MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009464	ATT	2	6	187511	187516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918860
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3004	NC_009464	CAG	2	6	187840	187845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918860
3005	NC_009464	TAT	2	6	187900	187905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918860
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3007	NC_009464	TCA	2	6	188181	188186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918860
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3011	NC_009464	ATC	2	6	188420	188425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918860
3012	NC_009464	TCG	2	6	188463	188468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918860
3013	NC_009464	TTG	2	6	188482	188487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918860
3014	NC_009464	ATC	2	6	188561	188566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918860
3015	NC_009464	TTG	2	6	188764	188769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918861
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3017	NC_009464	GTA	2	6	188855	188860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918861
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3022	NC_009464	TCTT	2	8	189462	189469	0 %	75 %	0 %	25 %	147918862
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3029	NC_009464	TTG	2	6	189693	189698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918862
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3035	NC_009464	TCTTT	2	10	189973	189982	0 %	80 %	0 %	20 %	147918862
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3039	NC_009464	TTGCGC	2	12	190248	190259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918862
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3041	NC_009464	TAA	2	6	190402	190407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918862
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3052	NC_009464	TAT	2	6	191122	191127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918863
3053	NC_009464	GCA	2	6	191130	191135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918863
3054	NC_009464	AGT	2	6	191258	191263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918863
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3064	NC_009464	AGC	2	6	191917	191922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918864
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3091	NC_009464	CAT	2	6	193565	193570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918866
3092	NC_009464	CAT	2	6	193590	193595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918866
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3101	NC_009464	CGA	2	6	195383	195388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918868
3102	NC_009464	AAT	2	6	195477	195482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918868
3103	NC_009464	GCA	2	6	195543	195548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918868
3104	NC_009464	CCTG	2	8	195565	195572	0 %	25 %	25 %	50 %	147918868
3105	NC_009464	AGC	2	6	195611	195616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918868
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3120	NC_009464	A	6	6	196796	196801	100 %	0 %	0 %	0 %	147918869
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3240	NC_009464	GAT	2	6	204603	204608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918875
3241	NC_009464	GCC	2	6	204663	204668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918875
3242	NC_009464	GAT	2	6	204720	204725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918875
3243	NC_009464	AAGG	2	8	204805	204812	50 %	0 %	50 %	0 %	147918876
3244	NC_009464	TGA	2	6	204905	204910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918876
3245	NC_009464	TCGA	2	8	204925	204932	25 %	25 %	25 %	25 %	147918876
3246	NC_009464	ATG	2	6	204973	204978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918876
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3249	NC_009464	CCGGG	2	10	205301	205310	0 %	0 %	60 %	40 %	147918876
3250	NC_009464	CAT	2	6	205311	205316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918876
3251	NC_009464	TGA	2	6	205385	205390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918876
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3253	NC_009464	AGC	2	6	205426	205431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918876
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3257	NC_009464	A	6	6	205531	205536	100 %	0 %	0 %	0 %	147918876
3258	NC_009464	CTGG	2	8	205540	205547	0 %	25 %	50 %	25 %	147918876
3259	NC_009464	GTCA	2	8	205572	205579	25 %	25 %	25 %	25 %	147918876
3260	NC_009464	C	6	6	205901	205906	0 %	0 %	0 %	100 %	147918877
3261	NC_009464	GCA	2	6	205913	205918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918877
3262	NC_009464	CAT	2	6	205929	205934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918877
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3267	NC_009464	GTA	2	6	206287	206292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918877
3268	NC_009464	GAT	2	6	206365	206370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918877
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3273	NC_009464	ATC	2	6	206704	206709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918877
3274	NC_009464	TA	3	6	207387	207392	50 %	50 %	0 %	0 %	147918878
3275	NC_009464	CAG	2	6	207394	207399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918878
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3278	NC_009464	G	6	6	207499	207504	0 %	0 %	100 %	0 %	147918878
3279	NC_009464	AACCTG	2	12	207601	207612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147918878
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3281	NC_009464	GT	3	6	207693	207698	0 %	50 %	50 %	0 %	147918878
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3287	NC_009464	CAGT	2	8	207976	207983	25 %	25 %	25 %	25 %	147918878
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3343	NC_009464	CAT	2	6	211321	211326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918881
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3345	NC_009464	AGA	2	6	211357	211362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918881
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3347	NC_009464	CAG	2	6	211411	211416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918881
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3349	NC_009464	TTC	2	6	211521	211526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918881
3350	NC_009464	CGC	2	6	211567	211572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918882
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3352	NC_009464	CCT	2	6	211594	211599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918882
3353	NC_009464	T	7	7	211602	211608	0 %	100 %	0 %	0 %	147918882
3354	NC_009464	GGC	2	6	211616	211621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918882
3355	NC_009464	TAC	2	6	211658	211663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918882
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3358	NC_009464	GGA	2	6	211753	211758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918882
3359	NC_009464	GAA	2	6	211774	211779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918882
3360	NC_009464	CAC	2	6	211780	211785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918882
3361	NC_009464	CCTT	2	8	211807	211814	0 %	50 %	0 %	50 %	147918882
3362	NC_009464	ATA	2	6	211827	211832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918882
3363	NC_009464	GACA	2	8	211841	211848	50 %	0 %	25 %	25 %	147918882
3364	NC_009464	CAT	2	6	211927	211932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918882
3365	NC_009464	GTT	2	6	211964	211969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918882
3366	NC_009464	AATC	2	8	212215	212222	50 %	25 %	0 %	25 %	147918883
3367	NC_009464	GAC	2	6	212230	212235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918883
3368	NC_009464	CTG	2	6	212284	212289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918883
3369	NC_009464	ATC	2	6	212305	212310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918883
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3373	NC_009464	TG	3	6	212499	212504	0 %	50 %	50 %	0 %	147918883
3374	NC_009464	TCT	3	9	212516	212524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918883
3375	NC_009464	ATC	2	6	212533	212538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918883
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3378	NC_009464	AT	3	6	212662	212667	50 %	50 %	0 %	0 %	147918883
3379	NC_009464	TC	3	6	212732	212737	0 %	50 %	0 %	50 %	147918883
3380	NC_009464	CTT	2	6	212850	212855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918883
3381	NC_009464	GGA	2	6	212885	212890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918883
3382	NC_009464	GGC	2	6	212893	212898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918883
3383	NC_009464	CTT	2	6	212928	212933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918883
3384	NC_009464	TGA	2	6	212996	213001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918883
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3386	NC_009464	C	6	6	213073	213078	0 %	0 %	0 %	100 %	147918883
3387	NC_009464	GCT	2	6	213091	213096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918883
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3389	NC_009464	CTT	2	6	213168	213173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918883
3390	NC_009464	AAGC	2	8	213203	213210	50 %	0 %	25 %	25 %	147918883
3391	NC_009464	GCT	2	6	213261	213266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918883
3392	NC_009464	GAAA	2	8	213267	213274	75 %	0 %	25 %	0 %	147918883
3393	NC_009464	GGCA	2	8	213435	213442	25 %	0 %	50 %	25 %	147918883
3394	NC_009464	ATG	2	6	213502	213507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918883
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3396	NC_009464	TGC	2	6	213524	213529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918883
3397	NC_009464	ATC	2	6	213670	213675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918883
3398	NC_009464	CGA	2	6	213806	213811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918883
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3401	NC_009464	GCA	2	6	213961	213966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918883
3402	NC_009464	CGCC	2	8	214070	214077	0 %	0 %	25 %	75 %	147918883
3403	NC_009464	CTC	2	6	214084	214089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918883
3404	NC_009464	TGC	2	6	214125	214130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918883
3405	NC_009464	CTGC	2	8	214164	214171	0 %	25 %	25 %	50 %	147918883
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3412	NC_009464	CATT	2	8	214677	214684	25 %	50 %	0 %	25 %	147918884
3413	NC_009464	TCA	2	6	214749	214754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918884
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3420	NC_009464	TAC	2	6	215919	215924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918885
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3431	NC_009464	TAAA	2	8	216533	216540	75 %	25 %	0 %	0 %	147918885
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3440	NC_009464	CTG	2	6	217425	217430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918886
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3450	NC_009464	TA	3	6	217907	217912	50 %	50 %	0 %	0 %	147918888
3451	NC_009464	CTC	2	6	217989	217994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918888
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3455	NC_009464	ATCTTC	2	12	218239	218250	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	147918888
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3462	NC_009464	GGGA	2	8	218809	218816	25 %	0 %	75 %	0 %	147918889
3463	NC_009464	GCT	2	6	218856	218861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918889
3464	NC_009464	GAT	2	6	218920	218925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918889
3465	NC_009464	CT	3	6	218936	218941	0 %	50 %	0 %	50 %	147918889
3466	NC_009464	TCC	2	6	218972	218977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918889
3467	NC_009464	CAT	2	6	218989	218994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918889
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3470	NC_009464	ACG	2	6	219216	219221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918890
3471	NC_009464	TCG	2	6	219291	219296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918890
3472	NC_009464	CAA	2	6	219346	219351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918890
3473	NC_009464	GAA	2	6	219371	219376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918890
3474	NC_009464	GAA	2	6	219415	219420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918890
3475	NC_009464	A	6	6	219522	219527	100 %	0 %	0 %	0 %	147918891
3476	NC_009464	TCC	2	6	219529	219534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918891
3477	NC_009464	GAG	2	6	219543	219548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918891
3478	NC_009464	AGA	2	6	219578	219583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918891
3479	NC_009464	AGG	2	6	219613	219618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918891
3480	NC_009464	TCG	2	6	219655	219660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918891
3481	NC_009464	AGTC	2	8	219787	219794	25 %	25 %	25 %	25 %	147918891
3482	NC_009464	GCC	2	6	219801	219806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918891
3483	NC_009464	GCA	2	6	219881	219886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918891
3484	NC_009464	CGC	2	6	219926	219931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918891
3485	NC_009464	GCA	2	6	219939	219944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918891
3486	NC_009464	GAA	2	6	220112	220117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918891
3487	NC_009464	TCTG	2	8	220148	220155	0 %	50 %	25 %	25 %	147918891
3488	NC_009464	CAT	2	6	220163	220168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918891
3489	NC_009464	CGA	2	6	220175	220180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918891
3490	NC_009464	ATC	2	6	220191	220196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918891
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3493	NC_009464	AC	3	6	220272	220277	50 %	0 %	0 %	50 %	147918891
3494	NC_009464	CGA	2	6	220315	220320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918891
3495	NC_009464	AG	3	6	220340	220345	50 %	0 %	50 %	0 %	147918891
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3499	NC_009464	GCCT	2	8	220940	220947	0 %	25 %	25 %	50 %	147918893
3500	NC_009464	TCT	2	6	221029	221034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918893

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