MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009464	GCCT	2	8	156055	156062	0 %	25 %	25 %	50 %	147918828
2502	NC_009464	CAGC	2	8	156102	156109	25 %	0 %	25 %	50 %	147918828
2503	NC_009464	TCCGC	2	10	156158	156167	0 %	20 %	20 %	60 %	147918828
2504	NC_009464	CAT	2	6	156272	156277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918829
2505	NC_009464	CAC	2	6	156311	156316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918829
2506	NC_009464	CGT	2	6	156404	156409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918829
2507	NC_009464	ACG	2	6	156436	156441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918829
2508	NC_009464	GAC	2	6	156462	156467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918829
2509	NC_009464	TAA	2	6	156695	156700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918829
2510	NC_009464	ACCA	2	8	157619	157626	50 %	0 %	0 %	50 %	147918830
2511	NC_009464	GAT	2	6	157642	157647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918830
2512	NC_009464	CGA	2	6	157702	157707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918830
2513	NC_009464	CGT	2	6	157822	157827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918830
2514	NC_009464	GTC	2	6	157868	157873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918830
2515	NC_009464	GTG	2	6	158000	158005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918830
2516	NC_009464	ACA	2	6	158013	158018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918830
2517	NC_009464	AT	3	6	158044	158049	50 %	50 %	0 %	0 %	147918830
2518	NC_009464	GCA	2	6	158114	158119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918830
2519	NC_009464	GAT	2	6	158146	158151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918830
2520	NC_009464	AGC	2	6	158184	158189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918830
2521	NC_009464	GCA	2	6	158399	158404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918831
2522	NC_009464	GAA	2	6	158474	158479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918831
2523	NC_009464	TA	3	6	158587	158592	50 %	50 %	0 %	0 %	147918831
2524	NC_009464	AGA	2	6	158731	158736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918831
2525	NC_009464	GCC	2	6	158815	158820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918831
2526	NC_009464	GTTCA	2	10	158900	158909	20 %	40 %	20 %	20 %	147918831
2527	NC_009464	TTA	2	6	159042	159047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918831
2528	NC_009464	GCA	2	6	159056	159061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918831
2529	NC_009464	A	6	6	159074	159079	100 %	0 %	0 %	0 %	147918831
2530	NC_009464	TAC	2	6	159137	159142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918832
2531	NC_009464	AAG	2	6	159206	159211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918832
2532	NC_009464	AAT	2	6	159235	159240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918832
2533	NC_009464	CT	3	6	159281	159286	0 %	50 %	0 %	50 %	147918832
2534	NC_009464	GCAG	2	8	159332	159339	25 %	0 %	50 %	25 %	147918832
2535	NC_009464	ATCCT	2	10	159441	159450	20 %	40 %	0 %	40 %	147918832
2536	NC_009464	TA	3	6	159560	159565	50 %	50 %	0 %	0 %	147918832
2537	NC_009464	GAT	2	6	159583	159588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918832
2538	NC_009464	AAT	2	6	159625	159630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918832
2539	NC_009464	TG	3	6	159657	159662	0 %	50 %	50 %	0 %	147918832
2540	NC_009464	GTC	2	6	159789	159794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918833
2541	NC_009464	TCA	2	6	159910	159915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918833
2542	NC_009464	ATG	2	6	159990	159995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918834
2543	NC_009464	CCA	2	6	160204	160209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918834
2544	NC_009464	GCCAGC	2	12	160287	160298	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	147918834
2545	NC_009464	TTG	2	6	160314	160319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918834
2546	NC_009464	ACG	2	6	160359	160364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918834
2547	NC_009464	T	6	6	160373	160378	0 %	100 %	0 %	0 %	147918834
2548	NC_009464	CAG	2	6	160393	160398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918834
2549	NC_009464	TTC	2	6	160503	160508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918834
2550	NC_009464	GAT	2	6	160526	160531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918834
2551	NC_009464	ACA	2	6	160756	160761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918834
2552	NC_009464	GCC	2	6	160770	160775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918834
2553	NC_009464	CAAGG	2	10	160835	160844	40 %	0 %	40 %	20 %	147918834
2554	NC_009464	TCCT	2	8	160861	160868	0 %	50 %	0 %	50 %	147918834
2555	NC_009464	TCT	2	6	160894	160899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918834
2556	NC_009464	GTA	2	6	160912	160917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918834
2557	NC_009464	GGC	2	6	161313	161318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918835
2558	NC_009464	TAC	2	6	161379	161384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918835
2559	NC_009464	CGA	2	6	161436	161441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918835
2560	NC_009464	CAC	2	6	161454	161459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918835
2561	NC_009464	ACC	2	6	161527	161532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918835
2562	NC_009464	GTC	2	6	161554	161559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918835
2563	NC_009464	CCT	2	6	161574	161579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918835
2564	NC_009464	CTGG	2	8	161615	161622	0 %	25 %	50 %	25 %	147918835
2565	NC_009464	CAG	3	9	161624	161632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918835
2566	NC_009464	AG	3	6	161689	161694	50 %	0 %	50 %	0 %	147918835
2567	NC_009464	GAT	2	6	161751	161756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918835
2568	NC_009464	GGA	2	6	161768	161773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918835
2569	NC_009464	GTA	2	6	161842	161847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918835
2570	NC_009464	ACTGGG	2	12	161948	161959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147918835
2571	NC_009464	CT	3	6	161983	161988	0 %	50 %	0 %	50 %	147918835
2572	NC_009464	TTTGA	2	10	162040	162049	20 %	60 %	20 %	0 %	147918835
2573	NC_009464	GAT	2	6	162057	162062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918835
2574	NC_009464	A	6	6	162092	162097	100 %	0 %	0 %	0 %	147918835
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2578	NC_009464	TTG	2	6	162263	162268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918835
2579	NC_009464	CTT	2	6	162428	162433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918835
2580	NC_009464	ATT	2	6	162445	162450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918835
2581	NC_009464	TTA	2	6	162485	162490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918835
2582	NC_009464	TCA	2	6	162572	162577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918835
2583	NC_009464	CTG	2	6	162598	162603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918835
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2585	NC_009464	ATTA	2	8	162638	162645	50 %	50 %	0 %	0 %	147918835
2586	NC_009464	GGCA	2	8	162826	162833	25 %	0 %	50 %	25 %	147918836
2587	NC_009464	CGG	2	6	162838	162843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918836
2588	NC_009464	G	6	6	162886	162891	0 %	0 %	100 %	0 %	147918836
2589	NC_009464	TGC	2	6	162904	162909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918836
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2591	NC_009464	A	7	7	163084	163090	100 %	0 %	0 %	0 %	147918836
2592	NC_009464	GCAG	2	8	163122	163129	25 %	0 %	50 %	25 %	147918836
2593	NC_009464	TAGGCG	2	12	163146	163157	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147918836
2594	NC_009464	A	6	6	163207	163212	100 %	0 %	0 %	0 %	147918836
2595	NC_009464	CGA	2	6	163255	163260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918836
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2600	NC_009464	TCC	2	6	163600	163605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918836
2601	NC_009464	GCA	2	6	163713	163718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918836
2602	NC_009464	TGGTG	2	10	163737	163746	0 %	40 %	60 %	0 %	147918836
2603	NC_009464	CAA	2	6	163756	163761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918836
2604	NC_009464	GGA	2	6	163789	163794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918836
2605	NC_009464	CGA	2	6	163843	163848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918836
2606	NC_009464	GTC	2	6	163877	163882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918836
2607	NC_009464	CTG	2	6	163899	163904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918837
2608	NC_009464	GAA	2	6	164109	164114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918837
2609	NC_009464	CCT	2	6	164119	164124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918837
2610	NC_009464	GCA	2	6	164126	164131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918837
2611	NC_009464	AC	3	6	164140	164145	50 %	0 %	0 %	50 %	147918837
2612	NC_009464	CATA	2	8	164155	164162	50 %	25 %	0 %	25 %	147918837
2613	NC_009464	AG	3	6	164235	164240	50 %	0 %	50 %	0 %	147918837
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2616	NC_009464	TGG	2	6	164407	164412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918837
2617	NC_009464	AG	3	6	164415	164420	50 %	0 %	50 %	0 %	147918837
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2619	NC_009464	GCTG	2	8	164525	164532	0 %	25 %	50 %	25 %	147918837
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2622	NC_009464	CAT	2	6	164687	164692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918837
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2625	NC_009464	TGAC	2	8	164756	164763	25 %	25 %	25 %	25 %	147918838
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2861	NC_009464	GAA	2	6	178772	178777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918852
2862	NC_009464	A	7	7	178803	178809	100 %	0 %	0 %	0 %	147918852
2863	NC_009464	CAGA	2	8	178859	178866	50 %	0 %	25 %	25 %	147918852
2864	NC_009464	TCA	2	6	178975	178980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918852
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2880	NC_009464	GCAT	2	8	180183	180190	25 %	25 %	25 %	25 %	147918853
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2981	NC_009464	TTG	2	6	185749	185754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918859
2982	NC_009464	CGGTT	2	10	185867	185876	0 %	40 %	40 %	20 %	147918859
2983	NC_009464	TAT	2	6	185902	185907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918859
2984	NC_009464	TCA	2	6	185970	185975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918859
2985	NC_009464	TCGA	2	8	185993	186000	25 %	25 %	25 %	25 %	147918859
2986	NC_009464	TAT	2	6	186029	186034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918859
2987	NC_009464	TCG	2	6	186153	186158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918859
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2990	NC_009464	GGTGT	2	10	186327	186336	0 %	40 %	60 %	0 %	147918859
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2996	NC_009464	AGA	2	6	187152	187157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918860
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