MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_008740	TTC	2	6	4322445	4322450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556797
74002	NC_008740	TGA	2	6	4322494	4322499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120556797
74003	NC_008740	GCA	2	6	4322521	4322526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556797
74004	NC_008740	TGT	2	6	4322602	4322607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120556797
74005	NC_008740	GGA	2	6	4322610	4322615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120556797
74006	NC_008740	GGGC	2	8	4322653	4322660	0 %	0 %	75 %	25 %	120556797
74007	NC_008740	TCCT	2	8	4322668	4322675	0 %	50 %	0 %	50 %	120556797
74008	NC_008740	ATT	2	6	4322678	4322683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120556797
74009	NC_008740	CTG	2	6	4322698	4322703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556797
74010	NC_008740	GCA	2	6	4322831	4322836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556798
74011	NC_008740	GGT	2	6	4322898	4322903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556798
74012	NC_008740	TGC	2	6	4322967	4322972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556798
74013	NC_008740	CAGA	2	8	4323029	4323036	50 %	0 %	25 %	25 %	120556798
74014	NC_008740	TCACCG	2	12	4323053	4323064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120556798
74015	NC_008740	GGT	3	9	4323126	4323134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556798
74016	NC_008740	CCA	2	6	4323140	4323145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120556798
74017	NC_008740	TTC	2	6	4323174	4323179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556798
74018	NC_008740	CGG	2	6	4323233	4323238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556798
74019	NC_008740	AAT	2	6	4323243	4323248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120556798
74020	NC_008740	CCCGC	2	10	4323332	4323341	0 %	0 %	20 %	80 %	120556798
74021	NC_008740	CAG	2	6	4323351	4323356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556798
74022	NC_008740	GCCG	2	8	4323377	4323384	0 %	0 %	50 %	50 %	120556798
74023	NC_008740	CTG	2	6	4323444	4323449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556798
74024	NC_008740	CAG	2	6	4323459	4323464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556798
74025	NC_008740	TCC	2	6	4323514	4323519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120556798
74026	NC_008740	CCA	2	6	4323569	4323574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120556798
74027	NC_008740	GCC	2	6	4323628	4323633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120556798
74028	NC_008740	ATCAG	2	10	4323652	4323661	40 %	20 %	20 %	20 %	120556798
74029	NC_008740	GCC	2	6	4323789	4323794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120556798
74030	NC_008740	TCA	2	6	4323865	4323870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556798
74031	NC_008740	ATGGCC	2	12	4323952	4323963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120556798
74032	NC_008740	GGC	2	6	4324020	4324025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556798
74033	NC_008740	GCTG	2	8	4324039	4324046	0 %	25 %	50 %	25 %	120556798
74034	NC_008740	CTT	2	6	4324128	4324133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556799
74035	NC_008740	CTG	2	6	4324173	4324178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
74036	NC_008740	TGT	2	6	4324193	4324198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120556799
74037	NC_008740	CCAG	2	8	4324202	4324209	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
74038	NC_008740	CCGG	2	8	4324222	4324229	0 %	0 %	50 %	50 %	120556799
74039	NC_008740	GAA	2	6	4324239	4324244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
74040	NC_008740	GATT	2	8	4324499	4324506	25 %	50 %	25 %	0 %	120556799
74041	NC_008740	CAT	2	6	4324527	4324532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556799
74042	NC_008740	ATC	2	6	4324554	4324559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556799
74043	NC_008740	CG	3	6	4324599	4324604	0 %	0 %	50 %	50 %	120556799
74044	NC_008740	TGG	2	6	4324628	4324633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556799
74045	NC_008740	GAA	2	6	4324644	4324649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
74046	NC_008740	CAG	2	6	4324671	4324676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556799
74047	NC_008740	GAT	2	6	4324677	4324682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120556799
74048	NC_008740	GACCA	2	10	4324701	4324710	40 %	0 %	20 %	40 %	120556799
74049	NC_008740	GAA	2	6	4324749	4324754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
74050	NC_008740	CAGC	2	8	4324755	4324762	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
74051	NC_008740	CGT	2	6	4324872	4324877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
74052	NC_008740	GGT	2	6	4324920	4324925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556799
74053	NC_008740	TGC	2	6	4324978	4324983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
74054	NC_008740	GCCA	3	12	4324990	4325001	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
74055	NC_008740	CACG	2	8	4325144	4325151	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
74056	NC_008740	GAT	2	6	4325240	4325245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120556799
74057	NC_008740	GTG	2	6	4325275	4325280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556799
74058	NC_008740	AGA	2	6	4325410	4325415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
74059	NC_008740	TCG	2	6	4325473	4325478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
74060	NC_008740	TAA	2	6	4325555	4325560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120556799
74061	NC_008740	CGC	2	6	4325636	4325641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120556799
74062	NC_008740	GTT	2	6	4325646	4325651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120556799
74063	NC_008740	CAGG	2	8	4325657	4325664	25 %	0 %	50 %	25 %	120556799
74064	NC_008740	CTG	2	6	4325692	4325697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
74065	NC_008740	CTGTT	2	10	4325724	4325733	0 %	60 %	20 %	20 %	120556799
74066	NC_008740	CAAA	2	8	4325798	4325805	75 %	0 %	0 %	25 %	120556799
74067	NC_008740	GTCTG	2	10	4325835	4325844	0 %	40 %	40 %	20 %	120556800
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74069	NC_008740	GTTCC	2	10	4325907	4325916	0 %	40 %	20 %	40 %	120556800
74070	NC_008740	TGGC	2	8	4326056	4326063	0 %	25 %	50 %	25 %	120556800
74071	NC_008740	CAT	2	6	4326064	4326069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556800
74072	NC_008740	T	6	6	4326177	4326182	0 %	100 %	0 %	0 %	120556801
74073	NC_008740	GGC	2	6	4326251	4326256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556801
74074	NC_008740	TTC	2	6	4326355	4326360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556801
74075	NC_008740	CTG	2	6	4326463	4326468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556801
74076	NC_008740	CGA	2	6	4326571	4326576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556802

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.