MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens PA1 chromosome

Total Repeats: 122243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010172	GCA	2	6	494860	494865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849901
10002	NC_010172	GCGA	2	8	494868	494875	25 %	0 %	50 %	25 %	163849901
10003	NC_010172	GCG	2	6	494941	494946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849901
10004	NC_010172	CAG	2	6	495020	495025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849901
10005	NC_010172	TCAGCG	2	12	495091	495102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163849901
10006	NC_010172	GCC	2	6	495143	495148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849901
10007	NC_010172	CGA	2	6	495203	495208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849901
10008	NC_010172	TCA	2	6	495214	495219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849901
10009	NC_010172	CGT	2	6	495341	495346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849902
10010	NC_010172	CCT	2	6	495392	495397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849902
10011	NC_010172	CGGG	2	8	495402	495409	0 %	0 %	75 %	25 %	163849902
10012	NC_010172	CAT	2	6	495450	495455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849902
10013	NC_010172	TGGC	2	8	495501	495508	0 %	25 %	50 %	25 %	163849902
10014	NC_010172	GAGC	2	8	495632	495639	25 %	0 %	50 %	25 %	163849902
10015	NC_010172	TTG	2	6	495646	495651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163849902
10016	NC_010172	AGT	2	6	495662	495667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849902
10017	NC_010172	AGTTCG	2	12	495926	495937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163849903
10018	NC_010172	GCG	2	6	496033	496038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849903
10019	NC_010172	GCG	2	6	496061	496066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849903
10020	NC_010172	CGT	2	6	496094	496099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849903
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10022	NC_010172	AGT	2	6	496373	496378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849904
10023	NC_010172	GCGG	2	8	496418	496425	0 %	0 %	75 %	25 %	163849904
10024	NC_010172	TGG	2	6	496426	496431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849904
10025	NC_010172	GGCCGA	2	12	496500	496511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163849904
10026	NC_010172	CCGA	2	8	496513	496520	25 %	0 %	25 %	50 %	163849904
10027	NC_010172	CAGGCC	2	12	496527	496538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163849904
10028	NC_010172	GCC	2	6	496546	496551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849904
10029	NC_010172	ATC	2	6	496552	496557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849904
10030	NC_010172	TCG	2	6	496816	496821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849905
10031	NC_010172	GCC	3	9	496824	496832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849905
10032	NC_010172	GGCC	2	8	496835	496842	0 %	0 %	50 %	50 %	163849905
10033	NC_010172	GCC	2	6	496845	496850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849905
10034	NC_010172	GAG	2	6	496863	496868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849905
10035	NC_010172	CGT	2	6	496925	496930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849905
10036	NC_010172	CAC	2	6	496946	496951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849905
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10038	NC_010172	AAGG	2	8	497022	497029	50 %	0 %	50 %	0 %	163849905
10039	NC_010172	CTG	2	6	497030	497035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849905
10040	NC_010172	CTT	2	6	497096	497101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849906
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10042	NC_010172	TGC	2	6	497170	497175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849906
10043	NC_010172	CCGGT	2	10	497205	497214	0 %	20 %	40 %	40 %	163849906
10044	NC_010172	CGG	2	6	497215	497220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849906
10045	NC_010172	TCG	2	6	497223	497228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849906
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10047	NC_010172	CCGC	2	8	497284	497291	0 %	0 %	25 %	75 %	163849906
10048	NC_010172	GCG	2	6	497316	497321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849906
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10051	NC_010172	CTA	2	6	497386	497391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849906
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10053	NC_010172	TCG	2	6	497481	497486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849906
10054	NC_010172	CGAG	2	8	497628	497635	25 %	0 %	50 %	25 %	163849907
10055	NC_010172	GCG	3	9	497702	497710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849907
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10057	NC_010172	TGC	2	6	497783	497788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849907
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10059	NC_010172	GCT	2	6	497806	497811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849907
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10065	NC_010172	TGG	2	6	498102	498107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849907
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10067	NC_010172	GTA	2	6	498178	498183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849907
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10118	NC_010172	TCA	2	6	501264	501269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849910
10119	NC_010172	GTGAG	2	10	501285	501294	20 %	20 %	60 %	0 %	163849910
10120	NC_010172	CGT	2	6	501295	501300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
10121	NC_010172	GCT	2	6	501392	501397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
10122	NC_010172	GC	3	6	501438	501443	0 %	0 %	50 %	50 %	163849910
10123	NC_010172	ACCG	2	8	501466	501473	25 %	0 %	25 %	50 %	163849910
10124	NC_010172	CAT	2	6	501556	501561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849910
10125	NC_010172	GCGT	2	8	501668	501675	0 %	25 %	50 %	25 %	163849910
10126	NC_010172	TGC	2	6	501676	501681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
10127	NC_010172	CGG	2	6	501765	501770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849910
10128	NC_010172	GCCG	2	8	501784	501791	0 %	0 %	50 %	50 %	163849910
10129	NC_010172	CACG	2	8	501816	501823	25 %	0 %	25 %	50 %	163849910
10130	NC_010172	GTG	2	6	501828	501833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849910
10131	NC_010172	TCC	2	6	501845	501850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849910
10132	NC_010172	GCC	2	6	501902	501907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849910
10133	NC_010172	ATGCCG	2	12	501965	501976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163849910
10134	NC_010172	GGT	2	6	502162	502167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849911
10135	NC_010172	TGC	2	6	502244	502249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10136	NC_010172	TCG	3	9	502274	502282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10137	NC_010172	AGG	2	6	502307	502312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849911
10138	NC_010172	GGT	2	6	502350	502355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849911
10139	NC_010172	ATC	2	6	502372	502377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
10140	NC_010172	GTC	2	6	502387	502392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10141	NC_010172	AGC	2	6	502444	502449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10142	NC_010172	ATA	2	6	502492	502497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163849911
10143	NC_010172	CAT	2	6	502512	502517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
10144	NC_010172	CGA	2	6	502523	502528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10145	NC_010172	TGG	2	6	502529	502534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849911
10146	NC_010172	TGC	2	6	502556	502561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10147	NC_010172	ATC	2	6	502564	502569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
10148	NC_010172	GCT	2	6	502578	502583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10149	NC_010172	GTC	3	9	502630	502638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10150	NC_010172	TCG	2	6	502670	502675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10151	NC_010172	TCGC	2	8	502759	502766	0 %	25 %	25 %	50 %	163849911
10152	NC_010172	TCG	2	6	502805	502810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10153	NC_010172	TCA	2	6	502853	502858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
10154	NC_010172	ATG	2	6	502933	502938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849911
10155	NC_010172	GGCTG	2	10	502952	502961	0 %	20 %	60 %	20 %	163849911
10156	NC_010172	TGT	2	6	502971	502976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163849911
10157	NC_010172	GGC	2	6	503040	503045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849911
10158	NC_010172	TCG	2	6	503051	503056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10159	NC_010172	CCA	2	6	503063	503068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849911
10160	NC_010172	TCG	2	6	503096	503101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10161	NC_010172	TGC	3	9	503111	503119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
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10164	NC_010172	TGC	3	9	503216	503224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
10165	NC_010172	ATGA	2	8	503242	503249	50 %	25 %	25 %	0 %	163849911
10166	NC_010172	CCA	2	6	503288	503293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163849911
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10169	NC_010172	TCG	2	6	503595	503600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849912
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10172	NC_010172	GGC	2	6	503678	503683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
10173	NC_010172	ATG	2	6	503786	503791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849912
10174	NC_010172	CGG	2	6	503806	503811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
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10183	NC_010172	GAG	2	6	504212	504217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849912
10184	NC_010172	GCAG	2	8	504244	504251	25 %	0 %	50 %	25 %	163849912
10185	NC_010172	CGG	2	6	504334	504339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
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10188	NC_010172	CGG	2	6	504492	504497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
10189	NC_010172	GCCTGG	2	12	504498	504509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163849912
10190	NC_010172	CGG	2	6	504547	504552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
10191	NC_010172	CGA	2	6	504806	504811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849913
10192	NC_010172	GGT	2	6	504827	504832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849913
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10196	NC_010172	CT	4	8	504929	504936	0 %	50 %	0 %	50 %	163849913
10197	NC_010172	CCG	2	6	505088	505093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849913
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10200	NC_010172	ATC	2	6	505278	505283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849913
10201	NC_010172	TCA	2	6	505324	505329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849913
10202	NC_010172	CAT	2	6	505346	505351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849913
10203	NC_010172	TGC	2	6	505357	505362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849913
10204	NC_010172	AGGC	2	8	505382	505389	25 %	0 %	50 %	25 %	163849913
10205	NC_010172	CTG	2	6	505508	505513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849914
10206	NC_010172	CAGC	2	8	505580	505587	25 %	0 %	25 %	50 %	163849914
10207	NC_010172	CTT	2	6	505600	505605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849914
10208	NC_010172	GGC	2	6	505606	505611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849914
10209	NC_010172	CGG	2	6	505642	505647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849914
10210	NC_010172	CA	3	6	505660	505665	50 %	0 %	0 %	50 %	163849914
10211	NC_010172	GCT	2	6	505681	505686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849914
10212	NC_010172	GCCG	2	8	505768	505775	0 %	0 %	50 %	50 %	163849914
10213	NC_010172	GAA	2	6	505793	505798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849914
10214	NC_010172	GCG	2	6	505811	505816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849914
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10216	NC_010172	TGGG	2	8	505873	505880	0 %	25 %	75 %	0 %	163849914
10217	NC_010172	AAC	2	6	506055	506060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849915
10218	NC_010172	ACG	2	6	506152	506157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
10219	NC_010172	GGGTGA	2	12	506219	506230	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	163849915
10220	NC_010172	CGA	2	6	506255	506260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
10221	NC_010172	GCT	2	6	506290	506295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849915
10222	NC_010172	GCC	2	6	506405	506410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849915
10223	NC_010172	ACG	2	6	506440	506445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
10224	NC_010172	CGG	2	6	506561	506566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849915
10225	NC_010172	GAC	2	6	506607	506612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
10226	NC_010172	TGC	2	6	506633	506638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849915
10227	NC_010172	ATG	2	6	506820	506825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163849916
10228	NC_010172	GCTC	2	8	506868	506875	0 %	25 %	25 %	50 %	163849916
10229	NC_010172	CTCGC	2	10	506885	506894	0 %	20 %	20 %	60 %	163849916
10230	NC_010172	GC	3	6	506934	506939	0 %	0 %	50 %	50 %	163849916
10231	NC_010172	GAC	2	6	507002	507007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849916
10232	NC_010172	CGT	2	6	507105	507110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849916
10233	NC_010172	CAGC	2	8	507166	507173	25 %	0 %	25 %	50 %	163849916
10234	NC_010172	GCTAC	2	10	507208	507217	20 %	20 %	20 %	40 %	163849916
10235	NC_010172	CGG	2	6	507313	507318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849916
10236	NC_010172	CGG	2	6	507368	507373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849916
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10353	NC_010172	TCGAGG	2	12	513913	513924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163849919
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10473	NC_010172	GCT	2	6	524151	524156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849925
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10475	NC_010172	CGAC	2	8	524357	524364	25 %	0 %	25 %	50 %	163849925
10476	NC_010172	CTTC	2	8	524434	524441	0 %	50 %	0 %	50 %	163849925
10477	NC_010172	CGTC	2	8	524445	524452	0 %	25 %	25 %	50 %	163849925
10478	NC_010172	ACG	2	6	524948	524953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849926
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10480	NC_010172	ACG	2	6	525032	525037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849926
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10484	NC_010172	CTG	2	6	525158	525163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849926
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10497	NC_010172	CGA	2	6	525946	525951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849926
10498	NC_010172	CT	3	6	525979	525984	0 %	50 %	0 %	50 %	163849926
10499	NC_010172	CGGG	2	8	526011	526018	0 %	0 %	75 %	25 %	163849926
10500	NC_010172	CGAT	2	8	526061	526068	25 %	25 %	25 %	25 %	163849926

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