MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_011832	ACC	2	6	602662	602667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851276
12003	NC_011832	CGA	2	6	602723	602728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851276
12004	NC_011832	ACG	2	6	602863	602868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851276
12005	NC_011832	TTC	2	6	602872	602877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851276
12006	NC_011832	CGGT	2	8	602922	602929	0 %	25 %	50 %	25 %	219851276
12007	NC_011832	ATGG	2	8	602931	602938	25 %	25 %	50 %	0 %	219851276
12008	NC_011832	GAT	2	6	602955	602960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851276
12009	NC_011832	CAT	2	6	603018	603023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851276
12010	NC_011832	ATA	2	6	603033	603038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851276
12011	NC_011832	TGCG	2	8	603045	603052	0 %	25 %	50 %	25 %	219851276
12012	NC_011832	GAGAA	2	10	603121	603130	60 %	0 %	40 %	0 %	219851276
12013	NC_011832	TCC	2	6	603136	603141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851276
12014	NC_011832	GA	3	6	603217	603222	50 %	0 %	50 %	0 %	219851276
12015	NC_011832	TGA	2	6	603236	603241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851276
12016	NC_011832	GAT	2	6	603243	603248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851276
12017	NC_011832	CAC	2	6	603306	603311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851276
12018	NC_011832	ACC	2	6	603379	603384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851276
12019	NC_011832	TCA	2	6	603413	603418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851276
12020	NC_011832	TGA	2	6	603425	603430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851276
12021	NC_011832	ATCA	2	8	603459	603466	50 %	25 %	0 %	25 %	219851276
12022	NC_011832	TCG	2	6	603535	603540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851276
12023	NC_011832	TTGCC	2	10	603633	603642	0 %	40 %	20 %	40 %	219851277
12024	NC_011832	CTTCT	2	10	603712	603721	0 %	60 %	0 %	40 %	219851277
12025	NC_011832	CTG	2	6	603726	603731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851277
12026	NC_011832	ATC	2	6	603810	603815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851278
12027	NC_011832	GAT	2	6	603829	603834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851278
12028	NC_011832	CTG	2	6	603897	603902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851278
12029	NC_011832	CCT	2	6	604053	604058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851278
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12032	NC_011832	GTC	2	6	604207	604212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851279
12033	NC_011832	GAT	2	6	604299	604304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851279
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12039	NC_011832	GAATG	2	10	605249	605258	40 %	20 %	40 %	0 %	219851280
12040	NC_011832	CAG	2	6	605279	605284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851280
12041	NC_011832	TTCTG	2	10	605302	605311	0 %	60 %	20 %	20 %	219851280
12042	NC_011832	GGA	2	6	605398	605403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851280
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12044	NC_011832	TTC	2	6	605454	605459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851280
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12047	NC_011832	GA	3	6	605530	605535	50 %	0 %	50 %	0 %	219851280
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12049	NC_011832	T	7	7	605581	605587	0 %	100 %	0 %	0 %	219851280
12050	NC_011832	GGTACC	2	12	605632	605643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851280
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12052	NC_011832	GTCG	2	8	605679	605686	0 %	25 %	50 %	25 %	219851280
12053	NC_011832	CAG	2	6	605712	605717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851280
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12055	NC_011832	GCT	2	6	605778	605783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851280
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12060	NC_011832	ATCG	2	8	605957	605964	25 %	25 %	25 %	25 %	219851280
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12119	NC_011832	C	6	6	609763	609768	0 %	0 %	0 %	100 %	219851284
12120	NC_011832	GAG	2	6	609804	609809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851284
12121	NC_011832	GCA	2	6	609822	609827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851284
12122	NC_011832	CTT	2	6	609829	609834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851284
12123	NC_011832	TCT	2	6	610003	610008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851284
12124	NC_011832	TCC	2	6	610046	610051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851284
12125	NC_011832	GGT	2	6	610100	610105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851284
12126	NC_011832	GAT	2	6	610112	610117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851284
12127	NC_011832	TCT	2	6	610165	610170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851284
12128	NC_011832	TCG	2	6	610181	610186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851284
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12130	NC_011832	TCCGC	2	10	610263	610272	0 %	20 %	20 %	60 %	219851284
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12132	NC_011832	CTC	2	6	610295	610300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851284
12133	NC_011832	CCGG	2	8	610307	610314	0 %	0 %	50 %	50 %	219851284
12134	NC_011832	CCAT	2	8	610374	610381	25 %	25 %	0 %	50 %	219851284
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12136	NC_011832	C	6	6	610480	610485	0 %	0 %	0 %	100 %	219851284
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12140	NC_011832	AAG	2	6	611033	611038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851285
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12142	NC_011832	TGC	2	6	611082	611087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
12143	NC_011832	CCGG	2	8	611141	611148	0 %	0 %	50 %	50 %	219851285
12144	NC_011832	GCT	2	6	611155	611160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
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12147	NC_011832	TGA	2	6	611244	611249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851285
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12149	NC_011832	CTG	2	6	611375	611380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
12150	NC_011832	GAG	2	6	611437	611442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851285
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12222	NC_011832	CTG	2	6	614762	614767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
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12228	NC_011832	CTG	2	6	615185	615190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
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12233	NC_011832	GATT	2	8	615511	615518	25 %	50 %	25 %	0 %	219851285
12234	NC_011832	CAT	2	6	615578	615583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851285
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12236	NC_011832	CTC	2	6	615605	615610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851285
12237	NC_011832	GTC	2	6	615621	615626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
12238	NC_011832	CGG	2	6	615635	615640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851285
12239	NC_011832	AGCCG	2	10	615646	615655	20 %	0 %	40 %	40 %	219851285
12240	NC_011832	TGC	2	6	615675	615680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
12241	NC_011832	GAT	2	6	615769	615774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851285
12242	NC_011832	CTC	2	6	615818	615823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851285
12243	NC_011832	AAT	2	6	615851	615856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851285
12244	NC_011832	GCCGGG	2	12	615857	615868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851285
12245	NC_011832	GGA	2	6	615907	615912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851285
12246	NC_011832	TCT	2	6	615969	615974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851285
12247	NC_011832	CCAG	2	8	615988	615995	25 %	0 %	25 %	50 %	219851285
12248	NC_011832	CCT	3	9	616008	616016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851285
12249	NC_011832	TC	3	6	616095	616100	0 %	50 %	0 %	50 %	219851285
12250	NC_011832	GAT	2	6	616106	616111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851285
12251	NC_011832	CGG	2	6	616154	616159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851285
12252	NC_011832	GGT	2	6	616186	616191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851285
12253	NC_011832	CGA	2	6	616210	616215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851285
12254	NC_011832	ATG	2	6	616334	616339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851285
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12257	NC_011832	CTC	2	6	616444	616449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851285
12258	NC_011832	GGT	2	6	616486	616491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851285
12259	NC_011832	CACGAT	2	12	616504	616515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851285
12260	NC_011832	CGG	2	6	616530	616535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851285
12261	NC_011832	TAT	2	6	616598	616603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851285
12262	NC_011832	GGT	2	6	616654	616659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851285
12263	NC_011832	GGT	2	6	616720	616725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851285
12264	NC_011832	ACCCG	2	10	616734	616743	20 %	0 %	20 %	60 %	219851285
12265	NC_011832	TGG	2	6	616917	616922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851285
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12267	NC_011832	CCGG	2	8	617023	617030	0 %	0 %	50 %	50 %	219851285
12268	NC_011832	CGG	2	6	617045	617050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851285
12269	NC_011832	TGA	2	6	617065	617070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851285
12270	NC_011832	ATC	2	6	617105	617110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851285
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12272	NC_011832	TC	3	6	617216	617221	0 %	50 %	0 %	50 %	219851285
12273	NC_011832	TTC	2	6	617249	617254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851285
12274	NC_011832	ATC	2	6	617297	617302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851285
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12276	NC_011832	CTG	2	6	617747	617752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
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12279	NC_011832	CT	3	6	617787	617792	0 %	50 %	0 %	50 %	219851285
12280	NC_011832	TTC	2	6	617837	617842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851285
12281	NC_011832	TC	4	8	617997	618004	0 %	50 %	0 %	50 %	219851285
12282	NC_011832	GGTC	2	8	618043	618050	0 %	25 %	50 %	25 %	219851285
12283	NC_011832	TGC	2	6	618061	618066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851285
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12349	NC_011832	GGC	2	6	622129	622134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851287
12350	NC_011832	CTT	2	6	622141	622146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851287
12351	NC_011832	CGGT	2	8	622195	622202	0 %	25 %	50 %	25 %	219851287
12352	NC_011832	CTC	2	6	622203	622208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851287
12353	NC_011832	GGC	2	6	622294	622299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851287
12354	NC_011832	TC	3	6	622346	622351	0 %	50 %	0 %	50 %	219851287
12355	NC_011832	GA	3	6	622388	622393	50 %	0 %	50 %	0 %	219851287
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12357	NC_011832	GTGG	2	8	622438	622445	0 %	25 %	75 %	0 %	219851287
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12477	NC_011832	TGA	2	6	628337	628342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851293
12478	NC_011832	TGT	2	6	628367	628372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851293
12479	NC_011832	A	6	6	628410	628415	100 %	0 %	0 %	0 %	219851293
12480	NC_011832	TAA	2	6	628424	628429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851293
12481	NC_011832	ACT	2	6	628430	628435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851293
12482	NC_011832	A	6	6	628446	628451	100 %	0 %	0 %	0 %	219851293
12483	NC_011832	TTA	2	6	628452	628457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851293
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12487	NC_011832	CAT	2	6	628600	628605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851293
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12491	NC_011832	TTGA	2	8	628668	628675	25 %	50 %	25 %	0 %	219851293
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12493	NC_011832	ACG	2	6	628723	628728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851293
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12497	NC_011832	AT	4	8	628828	628835	50 %	50 %	0 %	0 %	219851293
12498	NC_011832	TTC	2	6	628885	628890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851293
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12500	NC_011832	A	6	6	628959	628964	100 %	0 %	0 %	0 %	219851293

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