MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011832	CCG	2	6	273725	273730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850916
5502	NC_011832	CTT	2	6	273802	273807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850916
5503	NC_011832	ACC	2	6	273842	273847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850916
5504	NC_011832	CGA	2	6	273864	273869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850916
5505	NC_011832	GTC	2	6	273874	273879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850916
5506	NC_011832	GATC	2	8	273948	273955	25 %	25 %	25 %	25 %	219850916
5507	NC_011832	TCT	2	6	273987	273992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850916
5508	NC_011832	GC	3	6	274070	274075	0 %	0 %	50 %	50 %	219850916
5509	NC_011832	TCG	2	6	274091	274096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850916
5510	NC_011832	ATC	2	6	274097	274102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850916
5511	NC_011832	TCC	2	6	274181	274186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850917
5512	NC_011832	CTTCT	2	10	274196	274205	0 %	60 %	0 %	40 %	219850917
5513	NC_011832	CGC	2	6	274235	274240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850917
5514	NC_011832	C	6	6	274273	274278	0 %	0 %	0 %	100 %	219850917
5515	NC_011832	GGA	2	6	274294	274299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850917
5516	NC_011832	AGGG	2	8	274308	274315	25 %	0 %	75 %	0 %	219850917
5517	NC_011832	GGC	3	9	274343	274351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850917
5518	NC_011832	TCG	2	6	274362	274367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850917
5519	NC_011832	GCC	2	6	274377	274382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850917
5520	NC_011832	GAA	2	6	274403	274408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850917
5521	NC_011832	ATT	2	6	274427	274432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850917
5522	NC_011832	ACC	2	6	274467	274472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850917
5523	NC_011832	CCCG	2	8	274479	274486	0 %	0 %	25 %	75 %	219850917
5524	NC_011832	TCG	2	6	274494	274499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850917
5525	NC_011832	ATC	2	6	274563	274568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850917
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5528	NC_011832	CGGC	2	8	274647	274654	0 %	0 %	50 %	50 %	219850917
5529	NC_011832	GAT	2	6	274673	274678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850917
5530	NC_011832	GAT	2	6	274721	274726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850917
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5535	NC_011832	CAC	2	6	274904	274909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850917
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5540	NC_011832	GTC	2	6	275057	275062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850917
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5544	NC_011832	GAC	2	6	275198	275203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850917
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5546	NC_011832	GTT	2	6	275470	275475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850918
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5550	NC_011832	GAG	2	6	275828	275833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850918
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5556	NC_011832	ACC	2	6	276120	276125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850918
5557	NC_011832	CGG	2	6	276139	276144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850918
5558	NC_011832	CTG	2	6	276173	276178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850918
5559	NC_011832	TC	3	6	276220	276225	0 %	50 %	0 %	50 %	219850918
5560	NC_011832	GTA	2	6	276281	276286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850918
5561	NC_011832	GGTCC	2	10	276335	276344	0 %	20 %	40 %	40 %	219850918
5562	NC_011832	TG	3	6	276351	276356	0 %	50 %	50 %	0 %	219850918
5563	NC_011832	GTG	2	6	276369	276374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850918
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5570	NC_011832	TTC	2	6	276707	276712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850919
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5606	NC_011832	GAT	2	6	278677	278682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850924
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5608	NC_011832	GAT	2	6	278824	278829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850924
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5622	NC_011832	GTGATG	2	12	279538	279549	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219850925
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5625	NC_011832	CGATCG	2	12	279635	279646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219850925
5626	NC_011832	CAACCG	2	12	279662	279673	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219850925
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5651	NC_011832	CTGG	2	8	281115	281122	0 %	25 %	50 %	25 %	219850926
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5742	NC_011832	CAGA	2	8	286166	286173	50 %	0 %	25 %	25 %	219850932
5743	NC_011832	TGC	3	9	286205	286213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
5744	NC_011832	AACTG	2	10	286250	286259	40 %	20 %	20 %	20 %	219850932
5745	NC_011832	GA	3	6	286273	286278	50 %	0 %	50 %	0 %	219850932
5746	NC_011832	TCG	2	6	286300	286305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
5747	NC_011832	CGAC	2	8	286311	286318	25 %	0 %	25 %	50 %	219850932
5748	NC_011832	ATC	2	6	286401	286406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
5749	NC_011832	GCCA	2	8	286413	286420	25 %	0 %	25 %	50 %	219850932
5750	NC_011832	TCA	2	6	286423	286428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
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5752	NC_011832	ATCG	2	8	286460	286467	25 %	25 %	25 %	25 %	219850932
5753	NC_011832	TGA	2	6	286498	286503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850932
5754	NC_011832	GCC	2	6	286521	286526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850932
5755	NC_011832	AAGGA	2	10	286555	286564	60 %	0 %	40 %	0 %	219850932
5756	NC_011832	ATG	2	6	286630	286635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850932
5757	NC_011832	TTG	2	6	286657	286662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850932
5758	NC_011832	CGTT	2	8	286674	286681	0 %	50 %	25 %	25 %	219850932
5759	NC_011832	CTGGTG	2	12	286698	286709	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219850932
5760	NC_011832	GTC	2	6	286740	286745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
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5762	NC_011832	TGG	2	6	286801	286806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850932
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5765	NC_011832	CGGC	2	8	286872	286879	0 %	0 %	50 %	50 %	219850932
5766	NC_011832	GGA	2	6	286880	286885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850932
5767	NC_011832	ACTG	2	8	286889	286896	25 %	25 %	25 %	25 %	219850932
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5772	NC_011832	ATC	2	6	287032	287037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
5773	NC_011832	AGAA	2	8	287086	287093	75 %	0 %	25 %	0 %	219850932
5774	NC_011832	CTA	2	6	287160	287165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850933
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5781	NC_011832	CCGA	2	8	287572	287579	25 %	0 %	25 %	50 %	219850933
5782	NC_011832	GCT	2	6	287602	287607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850933
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5854	NC_011832	AT	3	6	291130	291135	50 %	50 %	0 %	0 %	219850937
5855	NC_011832	TGA	2	6	291236	291241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850937
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5982	NC_011832	GCG	2	6	296350	296355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850940
5983	NC_011832	G	6	6	296355	296360	0 %	0 %	100 %	0 %	219850940
5984	NC_011832	GGT	3	9	296374	296382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850940
5985	NC_011832	ATG	2	6	296409	296414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850940
5986	NC_011832	ATC	2	6	296471	296476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850940
5987	NC_011832	GACG	2	8	296517	296524	25 %	0 %	50 %	25 %	219850940
5988	NC_011832	GAG	2	6	296531	296536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850940
5989	NC_011832	ATCT	2	8	296580	296587	25 %	50 %	0 %	25 %	219850941
5990	NC_011832	T	6	6	296598	296603	0 %	100 %	0 %	0 %	219850941
5991	NC_011832	C	6	6	296612	296617	0 %	0 %	0 %	100 %	219850941
5992	NC_011832	CCT	2	6	296653	296658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850941
5993	NC_011832	CCT	2	6	296824	296829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850941
5994	NC_011832	AGA	2	6	296893	296898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850941
5995	NC_011832	GCT	2	6	296985	296990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850941
5996	NC_011832	TGA	2	6	297066	297071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850941
5997	NC_011832	TGC	3	9	297090	297098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850941
5998	NC_011832	AGC	2	6	297114	297119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850941
5999	NC_011832	TCTG	2	8	297135	297142	0 %	50 %	25 %	25 %	219850941
6000	NC_011832	CCT	2	6	297286	297291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850941

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