MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 40690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009515	TCT	2	6	541499	541504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642625
11502	NC_009515	T	6	6	541506	541511	0 %	100 %	0 %	0 %	148642625
11503	NC_009515	ATT	2	6	541556	541561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642625
11504	NC_009515	AAG	2	6	541571	541576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642625
11505	NC_009515	AAG	2	6	541578	541583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642625
11506	NC_009515	TTG	2	6	541768	541773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642625
11507	NC_009515	ACC	2	6	541777	541782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642625
11508	NC_009515	GCT	2	6	541835	541840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642625
11509	NC_009515	TTC	2	6	541852	541857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642625
11510	NC_009515	ATCTTC	2	12	541876	541887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642625
11511	NC_009515	T	7	7	541972	541978	0 %	100 %	0 %	0 %	148642625
11512	NC_009515	CAA	2	6	541986	541991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642625
11513	NC_009515	CAT	3	9	542001	542009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642625
11514	NC_009515	TCAT	2	8	542066	542073	25 %	50 %	0 %	25 %	148642625
11515	NC_009515	TGA	2	6	542088	542093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642625
11516	NC_009515	T	6	6	542165	542170	0 %	100 %	0 %	0 %	148642625
11517	NC_009515	A	6	6	542188	542193	100 %	0 %	0 %	0 %	148642625
11518	NC_009515	ATT	2	6	542222	542227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642625
11519	NC_009515	CAA	2	6	542259	542264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642626
11520	NC_009515	TAATAC	2	12	542284	542295	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642626
11521	NC_009515	AAT	2	6	542296	542301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642626
11522	NC_009515	CTG	3	9	542310	542318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642626
11523	NC_009515	CATA	2	8	542433	542440	50 %	25 %	0 %	25 %	148642626
11524	NC_009515	GCT	3	9	542444	542452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642626
11525	NC_009515	ATT	2	6	542492	542497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642626
11526	NC_009515	TGC	2	6	542506	542511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642626
11527	NC_009515	CCT	2	6	542564	542569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642626
11528	NC_009515	AGA	2	6	542590	542595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642626
11529	NC_009515	TTG	2	6	542622	542627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642626
11530	NC_009515	TCC	2	6	542653	542658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642626
11531	NC_009515	ACA	2	6	542690	542695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642626
11532	NC_009515	A	6	6	542695	542700	100 %	0 %	0 %	0 %	148642626
11533	NC_009515	CCAAA	2	10	542703	542712	60 %	0 %	0 %	40 %	148642626
11534	NC_009515	TGA	2	6	542763	542768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642626
11535	NC_009515	TTTGA	2	10	542781	542790	20 %	60 %	20 %	0 %	148642626
11536	NC_009515	TAT	2	6	542839	542844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642626
11537	NC_009515	GCA	2	6	542846	542851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642626
11538	NC_009515	AT	3	6	542863	542868	50 %	50 %	0 %	0 %	148642626
11539	NC_009515	AAT	2	6	542875	542880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642626
11540	NC_009515	CCTTC	2	10	542897	542906	0 %	40 %	0 %	60 %	148642626
11541	NC_009515	TAA	2	6	542943	542948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642626
11542	NC_009515	GTAAT	2	10	542997	543006	40 %	40 %	20 %	0 %	148642626
11543	NC_009515	CATT	2	8	543030	543037	25 %	50 %	0 %	25 %	148642626
11544	NC_009515	TTCA	2	8	543071	543078	25 %	50 %	0 %	25 %	148642626
11545	NC_009515	ATTT	2	8	543101	543108	25 %	75 %	0 %	0 %	148642627
11546	NC_009515	AGC	2	6	543135	543140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642627
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11548	NC_009515	ACA	2	6	543157	543162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642627
11549	NC_009515	AAT	2	6	543172	543177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642627
11550	NC_009515	TGTT	2	8	543221	543228	0 %	75 %	25 %	0 %	148642627
11551	NC_009515	TAA	2	6	543344	543349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642627
11552	NC_009515	ATA	2	6	543373	543378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642627
11553	NC_009515	TGC	2	6	543417	543422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642627
11554	NC_009515	ATA	2	6	543472	543477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642627
11555	NC_009515	AGC	2	6	543507	543512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642627
11556	NC_009515	ACA	2	6	543553	543558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642627
11557	NC_009515	A	6	6	543579	543584	100 %	0 %	0 %	0 %	148642627
11558	NC_009515	ACT	2	6	543592	543597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642627
11559	NC_009515	ATTTT	2	10	543641	543650	20 %	80 %	0 %	0 %	148642627
11560	NC_009515	TTC	2	6	543663	543668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642627
11561	NC_009515	ATA	2	6	543683	543688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642627
11562	NC_009515	AAAGT	2	10	543716	543725	60 %	20 %	20 %	0 %	148642627
11563	NC_009515	A	6	6	543799	543804	100 %	0 %	0 %	0 %	148642627
11564	NC_009515	A	6	6	543918	543923	100 %	0 %	0 %	0 %	148642627
11565	NC_009515	TAA	2	6	543977	543982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642628
11566	NC_009515	T	6	6	543983	543988	0 %	100 %	0 %	0 %	148642628
11567	NC_009515	ACC	2	6	544005	544010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642628
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11569	NC_009515	CAAT	2	8	544027	544034	50 %	25 %	0 %	25 %	148642628
11570	NC_009515	TAG	2	6	544115	544120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642628
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11572	NC_009515	ATC	2	6	544161	544166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642628
11573	NC_009515	AAC	2	6	544248	544253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642628
11574	NC_009515	CAT	2	6	544256	544261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642628
11575	NC_009515	CTT	2	6	544319	544324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642628
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11577	NC_009515	TCA	2	6	544411	544416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642628
11578	NC_009515	ATTG	2	8	544443	544450	25 %	50 %	25 %	0 %	148642628
11579	NC_009515	CAG	2	6	544532	544537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642628
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11581	NC_009515	TGA	2	6	544680	544685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642628
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11585	NC_009515	GAG	2	6	544950	544955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148642629
11586	NC_009515	TGG	2	6	544956	544961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148642629
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11588	NC_009515	AAT	2	6	544999	545004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642629
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11592	NC_009515	TAT	2	6	545116	545121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642629
11593	NC_009515	ATTT	2	8	545130	545137	25 %	75 %	0 %	0 %	148642629
11594	NC_009515	TTC	2	6	545155	545160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642629
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11600	NC_009515	TCA	2	6	545492	545497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642629
11601	NC_009515	AT	3	6	545579	545584	50 %	50 %	0 %	0 %	148642629
11602	NC_009515	ATCA	2	8	545647	545654	50 %	25 %	0 %	25 %	148642629
11603	NC_009515	TTCC	2	8	545673	545680	0 %	50 %	0 %	50 %	148642629
11604	NC_009515	AGC	2	6	545696	545701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642629
11605	NC_009515	CGT	2	6	545714	545719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642629
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11610	NC_009515	T	6	6	545975	545980	0 %	100 %	0 %	0 %	148642630
11611	NC_009515	ATC	2	6	546003	546008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642630
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11613	NC_009515	AAT	2	6	546091	546096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642630
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11617	NC_009515	TA	3	6	546296	546301	50 %	50 %	0 %	0 %	148642630
11618	NC_009515	ATT	2	6	546303	546308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642630
11619	NC_009515	ATAA	2	8	546329	546336	75 %	25 %	0 %	0 %	148642630
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11986	NC_009515	T	6	6	563042	563047	0 %	100 %	0 %	0 %	148642649
11987	NC_009515	ATA	2	6	563056	563061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642649
11988	NC_009515	TCA	2	6	563064	563069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642649
11989	NC_009515	CAA	2	6	563098	563103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642649
11990	NC_009515	TAA	2	6	563114	563119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642649
11991	NC_009515	TTAAT	2	10	563128	563137	40 %	60 %	0 %	0 %	148642649
11992	NC_009515	AAT	2	6	563141	563146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642649
11993	NC_009515	T	6	6	563153	563158	0 %	100 %	0 %	0 %	148642649
11994	NC_009515	TCAT	2	8	563169	563176	25 %	50 %	0 %	25 %	148642649
11995	NC_009515	CAT	2	6	563210	563215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642649
11996	NC_009515	AGC	2	6	563249	563254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642649
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11998	NC_009515	ATC	3	9	563282	563290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642649
11999	NC_009515	TTC	2	6	563315	563320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642649
12000	NC_009515	CAA	2	6	563359	563364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642649

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