MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011832	CCGA	2	8	477386	477393	25 %	0 %	25 %	50 %	219851138
9502	NC_011832	GCA	2	6	477445	477450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851139
9503	NC_011832	AGC	2	6	477487	477492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851139
9504	NC_011832	TCG	3	9	477518	477526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851139
9505	NC_011832	ATGT	2	8	477553	477560	25 %	50 %	25 %	0 %	219851139
9506	NC_011832	T	6	6	477713	477718	0 %	100 %	0 %	0 %	219851140
9507	NC_011832	GCT	2	6	477735	477740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9508	NC_011832	TTC	2	6	477876	477881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851140
9509	NC_011832	CT	3	6	477918	477923	0 %	50 %	0 %	50 %	219851140
9510	NC_011832	TCG	2	6	477933	477938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9511	NC_011832	CTT	2	6	477980	477985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851140
9512	NC_011832	TGA	2	6	477993	477998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851140
9513	NC_011832	G	6	6	478033	478038	0 %	0 %	100 %	0 %	219851140
9514	NC_011832	GGA	2	6	478048	478053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851140
9515	NC_011832	AT	3	6	478063	478068	50 %	50 %	0 %	0 %	219851140
9516	NC_011832	GTTG	2	8	478085	478092	0 %	50 %	50 %	0 %	219851140
9517	NC_011832	CTG	2	6	478133	478138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9518	NC_011832	TGC	2	6	478140	478145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9519	NC_011832	CGA	2	6	478168	478173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9520	NC_011832	GCG	2	6	478194	478199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851140
9521	NC_011832	TGG	2	6	478207	478212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851140
9522	NC_011832	GCT	3	9	478255	478263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9523	NC_011832	CGAT	2	8	478275	478282	25 %	25 %	25 %	25 %	219851140
9524	NC_011832	CTCGGT	2	12	478358	478369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851140
9525	NC_011832	ATC	2	6	478383	478388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851140
9526	NC_011832	CCGA	2	8	478397	478404	25 %	0 %	25 %	50 %	219851140
9527	NC_011832	GCA	2	6	478456	478461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851141
9528	NC_011832	CTT	2	6	478533	478538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851141
9529	NC_011832	CGT	2	6	478610	478615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851141
9530	NC_011832	CCA	2	6	478649	478654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851141
9531	NC_011832	CGC	2	6	478674	478679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851141
9532	NC_011832	CCCCGC	2	12	478691	478702	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	219851141
9533	NC_011832	TCG	2	6	478732	478737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851141
9534	NC_011832	GA	3	6	478793	478798	50 %	0 %	50 %	0 %	219851141
9535	NC_011832	CCT	2	6	478811	478816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851141
9536	NC_011832	CGA	2	6	478823	478828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851141
9537	NC_011832	CCA	2	6	478853	478858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851141
9538	NC_011832	AAC	2	6	478905	478910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851141
9539	NC_011832	TGT	2	6	478970	478975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851141
9540	NC_011832	TGA	2	6	478985	478990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851141
9541	NC_011832	CTC	2	6	479130	479135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851141
9542	NC_011832	TGA	2	6	479341	479346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851142
9543	NC_011832	ATCCT	2	10	479506	479515	20 %	40 %	0 %	40 %	219851143
9544	NC_011832	ACA	2	6	479543	479548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851143
9545	NC_011832	TC	3	6	479577	479582	0 %	50 %	0 %	50 %	219851143
9546	NC_011832	CT	3	6	479643	479648	0 %	50 %	0 %	50 %	219851143
9547	NC_011832	GCA	2	6	479649	479654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851143
9548	NC_011832	GTG	2	6	479690	479695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851143
9549	NC_011832	GTCG	2	8	479702	479709	0 %	25 %	50 %	25 %	219851143
9550	NC_011832	GAG	2	6	479724	479729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851143
9551	NC_011832	GCA	2	6	479871	479876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851143
9552	NC_011832	CCGAT	2	10	479885	479894	20 %	20 %	20 %	40 %	219851143
9553	NC_011832	CTG	2	6	479897	479902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851143
9554	NC_011832	GGTC	2	8	479915	479922	0 %	25 %	50 %	25 %	219851143
9555	NC_011832	C	6	6	479943	479948	0 %	0 %	0 %	100 %	219851143
9556	NC_011832	TGC	2	6	479969	479974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851143
9557	NC_011832	CCG	3	9	479984	479992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851143
9558	NC_011832	TGG	2	6	480035	480040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851143
9559	NC_011832	GCC	2	6	480118	480123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851144
9560	NC_011832	AT	3	6	480138	480143	50 %	50 %	0 %	0 %	219851144
9561	NC_011832	TCC	2	6	480159	480164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851144
9562	NC_011832	GTG	2	6	480186	480191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851144
9563	NC_011832	CTT	2	6	480223	480228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851144
9564	NC_011832	TGG	2	6	480232	480237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851144
9565	NC_011832	CGCC	2	8	480242	480249	0 %	0 %	25 %	75 %	219851144
9566	NC_011832	AAG	2	6	480264	480269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851144
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9568	NC_011832	CTG	2	6	480417	480422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851144
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9570	NC_011832	TCT	2	6	480463	480468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851144
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9581	NC_011832	AT	3	6	480910	480915	50 %	50 %	0 %	0 %	219851144
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9586	NC_011832	C	6	6	481028	481033	0 %	0 %	0 %	100 %	219851144
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9589	NC_011832	GCT	2	6	481261	481266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851145
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9592	NC_011832	CGA	2	6	481368	481373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851145
9593	NC_011832	ACC	2	6	481403	481408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851145
9594	NC_011832	TCC	2	6	481485	481490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851145
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9599	NC_011832	GAA	2	6	481645	481650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851145
9600	NC_011832	TC	3	6	481690	481695	0 %	50 %	0 %	50 %	219851145
9601	NC_011832	ACG	2	6	481724	481729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851145
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9605	NC_011832	CT	3	6	482004	482009	0 %	50 %	0 %	50 %	219851145
9606	NC_011832	CGT	2	6	482047	482052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851145
9607	NC_011832	TCAG	2	8	482142	482149	25 %	25 %	25 %	25 %	219851145
9608	NC_011832	GTT	2	6	482162	482167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851145
9609	NC_011832	GAG	2	6	482193	482198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851145
9610	NC_011832	TCTG	2	8	482304	482311	0 %	50 %	25 %	25 %	219851146
9611	NC_011832	A	6	6	482312	482317	100 %	0 %	0 %	0 %	219851146
9612	NC_011832	TTC	2	6	482335	482340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851146
9613	NC_011832	CTCTTC	2	12	482419	482430	0 %	50 %	0 %	50 %	219851146
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9616	NC_011832	ATC	2	6	482644	482649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146
9617	NC_011832	CTG	2	6	482665	482670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851146
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9619	NC_011832	TTC	2	6	482698	482703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851146
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9984	NC_011832	GA	3	6	502291	502296	50 %	0 %	50 %	0 %	219851157
9985	NC_011832	ACC	2	6	502301	502306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851157
9986	NC_011832	CTC	2	6	502398	502403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851157
9987	NC_011832	CGAA	2	8	502427	502434	50 %	0 %	25 %	25 %	219851157
9988	NC_011832	TTC	2	6	502456	502461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851157
9989	NC_011832	CGT	2	6	502466	502471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851157
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9991	NC_011832	TC	3	6	502507	502512	0 %	50 %	0 %	50 %	219851157
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