MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD07

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010504	GCA	2	6	586	591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745635
2	NC_010504	CG	3	6	651	656	0 %	0 %	50 %	50 %	170745635
3	NC_010504	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745635
4	NC_010504	TGG	2	6	937	942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745636
5	NC_010504	CTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745636
6	NC_010504	GGCG	2	8	1202	1209	0 %	0 %	75 %	25 %	170745636
7	NC_010504	GTG	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745636
8	NC_010504	CTG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745636
9	NC_010504	GCC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745636
10	NC_010504	GCTTT	2	10	2410	2419	0 %	60 %	20 %	20 %	170745637
11	NC_010504	CAG	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745637
12	NC_010504	AGG	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745637
13	NC_010504	CAG	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745637
14	NC_010504	TCC	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745637
15	NC_010504	ACG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745637
16	NC_010504	CCG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745637
17	NC_010504	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745637
18	NC_010504	CGG	2	6	2854	2859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745637
19	NC_010504	CAC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745638
20	NC_010504	GAT	2	6	3061	3066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745638
21	NC_010504	CTG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745638
22	NC_010504	CAA	2	6	3116	3121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745638
23	NC_010504	GCC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745638
24	NC_010504	AGC	2	6	3253	3258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745638
25	NC_010504	CCG	2	6	3294	3299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745638
26	NC_010504	GGC	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745638
27	NC_010504	A	6	6	3380	3385	100 %	0 %	0 %	0 %	170745638
28	NC_010504	GCC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745638
29	NC_010504	CCTACC	2	12	3441	3452	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	170745638
30	NC_010504	GCT	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745638
31	NC_010504	TGC	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745638
32	NC_010504	GC	3	6	3528	3533	0 %	0 %	50 %	50 %	170745638
33	NC_010504	CGAT	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	170745638
34	NC_010504	CG	3	6	3678	3683	0 %	0 %	50 %	50 %	170745638
35	NC_010504	CGG	2	6	5171	5176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745639
36	NC_010504	TGG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745639
37	NC_010504	CGG	2	6	5216	5221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745639
38	NC_010504	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745639
39	NC_010504	TGC	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745639
40	NC_010504	ACG	2	6	5332	5337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745639
41	NC_010504	GCT	2	6	5359	5364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745639
42	NC_010504	GGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745639
43	NC_010504	GTT	3	9	5526	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170745639
44	NC_010504	TCT	2	6	5604	5609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745639
45	NC_010504	CTG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745639
46	NC_010504	CGGA	2	8	5623	5630	25 %	0 %	50 %	25 %	170745639
47	NC_010504	CAG	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745639
48	NC_010504	AGC	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745639
49	NC_010504	GAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745639
50	NC_010504	GAGG	2	8	5740	5747	25 %	0 %	75 %	0 %	170745639
51	NC_010504	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745639
52	NC_010504	CCCTG	2	10	5867	5876	0 %	20 %	20 %	60 %	170745639
53	NC_010504	CGG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745639
54	NC_010504	GAG	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745640
55	NC_010504	GTG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745640
56	NC_010504	GC	3	6	6493	6498	0 %	0 %	50 %	50 %	170745640
57	NC_010504	GCG	2	6	6504	6509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745640
58	NC_010504	GTG	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745640
59	NC_010504	GGC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745640
60	NC_010504	CGG	2	6	6623	6628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745640
61	NC_010504	TGG	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745640
62	NC_010504	CGG	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745640
63	NC_010504	GTC	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745640
64	NC_010504	CCG	2	6	6735	6740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745640
65	NC_010504	TCG	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745640
66	NC_010504	CCG	2	6	6775	6780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745640
67	NC_010504	GTCTG	2	10	6806	6815	0 %	40 %	40 %	20 %	170745640
68	NC_010504	CGC	2	6	6821	6826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745640
69	NC_010504	CGC	3	9	6830	6838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745640
70	NC_010504	GC	3	6	6842	6847	0 %	0 %	50 %	50 %	170745640
71	NC_010504	GAT	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745641
72	NC_010504	AGG	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745641
73	NC_010504	AGG	2	6	6948	6953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745641
74	NC_010504	GCCG	2	8	6955	6962	0 %	0 %	50 %	50 %	170745641
75	NC_010504	CCG	2	6	6971	6976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745641
76	NC_010504	CGC	2	6	7008	7013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745641
77	NC_010504	GGC	2	6	7027	7032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745641
78	NC_010504	GCC	2	6	7063	7068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745641
79	NC_010504	CAGC	2	8	7076	7083	25 %	0 %	25 %	50 %	170745641
80	NC_010504	CCA	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745641
81	NC_010504	CCG	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745641
82	NC_010504	CCG	2	6	7195	7200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745641
83	NC_010504	CTT	2	6	7389	7394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745642
84	NC_010504	TCAG	2	8	7421	7428	25 %	25 %	25 %	25 %	170745642
85	NC_010504	GAG	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745642
86	NC_010504	TCCAT	2	10	7531	7540	20 %	40 %	0 %	40 %	170745642
87	NC_010504	GTC	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
88	NC_010504	TGC	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
89	NC_010504	TCT	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170745642
90	NC_010504	CAC	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745642
91	NC_010504	GGCC	2	8	7757	7764	0 %	0 %	50 %	50 %	170745642
92	NC_010504	GTTC	2	8	7776	7783	0 %	50 %	25 %	25 %	170745642
93	NC_010504	TCG	2	6	7880	7885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
94	NC_010504	GAC	2	6	7948	7953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
95	NC_010504	TGC	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
96	NC_010504	GAG	2	6	8056	8061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745642
97	NC_010504	TGA	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
98	NC_010504	CCCG	2	8	8158	8165	0 %	0 %	25 %	75 %	170745642
99	NC_010504	CG	3	6	8234	8239	0 %	0 %	50 %	50 %	170745642
100	NC_010504	GC	3	6	8280	8285	0 %	0 %	50 %	50 %	170745642
101	NC_010504	CAT	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745642
102	NC_010504	CCTG	2	8	8324	8331	0 %	25 %	25 %	50 %	170745642
103	NC_010504	TCA	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745642
104	NC_010504	AGC	2	6	8381	8386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
105	NC_010504	TGC	2	6	8408	8413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
106	NC_010504	AAG	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170745642
107	NC_010504	GGC	2	6	8464	8469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745642
108	NC_010504	CCT	2	6	8613	8618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745642
109	NC_010504	GCT	2	6	8639	8644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
110	NC_010504	CG	3	6	8646	8651	0 %	0 %	50 %	50 %	170745642
111	NC_010504	ATG	2	6	8663	8668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
112	NC_010504	GCG	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745642
113	NC_010504	GAC	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
114	NC_010504	CCT	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745642
115	NC_010504	CGTG	2	8	8821	8828	0 %	25 %	50 %	25 %	170745642
116	NC_010504	CAGC	2	8	8985	8992	25 %	0 %	25 %	50 %	170745642
117	NC_010504	TGC	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
118	NC_010504	GGT	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745642
119	NC_010504	GCA	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
120	NC_010504	GCT	2	6	9159	9164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
121	NC_010504	CAG	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
122	NC_010504	TG	3	6	9227	9232	0 %	50 %	50 %	0 %	170745642
123	NC_010504	AGCC	2	8	9310	9317	25 %	0 %	25 %	50 %	170745642
124	NC_010504	GAG	2	6	9322	9327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745642
125	NC_010504	GC	3	6	9335	9340	0 %	0 %	50 %	50 %	170745642
126	NC_010504	GCA	2	6	9372	9377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
127	NC_010504	GTCG	2	8	9412	9419	0 %	25 %	50 %	25 %	170745642
128	NC_010504	ACAGC	2	10	9447	9456	40 %	0 %	20 %	40 %	170745642
129	NC_010504	TCA	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745642
130	NC_010504	GTG	2	6	9537	9542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745642
131	NC_010504	CGC	2	6	9758	9763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745642
132	NC_010504	TC	3	6	9855	9860	0 %	50 %	0 %	50 %	170745642
133	NC_010504	AGC	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
134	NC_010504	GC	3	6	9879	9884	0 %	0 %	50 %	50 %	170745642
135	NC_010504	GAT	2	6	9895	9900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
136	NC_010504	GAAGT	2	10	9903	9912	40 %	20 %	40 %	0 %	170745642
137	NC_010504	GCGCT	2	10	9920	9929	0 %	20 %	40 %	40 %	170745642
138	NC_010504	CGT	2	6	9983	9988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745642
139	NC_010504	TGCG	2	8	10017	10024	0 %	25 %	50 %	25 %	170745642
140	NC_010504	TCC	2	6	10027	10032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745642
141	NC_010504	GA	3	6	10065	10070	50 %	0 %	50 %	0 %	170745642
142	NC_010504	TGA	2	6	10114	10119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
143	NC_010504	TCA	2	6	10154	10159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745642
144	NC_010504	GAGGC	2	10	10298	10307	20 %	0 %	60 %	20 %	170745642
145	NC_010504	ACC	2	6	10310	10315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745642
146	NC_010504	ACG	2	6	10356	10361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
147	NC_010504	CAA	2	6	10437	10442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170745642
148	NC_010504	CCGT	2	8	10493	10500	0 %	25 %	25 %	50 %	170745642
149	NC_010504	TCA	2	6	10553	10558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745642
150	NC_010504	AGG	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745642
151	NC_010504	ACC	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745642
152	NC_010504	GAT	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
153	NC_010504	GCA	2	6	10730	10735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745642
154	NC_010504	CCT	2	6	10752	10757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745642
155	NC_010504	GGT	2	6	10792	10797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170745642
156	NC_010504	TGA	3	9	10812	10820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
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159	NC_010504	GAT	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745642
160	NC_010504	GGA	2	6	10863	10868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745642
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163	NC_010504	CA	3	6	11079	11084	50 %	0 %	0 %	50 %	170745642
164	NC_010504	GC	3	6	11555	11560	0 %	0 %	50 %	50 %	170745643
165	NC_010504	GCG	2	6	11615	11620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745643
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167	NC_010504	GCA	2	6	11734	11739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745643
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244	NC_010504	TCC	2	6	15809	15814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745648
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247	NC_010504	CCT	2	6	15983	15988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745648
248	NC_010504	GAG	2	6	15996	16001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745648
249	NC_010504	CAT	2	6	16043	16048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745648
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251	NC_010504	G	6	6	16139	16144	0 %	0 %	100 %	0 %	170745648
252	NC_010504	CGCA	2	8	16164	16171	25 %	0 %	25 %	50 %	170745648
253	NC_010504	AGCG	2	8	16235	16242	25 %	0 %	50 %	25 %	170745648
254	NC_010504	TCCAG	2	10	16779	16788	20 %	20 %	20 %	40 %	170745649
255	NC_010504	TGC	2	6	16830	16835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745649
256	NC_010504	GCA	2	6	16941	16946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745649
257	NC_010504	GTC	2	6	16958	16963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745649
258	NC_010504	GGTTC	2	10	17022	17031	0 %	40 %	40 %	20 %	170745649
259	NC_010504	TCGCC	2	10	17046	17055	0 %	20 %	20 %	60 %	170745649
260	NC_010504	TGA	2	6	17098	17103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170745649
261	NC_010504	ACCGC	2	10	17207	17216	20 %	0 %	20 %	60 %	170745649
262	NC_010504	GC	3	6	17302	17307	0 %	0 %	50 %	50 %	170745650
263	NC_010504	CTC	3	9	17308	17316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170745650
264	NC_010504	ACCG	2	8	17362	17369	25 %	0 %	25 %	50 %	170745650
265	NC_010504	GCT	2	6	17405	17410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745650
266	NC_010504	GCC	2	6	17441	17446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745650
267	NC_010504	CCTGG	2	10	17454	17463	0 %	20 %	40 %	40 %	170745650
268	NC_010504	ACC	2	6	17468	17473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745650
269	NC_010504	CGG	2	6	17502	17507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745650
270	NC_010504	AGG	2	6	17516	17521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170745650
271	NC_010504	GCAAG	2	10	17561	17570	40 %	0 %	40 %	20 %	170745650
272	NC_010504	CGG	2	6	17644	17649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745650
273	NC_010504	G	6	6	17673	17678	0 %	0 %	100 %	0 %	170745650
274	NC_010504	CGC	2	6	17679	17684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745650
275	NC_010504	GCGA	2	8	17718	17725	25 %	0 %	50 %	25 %	170745650
276	NC_010504	GCC	2	6	17773	17778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745650
277	NC_010504	GCC	2	6	18012	18017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745651
278	NC_010504	TCA	2	6	18052	18057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745651
279	NC_010504	CTG	2	6	18075	18080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745651
280	NC_010504	ACC	2	6	18088	18093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745651
281	NC_010504	AG	3	6	18099	18104	50 %	0 %	50 %	0 %	170745651
282	NC_010504	CACC	2	8	18175	18182	25 %	0 %	0 %	75 %	170745651
283	NC_010504	CCGAGC	2	12	18188	18199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170745651
284	NC_010504	GCT	2	6	18232	18237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170745651
285	NC_010504	GGC	2	6	18248	18253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745651
286	NC_010504	GAGCTT	2	12	18272	18283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170745651
287	NC_010504	GCG	2	6	18288	18293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745651
288	NC_010504	GC	3	6	18327	18332	0 %	0 %	50 %	50 %	170745651
289	NC_010504	CGTC	2	8	18337	18344	0 %	25 %	25 %	50 %	170745651
290	NC_010504	GGCC	2	8	18529	18536	0 %	0 %	50 %	50 %	170745652
291	NC_010504	CGG	2	6	18550	18555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745652
292	NC_010504	CGG	2	6	18636	18641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745652
293	NC_010504	GCCG	2	8	18722	18729	0 %	0 %	50 %	50 %	170745652
294	NC_010504	CG	3	6	18728	18733	0 %	0 %	50 %	50 %	170745652
295	NC_010504	GCG	2	6	18765	18770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745652
296	NC_010504	CGGA	2	8	18958	18965	25 %	0 %	50 %	25 %	170745653
297	NC_010504	AGCG	2	8	19036	19043	25 %	0 %	50 %	25 %	170745653
298	NC_010504	GCC	2	6	19055	19060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170745653
299	NC_010504	CAT	2	6	19141	19146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170745653
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301	NC_010504	CAC	2	6	19318	19323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745653
302	NC_010504	ACGA	2	8	19339	19346	50 %	0 %	25 %	25 %	170745653
303	NC_010504	AGC	2	6	19789	19794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745654
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305	NC_010504	AGC	2	6	19928	19933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170745654
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320	NC_010504	CGG	2	6	20709	20714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170745654
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346	NC_010504	ACC	3	9	22051	22059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170745655
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.