MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 32279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008942	CCT	2	6	276483	276488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485121
5002	NC_008942	CGA	2	6	276504	276509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485121
5003	NC_008942	ATG	3	9	276564	276572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5004	NC_008942	ATCACC	2	12	276575	276586	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	124485121
5005	NC_008942	AT	3	6	276638	276643	50 %	50 %	0 %	0 %	124485121
5006	NC_008942	TCA	2	6	276741	276746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485121
5007	NC_008942	CGA	2	6	276798	276803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485121
5008	NC_008942	AT	3	6	276830	276835	50 %	50 %	0 %	0 %	124485121
5009	NC_008942	AGG	2	6	276912	276917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485121
5010	NC_008942	AAG	2	6	276977	276982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485121
5011	NC_008942	TGA	2	6	277024	277029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5012	NC_008942	GAT	3	9	277052	277060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5013	NC_008942	TCGA	2	8	277076	277083	25 %	25 %	25 %	25 %	124485121
5014	NC_008942	GGT	2	6	277151	277156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485121
5015	NC_008942	GAAG	2	8	277178	277185	50 %	0 %	50 %	0 %	124485121
5016	NC_008942	TCG	2	6	277253	277258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485121
5017	NC_008942	CCCG	2	8	277290	277297	0 %	0 %	25 %	75 %	124485121
5018	NC_008942	GGC	2	6	277328	277333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5019	NC_008942	GAC	2	6	277376	277381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485121
5020	NC_008942	CGA	2	6	277408	277413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485121
5021	NC_008942	CGG	2	6	277429	277434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5022	NC_008942	GAT	2	6	277457	277462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5023	NC_008942	GGC	2	6	277496	277501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5024	NC_008942	TGA	2	6	277522	277527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5025	NC_008942	GCAT	2	8	277530	277537	25 %	25 %	25 %	25 %	124485121
5026	NC_008942	GAT	3	9	277541	277549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5027	NC_008942	CGG	2	6	277669	277674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5028	NC_008942	ATG	3	9	277697	277705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5029	NC_008942	GGC	3	9	277706	277714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5030	NC_008942	CTTCA	2	10	277732	277741	20 %	40 %	0 %	40 %	124485121
5031	NC_008942	CGG	2	6	277939	277944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5032	NC_008942	CTT	2	6	277989	277994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485121
5033	NC_008942	CT	3	6	278008	278013	0 %	50 %	0 %	50 %	124485121
5034	NC_008942	TC	3	6	278055	278060	0 %	50 %	0 %	50 %	124485121
5035	NC_008942	ATC	2	6	278123	278128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485121
5036	NC_008942	TCG	2	6	278181	278186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485121
5037	NC_008942	GTACG	2	10	278218	278227	20 %	20 %	40 %	20 %	124485121
5038	NC_008942	ATG	2	6	278240	278245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485121
5039	NC_008942	GGC	3	9	278246	278254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485121
5040	NC_008942	AGC	2	6	278434	278439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485122
5041	NC_008942	TC	3	6	278456	278461	0 %	50 %	0 %	50 %	124485122
5042	NC_008942	GCG	2	6	278511	278516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485122
5043	NC_008942	GCT	2	6	278563	278568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485122
5044	NC_008942	CCG	2	6	278589	278594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485122
5045	NC_008942	A	7	7	278611	278617	100 %	0 %	0 %	0 %	124485122
5046	NC_008942	A	7	7	278641	278647	100 %	0 %	0 %	0 %	124485122
5047	NC_008942	GAA	2	6	278675	278680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485122
5048	NC_008942	CTT	2	6	278681	278686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485122
5049	NC_008942	A	7	7	278696	278702	100 %	0 %	0 %	0 %	124485122
5050	NC_008942	GGC	2	6	278784	278789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485123
5051	NC_008942	T	6	6	278811	278816	0 %	100 %	0 %	0 %	124485123
5052	NC_008942	TTC	2	6	278952	278957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485123
5053	NC_008942	TTAC	2	8	278973	278980	25 %	50 %	0 %	25 %	124485123
5054	NC_008942	GGC	2	6	278988	278993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485123
5055	NC_008942	ATT	2	6	279091	279096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124485123
5056	NC_008942	TG	3	6	279169	279174	0 %	50 %	50 %	0 %	124485123
5057	NC_008942	TTG	2	6	279182	279187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485123
5058	NC_008942	AAAAT	2	10	279232	279241	80 %	20 %	0 %	0 %	124485123
5059	NC_008942	ATG	2	6	279645	279650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485124
5060	NC_008942	G	6	6	279659	279664	0 %	0 %	100 %	0 %	124485124
5061	NC_008942	GCT	2	6	279666	279671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485124
5062	NC_008942	TAG	2	6	279695	279700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485124
5063	NC_008942	CAA	2	6	279724	279729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485124
5064	NC_008942	TAT	2	6	279779	279784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124485124
5065	NC_008942	TTC	2	6	279867	279872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485124
5066	NC_008942	GAC	2	6	279875	279880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485124
5067	NC_008942	GGTATC	2	12	279915	279926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	124485124
5068	NC_008942	CGA	2	6	279943	279948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485124
5069	NC_008942	TAC	2	6	279966	279971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485124
5070	NC_008942	GGC	2	6	280007	280012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485124
5071	NC_008942	ACA	2	6	280154	280159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485124
5072	NC_008942	TTC	2	6	280251	280256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485124
5073	NC_008942	CGA	2	6	280264	280269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485124
5074	NC_008942	TCT	2	6	280366	280371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485124
5075	NC_008942	GGA	2	6	280375	280380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485124
5076	NC_008942	TGA	2	6	280402	280407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485124
5077	NC_008942	CTGT	2	8	280445	280452	0 %	50 %	25 %	25 %	124485124
5078	NC_008942	TC	3	6	280465	280470	0 %	50 %	0 %	50 %	124485124
5079	NC_008942	TGA	2	6	280492	280497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485124
5080	NC_008942	TTG	2	6	280498	280503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485124
5081	NC_008942	TGGC	2	8	280538	280545	0 %	25 %	50 %	25 %	124485124
5082	NC_008942	CGC	2	6	280558	280563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485124
5083	NC_008942	GGA	2	6	280587	280592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485124
5084	NC_008942	GCC	2	6	280635	280640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485124
5085	NC_008942	CGT	2	6	280715	280720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485124
5086	NC_008942	TCCG	2	8	280873	280880	0 %	25 %	25 %	50 %	124485125
5087	NC_008942	CAGATC	2	12	280965	280976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124485125
5088	NC_008942	CGC	2	6	281010	281015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485125
5089	NC_008942	ATC	2	6	281065	281070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485125
5090	NC_008942	ATC	2	6	281097	281102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485125
5091	NC_008942	TGC	2	6	281114	281119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485125
5092	NC_008942	ATC	2	6	281122	281127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485125
5093	NC_008942	GTCT	3	12	281312	281323	0 %	50 %	25 %	25 %	124485125
5094	NC_008942	ATC	2	6	281326	281331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485125
5095	NC_008942	GTT	2	6	281427	281432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485126
5096	NC_008942	CTC	3	9	281477	281485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485126
5097	NC_008942	T	6	6	281489	281494	0 %	100 %	0 %	0 %	124485126
5098	NC_008942	GAT	2	6	281575	281580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485126
5099	NC_008942	CAC	2	6	281636	281641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485126
5100	NC_008942	CGT	2	6	281656	281661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485126
5101	NC_008942	GAATC	2	10	281680	281689	40 %	20 %	20 %	20 %	124485126
5102	NC_008942	CCG	2	6	281697	281702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485126
5103	NC_008942	ATG	2	6	281766	281771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485126
5104	NC_008942	ATC	2	6	281780	281785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485126
5105	NC_008942	ATA	2	6	281849	281854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485126
5106	NC_008942	TTC	2	6	281967	281972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485126
5107	NC_008942	TC	3	6	282023	282028	0 %	50 %	0 %	50 %	124485126
5108	NC_008942	AC	3	6	282073	282078	50 %	0 %	0 %	50 %	124485126
5109	NC_008942	TCG	2	6	282087	282092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485126
5110	NC_008942	C	6	6	282152	282157	0 %	0 %	0 %	100 %	124485126
5111	NC_008942	CGA	2	6	282163	282168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485126
5112	NC_008942	CGT	2	6	282319	282324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485127
5113	NC_008942	CGTC	2	8	282384	282391	0 %	25 %	25 %	50 %	124485127
5114	NC_008942	TGGT	2	8	282459	282466	0 %	50 %	50 %	0 %	124485127
5115	NC_008942	GCT	2	6	282508	282513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485127
5116	NC_008942	TCG	2	6	282522	282527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485127
5117	NC_008942	GACCCG	2	12	282620	282631	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124485127
5118	NC_008942	TCGACG	2	12	282690	282701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124485127
5119	NC_008942	TC	3	6	282703	282708	0 %	50 %	0 %	50 %	124485127
5120	NC_008942	GAA	2	6	282824	282829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485127
5121	NC_008942	TGA	2	6	282835	282840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485127
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5220	NC_008942	CTCC	2	8	290054	290061	0 %	25 %	0 %	75 %	124485132
5221	NC_008942	CCT	2	6	290158	290163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485132
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5237	NC_008942	GTG	2	6	290943	290948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485132
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5240	NC_008942	ACC	2	6	291024	291029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485132
5241	NC_008942	GA	3	6	291039	291044	50 %	0 %	50 %	0 %	124485132
5242	NC_008942	CAG	2	6	291117	291122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485132
5243	NC_008942	AGG	2	6	291181	291186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485132
5244	NC_008942	GCG	3	9	291198	291206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485132
5245	NC_008942	GAT	2	6	291209	291214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485132
5246	NC_008942	GCGAG	2	10	291220	291229	20 %	0 %	60 %	20 %	124485132
5247	NC_008942	GAG	2	6	291239	291244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485132
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5253	NC_008942	CTG	2	6	292129	292134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485133
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5262	NC_008942	CTG	2	6	292661	292666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485133
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5338	NC_008942	AAT	2	6	298197	298202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485140
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5485	NC_008942	GAT	2	6	305597	305602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485150
5486	NC_008942	CTT	2	6	305719	305724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485150
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5488	NC_008942	T	6	6	305930	305935	0 %	100 %	0 %	0 %	124485150
5489	NC_008942	CTTT	2	8	305992	305999	0 %	75 %	0 %	25 %	124485150
5490	NC_008942	CGA	2	6	306004	306009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485150
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5492	NC_008942	CTCC	2	8	306220	306227	0 %	25 %	0 %	75 %	124485150
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5498	NC_008942	CCGTC	2	10	306577	306586	0 %	20 %	20 %	60 %	124485150
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