MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens PA1 chromosome

Total Repeats: 122243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010172	GCTC	2	8	47307	47314	0 %	25 %	25 %	50 %	163849496
1002	NC_010172	ATC	2	6	47350	47355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849496
1003	NC_010172	GGA	2	6	47487	47492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849496
1004	NC_010172	CG	3	6	47505	47510	0 %	0 %	50 %	50 %	163849496
1005	NC_010172	CGG	2	6	47523	47528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849496
1006	NC_010172	GCG	2	6	47626	47631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849496
1007	NC_010172	GCC	2	6	47674	47679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849496
1008	NC_010172	TCG	2	6	47681	47686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849496
1009	NC_010172	CGG	2	6	47694	47699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849496
1010	NC_010172	GAA	2	6	47847	47852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849496
1011	NC_010172	ATC	2	6	47855	47860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849496
1012	NC_010172	CGGC	2	8	47869	47876	0 %	0 %	50 %	50 %	163849496
1013	NC_010172	CG	4	8	47892	47899	0 %	0 %	50 %	50 %	163849496
1014	NC_010172	TGG	2	6	47940	47945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849496
1015	NC_010172	GTACCC	2	12	48001	48012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163849496
1016	NC_010172	CGA	2	6	48186	48191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849496
1017	NC_010172	CGA	2	6	48198	48203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849496
1018	NC_010172	GCC	2	6	48313	48318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849496
1019	NC_010172	CGG	2	6	48363	48368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849496
1020	NC_010172	TAA	2	6	48480	48485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163849496
1021	NC_010172	CCA	2	6	48579	48584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849496
1022	NC_010172	GACC	2	8	48612	48619	25 %	0 %	25 %	50 %	163849496
1023	NC_010172	AGT	2	6	48624	48629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849496
1024	NC_010172	GCC	2	6	48632	48637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849496
1025	NC_010172	GCC	2	6	48693	48698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849496
1026	NC_010172	GTA	2	6	48895	48900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849497
1027	NC_010172	GTA	2	6	48940	48945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849497
1028	NC_010172	GCG	3	9	48950	48958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849497
1029	NC_010172	GCC	2	6	49021	49026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1030	NC_010172	CCGAC	2	10	49046	49055	20 %	0 %	20 %	60 %	163849497
1031	NC_010172	GCCG	2	8	49107	49114	0 %	0 %	50 %	50 %	163849497
1032	NC_010172	C	6	6	49131	49136	0 %	0 %	0 %	100 %	163849497
1033	NC_010172	C	6	6	49167	49172	0 %	0 %	0 %	100 %	163849497
1034	NC_010172	GCC	2	6	49179	49184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1035	NC_010172	CCG	2	6	49190	49195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1036	NC_010172	ACC	3	9	49216	49224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849497
1037	NC_010172	CCG	2	6	49238	49243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1038	NC_010172	GCC	4	12	49249	49260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1039	NC_010172	GCC	3	9	49267	49275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1040	NC_010172	ACC	2	6	49276	49281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849497
1041	NC_010172	CG	3	6	49290	49295	0 %	0 %	50 %	50 %	163849497
1042	NC_010172	GCC	2	6	49301	49306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849497
1043	NC_010172	GGC	2	6	49333	49338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849497
1044	NC_010172	ATG	2	6	49639	49644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849498
1045	NC_010172	CGC	2	6	49661	49666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849498
1046	NC_010172	GC	3	6	49665	49670	0 %	0 %	50 %	50 %	163849498
1047	NC_010172	GC	3	6	49724	49729	0 %	0 %	50 %	50 %	163849498
1048	NC_010172	GGA	2	6	49730	49735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849498
1049	NC_010172	TGC	2	6	49736	49741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849498
1050	NC_010172	AAC	2	6	49804	49809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849498
1051	NC_010172	CTC	2	6	50058	50063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849499
1052	NC_010172	TGCC	2	8	50111	50118	0 %	25 %	25 %	50 %	163849499
1053	NC_010172	GCGT	2	8	50131	50138	0 %	25 %	50 %	25 %	163849499
1054	NC_010172	GGC	2	6	50142	50147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849499
1055	NC_010172	GCT	2	6	50246	50251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1056	NC_010172	GCG	2	6	50277	50282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849499
1057	NC_010172	GCG	2	6	50292	50297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849499
1058	NC_010172	TCA	2	6	50324	50329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849499
1059	NC_010172	GC	3	6	50356	50361	0 %	0 %	50 %	50 %	163849499
1060	NC_010172	CGG	2	6	50413	50418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849499
1061	NC_010172	TCC	2	6	50425	50430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849499
1062	NC_010172	GCG	2	6	50436	50441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849499
1063	NC_010172	GAG	2	6	50475	50480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849499
1064	NC_010172	GGC	2	6	50499	50504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849499
1065	NC_010172	CGT	2	6	50553	50558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1066	NC_010172	GCT	2	6	50559	50564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1067	NC_010172	GCA	2	6	50579	50584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1068	NC_010172	TGG	2	6	50662	50667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849499
1069	NC_010172	CGT	2	6	50717	50722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1070	NC_010172	ACC	2	6	50740	50745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849499
1071	NC_010172	GTT	2	6	50811	50816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163849499
1072	NC_010172	CAG	2	6	50820	50825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1073	NC_010172	GAGG	2	8	50838	50845	25 %	0 %	75 %	0 %	163849499
1074	NC_010172	TGG	2	6	50849	50854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849499
1075	NC_010172	GAG	2	6	50868	50873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849499
1076	NC_010172	CGA	2	6	51020	51025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849499
1077	NC_010172	AGC	2	6	51693	51698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849500
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1079	NC_010172	CTG	2	6	51757	51762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849500
1080	NC_010172	CAT	2	6	51766	51771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849500
1081	NC_010172	CCT	2	6	51783	51788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849500
1082	NC_010172	GGC	2	6	51790	51795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849500
1083	NC_010172	CGAGAA	2	12	51813	51824	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	163849500
1084	NC_010172	CGGT	2	8	51837	51844	0 %	25 %	50 %	25 %	163849500
1085	NC_010172	TGC	2	6	51858	51863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849500
1086	NC_010172	CTT	2	6	51931	51936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849500
1087	NC_010172	GCT	2	6	52145	52150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1088	NC_010172	CGC	2	6	52213	52218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849501
1089	NC_010172	GCC	2	6	52291	52296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849501
1090	NC_010172	GCT	2	6	52334	52339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1091	NC_010172	CGT	2	6	52380	52385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1092	NC_010172	CGA	2	6	52402	52407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1093	NC_010172	G	8	8	52418	52425	0 %	0 %	100 %	0 %	163849501
1094	NC_010172	CAGTCG	2	12	52428	52439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1095	NC_010172	AAG	2	6	52660	52665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849501
1096	NC_010172	CT	3	6	52777	52782	0 %	50 %	0 %	50 %	163849501
1097	NC_010172	CGA	2	6	52862	52867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1098	NC_010172	GCC	2	6	52917	52922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849501
1099	NC_010172	AGC	2	6	52954	52959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849501
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1101	NC_010172	CG	3	6	52977	52982	0 %	0 %	50 %	50 %	163849501
1102	NC_010172	CAA	2	6	52988	52993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849501
1103	NC_010172	CGAG	2	8	53048	53055	25 %	0 %	50 %	25 %	163849501
1104	NC_010172	GCC	2	6	53076	53081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849501
1105	NC_010172	CGA	2	6	53144	53149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849501
1106	NC_010172	GA	3	6	53196	53201	50 %	0 %	50 %	0 %	163849501
1107	NC_010172	CGGG	2	8	53237	53244	0 %	0 %	75 %	25 %	163849501
1108	NC_010172	CA	3	6	53251	53256	50 %	0 %	0 %	50 %	163849501
1109	NC_010172	GTC	2	6	53428	53433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849502
1110	NC_010172	GGCCAC	2	12	53456	53467	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163849502
1111	NC_010172	CCAC	2	8	53494	53501	25 %	0 %	0 %	75 %	163849502
1112	NC_010172	GTT	2	6	53502	53507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163849502
1113	NC_010172	CGA	2	6	53509	53514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849502
1114	NC_010172	GGT	2	6	53617	53622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849502
1115	NC_010172	TGC	2	6	53661	53666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849502
1116	NC_010172	GCCA	2	8	54094	54101	25 %	0 %	25 %	50 %	163849503
1117	NC_010172	CGC	2	6	54145	54150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849503
1118	NC_010172	GCC	2	6	54152	54157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849503
1119	NC_010172	GCC	2	6	54174	54179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849503
1120	NC_010172	ACG	2	6	54190	54195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849503
1121	NC_010172	CGG	2	6	54209	54214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849503
1122	NC_010172	CATT	2	8	54259	54266	25 %	50 %	0 %	25 %	163849503
1123	NC_010172	CG	3	6	54268	54273	0 %	0 %	50 %	50 %	163849503
1124	NC_010172	CGA	2	6	54287	54292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849503
1125	NC_010172	TGCG	2	8	54295	54302	0 %	25 %	50 %	25 %	163849503
1126	NC_010172	CTA	2	6	54428	54433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849503
1127	NC_010172	GGA	2	6	54672	54677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849504
1128	NC_010172	TGCAA	2	10	54678	54687	40 %	20 %	20 %	20 %	163849504
1129	NC_010172	GCTG	2	8	54705	54712	0 %	25 %	50 %	25 %	163849504
1130	NC_010172	CCG	2	6	54746	54751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849504
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1133	NC_010172	GGC	2	6	54787	54792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849504
1134	NC_010172	CGG	2	6	54798	54803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849504
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1234	NC_010172	CTCG	2	8	59643	59650	0 %	25 %	25 %	50 %	163849508
1235	NC_010172	CGG	2	6	59817	59822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849508
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1237	NC_010172	GGCC	2	8	59901	59908	0 %	0 %	50 %	50 %	163849508
1238	NC_010172	ATC	2	6	60022	60027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849508
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1242	NC_010172	CGC	2	6	60220	60225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849509
1243	NC_010172	GT	3	6	60236	60241	0 %	50 %	50 %	0 %	163849509
1244	NC_010172	CTG	2	6	60268	60273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849509
1245	NC_010172	GAG	2	6	60340	60345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849509
1246	NC_010172	GGC	2	6	60360	60365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849509
1247	NC_010172	CGC	3	9	60399	60407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849509
1248	NC_010172	GTC	2	6	60418	60423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849509
1249	NC_010172	GAG	2	6	60463	60468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849509
1250	NC_010172	CGCT	2	8	60497	60504	0 %	25 %	25 %	50 %	163849509
1251	NC_010172	TCC	2	6	60542	60547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849509
1252	NC_010172	GGC	2	6	60548	60553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849509
1253	NC_010172	CGT	3	9	60747	60755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849509
1254	NC_010172	TG	3	6	60782	60787	0 %	50 %	50 %	0 %	163849509
1255	NC_010172	GCGG	2	8	60797	60804	0 %	0 %	75 %	25 %	163849509
1256	NC_010172	GTC	2	6	60883	60888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849509
1257	NC_010172	ATG	2	6	60895	60900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849509
1258	NC_010172	GCTCG	2	10	61071	61080	0 %	20 %	40 %	40 %	163849509
1259	NC_010172	TGG	2	6	61082	61087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849509
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1261	NC_010172	CGG	2	6	61122	61127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849509
1262	NC_010172	ACG	2	6	61139	61144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849509
1263	NC_010172	GCC	2	6	61174	61179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849509
1264	NC_010172	CGG	2	6	61202	61207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849509
1265	NC_010172	GGTCC	2	10	61241	61250	0 %	20 %	40 %	40 %	163849509
1266	NC_010172	CGG	2	6	61268	61273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849509
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1272	NC_010172	TCA	2	6	61512	61517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849510
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1275	NC_010172	CGG	2	6	61660	61665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849510
1276	NC_010172	CAA	2	6	61675	61680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849510
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1278	NC_010172	CTT	2	6	61822	61827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849510
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1280	NC_010172	GGC	2	6	63019	63024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849511
1281	NC_010172	GAA	2	6	63044	63049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849511
1282	NC_010172	CGA	2	6	63055	63060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849511
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1284	NC_010172	CGTGGC	2	12	63131	63142	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163849511
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1286	NC_010172	TGA	2	6	63184	63189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849511
1287	NC_010172	GCGAC	2	10	63200	63209	20 %	0 %	40 %	40 %	163849511
1288	NC_010172	GCA	2	6	63214	63219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849511
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1290	NC_010172	CCGT	2	8	63282	63289	0 %	25 %	25 %	50 %	163849511
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1318	NC_010172	CG	4	8	64525	64532	0 %	0 %	50 %	50 %	163849512
1319	NC_010172	GCCGG	2	10	64570	64579	0 %	0 %	60 %	40 %	163849512
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1322	NC_010172	TGCCGT	2	12	64653	64664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849512
1323	NC_010172	AGT	2	6	64701	64706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849512
1324	NC_010172	GCT	3	9	64811	64819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849512
1325	NC_010172	GCT	2	6	65122	65127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849513
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1330	NC_010172	CATGC	2	10	65245	65254	20 %	20 %	20 %	40 %	163849513
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1335	NC_010172	GAT	2	6	65317	65322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849513
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1342	NC_010172	CGACG	2	10	65894	65903	20 %	0 %	40 %	40 %	163849514
1343	NC_010172	ACGCCA	2	12	65910	65921	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	163849514
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1346	NC_010172	GCCT	2	8	65978	65985	0 %	25 %	25 %	50 %	163849514
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1352	NC_010172	AGA	2	6	66159	66164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849514
1353	NC_010172	CAA	2	6	66181	66186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849514
1354	NC_010172	GCT	2	6	66366	66371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849514
1355	NC_010172	ATG	2	6	66372	66377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849514
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1358	NC_010172	GCA	2	6	68854	68859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849515
1359	NC_010172	TGC	2	6	68959	68964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849515
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1361	NC_010172	ATA	2	6	69026	69031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163849515
1362	NC_010172	GCA	2	6	69091	69096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849515
1363	NC_010172	ATC	3	9	69189	69197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849515
1364	NC_010172	GATC	2	8	69244	69251	25 %	25 %	25 %	25 %	163849515
1365	NC_010172	GAA	2	6	69334	69339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849515
1366	NC_010172	GCC	2	6	69401	69406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849515
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1369	NC_010172	GC	3	6	69753	69758	0 %	0 %	50 %	50 %	163849516
1370	NC_010172	ATG	2	6	69824	69829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849516
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1373	NC_010172	AGG	2	6	69894	69899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849516
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1496	NC_010172	AGC	2	6	80002	80007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849524
1497	NC_010172	TGC	2	6	80010	80015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849524
1498	NC_010172	GCA	2	6	80054	80059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849524
1499	NC_010172	TGG	2	6	80071	80076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849524
1500	NC_010172	CGG	2	6	80080	80085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849524

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