MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011832	A	6	6	629455	629460	100 %	0 %	0 %	0 %	219851294
12502	NC_011832	TCTCAT	2	12	629577	629588	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219851294
12503	NC_011832	AAT	2	6	629691	629696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851294
12504	NC_011832	GAA	2	6	629752	629757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851294
12505	NC_011832	ATC	2	6	629782	629787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851294
12506	NC_011832	TTG	2	6	629790	629795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851294
12507	NC_011832	A	6	6	629798	629803	100 %	0 %	0 %	0 %	219851294
12508	NC_011832	ACTG	2	8	629809	629816	25 %	25 %	25 %	25 %	219851294
12509	NC_011832	CAT	2	6	629854	629859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851294
12510	NC_011832	TAC	2	6	629925	629930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851294
12511	NC_011832	TTG	2	6	630017	630022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851294
12512	NC_011832	AT	3	6	630059	630064	50 %	50 %	0 %	0 %	219851294
12513	NC_011832	AAG	2	6	630134	630139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851294
12514	NC_011832	ACA	2	6	630422	630427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851295
12515	NC_011832	AT	3	6	630445	630450	50 %	50 %	0 %	0 %	219851295
12516	NC_011832	G	7	7	630457	630463	0 %	0 %	100 %	0 %	219851295
12517	NC_011832	T	6	6	630490	630495	0 %	100 %	0 %	0 %	219851295
12518	NC_011832	T	6	6	630507	630512	0 %	100 %	0 %	0 %	219851295
12519	NC_011832	TAA	2	6	630579	630584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851295
12520	NC_011832	TCA	2	6	630585	630590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851295
12521	NC_011832	GAA	2	6	630631	630636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851295
12522	NC_011832	TTG	2	6	630657	630662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851295
12523	NC_011832	TCA	2	6	630693	630698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851295
12524	NC_011832	TCA	2	6	630710	630715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851295
12525	NC_011832	AT	3	6	630732	630737	50 %	50 %	0 %	0 %	219851295
12526	NC_011832	TCA	2	6	630805	630810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851295
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12528	NC_011832	TAT	2	6	630895	630900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851295
12529	NC_011832	CAGA	2	8	630910	630917	50 %	0 %	25 %	25 %	219851295
12530	NC_011832	T	7	7	630947	630953	0 %	100 %	0 %	0 %	219851295
12531	NC_011832	GA	3	6	631001	631006	50 %	0 %	50 %	0 %	219851295
12532	NC_011832	TA	3	6	631099	631104	50 %	50 %	0 %	0 %	219851295
12533	NC_011832	GAA	2	6	631108	631113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851295
12534	NC_011832	A	6	6	631121	631126	100 %	0 %	0 %	0 %	219851295
12535	NC_011832	GTTT	2	8	631136	631143	0 %	75 %	25 %	0 %	219851295
12536	NC_011832	A	6	6	631149	631154	100 %	0 %	0 %	0 %	219851295
12537	NC_011832	TGG	3	9	631269	631277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851295
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12539	NC_011832	A	8	8	631323	631330	100 %	0 %	0 %	0 %	219851295
12540	NC_011832	A	6	6	631368	631373	100 %	0 %	0 %	0 %	219851295
12541	NC_011832	ATA	2	6	631376	631381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851295
12542	NC_011832	ATG	2	6	631433	631438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851295
12543	NC_011832	AATTA	2	10	631550	631559	60 %	40 %	0 %	0 %	219851295
12544	NC_011832	TAA	2	6	631626	631631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851295
12545	NC_011832	TCT	2	6	631822	631827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851296
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12547	NC_011832	CGGC	2	8	631907	631914	0 %	0 %	50 %	50 %	219851296
12548	NC_011832	TCTA	2	8	631915	631922	25 %	50 %	0 %	25 %	219851296
12549	NC_011832	AC	3	6	632145	632150	50 %	0 %	0 %	50 %	219851297
12550	NC_011832	TGC	2	6	632157	632162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851297
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12552	NC_011832	GGAC	2	8	632208	632215	25 %	0 %	50 %	25 %	219851297
12553	NC_011832	C	6	6	632226	632231	0 %	0 %	0 %	100 %	219851297
12554	NC_011832	GGC	2	6	632254	632259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851297
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12560	NC_011832	ACC	2	6	632441	632446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851297
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12565	NC_011832	GGT	2	6	632614	632619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851297
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12570	NC_011832	CGA	2	6	632877	632882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851297
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12597	NC_011832	GCT	2	6	634111	634116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851299
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12602	NC_011832	TCGGG	2	10	634317	634326	0 %	20 %	60 %	20 %	219851299
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12605	NC_011832	CGGC	2	8	634392	634399	0 %	0 %	50 %	50 %	219851299
12606	NC_011832	GAA	3	9	634444	634452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851299
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12609	NC_011832	G	7	7	634537	634543	0 %	0 %	100 %	0 %	219851299
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12618	NC_011832	TCGA	2	8	635857	635864	25 %	25 %	25 %	25 %	219851301
12619	NC_011832	T	6	6	635906	635911	0 %	100 %	0 %	0 %	219851301
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12742	NC_011832	GGA	2	6	641960	641965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851307
12743	NC_011832	TCC	2	6	641970	641975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851307
12744	NC_011832	AAG	2	6	642075	642080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851307
12745	NC_011832	A	6	6	642094	642099	100 %	0 %	0 %	0 %	219851307
12746	NC_011832	TTCCGC	2	12	642186	642197	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219851307
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12750	NC_011832	GAT	2	6	642336	642341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851307
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12754	NC_011832	CTG	3	9	642518	642526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851308
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12757	NC_011832	TGT	2	6	642695	642700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851308
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12771	NC_011832	TTCG	2	8	643259	643266	0 %	50 %	25 %	25 %	219851308
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12774	NC_011832	GAT	2	6	643316	643321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851308
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12853	NC_011832	ACC	2	6	648040	648045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851314
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12857	NC_011832	TC	3	6	648107	648112	0 %	50 %	0 %	50 %	219851314
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12975	NC_011832	ATC	2	6	655383	655388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851321
12976	NC_011832	CTGG	2	8	655395	655402	0 %	25 %	50 %	25 %	219851321
12977	NC_011832	GCG	2	6	655524	655529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851321
12978	NC_011832	GAT	3	9	655537	655545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851321
12979	NC_011832	CTG	2	6	655585	655590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851321
12980	NC_011832	TGA	2	6	655632	655637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851321
12981	NC_011832	CGT	2	6	655647	655652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851321
12982	NC_011832	CGA	2	6	655671	655676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851321
12983	NC_011832	TCT	2	6	655680	655685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851321
12984	NC_011832	TTC	2	6	655715	655720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851321
12985	NC_011832	CAG	2	6	655735	655740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851321
12986	NC_011832	TCT	2	6	655743	655748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851321
12987	NC_011832	TGGC	2	8	655760	655767	0 %	25 %	50 %	25 %	219851321
12988	NC_011832	GTC	3	9	655778	655786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851321
12989	NC_011832	GGA	2	6	655815	655820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851321
12990	NC_011832	CTT	2	6	655849	655854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851321
12991	NC_011832	CCT	2	6	655971	655976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851321
12992	NC_011832	CATC	2	8	655983	655990	25 %	25 %	0 %	50 %	219851321
12993	NC_011832	GAT	2	6	656029	656034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851321
12994	NC_011832	CCCG	2	8	656115	656122	0 %	0 %	25 %	75 %	219851321
12995	NC_011832	GCCGT	2	10	656144	656153	0 %	20 %	40 %	40 %	219851321
12996	NC_011832	AGA	2	6	656163	656168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851321
12997	NC_011832	CTC	2	6	656185	656190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851321
12998	NC_011832	CGG	2	6	656198	656203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851321
12999	NC_011832	GCG	2	6	656225	656230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851321
13000	NC_011832	GTG	2	6	656245	656250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851321

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