MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_009464	TCC	2	6	123684	123689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918797
2003	NC_009464	TAC	2	6	123698	123703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918797
2004	NC_009464	TCG	2	6	123723	123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918797
2005	NC_009464	ACC	2	6	123852	123857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918797
2006	NC_009464	GAT	2	6	123919	123924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918797
2007	NC_009464	GAC	2	6	123950	123955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918797
2008	NC_009464	GAG	2	6	123976	123981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918797
2009	NC_009464	ATC	2	6	124004	124009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918797
2010	NC_009464	GGCT	2	8	124128	124135	0 %	25 %	50 %	25 %	147918797
2011	NC_009464	ATCG	2	8	124139	124146	25 %	25 %	25 %	25 %	147918797
2012	NC_009464	ACT	2	6	124350	124355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918797
2013	NC_009464	CAG	2	6	124427	124432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918798
2014	NC_009464	GGC	2	6	124433	124438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918798
2015	NC_009464	CTG	2	6	124477	124482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918798
2016	NC_009464	CTGGC	2	10	124541	124550	0 %	20 %	40 %	40 %	147918798
2017	NC_009464	TTC	2	6	124554	124559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918798
2018	NC_009464	TCA	2	6	124562	124567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918798
2019	NC_009464	GAC	2	6	124585	124590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918798
2020	NC_009464	C	6	6	124679	124684	0 %	0 %	0 %	100 %	147918798
2021	NC_009464	TGA	2	6	124700	124705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918798
2022	NC_009464	GGA	2	6	124734	124739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918798
2023	NC_009464	GCT	2	6	124805	124810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918799
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2025	NC_009464	GAT	2	6	124932	124937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918799
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2033	NC_009464	G	6	6	125293	125298	0 %	0 %	100 %	0 %	147918799
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2039	NC_009464	AGC	2	6	125483	125488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918800
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2041	NC_009464	GGC	2	6	125597	125602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918800
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2043	NC_009464	TGT	2	6	125700	125705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918800
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2045	NC_009464	CGA	2	6	125940	125945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918800
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2051	NC_009464	G	6	6	126857	126862	0 %	0 %	100 %	0 %	147918801
2052	NC_009464	GAT	2	6	126880	126885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918801
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2061	NC_009464	GGC	2	6	127551	127556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918802
2062	NC_009464	CAG	2	6	127567	127572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918802
2063	NC_009464	TCCA	2	8	127611	127618	25 %	25 %	0 %	50 %	147918802
2064	NC_009464	ACA	2	6	127639	127644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918802
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2110	NC_009464	TGCTC	2	10	131148	131157	0 %	40 %	20 %	40 %	147918806
2111	NC_009464	CACTT	2	10	131224	131233	20 %	40 %	0 %	40 %	147918806
2112	NC_009464	GGC	2	6	131262	131267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918806
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2120	NC_009464	GCCG	2	8	131518	131525	0 %	0 %	50 %	50 %	147918806
2121	NC_009464	GAC	2	6	131540	131545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918806
2122	NC_009464	GAA	2	6	131578	131583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918806
2123	NC_009464	AAG	2	6	131738	131743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918806
2124	NC_009464	TGA	2	6	131892	131897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918806
2125	NC_009464	TGG	2	6	131922	131927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918806
2126	NC_009464	GATCAT	2	12	131971	131982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	147918806
2127	NC_009464	GAAG	2	8	132002	132009	50 %	0 %	50 %	0 %	147918806
2128	NC_009464	CTAC	2	8	132012	132019	25 %	25 %	0 %	50 %	147918806
2129	NC_009464	GGC	2	6	132029	132034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918806
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2132	NC_009464	CAGG	2	8	132085	132092	25 %	0 %	50 %	25 %	147918806
2133	NC_009464	GTG	2	6	132098	132103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918806
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2135	NC_009464	CAT	2	6	132332	132337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918807
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2137	NC_009464	GCCA	2	8	132518	132525	25 %	0 %	25 %	50 %	147918807
2138	NC_009464	A	7	7	132604	132610	100 %	0 %	0 %	0 %	147918807
2139	NC_009464	TGC	2	6	132640	132645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918807
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2141	NC_009464	GAC	2	6	132759	132764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918807
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2143	NC_009464	A	6	6	132825	132830	100 %	0 %	0 %	0 %	147918807
2144	NC_009464	CT	3	6	132831	132836	0 %	50 %	0 %	50 %	147918807
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2149	NC_009464	AGT	2	6	133177	133182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918808
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2152	NC_009464	CCTC	2	8	133290	133297	0 %	25 %	0 %	75 %	147918808
2153	NC_009464	CGA	2	6	133363	133368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918808
2154	NC_009464	CAT	2	6	133370	133375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918808
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2156	NC_009464	AT	3	6	133413	133418	50 %	50 %	0 %	0 %	147918808
2157	NC_009464	TCAGG	2	10	133549	133558	20 %	20 %	40 %	20 %	147918809
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2162	NC_009464	TG	3	6	133807	133812	0 %	50 %	50 %	0 %	147918809
2163	NC_009464	GGT	2	6	133823	133828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918809
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2169	NC_009464	AG	3	6	134139	134144	50 %	0 %	50 %	0 %	147918810
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2172	NC_009464	AGAC	2	8	134288	134295	50 %	0 %	25 %	25 %	147918810
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2230	NC_009464	AGC	2	6	137721	137726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918813
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2233	NC_009464	GCC	2	6	137897	137902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918813
2234	NC_009464	GAT	2	6	137903	137908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918813
2235	NC_009464	TTC	2	6	138018	138023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918813
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2237	NC_009464	AGA	2	6	138043	138048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918813
2238	NC_009464	TCA	2	6	138064	138069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918813
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2241	NC_009464	CGA	2	6	138574	138579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918814
2242	NC_009464	TAT	2	6	138592	138597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918814
2243	NC_009464	TGGTAA	2	12	138615	138626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918814
2244	NC_009464	GA	3	6	138631	138636	50 %	0 %	50 %	0 %	147918814
2245	NC_009464	GCT	2	6	138654	138659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918814
2246	NC_009464	GCT	2	6	138699	138704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918814
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2262	NC_009464	CAG	2	6	139214	139219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918815
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2265	NC_009464	TGT	2	6	139296	139301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918815
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2275	NC_009464	CGT	2	6	139999	140004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918815
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2347	NC_009464	GAA	2	6	145180	145185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918818
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2360	NC_009464	CAG	2	6	146468	146473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918820
2361	NC_009464	CAT	2	6	146494	146499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918820
2362	NC_009464	GCC	2	6	146531	146536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918820
2363	NC_009464	CCA	2	6	146694	146699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918820
2364	NC_009464	TTC	2	6	146729	146734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918820
2365	NC_009464	GCT	2	6	146780	146785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918820
2366	NC_009464	CAGG	2	8	146810	146817	25 %	0 %	50 %	25 %	147918820
2367	NC_009464	CTC	2	6	146867	146872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918820
2368	NC_009464	CAT	3	9	147013	147021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918820
2369	NC_009464	CGC	2	6	147022	147027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918820
2370	NC_009464	GCT	2	6	147043	147048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918820
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2372	NC_009464	GAT	2	6	147132	147137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918821
2373	NC_009464	GCTGG	2	10	147144	147153	0 %	20 %	60 %	20 %	147918821
2374	NC_009464	CTG	2	6	147166	147171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918821
2375	NC_009464	TCCTGC	2	12	147194	147205	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	147918821
2376	NC_009464	GATT	2	8	147329	147336	25 %	50 %	25 %	0 %	147918821
2377	NC_009464	GCAGGT	2	12	147402	147413	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147918821
2378	NC_009464	TCA	2	6	147446	147451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918821
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2380	NC_009464	CTG	2	6	147724	147729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918821
2381	NC_009464	AT	3	6	147781	147786	50 %	50 %	0 %	0 %	147918821
2382	NC_009464	GTA	2	6	147787	147792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918821
2383	NC_009464	TGC	3	9	147923	147931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918821
2384	NC_009464	CCCAGA	2	12	147932	147943	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	147918821
2385	NC_009464	CTG	2	6	147952	147957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918821
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2387	NC_009464	TCGC	2	8	148006	148013	0 %	25 %	25 %	50 %	147918821
2388	NC_009464	TACT	2	8	148111	148118	25 %	50 %	0 %	25 %	147918821
2389	NC_009464	CCA	2	6	148263	148268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918821
2390	NC_009464	TGA	2	6	148370	148375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918821
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2392	NC_009464	TACC	2	8	148434	148441	25 %	25 %	0 %	50 %	147918821
2393	NC_009464	TCA	2	6	148544	148549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918821
2394	NC_009464	GAG	2	6	148684	148689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918821
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2396	NC_009464	GA	3	6	148745	148750	50 %	0 %	50 %	0 %	147918821
2397	NC_009464	TCC	2	6	148802	148807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918821
2398	NC_009464	TCG	2	6	148868	148873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918821
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2400	NC_009464	GTG	2	6	148933	148938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918821
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2402	NC_009464	TCC	2	6	149069	149074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918822
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2422	NC_009464	TCCC	2	8	150879	150886	0 %	25 %	0 %	75 %	147918824
2423	NC_009464	CAG	2	6	150961	150966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918824
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2430	NC_009464	CTA	2	6	151502	151507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918825
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2432	NC_009464	TGGGG	2	10	151631	151640	0 %	20 %	80 %	0 %	147918825
2433	NC_009464	CCG	2	6	151658	151663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918825
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2435	NC_009464	TA	3	6	151735	151740	50 %	50 %	0 %	0 %	147918825
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2442	NC_009464	CTG	2	6	152277	152282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918826
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2470	NC_009464	TTG	2	6	153553	153558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918827
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2475	NC_009464	CTT	3	9	153905	153913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918827
2476	NC_009464	AATGG	2	10	153992	154001	40 %	20 %	40 %	0 %	147918827
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2480	NC_009464	CAT	2	6	154208	154213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918827
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2482	NC_009464	GTC	2	6	154278	154283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918827
2483	NC_009464	AAG	2	6	154311	154316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918827
2484	NC_009464	TG	3	6	154340	154345	0 %	50 %	50 %	0 %	147918827
2485	NC_009464	GGA	2	6	154349	154354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918827
2486	NC_009464	TAC	2	6	154395	154400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918827
2487	NC_009464	CAA	2	6	154466	154471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918827
2488	NC_009464	AAG	2	6	154629	154634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918827
2489	NC_009464	ATC	2	6	154647	154652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918827
2490	NC_009464	AAG	2	6	155007	155012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918827
2491	NC_009464	GAA	2	6	155016	155021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918827
2492	NC_009464	CGA	2	6	155054	155059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918827
2493	NC_009464	A	6	6	155121	155126	100 %	0 %	0 %	0 %	147918827
2494	NC_009464	TGG	2	6	155212	155217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918827
2495	NC_009464	CTG	2	6	155316	155321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918827
2496	NC_009464	TCA	2	6	155534	155539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918828
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2500	NC_009464	TG	3	6	155987	155992	0 %	50 %	50 %	0 %	147918828

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