MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 53838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009464	CATA	2	8	312017	312024	50 %	25 %	0 %	25 %	147918982
5002	NC_009464	TTC	2	6	312081	312086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918982
5003	NC_009464	AAC	2	6	312123	312128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918982
5004	NC_009464	GGC	2	6	312133	312138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918982
5005	NC_009464	ATG	2	6	312175	312180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918982
5006	NC_009464	TGC	2	6	312217	312222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918982
5007	NC_009464	TAT	2	6	312239	312244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918982
5008	NC_009464	ATG	2	6	312362	312367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918982
5009	NC_009464	ATG	2	6	312421	312426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918982
5010	NC_009464	ATG	2	6	312436	312441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918982
5011	NC_009464	ATC	2	6	312460	312465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918982
5012	NC_009464	AAC	2	6	312489	312494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918982
5013	NC_009464	GTAT	2	8	312498	312505	25 %	50 %	25 %	0 %	147918982
5014	NC_009464	ATC	2	6	312689	312694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918983
5015	NC_009464	CAT	2	6	312754	312759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918983
5016	NC_009464	CTC	2	6	312760	312765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918983
5017	NC_009464	GGC	2	6	312816	312821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918983
5018	NC_009464	GTC	2	6	312943	312948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918983
5019	NC_009464	CAG	2	6	312979	312984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918983
5020	NC_009464	GGC	2	6	313043	313048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918983
5021	NC_009464	GA	3	6	313078	313083	50 %	0 %	50 %	0 %	147918983
5022	NC_009464	AG	3	6	313148	313153	50 %	0 %	50 %	0 %	147918983
5023	NC_009464	GGT	2	6	313269	313274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918983
5024	NC_009464	GCC	2	6	313405	313410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918983
5025	NC_009464	ATC	2	6	313481	313486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918983
5026	NC_009464	CTTAGT	2	12	313570	313581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	147918983
5027	NC_009464	GAG	2	6	313609	313614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918983
5028	NC_009464	GAA	2	6	313710	313715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918983
5029	NC_009464	TCTT	2	8	313730	313737	0 %	75 %	0 %	25 %	147918983
5030	NC_009464	AGCC	2	8	313766	313773	25 %	0 %	25 %	50 %	147918983
5031	NC_009464	GCGG	2	8	313793	313800	0 %	0 %	75 %	25 %	147918983
5032	NC_009464	CTT	2	6	313807	313812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918983
5033	NC_009464	CAT	2	6	313848	313853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918983
5034	NC_009464	TCG	2	6	313898	313903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918983
5035	NC_009464	TC	3	6	313931	313936	0 %	50 %	0 %	50 %	147918983
5036	NC_009464	GGC	2	6	313966	313971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918983
5037	NC_009464	CTGCA	2	10	313975	313984	20 %	20 %	20 %	40 %	147918983
5038	NC_009464	GGA	2	6	314052	314057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918983
5039	NC_009464	CTT	2	6	314137	314142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918984
5040	NC_009464	CTT	2	6	314160	314165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918984
5041	NC_009464	TCA	2	6	314193	314198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918984
5042	NC_009464	CTT	2	6	314208	314213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918984
5043	NC_009464	CGC	2	6	314361	314366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918984
5044	NC_009464	GTAATA	2	12	314434	314445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	147918984
5045	NC_009464	GCC	2	6	314473	314478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918984
5046	NC_009464	GCC	2	6	314509	314514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918984
5047	NC_009464	GTC	2	6	314554	314559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918984
5048	NC_009464	TGA	2	6	314790	314795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918984
5049	NC_009464	TGT	2	6	314817	314822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918984
5050	NC_009464	TCT	2	6	314928	314933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918984
5051	NC_009464	CTT	2	6	314991	314996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918984
5052	NC_009464	TCG	2	6	315029	315034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918984
5053	NC_009464	CAG	2	6	315181	315186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918984
5054	NC_009464	GA	3	6	315204	315209	50 %	0 %	50 %	0 %	147918984
5055	NC_009464	AGA	3	9	315207	315215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918984
5056	NC_009464	TCG	2	6	315242	315247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918984
5057	NC_009464	CTT	2	6	315316	315321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918984
5058	NC_009464	TCA	3	9	315372	315380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918984
5059	NC_009464	GCGG	2	8	315672	315679	0 %	0 %	75 %	25 %	147918985
5060	NC_009464	TGG	2	6	315681	315686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918985
5061	NC_009464	GGAA	2	8	315704	315711	50 %	0 %	50 %	0 %	147918985
5062	NC_009464	GCA	2	6	315730	315735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918985
5063	NC_009464	GAC	2	6	315801	315806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918985
5064	NC_009464	GTC	2	6	315834	315839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918985
5065	NC_009464	T	6	6	315955	315960	0 %	100 %	0 %	0 %	147918985
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5067	NC_009464	ACA	2	6	316117	316122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918986
5068	NC_009464	CTG	2	6	316139	316144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918986
5069	NC_009464	GAT	2	6	316179	316184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918986
5070	NC_009464	GCC	2	6	316229	316234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918986
5071	NC_009464	CGC	2	6	316280	316285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918986
5072	NC_009464	GAG	3	9	316296	316304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918986
5073	NC_009464	ATC	2	6	316308	316313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918986
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5077	NC_009464	GAT	2	6	316580	316585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918986
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5079	NC_009464	GCC	2	6	316785	316790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918986
5080	NC_009464	ACC	2	6	316870	316875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918986
5081	NC_009464	TGG	2	6	316885	316890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918986
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5085	NC_009464	TCT	2	6	317175	317180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918987
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5087	NC_009464	GTC	2	6	317425	317430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918987
5088	NC_009464	GAC	2	6	317491	317496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918987
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5092	NC_009464	CTGC	2	8	317649	317656	0 %	25 %	25 %	50 %	147918987
5093	NC_009464	GCT	2	6	317670	317675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918987
5094	NC_009464	AGTC	2	8	317766	317773	25 %	25 %	25 %	25 %	147918987
5095	NC_009464	GTA	2	6	317788	317793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918987
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5099	NC_009464	CCA	2	6	317943	317948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918987
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5101	NC_009464	GTA	2	6	317983	317988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918987
5102	NC_009464	CGC	2	6	318018	318023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918987
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5105	NC_009464	CGG	2	6	318536	318541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918988
5106	NC_009464	CGG	2	6	318553	318558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918988
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5109	NC_009464	TACA	2	8	318765	318772	50 %	25 %	0 %	25 %	147918988
5110	NC_009464	CAG	2	6	318816	318821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918988
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5114	NC_009464	ACGAT	2	10	319018	319027	40 %	20 %	20 %	20 %	147918988
5115	NC_009464	CGT	2	6	319028	319033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918988
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5119	NC_009464	CGTCGA	2	12	319256	319267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	147918988
5120	NC_009464	TA	3	6	322196	322201	50 %	50 %	0 %	0 %	147918989
5121	NC_009464	ACA	2	6	322212	322217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918989
5122	NC_009464	GTA	2	6	322223	322228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918989
5123	NC_009464	TAT	2	6	322238	322243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918989
5124	NC_009464	GGTA	2	8	322267	322274	25 %	25 %	50 %	0 %	147918989
5125	NC_009464	CGA	2	6	322485	322490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918989
5126	NC_009464	TAT	2	6	322603	322608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918989
5127	NC_009464	CGG	2	6	322614	322619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918989
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5129	NC_009464	AT	3	6	322766	322771	50 %	50 %	0 %	0 %	147918989
5130	NC_009464	GAA	2	6	322880	322885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918989
5131	NC_009464	ATC	2	6	322988	322993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918989
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5133	NC_009464	CAT	2	6	323018	323023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918989
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5135	NC_009464	TTC	2	6	323246	323251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918989
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5140	NC_009464	CAT	2	6	323614	323619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918989
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5143	NC_009464	GAGC	2	8	323775	323782	25 %	0 %	50 %	25 %	147918989
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5148	NC_009464	CGAC	2	8	324159	324166	25 %	0 %	25 %	50 %	147918989
5149	NC_009464	ATCACG	2	12	324176	324187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147918989
5150	NC_009464	GCCC	2	8	324292	324299	0 %	0 %	25 %	75 %	147918989
5151	NC_009464	TCT	2	6	324309	324314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918989
5152	NC_009464	AGCA	2	8	324337	324344	50 %	0 %	25 %	25 %	147918989
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5154	NC_009464	CGT	3	9	324415	324423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918989
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5227	NC_009464	GATA	2	8	328548	328555	50 %	25 %	25 %	0 %	147918992
5228	NC_009464	GCT	2	6	328668	328673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918993
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5237	NC_009464	CGA	2	6	329251	329256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918994
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5481	NC_009464	TCT	2	6	344916	344921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147919006
5482	NC_009464	A	6	6	344925	344930	100 %	0 %	0 %	0 %	147919006
5483	NC_009464	CTA	2	6	345050	345055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147919006
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