MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_009464	CGG	2	6	2406326	2406331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921053
41002	NC_009464	GTC	2	6	2406354	2406359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921053
41003	NC_009464	CTT	2	6	2406441	2406446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921053
41004	NC_009464	GGGC	2	8	2406494	2406501	0 %	0 %	75 %	25 %	147921053
41005	NC_009464	GCAT	2	8	2406557	2406564	25 %	25 %	25 %	25 %	147921053
41006	NC_009464	GCC	2	6	2406654	2406659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921053
41007	NC_009464	TGC	2	6	2406685	2406690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921053
41008	NC_009464	CCG	2	6	2406742	2406747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921053
41009	NC_009464	TCG	2	6	2406829	2406834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921053
41010	NC_009464	TGC	2	6	2406950	2406955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921053
41011	NC_009464	AGTC	2	8	2406980	2406987	25 %	25 %	25 %	25 %	147921053
41012	NC_009464	GCC	2	6	2406999	2407004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921053
41013	NC_009464	GAA	2	6	2407038	2407043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921053
41014	NC_009464	GTA	2	6	2407053	2407058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921053
41015	NC_009464	CTT	2	6	2407133	2407138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921053
41016	NC_009464	GGTCAT	2	12	2407200	2407211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147921053
41017	NC_009464	TAGCT	2	10	2407234	2407243	20 %	40 %	20 %	20 %	147921053
41018	NC_009464	CACT	2	8	2407250	2407257	25 %	25 %	0 %	50 %	147921053
41019	NC_009464	AGC	2	6	2407529	2407534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921054
41020	NC_009464	CGG	2	6	2407547	2407552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921054
41021	NC_009464	GAT	2	6	2407767	2407772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921054
41022	NC_009464	TAC	2	6	2407897	2407902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921054
41023	NC_009464	GGGCG	2	10	2407956	2407965	0 %	0 %	80 %	20 %	147921054
41024	NC_009464	CGGCT	2	10	2408005	2408014	0 %	20 %	40 %	40 %	147921054
41025	NC_009464	GAC	2	6	2408026	2408031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921054
41026	NC_009464	GCCAG	2	10	2408042	2408051	20 %	0 %	40 %	40 %	147921054
41027	NC_009464	AGA	2	6	2408067	2408072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921054
41028	NC_009464	CAT	2	6	2408226	2408231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921054
41029	NC_009464	GCG	2	6	2408234	2408239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921054
41030	NC_009464	TTC	2	6	2408272	2408277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921054
41031	NC_009464	ACGAT	2	10	2408285	2408294	40 %	20 %	20 %	20 %	147921054
41032	NC_009464	TGC	2	6	2408345	2408350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921054
41033	NC_009464	GGA	2	6	2408373	2408378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921054
41034	NC_009464	ACT	2	6	2408396	2408401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921054
41035	NC_009464	GCG	2	6	2408439	2408444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921055
41036	NC_009464	GAA	2	6	2408542	2408547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921055
41037	NC_009464	TCG	2	6	2408574	2408579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921055
41038	NC_009464	GGCGA	2	10	2408588	2408597	20 %	0 %	60 %	20 %	147921055
41039	NC_009464	GCA	2	6	2408619	2408624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921055
41040	NC_009464	AAC	2	6	2408663	2408668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921055
41041	NC_009464	CCG	2	6	2408679	2408684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921055
41042	NC_009464	GGC	2	6	2408695	2408700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921055
41043	NC_009464	CAT	2	6	2408722	2408727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921055
41044	NC_009464	CAT	2	6	2408743	2408748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921055
41045	NC_009464	CCAACA	2	12	2408751	2408762	50 %	0 %	0 %	50 %	147921055
41046	NC_009464	TCG	2	6	2408772	2408777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921055
41047	NC_009464	CA	3	6	2408783	2408788	50 %	0 %	0 %	50 %	147921055
41048	NC_009464	A	6	6	2408788	2408793	100 %	0 %	0 %	0 %	147921055
41049	NC_009464	CAT	2	6	2408842	2408847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921055
41050	NC_009464	ATCAC	2	10	2408862	2408871	40 %	20 %	0 %	40 %	147921055
41051	NC_009464	CGT	2	6	2408938	2408943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921055
41052	NC_009464	ATG	2	6	2408948	2408953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921055
41053	NC_009464	AGC	2	6	2408995	2409000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921055
41054	NC_009464	TCT	2	6	2409494	2409499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921056
41055	NC_009464	TTCATG	2	12	2409504	2409515	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	147921056
41056	NC_009464	TGG	2	6	2409520	2409525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921056
41057	NC_009464	CCT	2	6	2409557	2409562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921056
41058	NC_009464	TGG	2	6	2409565	2409570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921056
41059	NC_009464	GTG	2	6	2409600	2409605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921056
41060	NC_009464	ATA	2	6	2409618	2409623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147921056
41061	NC_009464	CGG	2	6	2409638	2409643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921056
41062	NC_009464	TGGACG	2	12	2409646	2409657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147921056
41063	NC_009464	GTG	2	6	2409663	2409668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921056
41064	NC_009464	AGG	2	6	2409679	2409684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921056
41065	NC_009464	ATC	2	6	2409697	2409702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921056
41066	NC_009464	GAG	3	9	2409714	2409722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921056
41067	NC_009464	GCT	2	6	2409808	2409813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921056
41068	NC_009464	TGG	2	6	2409824	2409829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921056
41069	NC_009464	TGA	2	6	2409833	2409838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147921056
41070	NC_009464	CGG	2	6	2409905	2409910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921056
41071	NC_009464	GCG	2	6	2409928	2409933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921056
41072	NC_009464	TGAG	2	8	2409941	2409948	25 %	25 %	50 %	0 %	147921056
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41075	NC_009464	CGG	2	6	2410070	2410075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921056
41076	NC_009464	TCG	2	6	2410193	2410198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921056
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41082	NC_009464	CAG	2	6	2410383	2410388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921056
41083	NC_009464	TAAA	2	8	2410407	2410414	75 %	25 %	0 %	0 %	147921056
41084	NC_009464	GCG	2	6	2410466	2410471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921056
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41087	NC_009464	CTG	2	6	2410524	2410529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921056
41088	NC_009464	CAT	2	6	2410536	2410541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921056
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41090	NC_009464	TCA	2	6	2410661	2410666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921057
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41094	NC_009464	GGC	2	6	2411121	2411126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147921057
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41096	NC_009464	GTTATG	2	12	2411268	2411279	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	147921058
41097	NC_009464	AG	3	6	2411300	2411305	50 %	0 %	50 %	0 %	147921058
41098	NC_009464	TGG	2	6	2411413	2411418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921058
41099	NC_009464	GCT	2	6	2411453	2411458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921058
41100	NC_009464	CGA	2	6	2411476	2411481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921058
41101	NC_009464	GGA	2	6	2411486	2411491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921058
41102	NC_009464	AGG	2	6	2411580	2411585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921058
41103	NC_009464	CGGATG	2	12	2411637	2411648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147921058
41104	NC_009464	ACT	2	6	2411656	2411661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921058
41105	NC_009464	GCC	2	6	2411664	2411669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921058
41106	NC_009464	CGT	2	6	2411684	2411689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921058
41107	NC_009464	CAA	2	6	2411702	2411707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147921058
41108	NC_009464	GCT	2	6	2411714	2411719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921058
41109	NC_009464	ACGGCG	2	12	2411740	2411751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	147921058
41110	NC_009464	CAT	2	6	2411831	2411836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921058
41111	NC_009464	GCC	2	6	2411843	2411848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921058
41112	NC_009464	GACG	2	8	2411873	2411880	25 %	0 %	50 %	25 %	147921058
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41114	NC_009464	GAG	2	6	2411904	2411909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147921058
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41225	NC_009464	TTTATA	2	12	2418844	2418855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147921065
41226	NC_009464	GCT	2	6	2418915	2418920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921065
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41228	NC_009464	TCG	2	6	2419093	2419098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921065
41229	NC_009464	GCT	2	6	2419209	2419214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921065
41230	NC_009464	CGT	2	6	2419513	2419518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921066
41231	NC_009464	CGT	2	6	2419561	2419566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921066
41232	NC_009464	CTG	2	6	2419571	2419576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921066
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41258	NC_009464	TCTT	2	8	2420850	2420857	0 %	75 %	0 %	25 %	147921066
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41333	NC_009464	CGAAGA	2	12	2424452	2424463	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	147921071
41334	NC_009464	AAG	2	6	2424475	2424480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147921071
41335	NC_009464	ATAGC	2	10	2424750	2424759	40 %	20 %	20 %	20 %	147921072
41336	NC_009464	GC	3	6	2424758	2424763	0 %	0 %	50 %	50 %	147921072
41337	NC_009464	TTC	2	6	2424768	2424773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147921072
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41340	NC_009464	CTC	2	6	2424923	2424928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147921072
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41342	NC_009464	ATC	2	6	2424957	2424962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921072
41343	NC_009464	TGG	2	6	2425225	2425230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147921073
41344	NC_009464	TGC	2	6	2425278	2425283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921073
41345	NC_009464	GCC	2	6	2425284	2425289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147921073
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41372	NC_009464	CTG	3	9	2427202	2427210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921076
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41380	NC_009464	CTG	2	6	2427580	2427585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147921076
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41455	NC_009464	ACG	2	6	2431251	2431256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921079
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41459	NC_009464	AGC	2	6	2431340	2431345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147921079
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41485	NC_009464	ACT	2	6	2432953	2432958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147921080
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