MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_011832	CGA	2	6	2700094	2700099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853132
50002	NC_011832	ACC	2	6	2700119	2700124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853132
50003	NC_011832	GGA	2	6	2700140	2700145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853133
50004	NC_011832	GAG	2	6	2700181	2700186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853133
50005	NC_011832	CGA	2	6	2700246	2700251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853133
50006	NC_011832	CCCG	2	8	2700261	2700268	0 %	0 %	25 %	75 %	219853133
50007	NC_011832	GCC	2	6	2700307	2700312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853133
50008	NC_011832	CGG	2	6	2700402	2700407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853133
50009	NC_011832	GCC	2	6	2700436	2700441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853133
50010	NC_011832	CGA	2	6	2700468	2700473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853133
50011	NC_011832	TCG	2	6	2700485	2700490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853133
50012	NC_011832	TCCGTT	2	12	2700501	2700512	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219853133
50013	NC_011832	ACA	2	6	2700518	2700523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853133
50014	NC_011832	GTC	2	6	2700535	2700540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853133
50015	NC_011832	TCG	2	6	2700566	2700571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853133
50016	NC_011832	CGA	2	6	2700593	2700598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853133
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50018	NC_011832	G	6	6	2700647	2700652	0 %	0 %	100 %	0 %	219853133
50019	NC_011832	CT	3	6	2700699	2700704	0 %	50 %	0 %	50 %	219853133
50020	NC_011832	GGC	2	6	2700756	2700761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853133
50021	NC_011832	CA	3	6	2700800	2700805	50 %	0 %	0 %	50 %	219853133
50022	NC_011832	CTG	2	6	2700851	2700856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853134
50023	NC_011832	CCGG	2	8	2700882	2700889	0 %	0 %	50 %	50 %	219853134
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50027	NC_011832	CGA	2	6	2701306	2701311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853135
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50032	NC_011832	CCAC	2	8	2701515	2701522	25 %	0 %	0 %	75 %	219853135
50033	NC_011832	GTCG	2	8	2701529	2701536	0 %	25 %	50 %	25 %	219853135
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50042	NC_011832	CGAGGT	2	12	2702000	2702011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219853136
50043	NC_011832	TGC	2	6	2702068	2702073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853136
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50114	NC_011832	TGA	2	6	2705288	2705293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853139
50115	NC_011832	CGC	2	6	2705319	2705324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853139
50116	NC_011832	TGA	2	6	2705339	2705344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853139
50117	NC_011832	GATCGT	2	12	2705446	2705457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219853140
50118	NC_011832	CCG	2	6	2705514	2705519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853140
50119	NC_011832	GCA	2	6	2705590	2705595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853140
50120	NC_011832	ACC	2	6	2705613	2705618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853140
50121	NC_011832	TACC	2	8	2705656	2705663	25 %	25 %	0 %	50 %	219853140
50122	NC_011832	AGG	2	6	2705664	2705669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853140
50123	NC_011832	GTC	2	6	2705699	2705704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853140
50124	NC_011832	CTC	2	6	2705738	2705743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853140
50125	NC_011832	CTG	2	6	2705768	2705773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853140
50126	NC_011832	GGC	2	6	2705818	2705823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853140
50127	NC_011832	ACCG	2	8	2705861	2705868	25 %	0 %	25 %	50 %	219853140
50128	NC_011832	CCCT	2	8	2705904	2705911	0 %	25 %	0 %	75 %	219853140
50129	NC_011832	TGA	2	6	2705998	2706003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853140
50130	NC_011832	AGC	2	6	2706027	2706032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853140
50131	NC_011832	GAA	2	6	2706102	2706107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853141
50132	NC_011832	CTG	2	6	2706121	2706126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853141
50133	NC_011832	CCT	2	6	2706204	2706209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853141
50134	NC_011832	TCC	3	9	2706269	2706277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853141
50135	NC_011832	A	7	7	2706312	2706318	100 %	0 %	0 %	0 %	219853141
50136	NC_011832	AGGT	2	8	2706341	2706348	25 %	25 %	50 %	0 %	219853142
50137	NC_011832	CTG	2	6	2706353	2706358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853142
50138	NC_011832	TCG	2	6	2706379	2706384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853142
50139	NC_011832	TGA	2	6	2706452	2706457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853142
50140	NC_011832	GT	3	6	2706706	2706711	0 %	50 %	50 %	0 %	219853143
50141	NC_011832	GA	3	6	2706727	2706732	50 %	0 %	50 %	0 %	219853143
50142	NC_011832	CTC	2	6	2706764	2706769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853143
50143	NC_011832	CCT	2	6	2706784	2706789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853143
50144	NC_011832	TGTGGA	2	12	2706805	2706816	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219853143
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50146	NC_011832	CGG	2	6	2706962	2706967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853143
50147	NC_011832	GGAA	2	8	2707047	2707054	50 %	0 %	50 %	0 %	219853143
50148	NC_011832	GCC	2	6	2707089	2707094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853143
50149	NC_011832	CGGC	2	8	2707102	2707109	0 %	0 %	50 %	50 %	219853143
50150	NC_011832	GCT	2	6	2707210	2707215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853143
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50154	NC_011832	ATC	2	6	2707495	2707500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853144
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50156	NC_011832	ATC	2	6	2707513	2707518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853144
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50188	NC_011832	CTG	2	6	2709174	2709179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853145
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50214	NC_011832	GAC	2	6	2710340	2710345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853146
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50216	NC_011832	CCGG	2	8	2710380	2710387	0 %	0 %	50 %	50 %	219853146
50217	NC_011832	CCG	2	6	2710413	2710418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853146
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50221	NC_011832	GGA	2	6	2710510	2710515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853146
50222	NC_011832	GAC	2	6	2710556	2710561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853146
50223	NC_011832	ACC	2	6	2710596	2710601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853146
50224	NC_011832	GAG	2	6	2710650	2710655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853146
50225	NC_011832	GCTCT	2	10	2710682	2710691	0 %	40 %	20 %	40 %	219853146
50226	NC_011832	TCA	2	6	2710693	2710698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853146
50227	NC_011832	AGC	2	6	2710704	2710709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853146
50228	NC_011832	AAT	2	6	2710772	2710777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853147
50229	NC_011832	CTG	2	6	2710848	2710853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853147
50230	NC_011832	TTAT	2	8	2710920	2710927	25 %	75 %	0 %	0 %	219853147
50231	NC_011832	CAGC	2	8	2710991	2710998	25 %	0 %	25 %	50 %	219853147
50232	NC_011832	TGA	2	6	2711014	2711019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853148
50233	NC_011832	GGAT	2	8	2711174	2711181	25 %	25 %	50 %	0 %	219853148
50234	NC_011832	TGT	2	6	2711207	2711212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853148
50235	NC_011832	GAC	2	6	2711259	2711264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853148
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50334	NC_011832	ATC	2	6	2715906	2715911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853151
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50337	NC_011832	GAT	2	6	2716013	2716018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853151
50338	NC_011832	G	8	8	2716034	2716041	0 %	0 %	100 %	0 %	219853151
50339	NC_011832	GAT	2	6	2716043	2716048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853151
50340	NC_011832	GGCGA	2	10	2716083	2716092	20 %	0 %	60 %	20 %	219853151
50341	NC_011832	GATCT	2	10	2716308	2716317	20 %	40 %	20 %	20 %	219853151
50342	NC_011832	AGA	2	6	2716334	2716339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853151
50343	NC_011832	CGTCAG	2	12	2716358	2716369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219853152
50344	NC_011832	GAC	2	6	2716451	2716456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853152
50345	NC_011832	GCC	2	6	2716724	2716729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853153
50346	NC_011832	C	8	8	2716866	2716873	0 %	0 %	0 %	100 %	219853154
50347	NC_011832	CCGT	2	8	2716900	2716907	0 %	25 %	25 %	50 %	219853154
50348	NC_011832	GTC	2	6	2716916	2716921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853154
50349	NC_011832	ACGA	2	8	2716940	2716947	50 %	0 %	25 %	25 %	219853154
50350	NC_011832	CAGG	2	8	2716951	2716958	25 %	0 %	50 %	25 %	219853154
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50352	NC_011832	GCA	2	6	2716972	2716977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853154
50353	NC_011832	GCT	2	6	2716983	2716988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853154
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50392	NC_011832	CCT	2	6	2718653	2718658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853155
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50452	NC_011832	TCG	2	6	2721365	2721370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853156
50453	NC_011832	TC	3	6	2721413	2721418	0 %	50 %	0 %	50 %	219853156
50454	NC_011832	TAT	2	6	2721472	2721477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853156
50455	NC_011832	G	6	6	2721522	2721527	0 %	0 %	100 %	0 %	219853156
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50457	NC_011832	G	7	7	2721561	2721567	0 %	0 %	100 %	0 %	219853156
50458	NC_011832	GCG	2	6	2721571	2721576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853156
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50460	NC_011832	TGA	2	6	2721587	2721592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853156
50461	NC_011832	CGCCGG	2	12	2721607	2721618	0 %	0 %	50 %	50 %	219853156
50462	NC_011832	AGA	2	6	2721653	2721658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853157
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50464	NC_011832	ATC	2	6	2721750	2721755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853157
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50466	NC_011832	CTG	2	6	2721828	2721833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853157
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50471	NC_011832	AGCGT	2	10	2722081	2722090	20 %	20 %	40 %	20 %	219853158
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50482	NC_011832	GAG	2	6	2722548	2722553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853159
50483	NC_011832	ATC	2	6	2722560	2722565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853159
50484	NC_011832	GAAA	2	8	2722588	2722595	75 %	0 %	25 %	0 %	219853159
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50492	NC_011832	TGA	2	6	2722853	2722858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853160
50493	NC_011832	CAG	2	6	2722870	2722875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853160
50494	NC_011832	TCCC	2	8	2722887	2722894	0 %	25 %	0 %	75 %	219853160
50495	NC_011832	AAGG	2	8	2722927	2722934	50 %	0 %	50 %	0 %	219853160
50496	NC_011832	TCC	2	6	2722952	2722957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853160
50497	NC_011832	CAC	2	6	2723050	2723055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853160
50498	NC_011832	GT	3	6	2723092	2723097	0 %	50 %	50 %	0 %	219853160
50499	NC_011832	CTC	2	6	2723105	2723110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853160
50500	NC_011832	TCG	2	6	2723114	2723119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853160

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