MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 40690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	TTTTA	3	15	107	121	20 %	80 %	0 %	0 %	148642061
2	NC_009515	TCA	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
3	NC_009515	ACA	2	6	217	222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
4	NC_009515	TCA	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
5	NC_009515	TTC	2	6	267	272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
6	NC_009515	ATTT	2	8	284	291	25 %	75 %	0 %	0 %	148642061
7	NC_009515	ATT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
8	NC_009515	ATT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
9	NC_009515	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
10	NC_009515	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
11	NC_009515	T	9	9	490	498	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
12	NC_009515	ACAG	2	8	572	579	50 %	0 %	25 %	25 %	148642061
13	NC_009515	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
14	NC_009515	TAAA	2	8	608	615	75 %	25 %	0 %	0 %	148642061
15	NC_009515	T	6	6	630	635	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
16	NC_009515	ATT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
17	NC_009515	AT	3	6	664	669	50 %	50 %	0 %	0 %	148642061
18	NC_009515	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
19	NC_009515	CAG	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642061
20	NC_009515	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642061
21	NC_009515	TTTG	2	8	757	764	0 %	75 %	25 %	0 %	148642061
22	NC_009515	T	6	6	883	888	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
23	NC_009515	AAC	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
24	NC_009515	CAGCT	2	10	924	933	20 %	20 %	20 %	40 %	148642061
25	NC_009515	TGC	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642061
26	NC_009515	T	6	6	1020	1025	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
27	NC_009515	TCC	3	9	1086	1094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642061
28	NC_009515	TGTTT	2	10	1122	1131	0 %	80 %	20 %	0 %	148642061
29	NC_009515	CTGTA	2	10	1176	1185	20 %	40 %	20 %	20 %	148642061
30	NC_009515	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
31	NC_009515	T	6	6	1217	1222	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
32	NC_009515	TGT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642061
33	NC_009515	TTA	2	6	1268	1273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
34	NC_009515	T	7	7	1280	1286	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
35	NC_009515	T	6	6	1305	1310	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
36	NC_009515	CTT	2	6	1325	1330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
37	NC_009515	CAC	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642061
38	NC_009515	ACA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
39	NC_009515	TAG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642061
40	NC_009515	ATC	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
41	NC_009515	T	7	7	1640	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	148642061
42	NC_009515	ATCA	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	148642061
43	NC_009515	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
44	NC_009515	TTC	2	6	1689	1694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
45	NC_009515	GAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
46	NC_009515	AACCT	2	10	2139	2148	40 %	20 %	0 %	40 %	148642062
47	NC_009515	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
48	NC_009515	GAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
49	NC_009515	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
50	NC_009515	ACA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
51	NC_009515	AT	3	6	2312	2317	50 %	50 %	0 %	0 %	148642062
52	NC_009515	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642062
53	NC_009515	AAG	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
54	NC_009515	A	7	7	2430	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
55	NC_009515	A	6	6	2443	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
56	NC_009515	AGCAA	2	10	2464	2473	60 %	0 %	20 %	20 %	148642062
57	NC_009515	GTTG	2	8	2564	2571	0 %	50 %	50 %	0 %	148642062
58	NC_009515	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
59	NC_009515	TGA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
60	NC_009515	TA	3	6	2646	2651	50 %	50 %	0 %	0 %	148642062
61	NC_009515	ACA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
62	NC_009515	ATGAT	2	10	2737	2746	40 %	40 %	20 %	0 %	148642062
63	NC_009515	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
64	NC_009515	A	7	7	2810	2816	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
65	NC_009515	GCTGAA	2	12	2817	2828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148642062
66	NC_009515	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
67	NC_009515	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
68	NC_009515	T	7	7	2845	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	148642062
69	NC_009515	AAG	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
70	NC_009515	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	148642062
71	NC_009515	TGA	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
72	NC_009515	GA	3	6	2925	2930	50 %	0 %	50 %	0 %	148642062
73	NC_009515	AC	3	6	2996	3001	50 %	0 %	0 %	50 %	148642062
74	NC_009515	AAC	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
75	NC_009515	AT	3	6	3086	3091	50 %	50 %	0 %	0 %	148642062
76	NC_009515	TAA	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
77	NC_009515	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
78	NC_009515	ATA	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642063
79	NC_009515	AGA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642063
80	NC_009515	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
81	NC_009515	CAG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
82	NC_009515	TAG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642063
83	NC_009515	TTA	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
84	NC_009515	TAT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
85	NC_009515	TGT	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642063
86	NC_009515	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
87	NC_009515	GCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642063
88	NC_009515	ACC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642063
89	NC_009515	GCA	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
90	NC_009515	CA	3	6	4289	4294	50 %	0 %	0 %	50 %	148642063
91	NC_009515	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
92	NC_009515	ATT	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
93	NC_009515	T	6	6	4482	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	148642064
94	NC_009515	ATA	2	6	4552	4557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642064
95	NC_009515	TA	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	148642064
96	NC_009515	ATT	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
97	NC_009515	GTACCT	2	12	4640	4651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642064
98	NC_009515	TTTTCC	2	12	4689	4700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642064
99	NC_009515	TTA	2	6	4719	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
100	NC_009515	A	6	6	4765	4770	100 %	0 %	0 %	0 %	148642064
101	NC_009515	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
102	NC_009515	CA	3	6	4886	4891	50 %	0 %	0 %	50 %	148642064
103	NC_009515	CTT	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642064
104	NC_009515	ATAA	2	8	5018	5025	75 %	25 %	0 %	0 %	148642065
105	NC_009515	T	6	6	5067	5072	0 %	100 %	0 %	0 %	148642065
106	NC_009515	ACAG	2	8	5102	5109	50 %	0 %	25 %	25 %	148642065
107	NC_009515	TTA	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642065
108	NC_009515	T	8	8	5243	5250	0 %	100 %	0 %	0 %	148642065
109	NC_009515	TTGT	2	8	5591	5598	0 %	75 %	25 %	0 %	148642067
110	NC_009515	T	6	6	5712	5717	0 %	100 %	0 %	0 %	148642067
111	NC_009515	CTTT	2	8	5750	5757	0 %	75 %	0 %	25 %	148642067
112	NC_009515	AGC	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642067
113	NC_009515	TCG	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642067
114	NC_009515	T	7	7	5857	5863	0 %	100 %	0 %	0 %	148642067
115	NC_009515	CTG	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642067
116	NC_009515	CAAA	2	8	6139	6146	75 %	0 %	0 %	25 %	148642068
117	NC_009515	T	7	7	6199	6205	0 %	100 %	0 %	0 %	148642068
118	NC_009515	A	6	6	6210	6215	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
119	NC_009515	A	6	6	6225	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
120	NC_009515	ATA	2	6	6300	6305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
121	NC_009515	A	6	6	6359	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
122	NC_009515	ACAA	2	8	6381	6388	75 %	0 %	0 %	25 %	148642068
123	NC_009515	ACA	2	6	6404	6409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642068
124	NC_009515	A	6	6	6437	6442	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
125	NC_009515	A	7	7	6448	6454	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
126	NC_009515	AAT	2	6	6467	6472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
127	NC_009515	AAT	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
128	NC_009515	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
129	NC_009515	TCA	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642068
130	NC_009515	GAA	2	6	6641	6646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642068
131	NC_009515	TAT	2	6	6680	6685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642068
132	NC_009515	ATG	2	6	6690	6695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642068
133	NC_009515	A	6	6	6799	6804	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
134	NC_009515	A	6	6	6809	6814	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
135	NC_009515	CATT	2	8	6843	6850	25 %	50 %	0 %	25 %	148642068
136	NC_009515	AAC	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642068
137	NC_009515	AGA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642068
138	NC_009515	A	6	6	7030	7035	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
139	NC_009515	A	7	7	7054	7060	100 %	0 %	0 %	0 %	148642068
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250	NC_009515	TGA	2	6	12216	12221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642076
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402	NC_009515	GGCT	2	8	20089	20096	0 %	25 %	50 %	25 %	148642087
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