MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009464	CTC	2	6	252489	252494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918927
4002	NC_009464	CTG	2	6	252547	252552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4003	NC_009464	AGC	2	6	252643	252648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4004	NC_009464	AGC	3	9	252691	252699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4005	NC_009464	AGC	2	6	252703	252708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4006	NC_009464	GCT	2	6	252732	252737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4007	NC_009464	TCG	3	9	252751	252759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4008	NC_009464	CGT	2	6	252762	252767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4009	NC_009464	GAC	2	6	252822	252827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918927
4010	NC_009464	ACC	2	6	252908	252913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918927
4011	NC_009464	TGGC	2	8	252925	252932	0 %	25 %	50 %	25 %	147918927
4012	NC_009464	CTA	2	6	252956	252961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918927
4013	NC_009464	CA	3	6	252962	252967	50 %	0 %	0 %	50 %	147918927
4014	NC_009464	CGG	2	6	253192	253197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918928
4015	NC_009464	CGA	2	6	253237	253242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918928
4016	NC_009464	CGT	2	6	253278	253283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918928
4017	NC_009464	GCG	2	6	253355	253360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918928
4018	NC_009464	ATG	2	6	253406	253411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918928
4019	NC_009464	GGC	2	6	253450	253455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918928
4020	NC_009464	TGG	2	6	253458	253463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918928
4021	NC_009464	GA	3	6	253502	253507	50 %	0 %	50 %	0 %	147918928
4022	NC_009464	GGC	2	6	253632	253637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918928
4023	NC_009464	ATC	2	6	253769	253774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918928
4024	NC_009464	GAA	2	6	253846	253851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918928
4025	NC_009464	GCC	2	6	253870	253875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918928
4026	NC_009464	AAC	2	6	253949	253954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918928
4027	NC_009464	TCTT	2	8	254118	254125	0 %	75 %	0 %	25 %	147918929
4028	NC_009464	AGA	2	6	254149	254154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918929
4029	NC_009464	GAG	2	6	254186	254191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918929
4030	NC_009464	TCCCA	2	10	254223	254232	20 %	20 %	0 %	60 %	147918929
4031	NC_009464	GCT	2	6	254234	254239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
4032	NC_009464	CTG	2	6	254327	254332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
4033	NC_009464	CAG	2	6	254450	254455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918929
4034	NC_009464	ATC	2	6	254459	254464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918929
4035	NC_009464	CAG	2	6	254471	254476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918929
4036	NC_009464	CTT	2	6	254585	254590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918929
4037	NC_009464	TCG	2	6	254601	254606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
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4039	NC_009464	GTC	2	6	254624	254629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
4040	NC_009464	GTT	2	6	254672	254677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918929
4041	NC_009464	TCG	2	6	254679	254684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
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4043	NC_009464	ATG	2	6	254808	254813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918929
4044	NC_009464	GAG	2	6	254825	254830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918929
4045	NC_009464	ATG	2	6	254832	254837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918929
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4047	NC_009464	TCG	2	6	254971	254976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
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4049	NC_009464	CGT	2	6	255100	255105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918929
4050	NC_009464	CA	3	6	255116	255121	50 %	0 %	0 %	50 %	147918929
4051	NC_009464	TCG	2	6	255574	255579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918930
4052	NC_009464	CCAG	2	8	255665	255672	25 %	0 %	25 %	50 %	147918930
4053	NC_009464	TCG	2	6	255775	255780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918930
4054	NC_009464	AGG	2	6	255788	255793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918930
4055	NC_009464	CAA	2	6	255848	255853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918930
4056	NC_009464	AAG	2	6	255875	255880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918930
4057	NC_009464	GAC	2	6	255945	255950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918930
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4059	NC_009464	TGA	2	6	256051	256056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918930
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4061	NC_009464	CGG	2	6	256163	256168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918930
4062	NC_009464	GA	3	6	256281	256286	50 %	0 %	50 %	0 %	147918930
4063	NC_009464	GATC	2	8	256351	256358	25 %	25 %	25 %	25 %	147918931
4064	NC_009464	CGA	2	6	256396	256401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918931
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4083	NC_009464	TCA	2	6	257478	257483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918931
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4101	NC_009464	AAT	2	6	258659	258664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918932
4102	NC_009464	ACA	2	6	258760	258765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918932
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4105	NC_009464	AAT	2	6	258889	258894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918932
4106	NC_009464	TAA	2	6	258900	258905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918932
4107	NC_009464	ACT	2	6	258926	258931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918932
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4110	NC_009464	ATA	2	6	259096	259101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918933
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4112	NC_009464	ATA	2	6	259128	259133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918933
4113	NC_009464	TTA	2	6	259144	259149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918933
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4118	NC_009464	GAA	3	9	259230	259238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918933
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4120	NC_009464	TAA	2	6	259268	259273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918933
4121	NC_009464	TA	3	6	259312	259317	50 %	50 %	0 %	0 %	147918933
4122	NC_009464	AT	3	6	259335	259340	50 %	50 %	0 %	0 %	147918933
4123	NC_009464	TAA	2	6	259343	259348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918933
4124	NC_009464	TCC	2	6	259361	259366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918933
4125	NC_009464	ATAA	2	8	259380	259387	75 %	25 %	0 %	0 %	147918933
4126	NC_009464	AT	3	6	259396	259401	50 %	50 %	0 %	0 %	147918933
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4143	NC_009464	CTG	2	6	260767	260772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918935
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4152	NC_009464	GTC	2	6	261114	261119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918935
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4155	NC_009464	CTG	2	6	261277	261282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918935
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4229	NC_009464	A	6	6	265847	265852	100 %	0 %	0 %	0 %	147918940
4230	NC_009464	GGCT	2	8	265888	265895	0 %	25 %	50 %	25 %	147918940
4231	NC_009464	ATT	2	6	266034	266039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918941
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4233	NC_009464	GCA	2	6	266105	266110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918941
4234	NC_009464	ACCAGC	2	12	266122	266133	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	147918941
4235	NC_009464	CGA	2	6	266156	266161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918941
4236	NC_009464	GTC	2	6	266200	266205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918941
4237	NC_009464	GGC	2	6	266293	266298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918941
4238	NC_009464	TGAAGT	2	12	266325	266336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918941
4239	NC_009464	ACT	2	6	266348	266353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918941
4240	NC_009464	ATCAAG	2	12	266443	266454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	147918941
4241	NC_009464	GCA	2	6	266540	266545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918941
4242	NC_009464	CCA	2	6	266630	266635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918941
4243	NC_009464	TGC	2	6	266708	266713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918941
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4246	NC_009464	T	6	6	266813	266818	0 %	100 %	0 %	0 %	147918942
4247	NC_009464	ATGCGA	2	12	266907	266918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	147918942
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4252	NC_009464	TGA	2	6	267331	267336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918942
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4254	NC_009464	CGGTGA	2	12	267379	267390	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147918942
4255	NC_009464	TCT	2	6	267400	267405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918942
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4259	NC_009464	GAT	3	9	267554	267562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918942
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4268	NC_009464	GTA	2	6	268013	268018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918942
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4479	NC_009464	CCT	2	6	279089	279094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918954
4480	NC_009464	TCT	2	6	279107	279112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918954
4481	NC_009464	TTG	2	6	279136	279141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918954
4482	NC_009464	TCT	2	6	279152	279157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918954
4483	NC_009464	TTG	2	6	279250	279255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918954
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