MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011832	ACT	2	6	577856	577861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851245
11502	NC_011832	GAC	2	6	577873	577878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851245
11503	NC_011832	GTC	2	6	577883	577888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851245
11504	NC_011832	GAG	2	6	577943	577948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851246
11505	NC_011832	TGC	2	6	577959	577964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851246
11506	NC_011832	CGA	2	6	578017	578022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851246
11507	NC_011832	CCTT	2	8	578063	578070	0 %	50 %	0 %	50 %	219851246
11508	NC_011832	CT	4	8	578085	578092	0 %	50 %	0 %	50 %	219851246
11509	NC_011832	ATCC	2	8	578100	578107	25 %	25 %	0 %	50 %	219851246
11510	NC_011832	GATCCC	2	12	578237	578248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219851246
11511	NC_011832	CAG	2	6	578252	578257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851246
11512	NC_011832	CGA	2	6	578260	578265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851246
11513	NC_011832	CTC	2	6	578267	578272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851246
11514	NC_011832	GAA	2	6	578285	578290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851246
11515	NC_011832	GAC	2	6	578404	578409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851247
11516	NC_011832	GCCC	2	8	578459	578466	0 %	0 %	25 %	75 %	219851247
11517	NC_011832	CCA	2	6	578482	578487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851247
11518	NC_011832	AT	3	6	578556	578561	50 %	50 %	0 %	0 %	219851247
11519	NC_011832	TTC	2	6	578642	578647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851247
11520	NC_011832	GTC	2	6	578651	578656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851247
11521	NC_011832	GTT	2	6	578701	578706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851247
11522	NC_011832	GAC	2	6	578719	578724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851247
11523	NC_011832	TC	3	6	578769	578774	0 %	50 %	0 %	50 %	219851247
11524	NC_011832	G	6	6	578794	578799	0 %	0 %	100 %	0 %	219851247
11525	NC_011832	CTG	2	6	578915	578920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851247
11526	NC_011832	TCCC	2	8	578937	578944	0 %	25 %	0 %	75 %	219851247
11527	NC_011832	ATC	2	6	578959	578964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851247
11528	NC_011832	TAT	2	6	579587	579592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851248
11529	NC_011832	CTG	2	6	579617	579622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851248
11530	NC_011832	TG	3	6	579737	579742	0 %	50 %	50 %	0 %	219851248
11531	NC_011832	C	6	6	579777	579782	0 %	0 %	0 %	100 %	219851248
11532	NC_011832	ATGT	2	8	579795	579802	25 %	50 %	25 %	0 %	219851248
11533	NC_011832	A	7	7	579926	579932	100 %	0 %	0 %	0 %	219851248
11534	NC_011832	GAG	3	9	580103	580111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851249
11535	NC_011832	ACC	2	6	580175	580180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851249
11536	NC_011832	CGT	2	6	580288	580293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11537	NC_011832	GCCT	2	8	580295	580302	0 %	25 %	25 %	50 %	219851249
11538	NC_011832	GAG	2	6	580337	580342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851249
11539	NC_011832	TCTG	2	8	580365	580372	0 %	50 %	25 %	25 %	219851249
11540	NC_011832	GTG	2	6	580376	580381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851249
11541	NC_011832	CCG	2	6	580484	580489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851249
11542	NC_011832	ACT	2	6	580524	580529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851249
11543	NC_011832	TC	3	6	580558	580563	0 %	50 %	0 %	50 %	219851249
11544	NC_011832	CGG	2	6	580615	580620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851249
11545	NC_011832	AAC	2	6	580669	580674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851249
11546	NC_011832	GAC	2	6	580712	580717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11547	NC_011832	CGG	2	6	580730	580735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851249
11548	NC_011832	GAT	2	6	580765	580770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851249
11549	NC_011832	AAG	2	6	580778	580783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851249
11550	NC_011832	GCT	2	6	580810	580815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11551	NC_011832	CCT	2	6	580824	580829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851249
11552	NC_011832	CGA	2	6	580866	580871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11553	NC_011832	GGT	2	6	580873	580878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851249
11554	NC_011832	ATT	2	6	580884	580889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851249
11555	NC_011832	CGG	2	6	580930	580935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851249
11556	NC_011832	CAG	2	6	580943	580948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11557	NC_011832	TCT	2	6	580950	580955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851249
11558	NC_011832	TGC	2	6	581022	581027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11559	NC_011832	TGC	3	9	581049	581057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11560	NC_011832	ATG	2	6	581063	581068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851249
11561	NC_011832	GAG	2	6	581072	581077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851249
11562	NC_011832	G	6	6	581106	581111	0 %	0 %	100 %	0 %	219851249
11563	NC_011832	GTC	2	6	581261	581266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851249
11564	NC_011832	TCTG	2	8	581340	581347	0 %	50 %	25 %	25 %	219851249
11565	NC_011832	CTC	2	6	581351	581356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851249
11566	NC_011832	TC	3	6	581398	581403	0 %	50 %	0 %	50 %	219851249
11567	NC_011832	TC	3	6	581463	581468	0 %	50 %	0 %	50 %	219851249
11568	NC_011832	GAT	2	6	582034	582039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851250
11569	NC_011832	GAG	2	6	582058	582063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851250
11570	NC_011832	GCA	2	6	582081	582086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851250
11571	NC_011832	TCC	2	6	582134	582139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851250
11572	NC_011832	TGA	2	6	582149	582154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851250
11573	NC_011832	CTG	2	6	582198	582203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851250
11574	NC_011832	AGG	2	6	582226	582231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851250
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11576	NC_011832	GA	4	8	582258	582265	50 %	0 %	50 %	0 %	219851250
11577	NC_011832	ATCAG	2	10	582311	582320	40 %	20 %	20 %	20 %	219851250
11578	NC_011832	CGA	2	6	582347	582352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851250
11579	NC_011832	CTCTT	2	10	582358	582367	0 %	60 %	0 %	40 %	219851250
11580	NC_011832	AGG	2	6	582407	582412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851250
11581	NC_011832	CCTC	2	8	582515	582522	0 %	25 %	0 %	75 %	219851251
11582	NC_011832	CGC	2	6	582529	582534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851251
11583	NC_011832	CGGCT	2	10	582569	582578	0 %	20 %	40 %	40 %	219851251
11584	NC_011832	GAT	2	6	582581	582586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851251
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11587	NC_011832	GAT	2	6	582632	582637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851251
11588	NC_011832	CTG	2	6	582638	582643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851251
11589	NC_011832	GGA	2	6	582662	582667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851251
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11591	NC_011832	GATC	2	8	582694	582701	25 %	25 %	25 %	25 %	219851251
11592	NC_011832	AGGG	2	8	582710	582717	25 %	0 %	75 %	0 %	219851251
11593	NC_011832	TC	3	6	582742	582747	0 %	50 %	0 %	50 %	219851251
11594	NC_011832	AGG	2	6	582774	582779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851251
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11597	NC_011832	TCC	2	6	582868	582873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851251
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11600	NC_011832	CT	3	6	582929	582934	0 %	50 %	0 %	50 %	219851251
11601	NC_011832	CG	3	6	582953	582958	0 %	0 %	50 %	50 %	219851251
11602	NC_011832	TCC	2	6	583017	583022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851251
11603	NC_011832	G	6	6	583046	583051	0 %	0 %	100 %	0 %	219851251
11604	NC_011832	GGT	2	6	583138	583143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851251
11605	NC_011832	GGA	2	6	583192	583197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851251
11606	NC_011832	GCCG	2	8	583235	583242	0 %	0 %	50 %	50 %	219851251
11607	NC_011832	CCA	2	6	583327	583332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851251
11608	NC_011832	GCG	2	6	583354	583359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851251
11609	NC_011832	GCA	2	6	583361	583366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851251
11610	NC_011832	ACC	2	6	583376	583381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851251
11611	NC_011832	GT	3	6	583394	583399	0 %	50 %	50 %	0 %	219851251
11612	NC_011832	GGTC	2	8	583462	583469	0 %	25 %	50 %	25 %	219851251
11613	NC_011832	CGGC	2	8	583513	583520	0 %	0 %	50 %	50 %	219851251
11614	NC_011832	GGC	3	9	583591	583599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851251
11615	NC_011832	CAG	2	6	583655	583660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851251
11616	NC_011832	CGAT	2	8	583758	583765	25 %	25 %	25 %	25 %	219851251
11617	NC_011832	G	6	6	583811	583816	0 %	0 %	100 %	0 %	219851251
11618	NC_011832	GAA	2	6	583863	583868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851251
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11620	NC_011832	TC	3	6	583885	583890	0 %	50 %	0 %	50 %	219851251
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11742	NC_011832	GAA	2	6	590049	590054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851259
11743	NC_011832	GGC	2	6	590055	590060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851259
11744	NC_011832	GAC	2	6	590091	590096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851259
11745	NC_011832	TCC	3	9	590133	590141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851260
11746	NC_011832	CGG	2	6	590155	590160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851260
11747	NC_011832	AATG	2	8	590189	590196	50 %	25 %	25 %	0 %	219851260
11748	NC_011832	TGC	2	6	590210	590215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851260
11749	NC_011832	TGG	2	6	590221	590226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851260
11750	NC_011832	TGA	2	6	590332	590337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851260
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11752	NC_011832	CGG	2	6	590374	590379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851260
11753	NC_011832	GTCAGG	2	12	590406	590417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219851260
11754	NC_011832	CCT	2	6	590434	590439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851260
11755	NC_011832	CTG	2	6	590444	590449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851260
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11757	NC_011832	AGC	2	6	590568	590573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851260
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11762	NC_011832	GCCG	2	8	590794	590801	0 %	0 %	50 %	50 %	219851260
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11765	NC_011832	CTG	2	6	590894	590899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851260
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11770	NC_011832	GTT	2	6	591242	591247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851260
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11772	NC_011832	CGCTC	2	10	591272	591281	0 %	20 %	20 %	60 %	219851260
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11776	NC_011832	CG	3	6	591532	591537	0 %	0 %	50 %	50 %	219851260
11777	NC_011832	C	6	6	591545	591550	0 %	0 %	0 %	100 %	219851260
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11781	NC_011832	CTT	2	6	591847	591852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851262
11782	NC_011832	GTTCT	2	10	591882	591891	0 %	60 %	20 %	20 %	219851262
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11804	NC_011832	GCT	2	6	592847	592852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851264
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11822	NC_011832	GTCG	2	8	593545	593552	0 %	25 %	50 %	25 %	219851266
11823	NC_011832	TACGCA	2	12	593580	593591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851266
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11841	NC_011832	TGGGA	2	10	594469	594478	20 %	20 %	60 %	0 %	219851267
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11844	NC_011832	TGC	2	6	594599	594604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851267
11845	NC_011832	CAC	2	6	594622	594627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851267
11846	NC_011832	GACGAT	2	12	594643	594654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219851267
11847	NC_011832	CTT	2	6	594655	594660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851267
11848	NC_011832	CATC	2	8	594747	594754	25 %	25 %	0 %	50 %	219851267
11849	NC_011832	CGGT	2	8	594971	594978	0 %	25 %	50 %	25 %	219851267
11850	NC_011832	GGT	2	6	595006	595011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851267
11851	NC_011832	TCA	2	6	595064	595069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851267
11852	NC_011832	GAA	2	6	595330	595335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851268
11853	NC_011832	CTTG	2	8	595336	595343	0 %	50 %	25 %	25 %	219851268
11854	NC_011832	ATC	2	6	595358	595363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851268
11855	NC_011832	CTC	2	6	595378	595383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851268
11856	NC_011832	GAT	2	6	595477	595482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851268
11857	NC_011832	ATGATC	2	12	595485	595496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219851268
11858	NC_011832	CTC	2	6	595505	595510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851268
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11980	NC_011832	GATGAA	2	12	601726	601737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219851274
11981	NC_011832	CGG	2	6	601750	601755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851274
11982	NC_011832	CAG	2	6	601798	601803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851274
11983	NC_011832	GTT	2	6	601822	601827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851274
11984	NC_011832	CCGA	2	8	601829	601836	25 %	0 %	25 %	50 %	219851274
11985	NC_011832	CTA	2	6	601843	601848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851274
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11990	NC_011832	AGC	2	6	601911	601916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851274
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