50 %	0 %	50 %	0 %	219851323
13049	NC_011832	GTC	2	6	658514	658519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851323
13050	NC_011832	GGT	2	6	658544	658549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851323
13051	NC_011832	TCT	2	6	658597	658602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851323
13052	NC_011832	GCA	2	6	658611	658616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851323
13053	NC_011832	GGTAC	2	10	658638	658647	20 %	20 %	40 %	20 %	219851323
13054	NC_011832	AG	3	6	658658	658663	50 %	0 %	50 %	0 %	219851323
13055	NC_011832	AAG	3	9	658700	658708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851323
13056	NC_011832	A	6	6	658741	658746	100 %	0 %	0 %	0 %	219851323
13057	NC_011832	ATG	2	6	658827	658832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851324
13058	NC_011832	CAG	2	6	658859	658864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851324
13059	NC_011832	CAGCC	2	10	658896	658905	20 %	0 %	20 %	60 %	219851324
13060	NC_011832	GACC	2	8	658962	658969	25 %	0 %	25 %	50 %	219851324
13061	NC_011832	ATC	2	6	659404	659409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851325
13062	NC_011832	TCG	2	6	659410	659415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851325
13063	NC_011832	AGA	2	6	659428	659433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851325
13064	NC_011832	GGT	2	6	659508	659513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851325
13065	NC_011832	CCT	3	9	659570	659578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851325
13066	NC_011832	AGT	2	6	659636	659641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851325
13067	NC_011832	GGA	2	6	659663	659668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851325
13068	NC_011832	GA	3	6	659708	659713	50 %	0 %	50 %	0 %	219851325
13069	NC_011832	CAC	2	6	659787	659792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851325
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13071	NC_011832	CGG	2	6	659840	659845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851325
13072	NC_011832	CCCG	2	8	659855	659862	0 %	0 %	25 %	75 %	219851325
13073	NC_011832	CCG	2	6	659923	659928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851325
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13079	NC_011832	TCG	2	6	660163	660168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851325
13080	NC_011832	CCA	2	6	660415	660420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851325
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13084	NC_011832	C	6	6	660513	660518	0 %	0 %	0 %	100 %	219851325
13085	NC_011832	CGG	2	6	660568	660573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851325
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13091	NC_011832	GATCCG	2	12	660820	660831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851326
13092	NC_011832	CGA	2	6	660846	660851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851326
13093	NC_011832	TCT	2	6	660852	660857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851326
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13098	NC_011832	CTGA	2	8	660971	660978	25 %	25 %	25 %	25 %	219851326
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13101	NC_011832	GGC	2	6	661025	661030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851326
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13103	NC_011832	AGCG	2	8	661166	661173	25 %	0 %	50 %	25 %	219851326
13104	NC_011832	CGA	2	6	661290	661295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851326
13105	NC_011832	TCG	2	6	661310	661315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851326
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13108	NC_011832	TCG	2	6	661541	661546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851326
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13111	NC_011832	GAA	2	6	661680	661685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851326
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13114	NC_011832	CGG	2	6	661863	661868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851326
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13120	NC_011832	GGA	2	6	662115	662120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851326
13121	NC_011832	G	7	7	662144	662150	0 %	0 %	100 %	0 %	219851326
13122	NC_011832	TGA	2	6	662159	662164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851326
13123	NC_011832	CGA	2	6	662262	662267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851326
13124	NC_011832	GTTC	2	8	662297	662304	0 %	50 %	25 %	25 %	219851326
13125	NC_011832	GA	3	6	662412	662417	50 %	0 %	50 %	0 %	219851326
13126	NC_011832	T	6	6	662499	662504	0 %	100 %	0 %	0 %	219851326
13127	NC_011832	TGG	2	6	662510	662515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851326
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13144	NC_011832	GC	3	6	663165	663170	0 %	0 %	50 %	50 %	219851326
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13150	NC_011832	GAG	2	6	663487	663492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851326
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13152	NC_011832	TCG	3	9	663519	663527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851326
13153	NC_011832	TGA	2	6	663542	663547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851326
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13221	NC_011832	CTT	2	6	667222	667227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851328
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13223	NC_011832	GCT	2	6	667284	667289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851328
13224	NC_011832	TTG	2	6	667348	667353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851328
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13226	NC_011832	TCT	2	6	667557	667562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851329
13227	NC_011832	GCGG	2	8	667584	667591	0 %	0 %	75 %	25 %	219851329
13228	NC_011832	CCT	2	6	667626	667631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851329
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13230	NC_011832	GGA	2	6	667728	667733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851329
13231	NC_011832	CGTG	2	8	667758	667765	0 %	25 %	50 %	25 %	219851329
13232	NC_011832	GAG	2	6	667786	667791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851329
13233	NC_011832	TCC	2	6	667859	667864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851329
13234	NC_011832	CT	3	6	667892	667897	0 %	50 %	0 %	50 %	219851329
13235	NC_011832	CAT	2	6	667933	667938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851329
13236	NC_011832	GTC	3	9	668032	668040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851329
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13238	NC_011832	CT	3	6	668312	668317	0 %	50 %	0 %	50 %	219851330
13239	NC_011832	ATC	2	6	668343	668348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851330
13240	NC_011832	GAT	2	6	668420	668425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851330
13241	NC_011832	TCC	2	6	668430	668435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851330
13242	NC_011832	TGA	2	6	668442	668447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851330
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13244	NC_011832	ATG	2	6	668586	668591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851330
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13354	NC_011832	CTG	2	6	675003	675008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851336
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13474	NC_011832	AGG	2	6	680234	680239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851341
13475	NC_011832	GTC	3	9	680280	680288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851341
13476	NC_011832	CAG	2	6	680317	680322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851341
13477	NC_011832	AAG	2	6	680335	680340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851341
13478	NC_011832	GAG	2	6	680398	680403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851341
13479	NC_011832	GAT	2	6	680440	680445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851342
13480	NC_011832	CCT	2	6	680619	680624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851342
13481	NC_011832	GAGG	2	8	680707	680714	25 %	0 %	75 %	0 %	219851342
13482	NC_011832	ACG	3	9	680720	680728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851342
13483	NC_011832	CGG	2	6	680979	680984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851342
13484	NC_011832	AAG	2	6	681029	681034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851342
13485	NC_011832	GGC	2	6	681070	681075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851342
13486	NC_011832	TGC	2	6	681081	681086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851342
13487	NC_011832	CAT	3	9	681160	681168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851342
13488	NC_011832	TGA	2	6	681212	681217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851342
13489	NC_011832	GGGAT	2	10	681218	681227	20 %	20 %	60 %	0 %	219851343
13490	NC_011832	CGC	2	6	681258	681263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851343
13491	NC_011832	GCAG	2	8	681297	681304	25 %	0 %	50 %	25 %	219851343
13492	NC_011832	TCG	2	6	681348	681353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851343
13493	NC_011832	GGCT	2	8	681464	681471	0 %	25 %	50 %	25 %	219851343
13494	NC_011832	GGT	2	6	681504	681509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851343
13495	NC_011832	GCT	2	6	681528	681533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851343
13496	NC_011832	GAG	2	6	681556	681561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851343
13497	NC_011832	TGG	2	6	681705	681710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851343
13498	NC_011832	CT	3	6	681763	681768	0 %	50 %	0 %	50 %	219851343
13499	NC_011832	ATCGTG	2	12	681771	681782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219851343
13500	NC_011832	GTG	2	6	682039	682044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851344

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