MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 34899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	TAA	2	6	125	130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
2	NC_009637	ACT	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401931
3	NC_009637	GAAA	2	8	143	150	75 %	0 %	25 %	0 %	150401931
4	NC_009637	GAT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
5	NC_009637	TAA	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
6	NC_009637	A	6	6	191	196	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
7	NC_009637	CAT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401931
8	NC_009637	TAT	2	6	217	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
9	NC_009637	TAAA	2	8	229	236	75 %	25 %	0 %	0 %	150401931
10	NC_009637	AAT	2	6	243	248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
11	NC_009637	TGA	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
12	NC_009637	GGAT	2	8	290	297	25 %	25 %	50 %	0 %	150401931
13	NC_009637	TTTTG	2	10	305	314	0 %	80 %	20 %	0 %	150401931
14	NC_009637	TATT	2	8	341	348	25 %	75 %	0 %	0 %	150401931
15	NC_009637	GAT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
16	NC_009637	TGA	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
17	NC_009637	ATA	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
18	NC_009637	ATA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
19	NC_009637	CTTT	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	150401931
20	NC_009637	A	7	7	512	518	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
21	NC_009637	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401931
22	NC_009637	A	7	7	537	543	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
23	NC_009637	A	7	7	563	569	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
24	NC_009637	A	7	7	597	603	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
25	NC_009637	AT	3	6	647	652	50 %	50 %	0 %	0 %	150401931
26	NC_009637	GAAA	2	8	663	670	75 %	0 %	25 %	0 %	150401931
27	NC_009637	ATT	2	6	687	692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
28	NC_009637	TAA	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
29	NC_009637	CAA	2	6	740	745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
30	NC_009637	ATT	2	6	755	760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
31	NC_009637	A	6	6	778	783	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
32	NC_009637	GAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401931
33	NC_009637	A	6	6	795	800	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
34	NC_009637	ACA	2	6	959	964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
35	NC_009637	TGG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150401931
36	NC_009637	TAC	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401931
37	NC_009637	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
38	NC_009637	ATTTAA	2	12	1051	1062	50 %	50 %	0 %	0 %	150401931
39	NC_009637	ATT	2	6	1148	1153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
40	NC_009637	GAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401931
41	NC_009637	A	6	6	1205	1210	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
42	NC_009637	GCT	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150401931
43	NC_009637	AATTT	2	10	1258	1267	40 %	60 %	0 %	0 %	150401931
44	NC_009637	ACAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	0 %	25 %	150401931
45	NC_009637	TTA	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
46	NC_009637	TCAT	2	8	1286	1293	25 %	50 %	0 %	25 %	150401931
47	NC_009637	A	6	6	1341	1346	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
48	NC_009637	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	150401931
49	NC_009637	A	6	6	1507	1512	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
50	NC_009637	ATG	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
51	NC_009637	A	7	7	1533	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
52	NC_009637	A	6	6	1683	1688	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
53	NC_009637	TAA	3	9	1700	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401931
54	NC_009637	AAAGTT	2	12	1758	1769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150401931
55	NC_009637	ACA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
56	NC_009637	CTT	2	6	1795	1800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401931
57	NC_009637	T	6	6	1806	1811	0 %	100 %	0 %	0 %	150401931
58	NC_009637	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
59	NC_009637	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	150401931
60	NC_009637	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401931
61	NC_009637	A	6	6	1889	1894	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
62	NC_009637	AG	3	6	1943	1948	50 %	0 %	50 %	0 %	150401931
63	NC_009637	ATG	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401931
64	NC_009637	GTAT	2	8	2015	2022	25 %	50 %	25 %	0 %	150401931
65	NC_009637	A	6	6	2058	2063	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
66	NC_009637	A	6	6	2118	2123	100 %	0 %	0 %	0 %	150401931
67	NC_009637	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401931
68	NC_009637	AT	3	6	2204	2209	50 %	50 %	0 %	0 %	150401931
69	NC_009637	AAT	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
70	NC_009637	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401932
71	NC_009637	GTG	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150401932
72	NC_009637	TAA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
73	NC_009637	CAG	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401932
74	NC_009637	AAATT	2	10	2418	2427	60 %	40 %	0 %	0 %	150401932
75	NC_009637	T	6	6	2470	2475	0 %	100 %	0 %	0 %	150401932
76	NC_009637	AAT	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
77	NC_009637	A	6	6	2509	2514	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
78	NC_009637	AAT	2	6	2518	2523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
79	NC_009637	AAAATG	2	12	2562	2573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401932
80	NC_009637	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
81	NC_009637	AAT	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
82	NC_009637	CCA	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150401932
83	NC_009637	TAAATT	2	12	2722	2733	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
84	NC_009637	TGA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
85	NC_009637	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
86	NC_009637	ATT	2	6	2819	2824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
87	NC_009637	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	150401932
88	NC_009637	ATG	3	9	2856	2864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
89	NC_009637	AGT	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
90	NC_009637	GAA	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
91	NC_009637	ATT	2	6	3041	3046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
92	NC_009637	TAATC	2	10	3166	3175	40 %	40 %	0 %	20 %	150401932
93	NC_009637	AT	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
94	NC_009637	A	6	6	3238	3243	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
95	NC_009637	AT	3	6	3246	3251	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
96	NC_009637	ATCTAA	2	12	3253	3264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150401932
97	NC_009637	GAT	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
98	NC_009637	A	6	6	3303	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
99	NC_009637	GAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
100	NC_009637	TTTA	2	8	3328	3335	25 %	75 %	0 %	0 %	150401932
101	NC_009637	A	6	6	3344	3349	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
102	NC_009637	GAT	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
103	NC_009637	GAA	2	6	3397	3402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
104	NC_009637	ATTT	2	8	3428	3435	25 %	75 %	0 %	0 %	150401932
105	NC_009637	ATA	2	6	3456	3461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
106	NC_009637	A	6	6	3461	3466	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
107	NC_009637	GAT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
108	NC_009637	TAA	2	6	3510	3515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
109	NC_009637	A	6	6	3534	3539	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
110	NC_009637	A	8	8	3613	3620	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
111	NC_009637	A	6	6	3628	3633	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
112	NC_009637	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
113	NC_009637	TAAT	2	8	3681	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
114	NC_009637	TGA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401932
115	NC_009637	A	6	6	3713	3718	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
116	NC_009637	CATT	2	8	3735	3742	25 %	50 %	0 %	25 %	150401932
117	NC_009637	A	7	7	3744	3750	100 %	0 %	0 %	0 %	150401932
118	NC_009637	ATTT	2	8	3801	3808	25 %	75 %	0 %	0 %	150401932
119	NC_009637	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
120	NC_009637	ACA	2	6	3841	3846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150401932
121	NC_009637	AAT	2	6	3905	3910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401932
122	NC_009637	GATA	2	8	3940	3947	50 %	25 %	25 %	0 %	150401932
123	NC_009637	GT	3	6	3954	3959	0 %	50 %	50 %	0 %	150401932
124	NC_009637	TATG	2	8	3983	3990	25 %	50 %	25 %	0 %	150401932
125	NC_009637	TTA	2	6	4021	4026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401932
126	NC_009637	AGCAA	2	10	4052	4061	60 %	0 %	20 %	20 %	150401932
127	NC_009637	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401932
128	NC_009637	T	6	6	4127	4132	0 %	100 %	0 %	0 %	150401933
129	NC_009637	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401933
130	NC_009637	AGC	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401933
131	NC_009637	ATC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401933
132	NC_009637	T	7	7	4415	4421	0 %	100 %	0 %	0 %	150401933
133	NC_009637	TCT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401933
134	NC_009637	T	6	6	4485	4490	0 %	100 %	0 %	0 %	150401933
135	NC_009637	AATGCA	2	12	4540	4551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401933
136	NC_009637	TAA	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401933
137	NC_009637	T	6	6	4585	4590	0 %	100 %	0 %	0 %	150401933
138	NC_009637	AAG	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401933
139	NC_009637	T	6	6	4675	4680	0 %	100 %	0 %	0 %	150401933
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143	NC_009637	A	6	6	4827	4832	100 %	0 %	0 %	0 %	150401933
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260	NC_009637	A	7	7	10456	10462	100 %	0 %	0 %	0 %	150401935
261	NC_009637	A	6	6	10509	10514	100 %	0 %	0 %	0 %	150401935
262	NC_009637	T	6	6	10546	10551	0 %	100 %	0 %	0 %	150401935
263	NC_009637	GAA	2	6	10573	10578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150401935
264	NC_009637	G	6	6	10694	10699	0 %	0 %	100 %	0 %	150401935
265	NC_009637	TGT	2	6	10759	10764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150401936
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267	NC_009637	A	6	6	10867	10872	100 %	0 %	0 %	0 %	150401936
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270	NC_009637	CTT	2	6	10937	10942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150401936
271	NC_009637	TAA	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401936
272	NC_009637	TAC	2	6	11012	11017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401936
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274	NC_009637	ACT	2	6	11079	11084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401936
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