MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011832	GGT	2	6	551085	551090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851221
11002	NC_011832	ATG	2	6	551101	551106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851221
11003	NC_011832	CAC	2	6	551159	551164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851221
11004	NC_011832	GCA	2	6	551253	551258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
11005	NC_011832	GCAG	2	8	551282	551289	25 %	0 %	50 %	25 %	219851221
11006	NC_011832	AGG	2	6	551303	551308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851221
11007	NC_011832	GAA	2	6	551602	551607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851222
11008	NC_011832	ATC	2	6	551621	551626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11009	NC_011832	TTC	2	6	551635	551640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
11010	NC_011832	ATC	2	6	551696	551701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11011	NC_011832	CTG	2	6	551726	551731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851222
11012	NC_011832	TCG	2	6	551738	551743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851222
11013	NC_011832	CCT	2	6	551778	551783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851222
11014	NC_011832	CTC	2	6	551791	551796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851222
11015	NC_011832	TGGA	2	8	551806	551813	25 %	25 %	50 %	0 %	219851222
11016	NC_011832	ACC	2	6	551909	551914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851222
11017	NC_011832	GTTC	2	8	552065	552072	0 %	50 %	25 %	25 %	219851222
11018	NC_011832	TCA	2	6	552083	552088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11019	NC_011832	TGG	2	6	552123	552128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851222
11020	NC_011832	CAT	2	6	552181	552186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11021	NC_011832	TCT	2	6	552255	552260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
11022	NC_011832	ATG	2	6	552281	552286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851222
11023	NC_011832	CATC	2	8	552332	552339	25 %	25 %	0 %	50 %	219851222
11024	NC_011832	TGT	2	6	552348	552353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851222
11025	NC_011832	CGG	2	6	552396	552401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851222
11026	NC_011832	TTG	2	6	552431	552436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851222
11027	NC_011832	ATC	2	6	552547	552552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11028	NC_011832	TGGA	2	8	552598	552605	25 %	25 %	50 %	0 %	219851222
11029	NC_011832	ATC	2	6	552626	552631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11030	NC_011832	CCG	2	6	552650	552655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851222
11031	NC_011832	GGT	2	6	552682	552687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851222
11032	NC_011832	GGA	2	6	552716	552721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851222
11033	NC_011832	TCA	2	6	552728	552733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
11034	NC_011832	AGC	2	6	552774	552779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851222
11035	NC_011832	CGA	2	6	552822	552827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851222
11036	NC_011832	GAT	2	6	552868	552873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851222
11037	NC_011832	CTG	2	6	552904	552909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851222
11038	NC_011832	TTC	2	6	552926	552931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
11039	NC_011832	CTT	2	6	552943	552948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
11040	NC_011832	TCC	2	6	552989	552994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851222
11041	NC_011832	GTT	2	6	552996	553001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851222
11042	NC_011832	GCA	2	6	553094	553099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851223
11043	NC_011832	GAT	2	6	553104	553109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851223
11044	NC_011832	CGA	2	6	553157	553162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851223
11045	NC_011832	TCA	2	6	553177	553182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851223
11046	NC_011832	CGG	2	6	553204	553209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851223
11047	NC_011832	GAA	2	6	553212	553217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851223
11048	NC_011832	GTC	2	6	553224	553229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851223
11049	NC_011832	CCT	2	6	553244	553249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851223
11050	NC_011832	TCC	2	6	553258	553263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851223
11051	NC_011832	TCG	2	6	553276	553281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851223
11052	NC_011832	ATGGCC	2	12	553282	553293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851223
11053	NC_011832	CT	3	6	553400	553405	0 %	50 %	0 %	50 %	219851223
11054	NC_011832	TCT	2	6	553418	553423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851223
11055	NC_011832	C	6	6	553461	553466	0 %	0 %	0 %	100 %	219851224
11056	NC_011832	TGA	2	6	553516	553521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851224
11057	NC_011832	TGA	2	6	553582	553587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851224
11058	NC_011832	GAT	2	6	553728	553733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851224
11059	NC_011832	CTT	2	6	553754	553759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851224
11060	NC_011832	TGC	2	6	553835	553840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851225
11061	NC_011832	ATC	2	6	553841	553846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851225
11062	NC_011832	TTC	2	6	553849	553854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
11063	NC_011832	TCA	2	6	553901	553906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851225
11064	NC_011832	TTGG	2	8	553939	553946	0 %	50 %	50 %	0 %	219851225
11065	NC_011832	TCT	2	6	553971	553976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
11066	NC_011832	GAG	2	6	554059	554064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851225
11067	NC_011832	GAT	2	6	554098	554103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851225
11068	NC_011832	TCC	2	6	554104	554109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851225
11069	NC_011832	TGT	2	6	554157	554162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851225
11070	NC_011832	CGA	2	6	554196	554201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851225
11071	NC_011832	TTCC	2	8	554220	554227	0 %	50 %	0 %	50 %	219851225
11072	NC_011832	C	6	6	554245	554250	0 %	0 %	0 %	100 %	219851225
11073	NC_011832	GAC	2	6	554254	554259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851225
11074	NC_011832	AGA	2	6	554277	554282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851225
11075	NC_011832	GTC	2	6	554293	554298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851225
11076	NC_011832	CAG	2	6	554320	554325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851225
11077	NC_011832	TGA	2	6	554337	554342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851225
11078	NC_011832	CGGC	2	8	554348	554355	0 %	0 %	50 %	50 %	219851225
11079	NC_011832	CCT	2	6	554378	554383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851225
11080	NC_011832	TCT	2	6	554475	554480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
11081	NC_011832	TGG	2	6	554505	554510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851225
11082	NC_011832	ACC	2	6	554534	554539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851225
11083	NC_011832	TCT	2	6	554544	554549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
11084	NC_011832	GTT	2	6	554585	554590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851225
11085	NC_011832	ATA	2	6	554639	554644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851225
11086	NC_011832	CTT	2	6	555318	555323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851226
11087	NC_011832	C	7	7	555430	555436	0 %	0 %	0 %	100 %	219851226
11088	NC_011832	TCAT	2	8	555488	555495	25 %	50 %	0 %	25 %	219851226
11089	NC_011832	GA	3	6	555518	555523	50 %	0 %	50 %	0 %	219851226
11090	NC_011832	GAA	2	6	555728	555733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851227
11091	NC_011832	ATG	2	6	555738	555743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851227
11092	NC_011832	TGA	2	6	555745	555750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851227
11093	NC_011832	TTG	2	6	555757	555762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851227
11094	NC_011832	GAC	2	6	555800	555805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851227
11095	NC_011832	AT	3	6	555814	555819	50 %	50 %	0 %	0 %	219851227
11096	NC_011832	GTCA	2	8	555826	555833	25 %	25 %	25 %	25 %	219851227
11097	NC_011832	GGT	2	6	555834	555839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851227
11098	NC_011832	CTG	2	6	555883	555888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851227
11099	NC_011832	TGC	2	6	555923	555928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851227
11100	NC_011832	CT	3	6	555933	555938	0 %	50 %	0 %	50 %	219851227
11101	NC_011832	G	6	6	556026	556031	0 %	0 %	100 %	0 %	219851227
11102	NC_011832	TC	3	6	556126	556131	0 %	50 %	0 %	50 %	219851227
11103	NC_011832	ATCA	2	8	556133	556140	50 %	25 %	0 %	25 %	219851227
11104	NC_011832	AC	3	6	556204	556209	50 %	0 %	0 %	50 %	219851227
11105	NC_011832	T	8	8	556259	556266	0 %	100 %	0 %	0 %	219851228
11106	NC_011832	CTC	2	6	556289	556294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851228
11107	NC_011832	TCC	3	9	556329	556337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851228
11108	NC_011832	TGG	3	9	556414	556422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851228
11109	NC_011832	TCT	2	6	556441	556446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851228
11110	NC_011832	TGT	2	6	556458	556463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851228
11111	NC_011832	ATTC	2	8	556642	556649	25 %	50 %	0 %	25 %	219851228
11112	NC_011832	CTG	2	6	556694	556699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851228
11113	NC_011832	TTC	2	6	556706	556711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851228
11114	NC_011832	CGAC	2	8	557607	557614	25 %	0 %	25 %	50 %	219851229
11115	NC_011832	ATA	2	6	557679	557684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851229
11116	NC_011832	GGC	2	6	557771	557776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851229
11117	NC_011832	GAC	2	6	557861	557866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851229
11118	NC_011832	TCC	2	6	557952	557957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851229
11119	NC_011832	ACC	2	6	557964	557969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851229
11120	NC_011832	GAC	2	6	557975	557980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851229
11121	NC_011832	CGA	2	6	558112	558117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851229
11122	NC_011832	C	6	6	558233	558238	0 %	0 %	0 %	100 %	219851229
11123	NC_011832	GCC	2	6	558270	558275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851229
11124	NC_011832	TTTG	2	8	558331	558338	0 %	75 %	25 %	0 %	219851229
11125	NC_011832	TCC	2	6	558351	558356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851229
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11128	NC_011832	CAGC	2	8	558427	558434	25 %	0 %	25 %	50 %	219851229
11129	NC_011832	G	6	6	558439	558444	0 %	0 %	100 %	0 %	219851229
11130	NC_011832	ACG	2	6	558474	558479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851229
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11132	NC_011832	GACC	2	8	558502	558509	25 %	0 %	25 %	50 %	219851229
11133	NC_011832	GAT	2	6	558545	558550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851229
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11139	NC_011832	CCT	2	6	558826	558831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851229
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11143	NC_011832	AGGT	2	8	559112	559119	25 %	25 %	50 %	0 %	219851230
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11145	NC_011832	ATCG	2	8	559189	559196	25 %	25 %	25 %	25 %	219851230
11146	NC_011832	CCG	2	6	559217	559222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851230
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11149	NC_011832	AGGT	2	8	559379	559386	25 %	25 %	50 %	0 %	219851230
11150	NC_011832	ATGC	2	8	559416	559423	25 %	25 %	25 %	25 %	219851230
11151	NC_011832	AGTG	2	8	559503	559510	25 %	25 %	50 %	0 %	219851230
11152	NC_011832	ATCC	2	8	559593	559600	25 %	25 %	0 %	50 %	219851230
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11184	NC_011832	TCG	3	9	560829	560837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851231
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11220	NC_011832	TCGGT	2	10	562358	562367	0 %	40 %	40 %	20 %	219851232
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11223	NC_011832	CCT	2	6	562526	562531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851232
11224	NC_011832	GACC	2	8	562638	562645	25 %	0 %	25 %	50 %	219851232
11225	NC_011832	CGGT	2	8	562707	562714	0 %	25 %	50 %	25 %	219851232
11226	NC_011832	GAA	2	6	562719	562724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851232
11227	NC_011832	GTC	2	6	562740	562745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851232
11228	NC_011832	ATC	2	6	562771	562776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851232
11229	NC_011832	AGGT	2	8	562825	562832	25 %	25 %	50 %	0 %	219851232
11230	NC_011832	GTAGG	2	10	562833	562842	20 %	20 %	60 %	0 %	219851232
11231	NC_011832	GGA	2	6	562893	562898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851233
11232	NC_011832	CCT	2	6	563037	563042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851233
11233	NC_011832	CCG	2	6	563060	563065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851233
11234	NC_011832	GCTCG	2	10	563110	563119	0 %	20 %	40 %	40 %	219851233
11235	NC_011832	GCCG	2	8	563135	563142	0 %	0 %	50 %	50 %	219851233
11236	NC_011832	CGG	2	6	563282	563287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851233
11237	NC_011832	CTG	2	6	563294	563299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851233
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11239	NC_011832	GTG	2	6	563360	563365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851233
11240	NC_011832	GGA	2	6	563373	563378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851233
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11243	NC_011832	CGC	2	6	563436	563441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851233
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11245	NC_011832	GGT	2	6	563532	563537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851233
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11269	NC_011832	CTT	3	9	564612	564620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851234
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11355	NC_011832	ACGAT	2	10	569527	569536	40 %	20 %	20 %	20 %	219851238
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11361	NC_011832	CTG	2	6	570528	570533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851239
11362	NC_011832	AT	3	6	570576	570581	50 %	50 %	0 %	0 %	219851239
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11466	NC_011832	TCA	2	6	575947	575952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851243
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11471	NC_011832	A	6	6	576395	576400	100 %	0 %	0 %	0 %	219851244
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11479	NC_011832	GA	3	6	576684	576689	50 %	0 %	50 %	0 %	219851244
11480	NC_011832	CTG	2	6	576762	576767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851244
11481	NC_011832	CGA	2	6	576808	576813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851244
11482	NC_011832	CGA	2	6	576818	576823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851244
11483	NC_011832	GGT	2	6	576853	576858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851244
11484	NC_011832	ATGT	2	8	576864	576871	25 %	50 %	25 %	0 %	219851244
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