MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 40016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_009712	CCG	2	6	1628556	1628561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151102
25502	NC_009712	CTC	2	6	1628638	1628643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151102
25503	NC_009712	GCC	2	6	1628725	1628730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151102
25504	NC_009712	TTG	2	6	1628744	1628749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151102
25505	NC_009712	GAA	2	6	1628862	1628867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151102
25506	NC_009712	CCAT	2	8	1628956	1628963	25 %	25 %	0 %	50 %	154151103
25507	NC_009712	GCA	2	6	1628982	1628987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151103
25508	NC_009712	GA	3	6	1629040	1629045	50 %	0 %	50 %	0 %	154151103
25509	NC_009712	CCA	2	6	1629104	1629109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151103
25510	NC_009712	GCA	2	6	1629181	1629186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151103
25511	NC_009712	AGG	2	6	1629205	1629210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151103
25512	NC_009712	CA	3	6	1629222	1629227	50 %	0 %	0 %	50 %	154151103
25513	NC_009712	AGC	2	6	1629228	1629233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151103
25514	NC_009712	TC	3	6	1629284	1629289	0 %	50 %	0 %	50 %	154151103
25515	NC_009712	GCA	2	6	1629297	1629302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151103
25516	NC_009712	AAC	2	6	1629342	1629347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151103
25517	NC_009712	A	6	6	1629380	1629385	100 %	0 %	0 %	0 %	154151103
25518	NC_009712	CCT	2	6	1629419	1629424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151103
25519	NC_009712	ACCG	2	8	1629438	1629445	25 %	0 %	25 %	50 %	154151103
25520	NC_009712	TGT	2	6	1629454	1629459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151103
25521	NC_009712	CCCG	2	8	1629514	1629521	0 %	0 %	25 %	75 %	154151103
25522	NC_009712	TCT	2	6	1629547	1629552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151103
25523	NC_009712	CAC	2	6	1629611	1629616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151103
25524	NC_009712	GCC	2	6	1629653	1629658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151103
25525	NC_009712	CCCGG	2	10	1629673	1629682	0 %	0 %	40 %	60 %	154151104
25526	NC_009712	CAC	2	6	1629703	1629708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151104
25527	NC_009712	AGC	3	9	1629745	1629753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151104
25528	NC_009712	CCGC	2	8	1629781	1629788	0 %	0 %	25 %	75 %	154151104
25529	NC_009712	A	6	6	1630079	1630084	100 %	0 %	0 %	0 %	154151104
25530	NC_009712	CAGT	2	8	1630156	1630163	25 %	25 %	25 %	25 %	154151104
25531	NC_009712	CCT	2	6	1630167	1630172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151104
25532	NC_009712	ATG	2	6	1630178	1630183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151104
25533	NC_009712	TGT	2	6	1630357	1630362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151104
25534	NC_009712	ACT	2	6	1630371	1630376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151104
25535	NC_009712	CTT	2	6	1630390	1630395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151104
25536	NC_009712	TGC	2	6	1630402	1630407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151104
25537	NC_009712	TGG	2	6	1630608	1630613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151104
25538	NC_009712	ATC	2	6	1630637	1630642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151104
25539	NC_009712	AG	3	6	1630669	1630674	50 %	0 %	50 %	0 %	154151104
25540	NC_009712	CGG	2	6	1630771	1630776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151104
25541	NC_009712	ACC	2	6	1630797	1630802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151104
25542	NC_009712	CGG	2	6	1630840	1630845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151104
25543	NC_009712	GATCAC	2	12	1630846	1630857	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	154151104
25544	NC_009712	AGC	2	6	1631030	1631035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151105
25545	NC_009712	GGCC	2	8	1631037	1631044	0 %	0 %	50 %	50 %	154151105
25546	NC_009712	CAT	2	6	1631136	1631141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151105
25547	NC_009712	GCG	2	6	1631153	1631158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151105
25548	NC_009712	TGC	2	6	1631210	1631215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151105
25549	NC_009712	CTG	2	6	1631219	1631224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151105
25550	NC_009712	C	6	6	1631258	1631263	0 %	0 %	0 %	100 %	154151105
25551	NC_009712	CCG	2	6	1631319	1631324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151105
25552	NC_009712	GCA	3	9	1631335	1631343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151105
25553	NC_009712	CCGG	2	8	1631363	1631370	0 %	0 %	50 %	50 %	154151105
25554	NC_009712	ACA	2	6	1631371	1631376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151105
25555	NC_009712	GGC	2	6	1631385	1631390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151105
25556	NC_009712	CTT	2	6	1631407	1631412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151105
25557	NC_009712	CGC	2	6	1631471	1631476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151105
25558	NC_009712	GAA	2	6	1631494	1631499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151105
25559	NC_009712	GAAA	2	8	1631503	1631510	75 %	0 %	25 %	0 %	154151105
25560	NC_009712	CTT	2	6	1631512	1631517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151105
25561	NC_009712	TCA	2	6	1631687	1631692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151105
25562	NC_009712	TGA	2	6	1631748	1631753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151105
25563	NC_009712	CGG	2	6	1631898	1631903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151105
25564	NC_009712	ATT	2	6	1631950	1631955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151105
25565	NC_009712	GCA	2	6	1632181	1632186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151105
25566	NC_009712	CAC	2	6	1632201	1632206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151105
25567	NC_009712	CTT	2	6	1632258	1632263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151105
25568	NC_009712	ACC	2	6	1632283	1632288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151105
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25570	NC_009712	CGGCC	2	10	1632356	1632365	0 %	0 %	40 %	60 %	154151106
25571	NC_009712	GCCC	2	8	1632388	1632395	0 %	0 %	25 %	75 %	154151106
25572	NC_009712	GCT	2	6	1632428	1632433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151106
25573	NC_009712	GCC	2	6	1632442	1632447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151106
25574	NC_009712	C	6	6	1632457	1632462	0 %	0 %	0 %	100 %	154151106
25575	NC_009712	CG	3	6	1632574	1632579	0 %	0 %	50 %	50 %	154151106
25576	NC_009712	TACGA	2	10	1632582	1632591	40 %	20 %	20 %	20 %	154151106
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25578	NC_009712	GCT	2	6	1632874	1632879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151106
25579	NC_009712	ATG	2	6	1632936	1632941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151106
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25582	NC_009712	G	6	6	1633068	1633073	0 %	0 %	100 %	0 %	154151106
25583	NC_009712	CAGGA	2	10	1633081	1633090	40 %	0 %	40 %	20 %	154151106
25584	NC_009712	GTG	2	6	1633095	1633100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151106
25585	NC_009712	CAA	2	6	1633168	1633173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151106
25586	NC_009712	GGC	2	6	1633185	1633190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151106
25587	NC_009712	TCC	2	6	1633219	1633224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151106
25588	NC_009712	GA	3	6	1633443	1633448	50 %	0 %	50 %	0 %	154151107
25589	NC_009712	GCC	2	6	1633503	1633508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151107
25590	NC_009712	TCG	2	6	1633587	1633592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151107
25591	NC_009712	ATG	2	6	1633626	1633631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151107
25592	NC_009712	GCG	2	6	1633699	1633704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151107
25593	NC_009712	TCA	2	6	1633710	1633715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151107
25594	NC_009712	AGC	2	6	1633731	1633736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151107
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25596	NC_009712	CGG	2	6	1633768	1633773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151107
25597	NC_009712	AGC	2	6	1633794	1633799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151107
25598	NC_009712	TACCTG	2	12	1633808	1633819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154151107
25599	NC_009712	CAG	2	6	1633846	1633851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151107
25600	NC_009712	GCA	2	6	1633868	1633873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151107
25601	NC_009712	AAT	2	6	1633877	1633882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151107
25602	NC_009712	CCCG	2	8	1633894	1633901	0 %	0 %	25 %	75 %	154151107
25603	NC_009712	GCC	2	6	1634061	1634066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151108
25604	NC_009712	GGC	2	6	1634080	1634085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151108
25605	NC_009712	GCG	2	6	1634130	1634135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151108
25606	NC_009712	CAG	2	6	1634157	1634162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151108
25607	NC_009712	CA	3	6	1634178	1634183	50 %	0 %	0 %	50 %	154151108
25608	NC_009712	T	6	6	1634247	1634252	0 %	100 %	0 %	0 %	154151108
25609	NC_009712	CTG	2	6	1634302	1634307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151108
25610	NC_009712	TC	3	6	1634336	1634341	0 %	50 %	0 %	50 %	154151108
25611	NC_009712	CAT	2	6	1634372	1634377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151108
25612	NC_009712	CGGG	2	8	1634453	1634460	0 %	0 %	75 %	25 %	154151108
25613	NC_009712	GCG	2	6	1634481	1634486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151108
25614	NC_009712	T	8	8	1634554	1634561	0 %	100 %	0 %	0 %	154151108
25615	NC_009712	CGG	2	6	1634614	1634619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151108
25616	NC_009712	GAAG	2	8	1634638	1634645	50 %	0 %	50 %	0 %	154151108
25617	NC_009712	TCT	2	6	1634651	1634656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151108
25618	NC_009712	GCCT	2	8	1634661	1634668	0 %	25 %	25 %	50 %	154151108
25619	NC_009712	T	6	6	1634668	1634673	0 %	100 %	0 %	0 %	154151108
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25723	NC_009712	TTGCAG	2	12	1641349	1641360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154151114
25724	NC_009712	TGCCG	2	10	1641362	1641371	0 %	20 %	40 %	40 %	154151114
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25726	NC_009712	GGT	2	6	1641634	1641639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151114
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25728	NC_009712	TGC	2	6	1641713	1641718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151114
25729	NC_009712	GA	3	6	1641814	1641819	50 %	0 %	50 %	0 %	154151114
25730	NC_009712	GAG	2	6	1642021	1642026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151115
25731	NC_009712	AAGG	2	8	1642075	1642082	50 %	0 %	50 %	0 %	154151115
25732	NC_009712	CCA	2	6	1642098	1642103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151115
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25736	NC_009712	GCA	2	6	1642423	1642428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151115
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25852	NC_009712	TCA	2	6	1649202	1649207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151121
25853	NC_009712	ATG	2	6	1649283	1649288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151121
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25863	NC_009712	CGG	2	6	1649852	1649857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151122
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25955	NC_009712	TCTG	2	8	1655176	1655183	0 %	50 %	25 %	25 %	154151128
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25963	NC_009712	CTGC	2	8	1655986	1655993	0 %	25 %	25 %	50 %	154151128
25964	NC_009712	CATCGG	2	12	1656019	1656030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154151128
25965	NC_009712	GTG	2	6	1656032	1656037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151128
25966	NC_009712	GGA	2	6	1656040	1656045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151128
25967	NC_009712	CCGC	2	8	1656067	1656074	0 %	0 %	25 %	75 %	154151128
25968	NC_009712	GAT	2	6	1656077	1656082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151128
25969	NC_009712	TCC	2	6	1656207	1656212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151128
25970	NC_009712	TCA	2	6	1656213	1656218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151128
25971	NC_009712	GTT	2	6	1656257	1656262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151128
25972	NC_009712	CAT	2	6	1656266	1656271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151128
25973	NC_009712	CGA	2	6	1656337	1656342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151128
25974	NC_009712	CAA	2	6	1656373	1656378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151128
25975	NC_009712	TGG	2	6	1656388	1656393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151128
25976	NC_009712	GTG	2	6	1656480	1656485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151128
25977	NC_009712	GCT	2	6	1656526	1656531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151128
25978	NC_009712	CCGGAC	2	12	1656566	1656577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	154151128
25979	NC_009712	TCT	2	6	1656762	1656767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151128
25980	NC_009712	TTA	2	6	1656953	1656958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151129
25981	NC_009712	GCC	2	6	1656976	1656981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151129
25982	NC_009712	T	8	8	1656983	1656990	0 %	100 %	0 %	0 %	154151129
25983	NC_009712	A	7	7	1657117	1657123	100 %	0 %	0 %	0 %	154151129
25984	NC_009712	A	6	6	1657151	1657156	100 %	0 %	0 %	0 %	154151129
25985	NC_009712	T	8	8	1657935	1657942	0 %	100 %	0 %	0 %	154151130
25986	NC_009712	ATC	2	6	1658016	1658021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151130
25987	NC_009712	TAA	2	6	1658033	1658038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151130
25988	NC_009712	GTT	2	6	1658126	1658131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151130
25989	NC_009712	TCA	2	6	1658146	1658151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151130
25990	NC_009712	TCT	2	6	1658185	1658190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151130
25991	NC_009712	ATT	2	6	1658218	1658223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151130
25992	NC_009712	GAG	2	6	1658230	1658235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151130
25993	NC_009712	CCT	2	6	1658240	1658245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151130
25994	NC_009712	TCT	2	6	1658287	1658292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151130
25995	NC_009712	CTG	2	6	1658295	1658300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151130
25996	NC_009712	GGA	2	6	1658305	1658310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151130
25997	NC_009712	A	7	7	1658336	1658342	100 %	0 %	0 %	0 %	154151130
25998	NC_009712	GAA	2	6	1658372	1658377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151130
25999	NC_009712	TTA	2	6	1658443	1658448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151130
26000	NC_009712	CAT	2	6	1658450	1658455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151130

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