MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011832	CGC	2	6	218271	218276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850867
4502	NC_011832	GAA	2	6	218433	218438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850868
4503	NC_011832	CCG	2	6	218471	218476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850868
4504	NC_011832	GGT	2	6	218483	218488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850868
4505	NC_011832	CCG	2	6	218575	218580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850868
4506	NC_011832	TCT	2	6	218679	218684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850868
4507	NC_011832	CCGA	2	8	218734	218741	25 %	0 %	25 %	50 %	219850868
4508	NC_011832	GAGATC	2	12	218755	218766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850868
4509	NC_011832	TCG	2	6	218830	218835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850868
4510	NC_011832	GCG	2	6	219051	219056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850868
4511	NC_011832	C	6	6	219089	219094	0 %	0 %	0 %	100 %	219850868
4512	NC_011832	AAG	2	6	219136	219141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850868
4513	NC_011832	TGG	2	6	219150	219155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850868
4514	NC_011832	GCA	2	6	219169	219174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850868
4515	NC_011832	GAT	2	6	219219	219224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850868
4516	NC_011832	GGT	2	6	219255	219260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850868
4517	NC_011832	GCTG	2	8	219261	219268	0 %	25 %	50 %	25 %	219850868
4518	NC_011832	GAT	2	6	219333	219338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850868
4519	NC_011832	TTC	2	6	219397	219402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850868
4520	NC_011832	CTGG	2	8	219405	219412	0 %	25 %	50 %	25 %	219850868
4521	NC_011832	C	7	7	219577	219583	0 %	0 %	0 %	100 %	219850868
4522	NC_011832	ATT	2	6	220795	220800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850869
4523	NC_011832	CA	3	6	220880	220885	50 %	0 %	0 %	50 %	219850869
4524	NC_011832	T	6	6	220891	220896	0 %	100 %	0 %	0 %	219850869
4525	NC_011832	ACA	2	6	220917	220922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850869
4526	NC_011832	GCA	2	6	220943	220948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850869
4527	NC_011832	CT	3	6	220957	220962	0 %	50 %	0 %	50 %	219850869
4528	NC_011832	TGGA	2	8	221117	221124	25 %	25 %	50 %	0 %	219850869
4529	NC_011832	GAT	2	6	221161	221166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850869
4530	NC_011832	TA	3	6	221340	221345	50 %	50 %	0 %	0 %	219850869
4531	NC_011832	TTG	2	6	221388	221393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850869
4532	NC_011832	T	8	8	221442	221449	0 %	100 %	0 %	0 %	219850869
4533	NC_011832	CTT	2	6	221454	221459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850869
4534	NC_011832	AT	3	6	221486	221491	50 %	50 %	0 %	0 %	219850869
4535	NC_011832	GA	3	6	221692	221697	50 %	0 %	50 %	0 %	219850870
4536	NC_011832	TG	3	6	221698	221703	0 %	50 %	50 %	0 %	219850870
4537	NC_011832	AGA	2	6	221742	221747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850870
4538	NC_011832	ATC	2	6	221779	221784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850870
4539	NC_011832	TGA	2	6	221808	221813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850870
4540	NC_011832	AATC	2	8	221832	221839	50 %	25 %	0 %	25 %	219850870
4541	NC_011832	GAA	2	6	221846	221851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850870
4542	NC_011832	TCATCT	2	12	221877	221888	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219850870
4543	NC_011832	TTCC	2	8	221902	221909	0 %	50 %	0 %	50 %	219850870
4544	NC_011832	AGA	2	6	221943	221948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850870
4545	NC_011832	GAA	2	6	221964	221969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850870
4546	NC_011832	ATG	2	6	222032	222037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850870
4547	NC_011832	TC	4	8	222045	222052	0 %	50 %	0 %	50 %	219850870
4548	NC_011832	TGT	2	6	222087	222092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850870
4549	NC_011832	ATAC	2	8	222097	222104	50 %	25 %	0 %	25 %	219850870
4550	NC_011832	TTGA	2	8	222226	222233	25 %	50 %	25 %	0 %	219850870
4551	NC_011832	AAG	2	6	222303	222308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850870
4552	NC_011832	ATG	2	6	222427	222432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850870
4553	NC_011832	CT	3	6	222446	222451	0 %	50 %	0 %	50 %	219850870
4554	NC_011832	TGA	2	6	222501	222506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850870
4555	NC_011832	GA	3	6	222587	222592	50 %	0 %	50 %	0 %	219850870
4556	NC_011832	TG	3	6	222667	222672	0 %	50 %	50 %	0 %	219850870
4557	NC_011832	TCAG	2	8	222785	222792	25 %	25 %	25 %	25 %	219850870
4558	NC_011832	GA	3	6	222918	222923	50 %	0 %	50 %	0 %	219850870
4559	NC_011832	GCT	2	6	222940	222945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850870
4560	NC_011832	GGA	2	6	222961	222966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850870
4561	NC_011832	TGC	2	6	222994	222999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850870
4562	NC_011832	ATGA	2	8	223015	223022	50 %	25 %	25 %	0 %	219850870
4563	NC_011832	CTG	2	6	223088	223093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850870
4564	NC_011832	AAG	2	6	223139	223144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850870
4565	NC_011832	GTT	2	6	223201	223206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850870
4566	NC_011832	GCAG	2	8	223222	223229	25 %	0 %	50 %	25 %	219850870
4567	NC_011832	CTCCGG	2	12	223366	223377	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219850871
4568	NC_011832	TTC	3	9	223381	223389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850871
4569	NC_011832	GGCA	2	8	223434	223441	25 %	0 %	50 %	25 %	219850871
4570	NC_011832	ACG	2	6	223489	223494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850871
4571	NC_011832	ATC	2	6	223498	223503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850871
4572	NC_011832	GCA	2	6	223514	223519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850871
4573	NC_011832	ACGC	2	8	223536	223543	25 %	0 %	25 %	50 %	219850871
4574	NC_011832	TTCGG	2	10	223637	223646	0 %	40 %	40 %	20 %	219850871
4575	NC_011832	TC	3	6	223669	223674	0 %	50 %	0 %	50 %	219850871
4576	NC_011832	CTCTT	2	10	223714	223723	0 %	60 %	0 %	40 %	219850871
4577	NC_011832	TTC	2	6	223744	223749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850871
4578	NC_011832	CAC	2	6	223794	223799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850871
4579	NC_011832	TCATCG	2	12	223841	223852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219850871
4580	NC_011832	CT	4	8	223878	223885	0 %	50 %	0 %	50 %	219850871
4581	NC_011832	GCA	2	6	223912	223917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850871
4582	NC_011832	AGGAC	2	10	223943	223952	40 %	0 %	40 %	20 %	219850871
4583	NC_011832	GTG	2	6	224022	224027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850871
4584	NC_011832	GAT	2	6	224552	224557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850872
4585	NC_011832	CGGG	2	8	224668	224675	0 %	0 %	75 %	25 %	219850872
4586	NC_011832	CCG	2	6	224817	224822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850872
4587	NC_011832	CTT	2	6	224843	224848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850872
4588	NC_011832	ACG	2	6	224892	224897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850872
4589	NC_011832	CTG	2	6	225656	225661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850873
4590	NC_011832	AGAT	2	8	225676	225683	50 %	25 %	25 %	0 %	219850873
4591	NC_011832	TCG	2	6	225727	225732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850873
4592	NC_011832	CA	3	6	225870	225875	50 %	0 %	0 %	50 %	219850873
4593	NC_011832	CTT	2	6	225954	225959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850873
4594	NC_011832	CA	3	6	225972	225977	50 %	0 %	0 %	50 %	219850873
4595	NC_011832	GCC	2	6	226162	226167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850873
4596	NC_011832	CGA	2	6	226235	226240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850873
4597	NC_011832	TGCC	2	8	226250	226257	0 %	25 %	25 %	50 %	219850873
4598	NC_011832	CTG	2	6	226283	226288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850873
4599	NC_011832	CCG	2	6	226323	226328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850873
4600	NC_011832	CTC	3	9	226353	226361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850873
4601	NC_011832	GAT	2	6	226404	226409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850873
4602	NC_011832	TCC	2	6	226429	226434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850873
4603	NC_011832	TCT	2	6	226466	226471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850873
4604	NC_011832	ATC	2	6	226474	226479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850873
4605	NC_011832	ACC	2	6	226506	226511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850873
4606	NC_011832	ATC	2	6	226525	226530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850873
4607	NC_011832	CATGGC	2	12	226575	226586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219850873
4608	NC_011832	TCT	2	6	226613	226618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850873
4609	NC_011832	CTT	2	6	226641	226646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850873
4610	NC_011832	AGG	2	6	226660	226665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850873
4611	NC_011832	CTT	2	6	226755	226760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850873
4612	NC_011832	CGA	2	6	226778	226783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850873
4613	NC_011832	TCG	2	6	227046	227051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4614	NC_011832	GAG	2	6	227093	227098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850874
4615	NC_011832	CTG	2	6	227185	227190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4616	NC_011832	TCA	2	6	227239	227244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850874
4617	NC_011832	GAA	2	6	227300	227305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850874
4618	NC_011832	TCT	2	6	227319	227324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850874
4619	NC_011832	GTC	2	6	227456	227461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4620	NC_011832	GGT	3	9	227556	227564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850874
4621	NC_011832	ACC	2	6	227691	227696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850874
4622	NC_011832	TGGT	2	8	227730	227737	0 %	50 %	50 %	0 %	219850874
4623	NC_011832	GAC	2	6	227750	227755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4624	NC_011832	TCG	2	6	227790	227795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4625	NC_011832	GTACC	2	10	227826	227835	20 %	20 %	20 %	40 %	219850874
4626	NC_011832	C	6	6	227854	227859	0 %	0 %	0 %	100 %	219850874
4627	NC_011832	CCT	2	6	227863	227868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850874
4628	NC_011832	TCT	2	6	227872	227877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850874
4629	NC_011832	TGC	2	6	227882	227887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4630	NC_011832	GAT	2	6	228086	228091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850874
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4632	NC_011832	TCT	2	6	228190	228195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850874
4633	NC_011832	CCTT	2	8	228249	228256	0 %	50 %	0 %	50 %	219850874
4634	NC_011832	CAT	2	6	228269	228274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850874
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4636	NC_011832	AGGT	2	8	228315	228322	25 %	25 %	50 %	0 %	219850874
4637	NC_011832	TGG	2	6	228384	228389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850874
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4639	NC_011832	CAT	2	6	228443	228448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850874
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4641	NC_011832	CGAC	2	8	228526	228533	25 %	0 %	25 %	50 %	219850874
4642	NC_011832	GTT	2	6	228566	228571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850874
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4644	NC_011832	CGA	2	6	228730	228735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850874
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4649	NC_011832	GAC	2	6	228881	228886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850874
4650	NC_011832	CAAC	2	8	228900	228907	50 %	0 %	0 %	50 %	219850874
4651	NC_011832	GGT	2	6	228923	228928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850874
4652	NC_011832	TG	3	6	229387	229392	0 %	50 %	50 %	0 %	219850875
4653	NC_011832	CTGCA	2	10	229542	229551	20 %	20 %	20 %	40 %	219850875
4654	NC_011832	CAA	2	6	229559	229564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850875
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4687	NC_011832	ACA	2	6	231096	231101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850876
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4701	NC_011832	AT	4	8	231663	231670	50 %	50 %	0 %	0 %	219850876
4702	NC_011832	ACTC	2	8	231843	231850	25 %	25 %	0 %	50 %	219850876
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4707	NC_011832	CAA	2	6	231995	232000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850876
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4713	NC_011832	GA	3	6	232288	232293	50 %	0 %	50 %	0 %	219850876
4714	NC_011832	CAT	2	6	232295	232300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850876
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4724	NC_011832	CT	3	6	232548	232553	0 %	50 %	0 %	50 %	219850876
4725	NC_011832	AGT	2	6	232584	232589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850876
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4727	NC_011832	TCA	2	6	232878	232883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850877
4728	NC_011832	GTGG	2	8	232952	232959	0 %	25 %	75 %	0 %	219850877
4729	NC_011832	TCC	2	6	232992	232997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850877
4730	NC_011832	CTG	2	6	233012	233017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850877
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4732	NC_011832	ATC	2	6	233219	233224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850877
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4735	NC_011832	GTG	2	6	233314	233319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850877
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4744	NC_011832	ACC	2	6	233979	233984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850878
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4746	NC_011832	TCC	2	6	234024	234029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850878
4747	NC_011832	TTC	2	6	234041	234046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850878
4748	NC_011832	CTC	3	9	234066	234074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850878
4749	NC_011832	G	6	6	234159	234164	0 %	0 %	100 %	0 %	219850878
4750	NC_011832	AGG	2	6	234173	234178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850878
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4752	NC_011832	CGGA	2	8	234203	234210	25 %	0 %	50 %	25 %	219850878
4753	NC_011832	GAG	2	6	234213	234218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850878
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4755	NC_011832	CTGC	2	8	234259	234266	0 %	25 %	25 %	50 %	219850878
4756	NC_011832	CT	3	6	234272	234277	0 %	50 %	0 %	50 %	219850878
4757	NC_011832	CT	4	8	234279	234286	0 %	50 %	0 %	50 %	219850878
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4854	NC_011832	CT	3	6	239110	239115	0 %	50 %	0 %	50 %	219850883
4855	NC_011832	GAGAT	2	10	239124	239133	40 %	20 %	40 %	0 %	219850883
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4858	NC_011832	GCA	2	6	239237	239242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850883
4859	NC_011832	CTGG	2	8	239245	239252	0 %	25 %	50 %	25 %	219850883
4860	NC_011832	CGA	2	6	239268	239273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850883
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4862	NC_011832	TCA	2	6	239313	239318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850883
4863	NC_011832	CCT	3	9	239385	239393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850883
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4865	NC_011832	GAT	2	6	239416	239421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850883
4866	NC_011832	CCTT	2	8	239453	239460	0 %	50 %	0 %	50 %	219850883
4867	NC_011832	G	6	6	239543	239548	0 %	0 %	100 %	0 %	219850883
4868	NC_011832	ATC	2	6	239573	239578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850883
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4986	NC_011832	CCG	2	6	245756	245761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850889
4987	NC_011832	GCTG	2	8	245877	245884	0 %	25 %	50 %	25 %	219850889
4988	NC_011832	GGT	2	6	245940	245945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850889
4989	NC_011832	CAG	3	9	245946	245954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850889
4990	NC_011832	GCT	4	12	245993	246004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850889
4991	NC_011832	TGA	2	6	246005	246010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850889
4992	NC_011832	CAC	2	6	246050	246055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850889
4993	NC_011832	GAG	2	6	246117	246122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850889
4994	NC_011832	TGA	2	6	246148	246153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850889
4995	NC_011832	G	6	6	246200	246205	0 %	0 %	100 %	0 %	219850889
4996	NC_011832	CCT	2	6	246309	246314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850890
4997	NC_011832	CAT	2	6	246327	246332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850890
4998	NC_011832	GAG	2	6	246466	246471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850890
4999	NC_011832	TGGAC	2	10	246513	246522	20 %	20 %	40 %	20 %	219850890
5000	NC_011832	GAG	2	6	246640	246645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850890

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