MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011832	CT	3	6	22203	22208	0 %	50 %	0 %	50 %	219850709
502	NC_011832	GAG	2	6	22247	22252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850709
503	NC_011832	CTC	2	6	22304	22309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850709
504	NC_011832	GAG	2	6	22313	22318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850709
505	NC_011832	GCC	2	6	22413	22418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
506	NC_011832	GGC	2	6	22427	22432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850709
507	NC_011832	CTG	2	6	22436	22441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850709
508	NC_011832	AGT	2	6	22477	22482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850709
509	NC_011832	GGC	2	6	22523	22528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850709
510	NC_011832	GGAT	2	8	22547	22554	25 %	25 %	50 %	0 %	219850709
511	NC_011832	CTG	2	6	22555	22560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850709
512	NC_011832	CT	3	6	22577	22582	0 %	50 %	0 %	50 %	219850709
513	NC_011832	CGC	2	6	22592	22597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
514	NC_011832	GCC	2	6	22605	22610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
515	NC_011832	AGT	2	6	22636	22641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850709
516	NC_011832	CTT	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850709
517	NC_011832	CTGGAA	2	12	22709	22720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850709
518	NC_011832	CGTC	2	8	22733	22740	0 %	25 %	25 %	50 %	219850709
519	NC_011832	GTG	2	6	22941	22946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850710
520	NC_011832	CGA	2	6	23101	23106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850710
521	NC_011832	CCT	2	6	23143	23148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850710
522	NC_011832	GCCA	2	8	23159	23166	25 %	0 %	25 %	50 %	219850710
523	NC_011832	TGA	2	6	23167	23172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850710
524	NC_011832	GGT	2	6	23174	23179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850710
525	NC_011832	CCA	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850710
526	NC_011832	GCT	2	6	23233	23238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850710
527	NC_011832	GAG	2	6	23291	23296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850710
528	NC_011832	CTCTT	2	10	23310	23319	0 %	60 %	0 %	40 %	219850710
529	NC_011832	CCT	2	6	23326	23331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850710
530	NC_011832	CCG	2	6	23372	23377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850710
531	NC_011832	GCT	2	6	23398	23403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850710
532	NC_011832	CAGGT	2	10	23549	23558	20 %	20 %	40 %	20 %	219850711
533	NC_011832	A	6	6	23589	23594	100 %	0 %	0 %	0 %	219850711
534	NC_011832	TCA	2	6	23597	23602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850711
535	NC_011832	GTT	2	6	23614	23619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850711
536	NC_011832	AGC	2	6	23635	23640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850711
537	NC_011832	TCT	2	6	23700	23705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850711
538	NC_011832	CGT	2	6	23709	23714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
539	NC_011832	AGT	2	6	23775	23780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850711
540	NC_011832	GCT	2	6	23873	23878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
541	NC_011832	GTTCAG	2	12	23929	23940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219850711
542	NC_011832	GA	3	6	23942	23947	50 %	0 %	50 %	0 %	219850711
543	NC_011832	TCG	2	6	23960	23965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
544	NC_011832	TAG	2	6	23975	23980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850711
545	NC_011832	GAG	2	6	24001	24006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850711
546	NC_011832	TCCTT	2	10	24011	24020	0 %	60 %	0 %	40 %	219850711
547	NC_011832	TCCT	2	8	24022	24029	0 %	50 %	0 %	50 %	219850711
548	NC_011832	TCG	2	6	24062	24067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
549	NC_011832	GAT	2	6	24070	24075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850711
550	NC_011832	GCA	2	6	24084	24089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850711
551	NC_011832	TGGA	2	8	24148	24155	25 %	25 %	50 %	0 %	219850711
552	NC_011832	TCG	2	6	24174	24179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
553	NC_011832	TCG	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
554	NC_011832	GAG	2	6	24301	24306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850711
555	NC_011832	ACC	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850711
556	NC_011832	GTTC	2	8	24516	24523	0 %	50 %	25 %	25 %	219850711
557	NC_011832	CTC	2	6	24562	24567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850711
558	NC_011832	GGC	2	6	24573	24578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850711
559	NC_011832	GCTTC	2	10	24582	24591	0 %	40 %	20 %	40 %	219850711
560	NC_011832	TCT	2	6	24630	24635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850711
561	NC_011832	TC	3	6	24643	24648	0 %	50 %	0 %	50 %	219850711
562	NC_011832	TCC	2	6	24840	24845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850712
563	NC_011832	GCG	2	6	24935	24940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850712
564	NC_011832	CGA	2	6	24961	24966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850712
565	NC_011832	TCG	2	6	24969	24974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850712
566	NC_011832	ACC	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
567	NC_011832	CACT	2	8	25164	25171	25 %	25 %	0 %	50 %	219850713
568	NC_011832	CTG	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850713
569	NC_011832	GTA	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850713
570	NC_011832	CCA	2	6	25332	25337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
571	NC_011832	GGCC	2	8	25358	25365	0 %	0 %	50 %	50 %	219850713
572	NC_011832	GAGC	2	8	25397	25404	25 %	0 %	50 %	25 %	219850713
573	NC_011832	GAA	2	6	25408	25413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850713
574	NC_011832	TTC	2	6	25487	25492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850713
575	NC_011832	GCC	2	6	25500	25505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850713
576	NC_011832	ACC	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
577	NC_011832	CAG	2	6	25589	25594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850713
578	NC_011832	CAC	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
579	NC_011832	CGG	2	6	25687	25692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850713
580	NC_011832	ATC	2	6	25698	25703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850713
581	NC_011832	CAGT	2	8	25753	25760	25 %	25 %	25 %	25 %	219850713
582	NC_011832	CTTCT	2	10	25781	25790	0 %	60 %	0 %	40 %	219850713
583	NC_011832	ATC	2	6	25806	25811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850713
584	NC_011832	TCA	2	6	25825	25830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850713
585	NC_011832	TCG	2	6	25890	25895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850713
586	NC_011832	ATA	2	6	25898	25903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850713
587	NC_011832	CTG	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850714
588	NC_011832	CAC	2	6	26005	26010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850714
589	NC_011832	CCG	2	6	26037	26042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850714
590	NC_011832	CAGTGG	2	12	26090	26101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850714
591	NC_011832	TG	3	6	26176	26181	0 %	50 %	50 %	0 %	219850714
592	NC_011832	CCG	2	6	26191	26196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850714
593	NC_011832	TCC	2	6	26198	26203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850714
594	NC_011832	G	6	6	26205	26210	0 %	0 %	100 %	0 %	219850714
595	NC_011832	GCG	2	6	26234	26239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850714
596	NC_011832	TCCAT	2	10	26259	26268	20 %	40 %	0 %	40 %	219850714
597	NC_011832	GAT	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850715
598	NC_011832	TCA	2	6	26379	26384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850715
599	NC_011832	CTG	2	6	26404	26409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850715
600	NC_011832	GCC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850715
601	NC_011832	CGA	2	6	26449	26454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850715
602	NC_011832	CGAA	2	8	26480	26487	50 %	0 %	25 %	25 %	219850715
603	NC_011832	CGC	2	6	26491	26496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850715
604	NC_011832	GAT	2	6	26585	26590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850715
605	NC_011832	GAA	2	6	26648	26653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850715
606	NC_011832	TGGG	2	8	26666	26673	0 %	25 %	75 %	0 %	219850715
607	NC_011832	CCA	2	6	26683	26688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850715
608	NC_011832	CCA	2	6	26700	26705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850715
609	NC_011832	GAT	2	6	26765	26770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850715
610	NC_011832	GAC	2	6	26882	26887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850715
611	NC_011832	CCG	2	6	26896	26901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850715
612	NC_011832	GATCA	2	10	27002	27011	40 %	20 %	20 %	20 %	219850715
613	NC_011832	TCG	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850716
614	NC_011832	CTC	2	6	27096	27101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850716
615	NC_011832	TCG	2	6	27127	27132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850716
616	NC_011832	GA	3	6	27145	27150	50 %	0 %	50 %	0 %	219850716
617	NC_011832	CCG	2	6	27151	27156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850716
618	NC_011832	GGTCG	2	10	27158	27167	0 %	20 %	60 %	20 %	219850716
619	NC_011832	GGA	2	6	27224	27229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850716
620	NC_011832	TTC	2	6	27235	27240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850716
621	NC_011832	CGC	2	6	27248	27253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850716
622	NC_011832	GA	3	6	27347	27352	50 %	0 %	50 %	0 %	219850716
623	NC_011832	CTC	2	6	27498	27503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850716
624	NC_011832	CCT	2	6	27518	27523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850716
625	NC_011832	CTC	2	6	27531	27536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850716
626	NC_011832	GGA	2	6	27560	27565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850716
627	NC_011832	GGA	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850716
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