MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011832	GCA	2	6	246659	246664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850890
5002	NC_011832	ATC	2	6	246734	246739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850890
5003	NC_011832	CTC	2	6	246891	246896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850891
5004	NC_011832	GAT	2	6	246897	246902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850891
5005	NC_011832	CGATG	2	10	246903	246912	20 %	20 %	40 %	20 %	219850891
5006	NC_011832	CGA	2	6	246920	246925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850891
5007	NC_011832	CGC	2	6	246927	246932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850891
5008	NC_011832	GGT	2	6	247005	247010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850891
5009	NC_011832	GTC	2	6	247133	247138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850891
5010	NC_011832	GGT	3	9	247143	247151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850891
5011	NC_011832	GCC	2	6	247192	247197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850891
5012	NC_011832	TCT	2	6	247216	247221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850891
5013	NC_011832	CGG	2	6	247262	247267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850891
5014	NC_011832	GTA	2	6	247311	247316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850891
5015	NC_011832	CCG	2	6	247337	247342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850891
5016	NC_011832	TGA	2	6	247361	247366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850891
5017	NC_011832	TCGGA	2	10	247445	247454	20 %	20 %	40 %	20 %	219850891
5018	NC_011832	CGA	2	6	247472	247477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850891
5019	NC_011832	CGG	2	6	247487	247492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850891
5020	NC_011832	GCCG	2	8	247564	247571	0 %	0 %	50 %	50 %	219850891
5021	NC_011832	C	6	6	247617	247622	0 %	0 %	0 %	100 %	219850892
5022	NC_011832	GCA	2	6	247927	247932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850892
5023	NC_011832	ACCA	2	8	248027	248034	50 %	0 %	0 %	50 %	219850892
5024	NC_011832	GCC	3	9	248087	248095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850892
5025	NC_011832	GCCG	2	8	248122	248129	0 %	0 %	50 %	50 %	219850892
5026	NC_011832	TCG	2	6	248191	248196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850892
5027	NC_011832	TGGG	2	8	248201	248208	0 %	25 %	75 %	0 %	219850892
5028	NC_011832	CCGAG	2	10	248218	248227	20 %	0 %	40 %	40 %	219850892
5029	NC_011832	GTGG	2	8	248234	248241	0 %	25 %	75 %	0 %	219850892
5030	NC_011832	TGC	2	6	248445	248450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850892
5031	NC_011832	AGC	2	6	248499	248504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850892
5032	NC_011832	GTT	2	6	248519	248524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850892
5033	NC_011832	TG	3	6	248530	248535	0 %	50 %	50 %	0 %	219850892
5034	NC_011832	TCC	2	6	248553	248558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850892
5035	NC_011832	CCG	2	6	248587	248592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850892
5036	NC_011832	GCC	2	6	248697	248702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850892
5037	NC_011832	ATC	2	6	248724	248729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850892
5038	NC_011832	CGTC	2	8	248785	248792	0 %	25 %	25 %	50 %	219850893
5039	NC_011832	TTCTCA	2	12	248810	248821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219850893
5040	NC_011832	CCG	2	6	248892	248897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850893
5041	NC_011832	CAC	2	6	248974	248979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850893
5042	NC_011832	CCGG	2	8	248980	248987	0 %	0 %	50 %	50 %	219850893
5043	NC_011832	TTG	2	6	249056	249061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850893
5044	NC_011832	TG	3	6	249112	249117	0 %	50 %	50 %	0 %	219850893
5045	NC_011832	GAG	2	6	249184	249189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850893
5046	NC_011832	TGA	2	6	249255	249260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850893
5047	NC_011832	GGA	2	6	249270	249275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850893
5048	NC_011832	TGG	2	6	249282	249287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850893
5049	NC_011832	CTG	2	6	249301	249306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850893
5050	NC_011832	C	6	6	249322	249327	0 %	0 %	0 %	100 %	219850893
5051	NC_011832	GCC	2	6	249367	249372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850893
5052	NC_011832	ATC	2	6	249410	249415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850893
5053	NC_011832	CTG	2	6	249604	249609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850894
5054	NC_011832	TCGA	2	8	249652	249659	25 %	25 %	25 %	25 %	219850894
5055	NC_011832	CGC	4	12	249717	249728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850894
5056	NC_011832	GAG	2	6	249732	249737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850894
5057	NC_011832	C	7	7	249755	249761	0 %	0 %	0 %	100 %	219850894
5058	NC_011832	TGA	2	6	249782	249787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850894
5059	NC_011832	GCG	2	6	249790	249795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850894
5060	NC_011832	GGA	2	6	249875	249880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850894
5061	NC_011832	ACC	2	6	249901	249906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850894
5062	NC_011832	TGCTG	2	10	249918	249927	0 %	40 %	40 %	20 %	219850894
5063	NC_011832	TCG	2	6	249931	249936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850894
5064	NC_011832	TCC	2	6	249939	249944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850894
5065	NC_011832	ATC	2	6	249955	249960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850894
5066	NC_011832	GCA	2	6	249983	249988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850894
5067	NC_011832	G	6	6	249991	249996	0 %	0 %	100 %	0 %	219850894
5068	NC_011832	GAG	2	6	250005	250010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850894
5069	NC_011832	GAG	2	6	250029	250034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850894
5070	NC_011832	CCTG	2	8	250168	250175	0 %	25 %	25 %	50 %	219850894
5071	NC_011832	CGA	2	6	250310	250315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850894
5072	NC_011832	CGC	2	6	250317	250322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850894
5073	NC_011832	CCTG	2	8	250345	250352	0 %	25 %	25 %	50 %	219850894
5074	NC_011832	TCC	2	6	250356	250361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850894
5075	NC_011832	CGG	2	6	250454	250459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850894
5076	NC_011832	CT	3	6	250462	250467	0 %	50 %	0 %	50 %	219850894
5077	NC_011832	TGG	2	6	250511	250516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850894
5078	NC_011832	CCT	2	6	250598	250603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850894
5079	NC_011832	CTC	2	6	250614	250619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850895
5080	NC_011832	GCT	2	6	250633	250638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850895
5081	NC_011832	CCCGG	2	10	251037	251046	0 %	0 %	40 %	60 %	219850895
5082	NC_011832	GAG	2	6	251051	251056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850895
5083	NC_011832	CAGC	2	8	251067	251074	25 %	0 %	25 %	50 %	219850895
5084	NC_011832	GCA	2	6	251079	251084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850895
5085	NC_011832	TGG	2	6	251098	251103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850895
5086	NC_011832	GAG	2	6	251144	251149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850895
5087	NC_011832	CTCC	2	8	251207	251214	0 %	25 %	0 %	75 %	219850896
5088	NC_011832	CAT	2	6	251233	251238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850896
5089	NC_011832	GCT	2	6	251240	251245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850896
5090	NC_011832	CGA	2	6	251292	251297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850896
5091	NC_011832	CCGT	2	8	251343	251350	0 %	25 %	25 %	50 %	219850896
5092	NC_011832	ATGGCA	2	12	251351	251362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850896
5093	NC_011832	TGA	2	6	251439	251444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850896
5094	NC_011832	AGG	2	6	251496	251501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850896
5095	NC_011832	CAGGT	2	10	251516	251525	20 %	20 %	40 %	20 %	219850896
5096	NC_011832	CCCTGA	2	12	251598	251609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219850896
5097	NC_011832	TCC	3	9	251720	251728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850896
5098	NC_011832	CGT	2	6	251741	251746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850896
5099	NC_011832	GGT	2	6	251767	251772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850896
5100	NC_011832	TGG	2	6	251825	251830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850896
5101	NC_011832	GTA	2	6	251845	251850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850896
5102	NC_011832	AGG	2	6	251891	251896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850896
5103	NC_011832	CT	3	6	251971	251976	0 %	50 %	0 %	50 %	219850896
5104	NC_011832	GAGG	2	8	252013	252020	25 %	0 %	75 %	0 %	219850896
5105	NC_011832	TCC	2	6	252042	252047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850896
5106	NC_011832	AGG	2	6	252107	252112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850896
5107	NC_011832	TCC	2	6	252257	252262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850896
5108	NC_011832	TGGA	2	8	252292	252299	25 %	25 %	50 %	0 %	219850896
5109	NC_011832	ATC	2	6	252332	252337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850896
5110	NC_011832	CCG	2	6	252338	252343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850896
5111	NC_011832	TCA	2	6	252384	252389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850896
5112	NC_011832	TTCC	2	8	252413	252420	0 %	50 %	0 %	50 %	219850896
5113	NC_011832	CTC	2	6	252471	252476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850896
5114	NC_011832	GGTC	2	8	252541	252548	0 %	25 %	50 %	25 %	219850896
5115	NC_011832	CGGC	2	8	252603	252610	0 %	0 %	50 %	50 %	219850896
5116	NC_011832	ATCG	2	8	252619	252626	25 %	25 %	25 %	25 %	219850896
5117	NC_011832	CAG	2	6	252649	252654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850896
5118	NC_011832	GTG	2	6	252680	252685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850896
5119	NC_011832	CTC	2	6	252688	252693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850896
5120	NC_011832	AG	3	6	252697	252702	50 %	0 %	50 %	0 %	219850896
5121	NC_011832	TGC	3	9	252847	252855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850897
5122	NC_011832	AGG	2	6	252890	252895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850897
5123	NC_011832	TGG	2	6	252986	252991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850897
5124	NC_011832	GTC	3	9	253008	253016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850897
5125	NC_011832	GAT	2	6	253074	253079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850897
5126	NC_011832	CCG	2	6	253134	253139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850897
5127	NC_011832	GTG	2	6	253185	253190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850897
5128	NC_011832	CCT	2	6	253226	253231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850897
5129	NC_011832	AT	3	6	253258	253263	50 %	50 %	0 %	0 %	219850897
5130	NC_011832	GAG	2	6	253291	253296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850897
5131	NC_011832	GGCG	2	8	253298	253305	0 %	0 %	75 %	25 %	219850897
5132	NC_011832	CCG	2	6	253314	253319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850897
5133	NC_011832	CTGA	2	8	253370	253377	25 %	25 %	25 %	25 %	219850897
5134	NC_011832	GCTCTT	2	12	253406	253417	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219850897
5135	NC_011832	CTG	2	6	253519	253524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850897
5136	NC_011832	CTGC	2	8	253595	253602	0 %	25 %	25 %	50 %	219850897
5137	NC_011832	CAT	2	6	253649	253654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850897
5138	NC_011832	TTTAA	2	10	253675	253684	40 %	60 %	0 %	0 %	219850897
5139	NC_011832	TCC	2	6	253729	253734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850897
5140	NC_011832	ATC	2	6	253900	253905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850897
5141	NC_011832	AGGAG	2	10	253916	253925	40 %	0 %	60 %	0 %	219850897
5142	NC_011832	TCC	2	6	254111	254116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850897
5143	NC_011832	GGT	2	6	254131	254136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850897
5144	NC_011832	TCA	2	6	254338	254343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850898
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5146	NC_011832	CTG	3	9	254365	254373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850898
5147	NC_011832	TC	3	6	254393	254398	0 %	50 %	0 %	50 %	219850898
5148	NC_011832	TC	3	6	254421	254426	0 %	50 %	0 %	50 %	219850898
5149	NC_011832	CGG	2	6	254427	254432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850898
5150	NC_011832	GCG	2	6	254446	254451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850898
5151	NC_011832	GACCG	2	10	254557	254566	20 %	0 %	40 %	40 %	219850898
5152	NC_011832	GACGGT	2	12	254586	254597	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850898
5153	NC_011832	GAT	2	6	254646	254651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850898
5154	NC_011832	AACTAT	2	12	254797	254808	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219850898
5155	NC_011832	ATC	2	6	254824	254829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850898
5156	NC_011832	TCG	2	6	254861	254866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850898
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5158	NC_011832	CGAC	2	8	255005	255012	25 %	0 %	25 %	50 %	219850898
5159	NC_011832	CGT	2	6	255048	255053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850898
5160	NC_011832	GCC	2	6	255091	255096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850898
5161	NC_011832	TCG	2	6	255119	255124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850898
5162	NC_011832	CGG	2	6	255186	255191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850898
5163	NC_011832	AGA	2	6	255242	255247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850898
5164	NC_011832	ACC	2	6	255283	255288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850898
5165	NC_011832	CGT	2	6	255513	255518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850898
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5172	NC_011832	GCT	2	6	255900	255905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850899
5173	NC_011832	AGC	2	6	255977	255982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850899
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5175	NC_011832	ACG	2	6	256126	256131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850899
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5188	NC_011832	GTC	2	6	256716	256721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850899
5189	NC_011832	GAT	2	6	256737	256742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850899
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5192	NC_011832	TGG	2	6	256877	256882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850899
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5213	NC_011832	ATG	2	6	257675	257680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850899
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5222	NC_011832	ATC	2	6	258349	258354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850900
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5226	NC_011832	TACA	2	8	258662	258669	50 %	25 %	0 %	25 %	219850901
5227	NC_011832	ATCG	2	8	258676	258683	25 %	25 %	25 %	25 %	219850901
5228	NC_011832	GT	3	6	258725	258730	0 %	50 %	50 %	0 %	219850901
5229	NC_011832	GTA	2	6	258756	258761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850901
5230	NC_011832	GTG	2	6	258879	258884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850901
5231	NC_011832	CGC	2	6	258896	258901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850901
5232	NC_011832	GAT	2	6	258903	258908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850901
5233	NC_011832	CGG	2	6	258973	258978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850901
5234	NC_011832	TGC	2	6	259043	259048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850901
5235	NC_011832	CTG	3	9	259066	259074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850901
5236	NC_011832	GTC	2	6	259113	259118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850901
5237	NC_011832	ATC	3	9	259149	259157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850901
5238	NC_011832	AGGATC	2	12	259167	259178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850901
5239	NC_011832	TGT	2	6	259206	259211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850901
5240	NC_011832	TC	4	8	259318	259325	0 %	50 %	0 %	50 %	219850902
5241	NC_011832	TC	3	6	259328	259333	0 %	50 %	0 %	50 %	219850902
5242	NC_011832	AG	3	6	259339	259344	50 %	0 %	50 %	0 %	219850902
5243	NC_011832	CTT	2	6	259364	259369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850902
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5247	NC_011832	TCGAT	2	10	259600	259609	20 %	40 %	20 %	20 %	219850902
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5362	NC_011832	GGA	2	6	266929	266934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850907
5363	NC_011832	TGA	2	6	266992	266997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850907
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5475	NC_011832	ATC	2	6	272314	272319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850914
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5480	NC_011832	T	6	6	272474	272479	0 %	100 %	0 %	0 %	219850915
5481	NC_011832	CCTC	2	8	272496	272503	0 %	25 %	0 %	75 %	219850915
5482	NC_011832	GAC	2	6	272558	272563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850915
5483	NC_011832	CTG	2	6	272594	272599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850915
5484	NC_011832	GCT	2	6	272672	272677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850916
5485	NC_011832	GAT	2	6	272734	272739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850916
5486	NC_011832	TCA	2	6	272745	272750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850916
5487	NC_011832	TCA	2	6	272862	272867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850916
5488	NC_011832	CT	4	8	272876	272883	0 %	50 %	0 %	50 %	219850916
5489	NC_011832	CAG	2	6	272926	272931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850916
5490	NC_011832	ACA	2	6	272941	272946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850916
5491	NC_011832	CAG	2	6	273076	273081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850916
5492	NC_011832	GCC	2	6	273230	273235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850916
5493	NC_011832	TGG	2	6	273240	273245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850916
5494	NC_011832	TGG	2	6	273293	273298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850916
5495	NC_011832	CAT	2	6	273354	273359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850916
5496	NC_011832	TCT	2	6	273387	273392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850916
5497	NC_011832	GCCG	2	8	273436	273443	0 %	0 %	50 %	50 %	219850916
5498	NC_011832	CAC	2	6	273661	273666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850916
5499	NC_011832	CCA	2	6	273699	273704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850916
5500	NC_011832	CA	3	6	273703	273708	50 %	0 %	0 %	50 %	219850916

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