MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 159442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008726	CGC	2	6	517793	517798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13002	NC_008726	GCG	2	6	517809	517814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401499
13003	NC_008726	CGC	3	9	517873	517881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13004	NC_008726	GTG	2	6	517936	517941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401499
13005	NC_008726	CCA	2	6	517964	517969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401499
13006	NC_008726	TG	3	6	517988	517993	0 %	50 %	50 %	0 %	120401499
13007	NC_008726	GCC	2	6	518010	518015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13008	NC_008726	CGC	2	6	518017	518022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13009	NC_008726	ACC	2	6	518107	518112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401499
13010	NC_008726	GGCT	2	8	518114	518121	0 %	25 %	50 %	25 %	120401499
13011	NC_008726	TCG	2	6	518130	518135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13012	NC_008726	GCC	2	6	518144	518149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13013	NC_008726	GAT	2	6	518176	518181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401499
13014	NC_008726	CTC	2	6	518198	518203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401499
13015	NC_008726	ACC	2	6	518220	518225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401499
13016	NC_008726	CCG	2	6	518248	518253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13017	NC_008726	TTC	2	6	518297	518302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401499
13018	NC_008726	GACCAG	2	12	518330	518341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13019	NC_008726	GCC	2	6	518348	518353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13020	NC_008726	GAC	2	6	518355	518360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13021	NC_008726	TGC	2	6	518427	518432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13022	NC_008726	TTC	2	6	518642	518647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401499
13023	NC_008726	CGCA	2	8	518653	518660	25 %	0 %	25 %	50 %	120401499
13024	NC_008726	TCG	2	6	518662	518667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13025	NC_008726	GTG	2	6	518669	518674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401499
13026	NC_008726	AC	3	6	518687	518692	50 %	0 %	0 %	50 %	120401499
13027	NC_008726	CGC	2	6	518765	518770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401499
13028	NC_008726	CTC	2	6	518816	518821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401499
13029	NC_008726	CTG	2	6	518858	518863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13030	NC_008726	CAA	2	6	518992	518997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401499
13031	NC_008726	CG	3	6	519015	519020	0 %	0 %	50 %	50 %	120401499
13032	NC_008726	TGC	2	6	519099	519104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13033	NC_008726	TCG	2	6	519150	519155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13034	NC_008726	GAT	2	6	519187	519192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401499
13035	NC_008726	CGA	2	6	519211	519216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401499
13036	NC_008726	ACC	2	6	519231	519236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401499
13037	NC_008726	CGGT	2	8	519800	519807	0 %	25 %	50 %	25 %	120401500
13038	NC_008726	GAG	2	6	519814	519819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401500
13039	NC_008726	CGT	2	6	519875	519880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13040	NC_008726	GTG	2	6	519888	519893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401500
13041	NC_008726	AGC	2	6	519905	519910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13042	NC_008726	GTG	3	9	520099	520107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401500
13043	NC_008726	GCT	2	6	520116	520121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13044	NC_008726	GGTGCG	2	12	520203	520214	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	120401500
13045	NC_008726	TGC	3	9	520244	520252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13046	NC_008726	CTG	2	6	520348	520353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13047	NC_008726	CGG	2	6	520419	520424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401500
13048	NC_008726	GAT	2	6	520482	520487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401500
13049	NC_008726	ACC	2	6	520623	520628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401500
13050	NC_008726	GA	3	6	520646	520651	50 %	0 %	50 %	0 %	120401500
13051	NC_008726	GA	3	6	520661	520666	50 %	0 %	50 %	0 %	120401500
13052	NC_008726	GCG	3	9	520680	520688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401500
13053	NC_008726	CGC	2	6	520712	520717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401500
13054	NC_008726	TTG	2	6	520747	520752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401500
13055	NC_008726	GGT	2	6	520773	520778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401500
13056	NC_008726	ACC	2	6	520810	520815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401500
13057	NC_008726	CGA	3	9	520839	520847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13058	NC_008726	AGC	2	6	520857	520862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13059	NC_008726	CAG	2	6	520884	520889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401500
13060	NC_008726	CGA	2	6	520910	520915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13061	NC_008726	CACCTG	2	12	520923	520934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120401501
13062	NC_008726	CGATC	2	10	520952	520961	20 %	20 %	20 %	40 %	120401501
13063	NC_008726	GGC	2	6	520963	520968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401501
13064	NC_008726	GTGGC	2	10	520991	521000	0 %	20 %	60 %	20 %	120401501
13065	NC_008726	CGC	2	6	521090	521095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
13066	NC_008726	GTC	2	6	521190	521195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13067	NC_008726	ACG	2	6	521236	521241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13068	NC_008726	CCG	2	6	521242	521247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
13069	NC_008726	TGC	2	6	521251	521256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13070	NC_008726	GGCCGG	2	12	521304	521315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401501
13071	NC_008726	CGC	2	6	521354	521359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
13072	NC_008726	GTG	2	6	521375	521380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401501
13073	NC_008726	GCT	2	6	521455	521460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13074	NC_008726	CCG	2	6	521579	521584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
13075	NC_008726	CGA	2	6	521612	521617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13076	NC_008726	CGA	2	6	521641	521646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13077	NC_008726	GGC	3	9	521660	521668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401501
13078	NC_008726	CCG	2	6	521683	521688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
13079	NC_008726	GCC	2	6	521691	521696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
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13083	NC_008726	GCC	2	6	521802	521807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401501
13084	NC_008726	CGA	2	6	521939	521944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
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13086	NC_008726	CGA	2	6	522053	522058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13087	NC_008726	GAT	2	6	522074	522079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401501
13088	NC_008726	CTG	2	6	522081	522086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13089	NC_008726	CCGG	2	8	522097	522104	0 %	0 %	50 %	50 %	120401501
13090	NC_008726	CAG	2	6	522158	522163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13091	NC_008726	AGC	2	6	522167	522172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13092	NC_008726	GAC	2	6	522180	522185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
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13100	NC_008726	CGA	2	6	522662	522667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13101	NC_008726	GTG	2	6	522719	522724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401501
13102	NC_008726	TGC	2	6	522727	522732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401501
13103	NC_008726	CTC	2	6	522951	522956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401501
13104	NC_008726	AGC	2	6	523117	523122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401502
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13106	NC_008726	CGG	2	6	523186	523191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401502
13107	NC_008726	GCG	2	6	523287	523292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401502
13108	NC_008726	CGC	2	6	523295	523300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401502
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13110	NC_008726	TCA	2	6	523344	523349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401502
13111	NC_008726	GA	3	6	523434	523439	50 %	0 %	50 %	0 %	120401502
13112	NC_008726	CGC	2	6	523466	523471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401502
13113	NC_008726	CAA	2	6	523506	523511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401502
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13116	NC_008726	TCG	2	6	523834	523839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401503
13117	NC_008726	GCG	2	6	523905	523910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401503
13118	NC_008726	TGG	2	6	523930	523935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401503
13119	NC_008726	GCT	2	6	524001	524006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401504
13120	NC_008726	CTG	2	6	524017	524022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401504
13121	NC_008726	GCG	2	6	524062	524067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401504
13122	NC_008726	CGC	2	6	524077	524082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401504
13123	NC_008726	CGC	2	6	524201	524206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401504
13124	NC_008726	AGT	2	6	524229	524234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401504
13125	NC_008726	AGCC	2	8	524266	524273	25 %	0 %	25 %	50 %	120401504
13126	NC_008726	CCACC	2	10	524287	524296	20 %	0 %	0 %	80 %	120401504
13127	NC_008726	TGG	2	6	524299	524304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401504
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13129	NC_008726	CCGAT	2	10	524342	524351	20 %	20 %	20 %	40 %	120401504
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13131	NC_008726	GAC	2	6	524392	524397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401504
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13136	NC_008726	ACC	3	9	524531	524539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401504
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13146	NC_008726	CGG	2	6	524881	524886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401504
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13151	NC_008726	GCC	2	6	525083	525088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401504
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13154	NC_008726	ACA	2	6	525189	525194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401504
13155	NC_008726	TGA	2	6	525483	525488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401505
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13158	NC_008726	CAC	2	6	525628	525633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401505
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13167	NC_008726	GTGG	2	8	526162	526169	0 %	25 %	75 %	0 %	120401506
13168	NC_008726	GCA	2	6	526189	526194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401506
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13225	NC_008726	ACT	2	6	528572	528577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401508
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13230	NC_008726	TCG	2	6	528856	528861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401508
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13232	NC_008726	CGG	2	6	528886	528891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401508
13233	NC_008726	ATC	2	6	528918	528923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401508
13234	NC_008726	TCG	2	6	528997	529002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401508
13235	NC_008726	CGG	2	6	529034	529039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401508
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13237	NC_008726	GC	3	6	529074	529079	0 %	0 %	50 %	50 %	120401508
13238	NC_008726	TCC	2	6	529126	529131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401508
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13351	NC_008726	GGGC	2	8	534202	534209	0 %	0 %	75 %	25 %	120401512
13352	NC_008726	GTGA	2	8	534253	534260	25 %	25 %	50 %	0 %	120401512
13353	NC_008726	GTC	2	6	534274	534279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401513
13354	NC_008726	GT	3	6	534296	534301	0 %	50 %	50 %	0 %	120401513
13355	NC_008726	CATGGC	2	12	534357	534368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120401513
13356	NC_008726	CGTCGC	2	12	534384	534395	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120401513
13357	NC_008726	GC	4	8	534480	534487	0 %	0 %	50 %	50 %	120401513
13358	NC_008726	TGC	2	6	534545	534550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401513
13359	NC_008726	CGT	2	6	534681	534686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401513
13360	NC_008726	CCT	2	6	534711	534716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401513
13361	NC_008726	GAG	2	6	534745	534750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401513
13362	NC_008726	CAC	2	6	534819	534824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401513
13363	NC_008726	CGG	2	6	534849	534854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401513
13364	NC_008726	GCA	2	6	534869	534874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401513
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13367	NC_008726	CCG	2	6	534956	534961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401513
13368	NC_008726	GTG	2	6	534970	534975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401513
13369	NC_008726	CGC	2	6	534981	534986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401513
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13372	NC_008726	GCA	2	6	535115	535120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401513
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13376	NC_008726	GGC	2	6	535213	535218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401513
13377	NC_008726	GCT	3	9	535221	535229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401513
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13383	NC_008726	TGGC	2	8	535557	535564	0 %	25 %	50 %	25 %	120401514
13384	NC_008726	GCT	2	6	535574	535579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401514
13385	NC_008726	CAA	2	6	535709	535714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401514
13386	NC_008726	GC	3	6	535732	535737	0 %	0 %	50 %	50 %	120401514
13387	NC_008726	CGC	2	6	535740	535745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401514
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13391	NC_008726	GGT	2	6	535940	535945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401514
13392	NC_008726	CGC	2	6	535993	535998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401514
13393	NC_008726	TGC	2	6	535999	536004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401514
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13396	NC_008726	TTC	2	6	536277	536282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401514
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13402	NC_008726	CGG	2	6	536414	536419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401514
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13424	NC_008726	CGG	2	6	537230	537235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401516
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13461	NC_008726	AGC	2	6	538942	538947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401519
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13471	NC_008726	TC	3	6	539697	539702	0 %	50 %	0 %	50 %	120401520
13472	NC_008726	TTG	2	6	539823	539828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401520
13473	NC_008726	TCG	2	6	539833	539838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401520
13474	NC_008726	CCGC	2	8	539919	539926	0 %	0 %	25 %	75 %	120401521
13475	NC_008726	GA	3	6	539953	539958	50 %	0 %	50 %	0 %	120401521
13476	NC_008726	GGC	2	6	540010	540015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401521
13477	NC_008726	CGC	2	6	540049	540054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401521
13478	NC_008726	GGT	2	6	540082	540087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401521
13479	NC_008726	GTC	2	6	540104	540109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401521
13480	NC_008726	CGC	2	6	540256	540261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401521
13481	NC_008726	ACC	2	6	540278	540283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401521
13482	NC_008726	CCTA	2	8	540354	540361	25 %	25 %	0 %	50 %	120401521
13483	NC_008726	GTC	2	6	540395	540400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401521
13484	NC_008726	TTG	2	6	540419	540424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401521
13485	NC_008726	TTC	2	6	540431	540436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401521
13486	NC_008726	TCA	2	6	540447	540452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401521
13487	NC_008726	TTC	2	6	540527	540532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401521
13488	NC_008726	CGC	2	6	540550	540555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401521
13489	NC_008726	TAC	2	6	540584	540589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401521
13490	NC_008726	CCG	2	6	540612	540617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401521
13491	NC_008726	GC	3	6	540637	540642	0 %	0 %	50 %	50 %	120401521
13492	NC_008726	CT	3	6	540696	540701	0 %	50 %	0 %	50 %	120401521
13493	NC_008726	CGG	2	6	540763	540768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401522
13494	NC_008726	GTG	2	6	540780	540785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401522
13495	NC_008726	GGC	2	6	540813	540818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401522
13496	NC_008726	GGT	2	6	540819	540824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401522
13497	NC_008726	CGG	2	6	540966	540971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401522
13498	NC_008726	ATCCA	2	10	541045	541054	40 %	20 %	0 %	40 %	120401522
13499	NC_008726	ACCC	2	8	541091	541098	25 %	0 %	0 %	75 %	120401522
13500	NC_008726	GCTCAA	2	12	541212	541223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120401522

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