MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 101828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009565	GCC	2	6	24262	24267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
502	NC_009565	GCTG	2	8	24296	24303	0 %	25 %	50 %	25 %	148821211
503	NC_009565	CGTAGT	2	12	24330	24341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148821211
504	NC_009565	CGGC	2	8	24344	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	148821211
505	NC_009565	GAG	2	6	24375	24380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821211
506	NC_009565	GCC	3	9	24427	24435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
507	NC_009565	GCCG	2	8	24444	24451	0 %	0 %	50 %	50 %	148821211
508	NC_009565	CGGG	2	8	24519	24526	0 %	0 %	75 %	25 %	148821211
509	NC_009565	CTC	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148821211
510	NC_009565	CCG	2	6	24596	24601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
511	NC_009565	GCC	2	6	24613	24618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
512	NC_009565	GCC	2	6	24637	24642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
513	NC_009565	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	148821211
514	NC_009565	AGG	2	6	24706	24711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821211
515	NC_009565	GCG	2	6	24726	24731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821211
516	NC_009565	C	6	6	24737	24742	0 %	0 %	0 %	100 %	148821211
517	NC_009565	CCTGGT	2	12	24768	24779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821211
518	NC_009565	GCC	2	6	24922	24927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
519	NC_009565	C	6	6	24943	24948	0 %	0 %	0 %	100 %	148821211
520	NC_009565	CCA	2	6	24980	24985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821211
521	NC_009565	GTC	2	6	25015	25020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821211
522	NC_009565	TCG	2	6	25028	25033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821211
523	NC_009565	GCCCCT	2	12	25038	25049	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148821211
524	NC_009565	CGG	2	6	25144	25149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821211
525	NC_009565	CGA	2	6	25210	25215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821211
526	NC_009565	GAC	2	6	25228	25233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821211
527	NC_009565	ATG	2	6	25355	25360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821211
528	NC_009565	GCC	2	6	25412	25417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821211
529	NC_009565	GCA	2	6	25425	25430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821211
530	NC_009565	GC	3	6	26021	26026	0 %	0 %	50 %	50 %	148821212
531	NC_009565	CGC	2	6	26044	26049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821212
532	NC_009565	TTG	2	6	26050	26055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821212
533	NC_009565	CGG	2	6	26076	26081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
534	NC_009565	CGG	2	6	26118	26123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
535	NC_009565	GCA	2	6	26150	26155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821212
536	NC_009565	CTT	2	6	26181	26186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821212
537	NC_009565	GT	3	6	26255	26260	0 %	50 %	50 %	0 %	148821212
538	NC_009565	GTG	2	6	26300	26305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821212
539	NC_009565	GTC	2	6	26314	26319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821212
540	NC_009565	GCC	2	6	26327	26332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821212
541	NC_009565	AGC	2	6	26333	26338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821212
542	NC_009565	CGG	2	6	26406	26411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
543	NC_009565	CGG	2	6	26427	26432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
544	NC_009565	CGG	2	6	26460	26465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
545	NC_009565	CG	3	6	26489	26494	0 %	0 %	50 %	50 %	148821212
546	NC_009565	CGA	2	6	26505	26510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821212
547	NC_009565	CCA	2	6	26577	26582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821212
548	NC_009565	GCTC	2	8	26606	26613	0 %	25 %	25 %	50 %	148821212
549	NC_009565	CGG	2	6	26655	26660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
550	NC_009565	AGC	2	6	26741	26746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821212
551	NC_009565	TGA	2	6	26772	26777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821212
552	NC_009565	GCG	2	6	26801	26806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821212
553	NC_009565	CCAA	2	8	26823	26830	50 %	0 %	0 %	50 %	148821212
554	NC_009565	GCC	2	6	26845	26850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821212
555	NC_009565	CAGC	2	8	26889	26896	25 %	0 %	25 %	50 %	148821212
556	NC_009565	CCG	2	6	26900	26905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821212
557	NC_009565	CAC	2	6	26977	26982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821212
558	NC_009565	CAC	2	6	27166	27171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821213
559	NC_009565	CAG	2	6	27214	27219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821213
560	NC_009565	CGC	2	6	27255	27260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821213
561	NC_009565	GCA	2	6	27273	27278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821213
562	NC_009565	CGT	2	6	27279	27284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821213
563	NC_009565	GCC	2	6	27319	27324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821213
564	NC_009565	GCT	2	6	27393	27398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821213
565	NC_009565	GCG	2	6	27470	27475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821213
566	NC_009565	CGT	2	6	27486	27491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821213
567	NC_009565	CGGC	2	8	27709	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
568	NC_009565	GGC	2	6	27767	27772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821214
569	NC_009565	CA	3	6	27829	27834	50 %	0 %	0 %	50 %	148821214
570	NC_009565	GCC	2	6	27872	27877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821214
571	NC_009565	CGC	2	6	27902	27907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821214
572	NC_009565	CGC	2	6	27938	27943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821214
573	NC_009565	CCG	2	6	27968	27973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821214
574	NC_009565	GTC	2	6	27984	27989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821214
575	NC_009565	CGA	2	6	28078	28083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821214
576	NC_009565	TC	3	6	28109	28114	0 %	50 %	0 %	50 %	148821214
577	NC_009565	GCC	2	6	28149	28154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821214
578	NC_009565	CCGG	2	8	28195	28202	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
579	NC_009565	CG	3	6	28234	28239	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
580	NC_009565	GC	3	6	28240	28245	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
581	NC_009565	GTC	2	6	28301	28306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821214
582	NC_009565	TCGGCG	2	12	28336	28347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148821214
583	NC_009565	CGA	2	6	28349	28354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821214
584	NC_009565	GC	3	6	28393	28398	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
585	NC_009565	TCG	2	6	28417	28422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821214
586	NC_009565	ACG	2	6	28441	28446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821214
587	NC_009565	GCA	2	6	28457	28462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821214
588	NC_009565	TCA	2	6	28498	28503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821215
589	NC_009565	CAC	2	6	28546	28551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821215
590	NC_009565	CTG	2	6	28565	28570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821215
591	NC_009565	GGC	2	6	28639	28644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821215
592	NC_009565	CTG	2	6	28653	28658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821215
593	NC_009565	TCA	2	6	28686	28691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821215
594	NC_009565	CGG	2	6	28721	28726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821215
595	NC_009565	CGA	2	6	28744	28749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821215
596	NC_009565	GCTC	2	8	28751	28758	0 %	25 %	25 %	50 %	148821215
597	NC_009565	ACC	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821215
598	NC_009565	CGT	2	6	28811	28816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821215
599	NC_009565	GC	4	8	28828	28835	0 %	0 %	50 %	50 %	148821215
600	NC_009565	CGA	2	6	28859	28864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821215
601	NC_009565	ACG	2	6	28870	28875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821215
602	NC_009565	GGC	2	6	28882	28887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821215
603	NC_009565	TGCG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	148821215
604	NC_009565	CGC	2	6	28987	28992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821215
605	NC_009565	CAC	2	6	29104	29109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821215
606	NC_009565	CCGG	2	8	29155	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	148821215
607	NC_009565	CAA	2	6	29209	29214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821215
608	NC_009565	GTC	2	6	29219	29224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821215
609	NC_009565	CAA	2	6	29269	29274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821215
610	NC_009565	GGCAA	2	10	29402	29411	40 %	0 %	40 %	20 %	148821216
611	NC_009565	ACG	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821216
612	NC_009565	GC	3	6	29461	29466	0 %	0 %	50 %	50 %	148821216
613	NC_009565	CGTC	2	8	29486	29493	0 %	25 %	25 %	50 %	148821216
614	NC_009565	CG	3	6	29523	29528	0 %	0 %	50 %	50 %	148821216
615	NC_009565	GGATCA	2	12	29534	29545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148821216
616	NC_009565	AGC	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821216
617	NC_009565	GTC	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821216
618	NC_009565	GCC	3	9	29628	29636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821216
619	NC_009565	CACG	2	8	29846	29853	25 %	0 %	25 %	50 %	148821217
620	NC_009565	ACCG	2	8	29927	29934	25 %	0 %	25 %	50 %	148821217
621	NC_009565	GGT	2	6	29945	29950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821217
622	NC_009565	CGC	2	6	30056	30061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821217
623	NC_009565	AGC	2	6	30083	30088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821217
624	NC_009565	GTC	2	6	30132	30137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821217
625	NC_009565	CGATC	2	10	30228	30237	20 %	20 %	20 %	40 %	148821217
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627	NC_009565	CG	3	6	30254	30259	0 %	0 %	50 %	50 %	148821217
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