MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011832	AGC	2	6	502984	502989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851157
10002	NC_011832	ACT	2	6	502990	502995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851157
10003	NC_011832	CTC	2	6	503335	503340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851158
10004	NC_011832	GAG	2	6	503393	503398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851158
10005	NC_011832	GAG	2	6	503403	503408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851158
10006	NC_011832	GAC	2	6	503437	503442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851158
10007	NC_011832	GCC	2	6	503451	503456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851158
10008	NC_011832	CT	3	6	503457	503462	0 %	50 %	0 %	50 %	219851158
10009	NC_011832	GGT	2	6	503509	503514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851158
10010	NC_011832	ATCT	2	8	503546	503553	25 %	50 %	0 %	25 %	219851158
10011	NC_011832	ACA	2	6	503556	503561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851158
10012	NC_011832	CAGA	2	8	503696	503703	50 %	0 %	25 %	25 %	219851158
10013	NC_011832	CTGT	2	8	503709	503716	0 %	50 %	25 %	25 %	219851158
10014	NC_011832	GTG	2	6	504045	504050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851159
10015	NC_011832	CAG	2	6	504114	504119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851159
10016	NC_011832	TGGA	2	8	504158	504165	25 %	25 %	50 %	0 %	219851159
10017	NC_011832	TCG	2	6	504309	504314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851160
10018	NC_011832	TCC	2	6	504326	504331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851160
10019	NC_011832	CGG	2	6	504343	504348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851160
10020	NC_011832	CTT	2	6	504636	504641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851161
10021	NC_011832	GTT	2	6	504645	504650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851161
10022	NC_011832	TCT	2	6	504653	504658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851161
10023	NC_011832	GTCATC	2	12	504663	504674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219851161
10024	NC_011832	TGG	2	6	504707	504712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851161
10025	NC_011832	ATG	2	6	504738	504743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851161
10026	NC_011832	TG	3	6	504742	504747	0 %	50 %	50 %	0 %	219851161
10027	NC_011832	CAT	2	6	504819	504824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
10028	NC_011832	ATA	2	6	504828	504833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851162
10029	NC_011832	CTGC	2	8	504859	504866	0 %	25 %	25 %	50 %	219851162
10030	NC_011832	G	7	7	504906	504912	0 %	0 %	100 %	0 %	219851162
10031	NC_011832	CAG	3	9	504933	504941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851162
10032	NC_011832	CGA	2	6	504944	504949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851162
10033	NC_011832	CAT	2	6	504960	504965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
10034	NC_011832	GAT	2	6	505017	505022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851162
10035	NC_011832	TGA	2	6	505169	505174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851162
10036	NC_011832	ATC	2	6	505231	505236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
10037	NC_011832	CTC	2	6	505263	505268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851162
10038	NC_011832	TCA	2	6	505271	505276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
10039	NC_011832	GAG	2	6	505308	505313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851162
10040	NC_011832	GAG	2	6	505317	505322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851162
10041	NC_011832	AAG	2	6	505372	505377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851162
10042	NC_011832	GA	3	6	505449	505454	50 %	0 %	50 %	0 %	219851162
10043	NC_011832	TAG	2	6	505474	505479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851162
10044	NC_011832	GTT	2	6	505488	505493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851162
10045	NC_011832	GAT	2	6	505575	505580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851162
10046	NC_011832	ACC	2	6	505591	505596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851162
10047	NC_011832	TCT	2	6	505601	505606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851162
10048	NC_011832	ATC	2	6	505654	505659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
10049	NC_011832	GGA	2	6	505694	505699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851162
10050	NC_011832	CCA	2	6	505721	505726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851162
10051	NC_011832	AGAT	2	8	505759	505766	50 %	25 %	25 %	0 %	219851162
10052	NC_011832	CCG	2	6	505970	505975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851162
10053	NC_011832	CTT	2	6	506220	506225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851163
10054	NC_011832	CTG	2	6	506233	506238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851163
10055	NC_011832	GCTC	2	8	506243	506250	0 %	25 %	25 %	50 %	219851163
10056	NC_011832	TCC	2	6	506270	506275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851163
10057	NC_011832	TCT	2	6	506372	506377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851163
10058	NC_011832	TGG	2	6	506418	506423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851163
10059	NC_011832	ATC	2	6	506464	506469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851163
10060	NC_011832	TCTTCC	2	12	506519	506530	0 %	50 %	0 %	50 %	219851163
10061	NC_011832	G	6	6	506586	506591	0 %	0 %	100 %	0 %	219851163
10062	NC_011832	TCA	2	6	506606	506611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851163
10063	NC_011832	ATC	2	6	506638	506643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851163
10064	NC_011832	CTC	2	6	506677	506682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851163
10065	NC_011832	TTC	2	6	506689	506694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851163
10066	NC_011832	CT	3	6	506719	506724	0 %	50 %	0 %	50 %	219851163
10067	NC_011832	TCG	2	6	506837	506842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851163
10068	NC_011832	TCTG	2	8	506864	506871	0 %	50 %	25 %	25 %	219851163
10069	NC_011832	GTT	2	6	506883	506888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851163
10070	NC_011832	GGGA	2	8	506900	506907	25 %	0 %	75 %	0 %	219851163
10071	NC_011832	TTC	2	6	506925	506930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851164
10072	NC_011832	GAG	2	6	507114	507119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851164
10073	NC_011832	TGCTGG	2	12	507184	507195	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219851164
10074	NC_011832	TC	3	6	507242	507247	0 %	50 %	0 %	50 %	219851164
10075	NC_011832	GGTC	2	8	507266	507273	0 %	25 %	50 %	25 %	219851164
10076	NC_011832	ATC	2	6	507336	507341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851164
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10078	NC_011832	TCC	2	6	507391	507396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851164
10079	NC_011832	CTG	2	6	507444	507449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851164
10080	NC_011832	GC	3	6	507487	507492	0 %	0 %	50 %	50 %	219851164
10081	NC_011832	CT	3	6	507499	507504	0 %	50 %	0 %	50 %	219851164
10082	NC_011832	CTG	2	6	507510	507515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851164
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10084	NC_011832	TGA	2	6	507839	507844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851165
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10086	NC_011832	AGGA	2	8	507954	507961	50 %	0 %	50 %	0 %	219851165
10087	NC_011832	AG	3	6	507976	507981	50 %	0 %	50 %	0 %	219851166
10088	NC_011832	TGA	2	6	508089	508094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851166
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10091	NC_011832	TGG	2	6	508225	508230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851166
10092	NC_011832	TGC	2	6	508263	508268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851166
10093	NC_011832	C	6	6	508307	508312	0 %	0 %	0 %	100 %	219851166
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10097	NC_011832	GACCGG	2	12	508457	508468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219851166
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10100	NC_011832	ATC	2	6	508592	508597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851167
10101	NC_011832	GAA	2	6	508603	508608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851167
10102	NC_011832	GAT	2	6	508634	508639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851167
10103	NC_011832	TGCGC	2	10	508699	508708	0 %	20 %	40 %	40 %	219851167
10104	NC_011832	CT	3	6	508743	508748	0 %	50 %	0 %	50 %	219851167
10105	NC_011832	CGA	2	6	508762	508767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851167
10106	NC_011832	CCG	2	6	508811	508816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851167
10107	NC_011832	A	6	6	508879	508884	100 %	0 %	0 %	0 %	219851167
10108	NC_011832	GATC	2	8	508888	508895	25 %	25 %	25 %	25 %	219851167
10109	NC_011832	CCCGA	2	10	508928	508937	20 %	0 %	20 %	60 %	219851168
10110	NC_011832	TCT	2	6	508965	508970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851168
10111	NC_011832	T	6	6	508985	508990	0 %	100 %	0 %	0 %	219851168
10112	NC_011832	TC	3	6	509095	509100	0 %	50 %	0 %	50 %	219851168
10113	NC_011832	ATTGC	2	10	509123	509132	20 %	40 %	20 %	20 %	219851168
10114	NC_011832	CCAG	2	8	509133	509140	25 %	0 %	25 %	50 %	219851168
10115	NC_011832	TCCA	2	8	509268	509275	25 %	25 %	0 %	50 %	219851168
10116	NC_011832	GCGG	2	8	509326	509333	0 %	0 %	75 %	25 %	219851168
10117	NC_011832	GTA	2	6	509416	509421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851168
10118	NC_011832	GTCT	2	8	509440	509447	0 %	50 %	25 %	25 %	219851168
10119	NC_011832	AATA	2	8	509471	509478	75 %	25 %	0 %	0 %	219851168
10120	NC_011832	GCA	2	6	509789	509794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851169
10121	NC_011832	CCG	2	6	509845	509850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
10122	NC_011832	CGT	2	6	509865	509870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851169
10123	NC_011832	CAG	2	6	509875	509880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851169
10124	NC_011832	GATC	2	8	509901	509908	25 %	25 %	25 %	25 %	219851169
10125	NC_011832	CCG	2	6	509945	509950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
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10129	NC_011832	GCCC	2	8	510090	510097	0 %	0 %	25 %	75 %	219851169
10130	NC_011832	ATCACG	2	12	510116	510127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851169
10131	NC_011832	CCT	2	6	510132	510137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851169
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10152	NC_011832	TCCC	2	8	511212	511219	0 %	25 %	0 %	75 %	219851169
10153	NC_011832	TCG	2	6	511313	511318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851169
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10227	NC_011832	GCC	2	6	514680	514685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851174
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10230	NC_011832	GATCAC	2	12	514847	514858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851174
10231	NC_011832	GGT	2	6	514905	514910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851174
10232	NC_011832	CGG	2	6	514960	514965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851174
10233	NC_011832	GGTG	2	8	515007	515014	0 %	25 %	75 %	0 %	219851174
10234	NC_011832	GTT	2	6	515031	515036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851174
10235	NC_011832	GAA	2	6	515066	515071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851174
10236	NC_011832	CAT	2	6	515075	515080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851174
10237	NC_011832	TGC	2	6	515090	515095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851174
10238	NC_011832	GTC	3	9	515118	515126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851174
10239	NC_011832	CGA	2	6	515192	515197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851174
10240	NC_011832	CGACG	2	10	515282	515291	20 %	0 %	40 %	40 %	219851174
10241	NC_011832	GAT	2	6	515404	515409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851175
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10243	NC_011832	AGT	2	6	515465	515470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851175
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10245	NC_011832	CAG	2	6	515611	515616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851175
10246	NC_011832	TGCACC	2	12	515681	515692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219851175
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10250	NC_011832	TTGG	2	8	515825	515832	0 %	50 %	50 %	0 %	219851175
10251	NC_011832	GTG	2	6	515882	515887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851175
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10258	NC_011832	GTC	2	6	516368	516373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851175
10259	NC_011832	TGG	2	6	516448	516453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851175
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10263	NC_011832	GGA	2	6	516647	516652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851176
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10273	NC_011832	CTGC	2	8	517349	517356	0 %	25 %	25 %	50 %	219851177
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10348	NC_011832	GATC	2	8	521206	521213	25 %	25 %	25 %	25 %	219851181
10349	NC_011832	GTTC	2	8	521303	521310	0 %	50 %	25 %	25 %	219851181
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10356	NC_011832	ACA	2	6	521574	521579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851181
10357	NC_011832	ACC	2	6	521793	521798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851181
10358	NC_011832	CGG	2	6	521812	521817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851181
10359	NC_011832	CTG	2	6	521821	521826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851181
10360	NC_011832	CTCG	2	8	521849	521856	0 %	25 %	25 %	50 %	219851181
10361	NC_011832	CCTG	2	8	521877	521884	0 %	25 %	25 %	50 %	219851181
10362	NC_011832	GCA	2	6	521891	521896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851181
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10431	NC_011832	CGT	2	6	525116	525121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851184
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10462	NC_011832	TCATC	2	10	526503	526512	20 %	40 %	0 %	40 %	219851186
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10466	NC_011832	CTGG	2	8	526594	526601	0 %	25 %	50 %	25 %	219851186
10467	NC_011832	CGA	2	6	526662	526667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
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10470	NC_011832	G	6	6	526787	526792	0 %	0 %	100 %	0 %	219851186
10471	NC_011832	CTC	3	9	526934	526942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851186
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10473	NC_011832	TGC	2	6	526992	526997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10474	NC_011832	GCA	2	6	527104	527109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10475	NC_011832	GGCC	2	8	527116	527123	0 %	0 %	50 %	50 %	219851186
10476	NC_011832	CTG	2	6	527255	527260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10477	NC_011832	CTG	2	6	527276	527281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10478	NC_011832	CGC	2	6	527332	527337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851186
10479	NC_011832	TAT	2	6	527363	527368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851186
10480	NC_011832	CTCGT	2	10	527393	527402	0 %	40 %	20 %	40 %	219851186
10481	NC_011832	CGG	2	6	527420	527425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851186
10482	NC_011832	TCT	2	6	527466	527471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851186
10483	NC_011832	GCT	2	6	527554	527559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10484	NC_011832	CAG	2	6	527574	527579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10485	NC_011832	TGA	2	6	527580	527585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851186
10486	NC_011832	CGGG	2	8	527587	527594	0 %	0 %	75 %	25 %	219851186
10487	NC_011832	CGA	2	6	527599	527604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10488	NC_011832	CTG	2	6	527681	527686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10489	NC_011832	GAC	2	6	527758	527763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10490	NC_011832	CCTT	2	8	527790	527797	0 %	50 %	0 %	50 %	219851186
10491	NC_011832	TCG	2	6	527823	527828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
10492	NC_011832	CGC	2	6	527854	527859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851186
10493	NC_011832	ATC	2	6	527891	527896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851186
10494	NC_011832	TGA	2	6	528003	528008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851186
10495	NC_011832	CTC	2	6	528026	528031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851186
10496	NC_011832	ACC	2	6	528053	528058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851186
10497	NC_011832	ACC	2	6	528077	528082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851186
10498	NC_011832	AGA	2	6	528591	528596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851187
10499	NC_011832	TGA	2	6	528624	528629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851187
10500	NC_011832	GCC	2	6	528676	528681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851187

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