MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009464	CTAT	2	8	95548	95555	25 %	50 %	0 %	25 %	147918774
1502	NC_009464	GGCGC	2	10	95566	95575	0 %	0 %	60 %	40 %	147918774
1503	NC_009464	AGC	2	6	95628	95633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918774
1504	NC_009464	CCCT	2	8	95648	95655	0 %	25 %	0 %	75 %	147918774
1505	NC_009464	GCT	2	6	95704	95709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918774
1506	NC_009464	TCA	2	6	95734	95739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918774
1507	NC_009464	TGGG	2	8	95740	95747	0 %	25 %	75 %	0 %	147918774
1508	NC_009464	TCC	2	6	95754	95759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918774
1509	NC_009464	TAT	2	6	95766	95771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918774
1510	NC_009464	TGTC	2	8	95774	95781	0 %	50 %	25 %	25 %	147918774
1511	NC_009464	TGCC	2	8	95784	95791	0 %	25 %	25 %	50 %	147918774
1512	NC_009464	GTC	2	6	95817	95822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918774
1513	NC_009464	CAG	2	6	95844	95849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918774
1514	NC_009464	GGCG	2	8	95870	95877	0 %	0 %	75 %	25 %	147918774
1515	NC_009464	TCC	2	6	95896	95901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918774
1516	NC_009464	GAT	2	6	95934	95939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918774
1517	NC_009464	GCCG	2	8	95958	95965	0 %	0 %	50 %	50 %	147918775
1518	NC_009464	CTG	2	6	95985	95990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918775
1519	NC_009464	GCC	2	6	95998	96003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918775
1520	NC_009464	AGGA	2	8	96023	96030	50 %	0 %	50 %	0 %	147918775
1521	NC_009464	TTC	2	6	96139	96144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918775
1522	NC_009464	TAC	2	6	96163	96168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918775
1523	NC_009464	CAT	2	6	96265	96270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918775
1524	NC_009464	TTC	2	6	96333	96338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918775
1525	NC_009464	ATCTG	2	10	96372	96381	20 %	40 %	20 %	20 %	147918775
1526	NC_009464	TCG	2	6	96383	96388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918775
1527	NC_009464	CCA	2	6	96519	96524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918775
1528	NC_009464	CTGG	2	8	96527	96534	0 %	25 %	50 %	25 %	147918775
1529	NC_009464	ATA	2	6	96541	96546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918775
1530	NC_009464	AGGC	2	8	96564	96571	25 %	0 %	50 %	25 %	147918775
1531	NC_009464	GAT	2	6	96601	96606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918775
1532	NC_009464	TAA	3	9	97019	97027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918776
1533	NC_009464	CAA	2	6	97037	97042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918776
1534	NC_009464	ACA	2	6	97050	97055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918776
1535	NC_009464	CAT	2	6	97146	97151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918776
1536	NC_009464	CGA	2	6	97155	97160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918776
1537	NC_009464	GAT	2	6	97182	97187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918776
1538	NC_009464	ACT	2	6	97235	97240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918776
1539	NC_009464	TCC	2	6	97247	97252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918776
1540	NC_009464	CGC	2	6	97289	97294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918776
1541	NC_009464	GGCG	2	8	97308	97315	0 %	0 %	75 %	25 %	147918776
1542	NC_009464	AGC	2	6	97382	97387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918776
1543	NC_009464	ACT	2	6	97459	97464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918776
1544	NC_009464	GCA	2	6	97487	97492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918776
1545	NC_009464	ACT	2	6	97601	97606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918776
1546	NC_009464	AAG	3	9	97612	97620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918776
1547	NC_009464	CGT	2	6	97632	97637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918776
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1550	NC_009464	TGC	2	6	97715	97720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918776
1551	NC_009464	CAA	2	6	97800	97805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918776
1552	NC_009464	TGA	2	6	97829	97834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918776
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1554	NC_009464	CA	3	6	97914	97919	50 %	0 %	0 %	50 %	147918776
1555	NC_009464	CTA	2	6	97956	97961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918776
1556	NC_009464	ACG	2	6	98000	98005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918776
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1558	NC_009464	CAC	2	6	98073	98078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918776
1559	NC_009464	CCGG	2	8	98187	98194	0 %	0 %	50 %	50 %	147918776
1560	NC_009464	CGG	2	6	98247	98252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918776
1561	NC_009464	AAG	2	6	98281	98286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918776
1562	NC_009464	GATG	2	8	98388	98395	25 %	25 %	50 %	0 %	147918776
1563	NC_009464	AG	3	6	98398	98403	50 %	0 %	50 %	0 %	147918776
1564	NC_009464	TCA	2	6	98475	98480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918776
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1567	NC_009464	A	6	6	98714	98719	100 %	0 %	0 %	0 %	147918776
1568	NC_009464	CCTG	2	8	98760	98767	0 %	25 %	25 %	50 %	147918777
1569	NC_009464	CT	3	6	98775	98780	0 %	50 %	0 %	50 %	147918777
1570	NC_009464	CTT	2	6	98823	98828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918777
1571	NC_009464	CTT	2	6	98857	98862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918777
1572	NC_009464	CGG	2	6	98886	98891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918777
1573	NC_009464	TGT	2	6	98916	98921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918777
1574	NC_009464	GTA	2	6	98965	98970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918777
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1576	NC_009464	GAT	2	6	99130	99135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918777
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1581	NC_009464	ACG	2	6	99560	99565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918777
1582	NC_009464	GTA	2	6	99571	99576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918777
1583	NC_009464	ATC	2	6	99632	99637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918777
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1588	NC_009464	CCG	2	6	99955	99960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918778
1589	NC_009464	CGT	2	6	99970	99975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918778
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1605	NC_009464	AT	3	6	100934	100939	50 %	50 %	0 %	0 %	147918779
1606	NC_009464	CAG	2	6	100988	100993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918779
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1608	NC_009464	TAAA	2	8	101158	101165	75 %	25 %	0 %	0 %	147918779
1609	NC_009464	CGT	3	9	101345	101353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918779
1610	NC_009464	GCT	2	6	101441	101446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918779
1611	NC_009464	AT	3	6	101510	101515	50 %	50 %	0 %	0 %	147918779
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1615	NC_009464	GCGG	2	8	101696	101703	0 %	0 %	75 %	25 %	147918779
1616	NC_009464	GAAGA	2	10	101706	101715	60 %	0 %	40 %	0 %	147918779
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1621	NC_009464	GAA	2	6	101913	101918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918779
1622	NC_009464	A	6	6	101917	101922	100 %	0 %	0 %	0 %	147918779
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1624	NC_009464	GCT	2	6	102050	102055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918779
1625	NC_009464	GAC	2	6	102180	102185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918779
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1628	NC_009464	GGA	2	6	102653	102658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918780
1629	NC_009464	ATG	2	6	102683	102688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918780
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1631	NC_009464	CAT	2	6	102762	102767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918780
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1643	NC_009464	GAC	2	6	103413	103418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918781
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1863	NC_009464	CGA	2	6	116081	116086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918790
1864	NC_009464	CGG	2	6	116179	116184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918790
1865	NC_009464	CAA	2	6	116189	116194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918790
1866	NC_009464	ACGAT	2	10	116296	116305	40 %	20 %	20 %	20 %	147918790
1867	NC_009464	ATC	2	6	116496	116501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918791
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1891	NC_009464	TCC	2	6	117722	117727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918792
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1894	NC_009464	TGA	2	6	117887	117892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918792
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1973	NC_009464	CTT	2	6	121980	121985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918795
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1980	NC_009464	CAG	2	6	122590	122595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918796
1981	NC_009464	ACT	2	6	122675	122680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918796
1982	NC_009464	TCG	2	6	122732	122737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918796
1983	NC_009464	GCA	2	6	122778	122783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918796
1984	NC_009464	TGA	2	6	122793	122798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918796
1985	NC_009464	ATC	2	6	122825	122830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918796
1986	NC_009464	TTC	2	6	122833	122838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918796
1987	NC_009464	CCA	2	6	122896	122901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918796
1988	NC_009464	TCG	3	9	122906	122914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918796
1989	NC_009464	TTG	2	6	122963	122968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918796
1990	NC_009464	GAC	3	9	122998	123006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918796
1991	NC_009464	AGC	2	6	123038	123043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918796
1992	NC_009464	ACC	2	6	123058	123063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918796
1993	NC_009464	TA	3	6	123242	123247	50 %	50 %	0 %	0 %	147918797
1994	NC_009464	GCT	2	6	123271	123276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918797
1995	NC_009464	CT	3	6	123370	123375	0 %	50 %	0 %	50 %	147918797
1996	NC_009464	TAC	2	6	123383	123388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918797
1997	NC_009464	CGC	2	6	123403	123408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918797
1998	NC_009464	TGC	2	6	123453	123458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918797
1999	NC_009464	CTG	2	6	123545	123550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918797
2000	NC_009464	GAG	2	6	123578	123583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918797

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