MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011832	CTG	2	6	528704	528709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851187
10502	NC_011832	TCG	2	6	528743	528748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851187
10503	NC_011832	CAA	2	6	528894	528899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851188
10504	NC_011832	ATC	2	6	528907	528912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851188
10505	NC_011832	CTC	2	6	528958	528963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851188
10506	NC_011832	A	7	7	528981	528987	100 %	0 %	0 %	0 %	219851188
10507	NC_011832	TCTA	2	8	529089	529096	25 %	50 %	0 %	25 %	219851189
10508	NC_011832	GCA	2	6	529105	529110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851189
10509	NC_011832	GGACC	2	10	529207	529216	20 %	0 %	40 %	40 %	219851190
10510	NC_011832	TGA	2	6	529221	529226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851190
10511	NC_011832	TCG	2	6	529266	529271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851190
10512	NC_011832	TGG	2	6	529299	529304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851190
10513	NC_011832	TGAA	2	8	529338	529345	50 %	25 %	25 %	0 %	219851190
10514	NC_011832	GGGA	2	8	529428	529435	25 %	0 %	75 %	0 %	219851190
10515	NC_011832	GGT	2	6	529450	529455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851190
10516	NC_011832	CAAC	2	8	529473	529480	50 %	0 %	0 %	50 %	219851190
10517	NC_011832	CACTT	2	10	529587	529596	20 %	40 %	0 %	40 %	219851190
10518	NC_011832	ACC	2	6	529794	529799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851191
10519	NC_011832	CAT	2	6	529829	529834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851191
10520	NC_011832	TC	3	6	529865	529870	0 %	50 %	0 %	50 %	219851191
10521	NC_011832	AG	3	6	529882	529887	50 %	0 %	50 %	0 %	219851191
10522	NC_011832	GTC	2	6	529947	529952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851191
10523	NC_011832	CTGGA	2	10	529969	529978	20 %	20 %	40 %	20 %	219851191
10524	NC_011832	GACC	2	8	529991	529998	25 %	0 %	25 %	50 %	219851191
10525	NC_011832	CT	3	6	530133	530138	0 %	50 %	0 %	50 %	219851191
10526	NC_011832	GTCA	2	8	530151	530158	25 %	25 %	25 %	25 %	219851191
10527	NC_011832	TCCC	2	8	530160	530167	0 %	25 %	0 %	75 %	219851191
10528	NC_011832	CTGA	2	8	530171	530178	25 %	25 %	25 %	25 %	219851191
10529	NC_011832	CAG	2	6	530222	530227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851192
10530	NC_011832	TCG	2	6	530256	530261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851192
10531	NC_011832	TCT	2	6	530284	530289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851192
10532	NC_011832	CCT	2	6	530345	530350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851193
10533	NC_011832	TCCG	2	8	530370	530377	0 %	25 %	25 %	50 %	219851193
10534	NC_011832	CTGAT	2	10	530407	530416	20 %	40 %	20 %	20 %	219851193
10535	NC_011832	GGTT	2	8	530431	530438	0 %	50 %	50 %	0 %	219851193
10536	NC_011832	AGC	2	6	530470	530475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10537	NC_011832	CCA	2	6	530495	530500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851193
10538	NC_011832	TCT	2	6	530529	530534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851193
10539	NC_011832	CT	3	6	530589	530594	0 %	50 %	0 %	50 %	219851193
10540	NC_011832	CCG	2	6	530595	530600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851193
10541	NC_011832	TCA	2	6	530603	530608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851193
10542	NC_011832	CT	3	6	530637	530642	0 %	50 %	0 %	50 %	219851193
10543	NC_011832	GATC	2	8	530690	530697	25 %	25 %	25 %	25 %	219851193
10544	NC_011832	TGC	2	6	530701	530706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10545	NC_011832	GAC	2	6	530748	530753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10546	NC_011832	GCT	2	6	530761	530766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10547	NC_011832	ACC	2	6	530842	530847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851193
10548	NC_011832	GAC	2	6	530874	530879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10549	NC_011832	GGT	2	6	530885	530890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851193
10550	NC_011832	CCT	2	6	530917	530922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851193
10551	NC_011832	CGA	2	6	530930	530935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10552	NC_011832	CCT	2	6	530961	530966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851193
10553	NC_011832	GCC	2	6	530971	530976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851193
10554	NC_011832	TCAGGG	2	12	531026	531037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219851193
10555	NC_011832	CCG	2	6	531042	531047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851193
10556	NC_011832	CGA	2	6	531087	531092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10557	NC_011832	TTTC	2	8	531136	531143	0 %	75 %	0 %	25 %	219851193
10558	NC_011832	CGA	2	6	531188	531193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851193
10559	NC_011832	CCCCT	2	10	531207	531216	0 %	20 %	0 %	80 %	219851193
10560	NC_011832	CGAT	2	8	531272	531279	25 %	25 %	25 %	25 %	219851193
10561	NC_011832	GATC	2	8	531311	531318	25 %	25 %	25 %	25 %	219851193
10562	NC_011832	CA	3	6	531348	531353	50 %	0 %	0 %	50 %	219851193
10563	NC_011832	TGG	2	6	531418	531423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851193
10564	NC_011832	GAG	2	6	531477	531482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851193
10565	NC_011832	CT	3	6	531664	531669	0 %	50 %	0 %	50 %	219851194
10566	NC_011832	CGC	2	6	531687	531692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851194
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10568	NC_011832	CTG	2	6	531763	531768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851194
10569	NC_011832	CTC	2	6	531789	531794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851194
10570	NC_011832	GCG	2	6	531865	531870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851194
10571	NC_011832	GCT	2	6	531889	531894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851194
10572	NC_011832	GTG	2	6	531925	531930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851194
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10574	NC_011832	GATC	2	8	532002	532009	25 %	25 %	25 %	25 %	219851194
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10576	NC_011832	TCTGC	2	10	532080	532089	0 %	40 %	20 %	40 %	219851194
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10578	NC_011832	CTCTG	2	10	532201	532210	0 %	40 %	20 %	40 %	219851194
10579	NC_011832	GAG	2	6	532381	532386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851194
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10582	NC_011832	GGCCGC	2	12	532762	532773	0 %	0 %	50 %	50 %	219851195
10583	NC_011832	CTG	2	6	532850	532855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851195
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10588	NC_011832	C	6	6	533154	533159	0 %	0 %	0 %	100 %	219851195
10589	NC_011832	GAT	2	6	533173	533178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851195
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10592	NC_011832	AAG	2	6	533378	533383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851195
10593	NC_011832	CGA	2	6	533386	533391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851195
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10599	NC_011832	GAT	2	6	533522	533527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851195
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10601	NC_011832	GAAC	2	8	533599	533606	50 %	0 %	25 %	25 %	219851195
10602	NC_011832	G	6	6	533651	533656	0 %	0 %	100 %	0 %	219851195
10603	NC_011832	AGC	2	6	533667	533672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851195
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10605	NC_011832	GAT	2	6	533773	533778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851195
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10607	NC_011832	ATGA	2	8	533830	533837	50 %	25 %	25 %	0 %	219851196
10608	NC_011832	GATC	2	8	533887	533894	25 %	25 %	25 %	25 %	219851196
10609	NC_011832	AGA	2	6	533907	533912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851196
10610	NC_011832	CGAT	2	8	533961	533968	25 %	25 %	25 %	25 %	219851196
10611	NC_011832	GCG	2	6	533972	533977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851196
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10613	NC_011832	CGG	2	6	534026	534031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851196
10614	NC_011832	GATCG	2	10	534116	534125	20 %	20 %	40 %	20 %	219851196
10615	NC_011832	GCCG	2	8	534137	534144	0 %	0 %	50 %	50 %	219851196
10616	NC_011832	GAT	2	6	534145	534150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851196
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10620	NC_011832	GCA	2	6	534286	534291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851196
10621	NC_011832	TG	3	6	534293	534298	0 %	50 %	50 %	0 %	219851196
10622	NC_011832	GAT	2	6	534314	534319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851196
10623	NC_011832	TGAG	2	8	534330	534337	25 %	25 %	50 %	0 %	219851196
10624	NC_011832	TCC	2	6	534342	534347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851196
10625	NC_011832	TTC	2	6	534363	534368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851196
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10640	NC_011832	TGG	2	6	535366	535371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851199
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10643	NC_011832	AG	3	6	535428	535433	50 %	0 %	50 %	0 %	219851199
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10652	NC_011832	GAG	2	6	535765	535770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851200
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10655	NC_011832	AGC	2	6	535886	535891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851200
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10668	NC_011832	CCT	2	6	536677	536682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851202
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10692	NC_011832	GTC	2	6	537766	537771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851205
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10727	NC_011832	TGA	2	6	539281	539286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851207
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10737	NC_011832	CTGG	2	8	539624	539631	0 %	25 %	50 %	25 %	219851208
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10978	NC_011832	CCG	2	6	550074	550079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851221
10979	NC_011832	GAG	2	6	550083	550088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851221
10980	NC_011832	ATC	2	6	550099	550104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851221
10981	NC_011832	CGA	2	6	550133	550138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
10982	NC_011832	AT	3	6	550216	550221	50 %	50 %	0 %	0 %	219851221
10983	NC_011832	GGT	2	6	550230	550235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851221
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10986	NC_011832	CTT	2	6	550328	550333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851221
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10997	NC_011832	CTT	2	6	550902	550907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851221
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10999	NC_011832	GAC	2	6	551010	551015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
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