MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_011832	AGC	2	6	2806143	2806148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853229
52003	NC_011832	TCT	2	6	2806217	2806222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853230
52004	NC_011832	TGA	2	6	2806268	2806273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853230
52005	NC_011832	CGT	2	6	2806327	2806332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853230
52006	NC_011832	TCT	2	6	2806337	2806342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853230
52007	NC_011832	AGC	2	6	2806354	2806359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853230
52008	NC_011832	TCG	2	6	2806367	2806372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853230
52009	NC_011832	CCA	2	6	2806403	2806408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853230
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52011	NC_011832	ATC	2	6	2806477	2806482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853230
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52013	NC_011832	GAGGTG	2	12	2806495	2806506	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	219853230
52014	NC_011832	ATC	2	6	2806552	2806557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853230
52015	NC_011832	CTG	2	6	2806563	2806568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853230
52016	NC_011832	CAT	2	6	2806626	2806631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853230
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52115	NC_011832	CAG	2	6	2810946	2810951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853234
52116	NC_011832	CCT	2	6	2810961	2810966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853234
52117	NC_011832	TTG	2	6	2810972	2810977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853234
52118	NC_011832	CTG	2	6	2810989	2810994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853234
52119	NC_011832	GGA	2	6	2811003	2811008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853234
52120	NC_011832	TCG	2	6	2811167	2811172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853234
52121	NC_011832	CT	3	6	2811449	2811454	0 %	50 %	0 %	50 %	219853235
52122	NC_011832	GAT	2	6	2811457	2811462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853235
52123	NC_011832	GAG	2	6	2811520	2811525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853235
52124	NC_011832	GAC	2	6	2811605	2811610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853235
52125	NC_011832	GCA	2	6	2811614	2811619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853235
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52127	NC_011832	AAG	2	6	2811718	2811723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853235
52128	NC_011832	GGC	2	6	2811727	2811732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853235
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52130	NC_011832	TCG	2	6	2811779	2811784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853235
52131	NC_011832	GCCTCT	2	12	2811866	2811877	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219853235
52132	NC_011832	CAG	3	9	2811948	2811956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853236
52133	NC_011832	TGC	2	6	2812053	2812058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853236
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52135	NC_011832	CTG	4	12	2812187	2812198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853236
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52139	NC_011832	TCT	2	6	2812235	2812240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853237
52140	NC_011832	GAA	2	6	2812292	2812297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853237
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52142	NC_011832	CAA	2	6	2812370	2812375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853237
52143	NC_011832	CGA	2	6	2812390	2812395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853237
52144	NC_011832	GAT	2	6	2812442	2812447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853237
52145	NC_011832	ACC	2	6	2812470	2812475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853237
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52195	NC_011832	CATG	2	8	2815395	2815402	25 %	25 %	25 %	25 %	219853241
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52201	NC_011832	ACC	2	6	2815695	2815700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853241
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52219	NC_011832	ACC	2	6	2816271	2816276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853241
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52222	NC_011832	C	7	7	2816375	2816381	0 %	0 %	0 %	100 %	219853241
52223	NC_011832	ATC	2	6	2816382	2816387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853241
52224	NC_011832	CAC	2	6	2816393	2816398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853241
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52228	NC_011832	GAG	2	6	2816570	2816575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853241
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52230	NC_011832	GTC	2	6	2816610	2816615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853241
52231	NC_011832	GCC	2	6	2816623	2816628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853241
52232	NC_011832	GAA	2	6	2816654	2816659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853241
52233	NC_011832	CAC	2	6	2816755	2816760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853241
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52235	NC_011832	GAT	2	6	2816918	2816923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853241
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52237	NC_011832	GATC	2	8	2817486	2817493	25 %	25 %	25 %	25 %	219853242
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52240	NC_011832	TGCA	2	8	2817649	2817656	25 %	25 %	25 %	25 %	219853242
52241	NC_011832	TCG	2	6	2817657	2817662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853242
52242	NC_011832	GGT	2	6	2817667	2817672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853242
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52253	NC_011832	CTC	2	6	2818228	2818233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853242
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52261	NC_011832	CTG	2	6	2818591	2818596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853242
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52293	NC_011832	TC	4	8	2820251	2820258	0 %	50 %	0 %	50 %	219853244
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52331	NC_011832	AG	3	6	2821949	2821954	50 %	0 %	50 %	0 %	219853247
52332	NC_011832	GAT	2	6	2821955	2821960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853247
52333	NC_011832	TCG	2	6	2821983	2821988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853247
52334	NC_011832	CCGA	2	8	2821992	2821999	25 %	0 %	25 %	50 %	219853247
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52339	NC_011832	GGGA	2	8	2822401	2822408	25 %	0 %	75 %	0 %	219853247
52340	NC_011832	TCG	2	6	2822413	2822418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853247
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52342	NC_011832	TCC	2	6	2822431	2822436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853247
52343	NC_011832	CGA	2	6	2822440	2822445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853247
52344	NC_011832	CGA	2	6	2822533	2822538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853247
52345	NC_011832	GCA	2	6	2822578	2822583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853247
52346	NC_011832	CACTGC	2	12	2822594	2822605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219853247
52347	NC_011832	CACC	2	8	2822606	2822613	25 %	0 %	0 %	75 %	219853248
52348	NC_011832	AGA	2	6	2822626	2822631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853248
52349	NC_011832	GCCC	2	8	2822666	2822673	0 %	0 %	25 %	75 %	219853248
52350	NC_011832	TGT	2	6	2822723	2822728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853248
52351	NC_011832	TCT	2	6	2822780	2822785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853248
52352	NC_011832	AGG	2	6	2822872	2822877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853248
52353	NC_011832	TCG	2	6	2822905	2822910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853248
52354	NC_011832	GAG	2	6	2822914	2822919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853248
52355	NC_011832	CCG	2	6	2823008	2823013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853248
52356	NC_011832	ATC	2	6	2823061	2823066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853248
52357	NC_011832	GCA	2	6	2823080	2823085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853248
52358	NC_011832	CGCAT	2	10	2823093	2823102	20 %	20 %	20 %	40 %	219853248
52359	NC_011832	AGGG	2	8	2823124	2823131	25 %	0 %	75 %	0 %	219853248
52360	NC_011832	TCG	2	6	2823133	2823138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853248
52361	NC_011832	CCTTC	2	10	2823177	2823186	0 %	40 %	0 %	60 %	219853248
52362	NC_011832	ACCC	2	8	2823290	2823297	25 %	0 %	0 %	75 %	219853248
52363	NC_011832	CAT	2	6	2823414	2823419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853248
52364	NC_011832	GCC	2	6	2823565	2823570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853248
52365	NC_011832	TCT	2	6	2823596	2823601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853248
52366	NC_011832	CCT	2	6	2823680	2823685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853248
52367	NC_011832	CGC	2	6	2823696	2823701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853248
52368	NC_011832	GAGT	2	8	2823762	2823769	25 %	25 %	50 %	0 %	219853248
52369	NC_011832	TATCGA	2	12	2823851	2823862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219853248
52370	NC_011832	GAG	2	6	2823950	2823955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853249
52371	NC_011832	GGC	2	6	2823959	2823964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853249
52372	NC_011832	GGAAA	2	10	2823992	2824001	60 %	0 %	40 %	0 %	219853249
52373	NC_011832	CCT	2	6	2824027	2824032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853249
52374	NC_011832	CTC	2	6	2824088	2824093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853249
52375	NC_011832	ATC	2	6	2824095	2824100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853249
52376	NC_011832	CTT	2	6	2824133	2824138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853249
52377	NC_011832	C	7	7	2824177	2824183	0 %	0 %	0 %	100 %	219853249
52378	NC_011832	CCTG	2	8	2824234	2824241	0 %	25 %	25 %	50 %	219853249
52379	NC_011832	CAC	2	6	2824309	2824314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853249
52380	NC_011832	CTT	2	6	2824373	2824378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853249
52381	NC_011832	GAT	2	6	2824379	2824384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853249
52382	NC_011832	AGC	2	6	2824425	2824430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853249
52383	NC_011832	CTGGCT	2	12	2824454	2824465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853249
52384	NC_011832	CCGA	2	8	2824535	2824542	25 %	0 %	25 %	50 %	219853249
52385	NC_011832	CAC	2	6	2824556	2824561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853249
52386	NC_011832	GA	3	6	2824563	2824568	50 %	0 %	50 %	0 %	219853249
52387	NC_011832	CCG	2	6	2824583	2824588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853249
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52390	NC_011832	GTC	2	6	2824659	2824664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853249
52391	NC_011832	CCTG	2	8	2824678	2824685	0 %	25 %	25 %	50 %	219853249
52392	NC_011832	CGG	3	9	2824761	2824769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853249
52393	NC_011832	CT	3	6	2824772	2824777	0 %	50 %	0 %	50 %	219853249
52394	NC_011832	CGT	2	6	2824822	2824827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853249
52395	NC_011832	TGA	2	6	2824852	2824857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853249
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52397	NC_011832	ATC	2	6	2824983	2824988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853249
52398	NC_011832	CGGTT	2	10	2825006	2825015	0 %	40 %	40 %	20 %	219853249
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52400	NC_011832	TGT	2	6	2825094	2825099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853249
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52402	NC_011832	GGT	2	6	2825288	2825293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853249
52403	NC_011832	ATC	2	6	2825319	2825324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853249
52404	NC_011832	GAT	2	6	2825378	2825383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853249
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52406	NC_011832	GAT	2	6	2825420	2825425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853249
52407	NC_011832	CAT	2	6	2825441	2825446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853249
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52410	NC_011832	TGA	2	6	2825533	2825538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853249
52411	NC_011832	CAG	2	6	2825573	2825578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853249
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52413	NC_011832	ATC	3	9	2825655	2825663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853249
52414	NC_011832	CGC	2	6	2825681	2825686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853249
52415	NC_011832	GATC	2	8	2825728	2825735	25 %	25 %	25 %	25 %	219853249
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52418	NC_011832	AGC	2	6	2826040	2826045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853250
52419	NC_011832	CGA	2	6	2826048	2826053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853250
52420	NC_011832	ATT	2	6	2826064	2826069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853250
52421	NC_011832	ACA	2	6	2826083	2826088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853250
52422	NC_011832	TCG	2	6	2826095	2826100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853250
52423	NC_011832	CTG	4	12	2826103	2826114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853250
52424	NC_011832	TCC	2	6	2826149	2826154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853250
52425	NC_011832	CAGT	2	8	2826230	2826237	25 %	25 %	25 %	25 %	219853250
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52427	NC_011832	CATC	2	8	2826267	2826274	25 %	25 %	0 %	50 %	219853250
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52429	NC_011832	TC	3	6	2826315	2826320	0 %	50 %	0 %	50 %	219853250
52430	NC_011832	TGC	2	6	2826374	2826379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853250
52431	NC_011832	ATC	2	6	2826446	2826451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853250
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52433	NC_011832	GTT	2	6	2826498	2826503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853250
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52435	NC_011832	ATC	2	6	2826529	2826534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853250
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52442	NC_011832	GCC	2	6	2826909	2826914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853251
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52444	NC_011832	GAT	2	6	2826959	2826964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853251
52445	NC_011832	CCGG	2	8	2826986	2826993	0 %	0 %	50 %	50 %	219853251
52446	NC_011832	ATC	2	6	2827053	2827058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853251
52447	NC_011832	CGG	2	6	2827109	2827114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853251
52448	NC_011832	GAG	2	6	2827126	2827131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853251
52449	NC_011832	CTG	2	6	2827158	2827163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853251
52450	NC_011832	CAC	2	6	2827179	2827184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853251
52451	NC_011832	CAG	2	6	2827209	2827214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853251
52452	NC_011832	GATCAG	2	12	2827280	2827291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853251
52453	NC_011832	CTC	2	6	2827322	2827327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853251
52454	NC_011832	TGT	2	6	2827349	2827354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853251
52455	NC_011832	AG	4	8	2827376	2827383	50 %	0 %	50 %	0 %	219853251
52456	NC_011832	GTC	2	6	2827454	2827459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853251
52457	NC_011832	G	6	6	2827485	2827490	0 %	0 %	100 %	0 %	219853251
52458	NC_011832	CCG	2	6	2827516	2827521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853251
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52460	NC_011832	GAA	2	6	2827557	2827562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853251
52461	NC_011832	GGA	2	6	2827629	2827634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853251
52462	NC_011832	CAG	2	6	2827646	2827651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853251
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52468	NC_011832	CTGA	2	8	2827895	2827902	25 %	25 %	25 %	25 %	219853252
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52484	NC_011832	ATC	2	6	2828697	2828702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853253
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