MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 40016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_009712	CAC	2	6	2233124	2233129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151700
35003	NC_009712	GCAA	2	8	2233140	2233147	50 %	0 %	25 %	25 %	154151700
35004	NC_009712	GCA	2	6	2233160	2233165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151700
35005	NC_009712	AACA	2	8	2233184	2233191	75 %	0 %	0 %	25 %	154151700
35006	NC_009712	CCA	2	6	2233207	2233212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151700
35007	NC_009712	GAATG	2	10	2233263	2233272	40 %	20 %	40 %	0 %	154151700
35008	NC_009712	CAC	2	6	2233304	2233309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151700
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35011	NC_009712	AAT	2	6	2233383	2233388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151700
35012	NC_009712	TC	3	6	2233463	2233468	0 %	50 %	0 %	50 %	154151700
35013	NC_009712	AAC	2	6	2233509	2233514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151700
35014	NC_009712	AAT	2	6	2233515	2233520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151700
35015	NC_009712	GCA	2	6	2233548	2233553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151700
35016	NC_009712	TAT	2	6	2233572	2233577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151700
35017	NC_009712	ATT	2	6	2233664	2233669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151700
35018	NC_009712	GGCT	2	8	2233840	2233847	0 %	25 %	50 %	25 %	154151701
35019	NC_009712	T	6	6	2233876	2233881	0 %	100 %	0 %	0 %	154151701
35020	NC_009712	CTT	2	6	2233936	2233941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151701
35021	NC_009712	GCA	2	6	2233942	2233947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151701
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35024	NC_009712	CCCG	2	8	2234405	2234412	0 %	0 %	25 %	75 %	154151702
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35031	NC_009712	TGA	2	6	2234801	2234806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151703
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35033	NC_009712	TCA	2	6	2234857	2234862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151703
35034	NC_009712	TGG	2	6	2234971	2234976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151703
35035	NC_009712	TGA	2	6	2235145	2235150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151703
35036	NC_009712	GGA	2	6	2235250	2235255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151703
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35039	NC_009712	TCGG	2	8	2235435	2235442	0 %	25 %	50 %	25 %	154151703
35040	NC_009712	CAC	2	6	2235458	2235463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151703
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35043	NC_009712	GAG	2	6	2235559	2235564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151703
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35051	NC_009712	TGC	2	6	2235997	2236002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151703
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35053	NC_009712	CAT	2	6	2236064	2236069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151703
35054	NC_009712	TGC	2	6	2236088	2236093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151703
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35101	NC_009712	AAC	2	6	2238550	2238555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151704
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35103	NC_009712	GATCC	2	10	2238671	2238680	20 %	20 %	20 %	40 %	154151704
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35107	NC_009712	T	6	6	2238850	2238855	0 %	100 %	0 %	0 %	154151705
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35110	NC_009712	CGG	2	6	2239054	2239059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151705
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35116	NC_009712	CAG	2	6	2239358	2239363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151705
35117	NC_009712	GCG	2	6	2239385	2239390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151705
35118	NC_009712	TTC	2	6	2239413	2239418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151705
35119	NC_009712	TAC	2	6	2239456	2239461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151705
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35123	NC_009712	GAA	2	6	2239690	2239695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151705
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35126	NC_009712	ATT	2	6	2239963	2239968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151706
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35136	NC_009712	TGA	2	6	2240414	2240419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151706
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35144	NC_009712	CT	3	6	2241048	2241053	0 %	50 %	0 %	50 %	154151707
35145	NC_009712	ATC	2	6	2241109	2241114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151707
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35151	NC_009712	CGA	2	6	2241366	2241371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151707
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35153	NC_009712	GCG	2	6	2241505	2241510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151708
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35203	NC_009712	AGGG	2	8	2244814	2244821	25 %	0 %	75 %	0 %	154151713
35204	NC_009712	TTA	2	6	2244841	2244846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151713
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35218	NC_009712	GGA	2	6	2245592	2245597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151714
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35220	NC_009712	TGC	3	9	2245636	2245644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151714
35221	NC_009712	G	6	6	2245648	2245653	0 %	0 %	100 %	0 %	154151714
35222	NC_009712	GGT	2	6	2245664	2245669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151714
35223	NC_009712	CAT	2	6	2245753	2245758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151714
35224	NC_009712	GGT	2	6	2245760	2245765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151714
35225	NC_009712	ATC	2	6	2245932	2245937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151714
35226	NC_009712	G	7	7	2245980	2245986	0 %	0 %	100 %	0 %	154151714
35227	NC_009712	CGGA	2	8	2245988	2245995	25 %	0 %	50 %	25 %	154151714
35228	NC_009712	CAGA	2	8	2246045	2246052	50 %	0 %	25 %	25 %	154151714
35229	NC_009712	CCA	2	6	2246065	2246070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151714
35230	NC_009712	AGG	2	6	2246073	2246078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151714
35231	NC_009712	GAA	2	6	2246255	2246260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151715
35232	NC_009712	GGC	2	6	2246378	2246383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151715
35233	NC_009712	TGCCC	2	10	2246404	2246413	0 %	20 %	20 %	60 %	154151715
35234	NC_009712	CAC	2	6	2246468	2246473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151715
35235	NC_009712	CTC	2	6	2246477	2246482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151715
35236	NC_009712	GT	3	6	2246499	2246504	0 %	50 %	50 %	0 %	154151715
35237	NC_009712	CAGGAT	2	12	2246510	2246521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154151715
35238	NC_009712	GAT	2	6	2246560	2246565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151715
35239	NC_009712	AG	3	6	2246599	2246604	50 %	0 %	50 %	0 %	154151715
35240	NC_009712	CCGTT	2	10	2246609	2246618	0 %	40 %	20 %	40 %	154151715
35241	NC_009712	TAT	2	6	2246642	2246647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151715
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35243	NC_009712	GGA	2	6	2246714	2246719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151715
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35257	NC_009712	AGG	2	6	2253485	2253490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151716
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35264	NC_009712	GCTG	2	8	2253763	2253770	0 %	25 %	50 %	25 %	154151716
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35304	NC_009712	CGA	2	6	2257068	2257073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151720
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35331	NC_009712	ATG	2	6	2258595	2258600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151721
35332	NC_009712	GCA	2	6	2258717	2258722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151722
35333	NC_009712	TCCA	2	8	2258782	2258789	25 %	25 %	0 %	50 %	154151722
35334	NC_009712	A	6	6	2258854	2258859	100 %	0 %	0 %	0 %	154151722
35335	NC_009712	GGA	2	6	2258896	2258901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151722
35336	NC_009712	TGA	2	6	2259092	2259097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151722
35337	NC_009712	CTG	2	6	2259133	2259138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151722
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35339	NC_009712	GCC	2	6	2259208	2259213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151722
35340	NC_009712	AGA	2	6	2259251	2259256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151722
35341	NC_009712	CTC	2	6	2259335	2259340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151723
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35343	NC_009712	CTC	2	6	2259380	2259385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151723
35344	NC_009712	A	7	7	2259417	2259423	100 %	0 %	0 %	0 %	154151723
35345	NC_009712	CTC	2	6	2259518	2259523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151723
35346	NC_009712	CTT	2	6	2259553	2259558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151723
35347	NC_009712	CAC	2	6	2259572	2259577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151723
35348	NC_009712	GTC	2	6	2259599	2259604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151723
35349	NC_009712	CTC	2	6	2259635	2259640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151723
35350	NC_009712	GAT	2	6	2259662	2259667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151723
35351	NC_009712	TCGA	2	8	2259707	2259714	25 %	25 %	25 %	25 %	154151723
35352	NC_009712	ATC	2	6	2259776	2259781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151723
35353	NC_009712	GTT	2	6	2259850	2259855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151723
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35355	NC_009712	AG	3	6	2259941	2259946	50 %	0 %	50 %	0 %	154151723
35356	NC_009712	GAT	2	6	2259965	2259970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151723
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35362	NC_009712	TCT	2	6	2260793	2260798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151724
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35368	NC_009712	GA	3	6	2261133	2261138	50 %	0 %	50 %	0 %	154151724
35369	NC_009712	TGTT	2	8	2261179	2261186	0 %	75 %	25 %	0 %	154151724
35370	NC_009712	CGT	2	6	2261261	2261266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151724
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35373	NC_009712	TCT	2	6	2261372	2261377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151724
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35375	NC_009712	GCTGGT	2	12	2261463	2261474	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	154151724
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35379	NC_009712	CCT	2	6	2261621	2261626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151724
35380	NC_009712	GCC	2	6	2261644	2261649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151724
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35382	NC_009712	GCA	2	6	2261719	2261724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151724
35383	NC_009712	CTT	2	6	2261742	2261747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151724
35384	NC_009712	CCG	2	6	2261755	2261760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151724
35385	NC_009712	CAG	2	6	2261781	2261786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151724
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35390	NC_009712	GCA	2	6	2262088	2262093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151724
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35409	NC_009712	CTCCTT	2	12	2262996	2263007	0 %	50 %	0 %	50 %	154151724
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35433	NC_009712	TCA	2	6	2264215	2264220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151725
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35435	NC_009712	CAA	2	6	2264690	2264695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151726
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35437	NC_009712	GGC	2	6	2264730	2264735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151726
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35439	NC_009712	GA	3	6	2264872	2264877	50 %	0 %	50 %	0 %	154151726
35440	NC_009712	GGC	2	6	2264904	2264909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151726
35441	NC_009712	AAG	2	6	2265024	2265029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151726
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35447	NC_009712	CAT	2	6	2265251	2265256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151726
35448	NC_009712	TGA	2	6	2265322	2265327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151726
35449	NC_009712	GAG	2	6	2265357	2265362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151726
35450	NC_009712	ACA	2	6	2265388	2265393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151726
35451	NC_009712	GAA	2	6	2265404	2265409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151726
35452	NC_009712	ACC	2	6	2265475	2265480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151726
35453	NC_009712	TGACC	2	10	2265491	2265500	20 %	20 %	20 %	40 %	154151726
35454	NC_009712	AGGC	2	8	2265544	2265551	25 %	0 %	50 %	25 %	154151726
35455	NC_009712	CAA	2	6	2265560	2265565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151726
35456	NC_009712	TAA	2	6	2265786	2265791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151726
35457	NC_009712	TGGA	2	8	2265848	2265855	25 %	25 %	50 %	0 %	154151727
35458	NC_009712	CCA	2	6	2266040	2266045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151727
35459	NC_009712	CA	3	6	2266044	2266049	50 %	0 %	0 %	50 %	154151727
35460	NC_009712	GCTCCC	2	12	2266113	2266124	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	154151727
35461	NC_009712	CGC	2	6	2266152	2266157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151727
35462	NC_009712	CTC	2	6	2266207	2266212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151727
35463	NC_009712	GGC	2	6	2266344	2266349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151727
35464	NC_009712	CAG	2	6	2266389	2266394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151727
35465	NC_009712	CAGG	2	8	2266419	2266426	25 %	0 %	50 %	25 %	154151727
35466	NC_009712	TCA	2	6	2266463	2266468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151727
35467	NC_009712	ATCA	2	8	2266513	2266520	50 %	25 %	0 %	25 %	154151727
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35479	NC_009712	ACCGC	2	10	2267216	2267225	20 %	0 %	20 %	60 %	154151728
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35483	NC_009712	CGG	2	6	2267556	2267561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151729
35484	NC_009712	GGAA	2	8	2267632	2267639	50 %	0 %	50 %	0 %	154151729
35485	NC_009712	CACC	2	8	2267664	2267671	25 %	0 %	0 %	75 %	154151729
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35495	NC_009712	AGGG	2	8	2268401	2268408	25 %	0 %	75 %	0 %	154151730
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