MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 40016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_009712	AGA	2	6	2174397	2174402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151639
34002	NC_009712	CCAT	2	8	2174456	2174463	25 %	25 %	0 %	50 %	154151639
34003	NC_009712	CTT	2	6	2174497	2174502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151639
34004	NC_009712	T	6	6	2174539	2174544	0 %	100 %	0 %	0 %	154151639
34005	NC_009712	GCCG	2	8	2174587	2174594	0 %	0 %	50 %	50 %	154151639
34006	NC_009712	CAA	2	6	2174624	2174629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151639
34007	NC_009712	GCA	2	6	2174635	2174640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151639
34008	NC_009712	GAA	2	6	2174653	2174658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151639
34009	NC_009712	A	6	6	2174688	2174693	100 %	0 %	0 %	0 %	154151639
34010	NC_009712	ACG	2	6	2174728	2174733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151640
34011	NC_009712	TCCT	2	8	2174784	2174791	0 %	50 %	0 %	50 %	154151640
34012	NC_009712	GAT	2	6	2174832	2174837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151640
34013	NC_009712	AATCAA	2	12	2174858	2174869	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154151640
34014	NC_009712	CAT	2	6	2174903	2174908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151640
34015	NC_009712	T	6	6	2174920	2174925	0 %	100 %	0 %	0 %	154151640
34016	NC_009712	AG	3	6	2175134	2175139	50 %	0 %	50 %	0 %	154151641
34017	NC_009712	AAC	2	6	2175276	2175281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151641
34018	NC_009712	TCA	2	6	2175290	2175295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151641
34019	NC_009712	GCT	2	6	2175497	2175502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151641
34020	NC_009712	ATC	2	6	2175514	2175519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151641
34021	NC_009712	AAG	2	6	2175534	2175539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151641
34022	NC_009712	AG	3	6	2175689	2175694	50 %	0 %	50 %	0 %	154151641
34023	NC_009712	AATC	2	8	2175701	2175708	50 %	25 %	0 %	25 %	154151641
34024	NC_009712	TGGG	2	8	2175808	2175815	0 %	25 %	75 %	0 %	154151641
34025	NC_009712	C	6	6	2175822	2175827	0 %	0 %	0 %	100 %	154151641
34026	NC_009712	CAA	2	6	2175848	2175853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151641
34027	NC_009712	TGG	2	6	2175952	2175957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151641
34028	NC_009712	TGA	2	6	2175965	2175970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151641
34029	NC_009712	GCA	2	6	2176123	2176128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151642
34030	NC_009712	GAG	2	6	2176168	2176173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151642
34031	NC_009712	CGGT	2	8	2176184	2176191	0 %	25 %	50 %	25 %	154151642
34032	NC_009712	GCA	2	6	2176192	2176197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151642
34033	NC_009712	ATC	2	6	2176219	2176224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151642
34034	NC_009712	CCT	2	6	2176252	2176257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151642
34035	NC_009712	GGC	2	6	2176329	2176334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151642
34036	NC_009712	AC	3	6	2176338	2176343	50 %	0 %	0 %	50 %	154151642
34037	NC_009712	CGCCT	2	10	2176423	2176432	0 %	20 %	20 %	60 %	154151642
34038	NC_009712	CCA	2	6	2176440	2176445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151642
34039	NC_009712	CAA	2	6	2176449	2176454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151642
34040	NC_009712	CTG	2	6	2176459	2176464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151642
34041	NC_009712	GAG	2	6	2176645	2176650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151642
34042	NC_009712	GAAA	2	8	2176708	2176715	75 %	0 %	25 %	0 %	154151642
34043	NC_009712	AGGC	2	8	2176726	2176733	25 %	0 %	50 %	25 %	154151642
34044	NC_009712	GAT	2	6	2176743	2176748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151642
34045	NC_009712	GTC	2	6	2176867	2176872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151642
34046	NC_009712	CGC	2	6	2176896	2176901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151642
34047	NC_009712	A	6	6	2176929	2176934	100 %	0 %	0 %	0 %	154151642
34048	NC_009712	TGA	2	6	2176941	2176946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151642
34049	NC_009712	CTC	2	6	2176960	2176965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151642
34050	NC_009712	GAA	2	6	2176984	2176989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151642
34051	NC_009712	CA	3	6	2176991	2176996	50 %	0 %	0 %	50 %	154151642
34052	NC_009712	CGA	2	6	2177028	2177033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151642
34053	NC_009712	CCG	2	6	2177039	2177044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151642
34054	NC_009712	GGCC	2	8	2177058	2177065	0 %	0 %	50 %	50 %	154151643
34055	NC_009712	GAC	2	6	2177070	2177075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151643
34056	NC_009712	TAA	2	6	2177286	2177291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151643
34057	NC_009712	AGT	2	6	2177295	2177300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151643
34058	NC_009712	T	7	7	2177305	2177311	0 %	100 %	0 %	0 %	154151643
34059	NC_009712	CGG	2	6	2177475	2177480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151643
34060	NC_009712	CAG	2	6	2177494	2177499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151643
34061	NC_009712	CAG	3	9	2177530	2177538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151643
34062	NC_009712	GGC	2	6	2177548	2177553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151643
34063	NC_009712	CCA	2	6	2177632	2177637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151643
34064	NC_009712	A	6	6	2177707	2177712	100 %	0 %	0 %	0 %	154151643
34065	NC_009712	GAT	2	6	2177725	2177730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151643
34066	NC_009712	TTC	2	6	2177744	2177749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151643
34067	NC_009712	ATC	2	6	2177795	2177800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151643
34068	NC_009712	CAA	2	6	2177847	2177852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151643
34069	NC_009712	TAA	2	6	2177904	2177909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151643
34070	NC_009712	GGCAT	2	10	2177933	2177942	20 %	20 %	40 %	20 %	154151643
34071	NC_009712	GTGTC	2	10	2177958	2177967	0 %	40 %	40 %	20 %	154151643
34072	NC_009712	TCC	2	6	2178107	2178112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151644
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34076	NC_009712	TGC	2	6	2178239	2178244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151644
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34078	NC_009712	CGA	2	6	2178309	2178314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151644
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34084	NC_009712	CGC	2	6	2178524	2178529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151645
34085	NC_009712	TC	3	6	2178561	2178566	0 %	50 %	0 %	50 %	154151645
34086	NC_009712	GTCTTT	2	12	2178616	2178627	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	154151645
34087	NC_009712	GA	3	6	2178667	2178672	50 %	0 %	50 %	0 %	154151645
34088	NC_009712	GAG	3	9	2178730	2178738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151645
34089	NC_009712	CAGG	2	8	2178744	2178751	25 %	0 %	50 %	25 %	154151645
34090	NC_009712	ATT	2	6	2178781	2178786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151645
34091	NC_009712	CTC	2	6	2178802	2178807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151645
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34098	NC_009712	GGA	2	6	2179596	2179601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151646
34099	NC_009712	CAT	2	6	2179680	2179685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151646
34100	NC_009712	GATG	2	8	2179707	2179714	25 %	25 %	50 %	0 %	154151646
34101	NC_009712	CCGG	2	8	2179775	2179782	0 %	0 %	50 %	50 %	154151646
34102	NC_009712	GAA	2	6	2179789	2179794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151646
34103	NC_009712	GTG	2	6	2179795	2179800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151646
34104	NC_009712	CAA	2	6	2179812	2179817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151646
34105	NC_009712	AGG	2	6	2179842	2179847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151646
34106	NC_009712	CAGG	2	8	2179887	2179894	25 %	0 %	50 %	25 %	154151646
34107	NC_009712	GAG	2	6	2179927	2179932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151646
34108	NC_009712	TCG	2	6	2180063	2180068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151646
34109	NC_009712	CTGCC	2	10	2180091	2180100	0 %	20 %	20 %	60 %	154151646
34110	NC_009712	ATC	2	6	2180191	2180196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151646
34111	NC_009712	CTGC	2	8	2180232	2180239	0 %	25 %	25 %	50 %	154151646
34112	NC_009712	ATA	2	6	2180255	2180260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151646
34113	NC_009712	AAAG	2	8	2180264	2180271	75 %	0 %	25 %	0 %	154151646
34114	NC_009712	ACG	2	6	2180300	2180305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151646
34115	NC_009712	ATT	2	6	2180381	2180386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151646
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34117	NC_009712	GCT	2	6	2180528	2180533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151646
34118	NC_009712	CGG	2	6	2180564	2180569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151646
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34230	NC_009712	TCT	2	6	2187131	2187136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151651
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34232	NC_009712	GGC	2	6	2187198	2187203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151651
34233	NC_009712	C	6	6	2187261	2187266	0 %	0 %	0 %	100 %	154151651
34234	NC_009712	GGT	2	6	2187282	2187287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151651
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34236	NC_009712	TTC	2	6	2187480	2187485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151651
34237	NC_009712	CT	3	6	2187739	2187744	0 %	50 %	0 %	50 %	154151652
34238	NC_009712	TCA	2	6	2187779	2187784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151652
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34304	NC_009712	GAC	2	6	2190901	2190906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151655
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34322	NC_009712	TGACGG	2	12	2191822	2191833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154151656
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34335	NC_009712	TGAGAC	2	12	2192996	2193007	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154151657
34336	NC_009712	CGG	2	6	2193260	2193265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151658
34337	NC_009712	CGGTA	2	10	2193286	2193295	20 %	20 %	40 %	20 %	154151658
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34342	NC_009712	GT	3	6	2193603	2193608	0 %	50 %	50 %	0 %	154151658
34343	NC_009712	T	8	8	2193649	2193656	0 %	100 %	0 %	0 %	154151658
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34350	NC_009712	AGG	2	6	2194073	2194078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151658
34351	NC_009712	TCTTT	2	10	2194089	2194098	0 %	80 %	0 %	20 %	154151658
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34453	NC_009712	A	6	6	2199730	2199735	100 %	0 %	0 %	0 %	154151666
34454	NC_009712	TTC	2	6	2199743	2199748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151666
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34458	NC_009712	CTGC	3	12	2199804	2199815	0 %	25 %	25 %	50 %	154151666
34459	NC_009712	GCCCC	2	10	2199833	2199842	0 %	0 %	20 %	80 %	154151666
34460	NC_009712	TGT	2	6	2199856	2199861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151666
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34466	NC_009712	CCT	2	6	2200160	2200165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151667
34467	NC_009712	A	6	6	2200189	2200194	100 %	0 %	0 %	0 %	154151667
34468	NC_009712	ATG	2	6	2200207	2200212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151667
34469	NC_009712	ACTGCC	2	12	2200281	2200292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154151667
34470	NC_009712	CGA	2	6	2200316	2200321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151667
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34472	NC_009712	AAAG	2	8	2200428	2200435	75 %	0 %	25 %	0 %	154151668
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34475	NC_009712	ACC	2	6	2200565	2200570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151668
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34487	NC_009712	CAA	2	6	2201452	2201457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151670
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34489	NC_009712	ATC	2	6	2201596	2201601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151670
34490	NC_009712	CCGGG	2	10	2201813	2201822	0 %	0 %	60 %	40 %	154151670
34491	NC_009712	TCGA	2	8	2201887	2201894	25 %	25 %	25 %	25 %	154151670
34492	NC_009712	TGC	2	6	2202011	2202016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151670
34493	NC_009712	TGA	2	6	2202035	2202040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151670
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34495	NC_009712	AG	3	6	2202086	2202091	50 %	0 %	50 %	0 %	154151670
34496	NC_009712	GAG	2	6	2202160	2202165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151670
34497	NC_009712	TGC	2	6	2202389	2202394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151670
34498	NC_009712	GGT	2	6	2202492	2202497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151670
34499	NC_009712	GCG	2	6	2202499	2202504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151670
34500	NC_009712	AT	3	6	2202539	2202544	50 %	50 %	0 %	0 %	154151670

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