MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 159442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008726	CTGC	2	8	563532	563539	0 %	25 %	25 %	50 %	120401543
14002	NC_008726	CGA	2	6	563546	563551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14003	NC_008726	GGC	2	6	563561	563566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401543
14004	NC_008726	GAC	2	6	563589	563594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14005	NC_008726	CGG	2	6	563606	563611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401543
14006	NC_008726	GCA	2	6	563651	563656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14007	NC_008726	ATC	2	6	563692	563697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401543
14008	NC_008726	CGC	2	6	563723	563728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401543
14009	NC_008726	GTG	2	6	563751	563756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401543
14010	NC_008726	GGT	2	6	563840	563845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401543
14011	NC_008726	GTTG	2	8	563876	563883	0 %	50 %	50 %	0 %	120401543
14012	NC_008726	GGC	2	6	563951	563956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401543
14013	NC_008726	CGG	2	6	563990	563995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401543
14014	NC_008726	GAT	2	6	564005	564010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401543
14015	NC_008726	GGC	2	6	564035	564040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401543
14016	NC_008726	CAC	3	9	564071	564079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401543
14017	NC_008726	CAA	2	6	564100	564105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401543
14018	NC_008726	CTG	3	9	564111	564119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14019	NC_008726	TGAT	2	8	564142	564149	25 %	50 %	25 %	0 %	120401543
14020	NC_008726	GTC	2	6	564153	564158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14021	NC_008726	CGGG	2	8	564270	564277	0 %	0 %	75 %	25 %	120401543
14022	NC_008726	GGA	2	6	564300	564305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401543
14023	NC_008726	CG	3	6	564306	564311	0 %	0 %	50 %	50 %	120401543
14024	NC_008726	CAC	2	6	564367	564372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401543
14025	NC_008726	CGA	2	6	564389	564394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14026	NC_008726	CCGT	2	8	564424	564431	0 %	25 %	25 %	50 %	120401543
14027	NC_008726	CCG	2	6	564481	564486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401543
14028	NC_008726	ACG	2	6	564499	564504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401543
14029	NC_008726	AAGCC	2	10	564506	564515	40 %	0 %	20 %	40 %	120401543
14030	NC_008726	CGG	2	6	564593	564598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401543
14031	NC_008726	GGA	2	6	564635	564640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401543
14032	NC_008726	TGT	2	6	564643	564648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401543
14033	NC_008726	TG	3	6	565002	565007	0 %	50 %	50 %	0 %	120401544
14034	NC_008726	TGT	2	6	565016	565021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401544
14035	NC_008726	GCC	2	6	565033	565038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401544
14036	NC_008726	CTG	2	6	565064	565069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14037	NC_008726	TCGA	2	8	565089	565096	25 %	25 %	25 %	25 %	120401544
14038	NC_008726	TGG	2	6	565192	565197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401544
14039	NC_008726	TGC	2	6	565207	565212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14040	NC_008726	CCGA	2	8	565228	565235	25 %	0 %	25 %	50 %	120401544
14041	NC_008726	TCGG	2	8	565237	565244	0 %	25 %	50 %	25 %	120401544
14042	NC_008726	CGG	2	6	565352	565357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401544
14043	NC_008726	CTG	2	6	565372	565377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14044	NC_008726	GC	5	10	565418	565427	0 %	0 %	50 %	50 %	120401544
14045	NC_008726	G	7	7	565441	565447	0 %	0 %	100 %	0 %	120401544
14046	NC_008726	CGT	2	6	565448	565453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14047	NC_008726	GC	3	6	565546	565551	0 %	0 %	50 %	50 %	120401544
14048	NC_008726	CGT	3	9	565706	565714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14049	NC_008726	CGC	2	6	565767	565772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401544
14050	NC_008726	TCG	2	6	565783	565788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14051	NC_008726	TTC	2	6	565797	565802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401544
14052	NC_008726	GCA	2	6	565804	565809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14053	NC_008726	ATG	2	6	565875	565880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401544
14054	NC_008726	TCT	2	6	565963	565968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401544
14055	NC_008726	TGG	2	6	565987	565992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401544
14056	NC_008726	TGA	2	6	566017	566022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401544
14057	NC_008726	TCG	2	6	566038	566043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14058	NC_008726	CCGA	2	8	566175	566182	25 %	0 %	25 %	50 %	120401544
14059	NC_008726	GCG	3	9	566193	566201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401544
14060	NC_008726	GC	4	8	566384	566391	0 %	0 %	50 %	50 %	120401544
14061	NC_008726	CAG	2	6	566398	566403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401544
14062	NC_008726	GC	3	6	566487	566492	0 %	0 %	50 %	50 %	120401545
14063	NC_008726	GCGA	2	8	566532	566539	25 %	0 %	50 %	25 %	120401545
14064	NC_008726	CGG	2	6	566648	566653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401545
14065	NC_008726	GGA	2	6	566676	566681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401545
14066	NC_008726	CGG	2	6	566719	566724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401545
14067	NC_008726	TGG	2	6	566762	566767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401545
14068	NC_008726	CCA	2	6	566768	566773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401545
14069	NC_008726	CGA	2	6	566784	566789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401545
14070	NC_008726	GCGAT	2	10	566843	566852	20 %	20 %	40 %	20 %	120401545
14071	NC_008726	GCC	2	6	566866	566871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401545
14072	NC_008726	TGAA	2	8	566882	566889	50 %	25 %	25 %	0 %	120401545
14073	NC_008726	AACG	2	8	566909	566916	50 %	0 %	25 %	25 %	120401545
14074	NC_008726	CGA	2	6	567239	567244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14075	NC_008726	GC	3	6	567265	567270	0 %	0 %	50 %	50 %	120401546
14076	NC_008726	TC	3	6	567301	567306	0 %	50 %	0 %	50 %	120401546
14077	NC_008726	TTGAA	2	10	567332	567341	40 %	40 %	20 %	0 %	120401546
14078	NC_008726	ATT	2	6	567436	567441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120401546
14079	NC_008726	CG	3	6	567444	567449	0 %	0 %	50 %	50 %	120401546
14080	NC_008726	GCA	2	6	567450	567455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14081	NC_008726	GCT	2	6	567504	567509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14082	NC_008726	AAC	2	6	567574	567579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401546
14083	NC_008726	GCA	2	6	567603	567608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14084	NC_008726	TGC	2	6	567621	567626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14085	NC_008726	GC	3	6	567651	567656	0 %	0 %	50 %	50 %	120401546
14086	NC_008726	GT	4	8	567696	567703	0 %	50 %	50 %	0 %	120401546
14087	NC_008726	TGA	3	9	567761	567769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401546
14088	NC_008726	AGA	2	6	567770	567775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401546
14089	NC_008726	CGGC	2	8	567779	567786	0 %	0 %	50 %	50 %	120401546
14090	NC_008726	TTG	2	6	567854	567859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401546
14091	NC_008726	TG	3	6	567896	567901	0 %	50 %	50 %	0 %	120401546
14092	NC_008726	GTT	2	6	567909	567914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401546
14093	NC_008726	CGGG	2	8	567959	567966	0 %	0 %	75 %	25 %	120401546
14094	NC_008726	GGGC	2	8	567971	567978	0 %	0 %	75 %	25 %	120401546
14095	NC_008726	CAC	2	6	567989	567994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401546
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14098	NC_008726	TTCA	2	8	568102	568109	25 %	50 %	0 %	25 %	120401546
14099	NC_008726	CTT	2	6	568134	568139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401546
14100	NC_008726	TTC	2	6	568243	568248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401546
14101	NC_008726	AGC	2	6	568277	568282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14102	NC_008726	TCGGGG	2	12	568310	568321	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	120401546
14103	NC_008726	GCG	2	6	568376	568381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401546
14104	NC_008726	TGG	2	6	568389	568394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401546
14105	NC_008726	GAC	2	6	568460	568465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14106	NC_008726	GAC	2	6	568559	568564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401546
14107	NC_008726	CG	3	6	568603	568608	0 %	0 %	50 %	50 %	120401547
14108	NC_008726	CGA	2	6	568640	568645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401547
14109	NC_008726	CG	4	8	568715	568722	0 %	0 %	50 %	50 %	120401547
14110	NC_008726	CGT	2	6	568828	568833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401547
14111	NC_008726	TCC	2	6	568850	568855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401547
14112	NC_008726	GTCAGG	2	12	568884	568895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	120401547
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14114	NC_008726	CGA	2	6	569012	569017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401547
14115	NC_008726	CTG	2	6	569049	569054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401547
14116	NC_008726	CAC	2	6	569060	569065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401547
14117	NC_008726	GC	3	6	569208	569213	0 %	0 %	50 %	50 %	120401548
14118	NC_008726	CCCGA	2	10	569257	569266	20 %	0 %	20 %	60 %	120401548
14119	NC_008726	ATGC	2	8	569350	569357	25 %	25 %	25 %	25 %	120401548
14120	NC_008726	GTC	2	6	569368	569373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401548
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14123	NC_008726	CGT	2	6	569567	569572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401548
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14234	NC_008726	CAG	2	6	575943	575948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401554
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14236	NC_008726	CGA	2	6	576101	576106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401554
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14238	NC_008726	TGC	2	6	576174	576179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401555
14239	NC_008726	CGA	2	6	576226	576231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401555
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14241	NC_008726	CGA	2	6	576265	576270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401555
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14243	NC_008726	CTG	2	6	576355	576360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401555
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14355	NC_008726	TG	3	6	582286	582291	0 %	50 %	50 %	0 %	120401562
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14357	NC_008726	TCG	2	6	582385	582390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401562
14358	NC_008726	TCGA	2	8	582408	582415	25 %	25 %	25 %	25 %	120401562
14359	NC_008726	GGC	2	6	582437	582442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401562
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14362	NC_008726	GCGA	2	8	582500	582507	25 %	0 %	50 %	25 %	120401562
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14465	NC_008726	ATC	2	6	587885	587890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401567
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14467	NC_008726	ATT	2	6	588177	588182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120401567
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14477	NC_008726	CACGA	2	10	588668	588677	40 %	0 %	20 %	40 %	120401567
14478	NC_008726	TCG	2	6	588699	588704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401567
14479	NC_008726	CGA	2	6	588715	588720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401567
14480	NC_008726	CAG	2	6	588731	588736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401567
14481	NC_008726	TACG	2	8	588749	588756	25 %	25 %	25 %	25 %	120401567
14482	NC_008726	GT	3	6	588774	588779	0 %	50 %	50 %	0 %	120401567
14483	NC_008726	GAC	2	6	588788	588793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401567
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14485	NC_008726	CGA	2	6	588889	588894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401567
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14491	NC_008726	CGA	2	6	589315	589320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401568
14492	NC_008726	GAC	2	6	589338	589343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401568
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14500	NC_008726	CGT	2	6	589748	589753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401569

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