MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 159442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008726	CGG	2	6	194242	194247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401214
5002	NC_008726	TCG	2	6	194271	194276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401214
5003	NC_008726	GGGTG	2	10	194279	194288	0 %	20 %	80 %	0 %	120401214
5004	NC_008726	CGG	2	6	194292	194297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401214
5005	NC_008726	TCC	2	6	194298	194303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401214
5006	NC_008726	C	6	6	194302	194307	0 %	0 %	0 %	100 %	120401214
5007	NC_008726	CCA	2	6	194332	194337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401214
5008	NC_008726	TCC	2	6	194348	194353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401215
5009	NC_008726	CGCCAC	2	12	194359	194370	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	120401215
5010	NC_008726	TCG	2	6	194411	194416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5011	NC_008726	GCCG	2	8	194419	194426	0 %	0 %	50 %	50 %	120401215
5012	NC_008726	CGC	2	6	194468	194473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
5013	NC_008726	GC	3	6	194496	194501	0 %	0 %	50 %	50 %	120401215
5014	NC_008726	GTA	2	6	194518	194523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401215
5015	NC_008726	CCG	2	6	194547	194552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
5016	NC_008726	CATC	2	8	194562	194569	25 %	25 %	0 %	50 %	120401215
5017	NC_008726	CG	4	8	194601	194608	0 %	0 %	50 %	50 %	120401215
5018	NC_008726	GCA	3	9	194688	194696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5019	NC_008726	TCG	2	6	194882	194887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5020	NC_008726	CAC	2	6	195001	195006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401215
5021	NC_008726	GTC	2	6	195046	195051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5022	NC_008726	GAT	2	6	195055	195060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401215
5023	NC_008726	CGAC	2	8	195105	195112	25 %	0 %	25 %	50 %	120401215
5024	NC_008726	GGA	2	6	195114	195119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401215
5025	NC_008726	CCAG	2	8	195126	195133	25 %	0 %	25 %	50 %	120401215
5026	NC_008726	CCA	2	6	195142	195147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401215
5027	NC_008726	TCG	2	6	195155	195160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5028	NC_008726	GCACCA	2	12	195180	195191	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	120401215
5029	NC_008726	GCG	2	6	195305	195310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5030	NC_008726	GCG	2	6	195453	195458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5031	NC_008726	CGA	2	6	195475	195480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5032	NC_008726	AGCC	2	8	195506	195513	25 %	0 %	25 %	50 %	120401215
5033	NC_008726	CGAC	2	8	195552	195559	25 %	0 %	25 %	50 %	120401215
5034	NC_008726	TCA	2	6	195567	195572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401215
5035	NC_008726	CAG	2	6	195613	195618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5036	NC_008726	CGA	2	6	195639	195644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5037	NC_008726	GTC	2	6	195679	195684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5038	NC_008726	GCC	2	6	195709	195714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
5039	NC_008726	GCG	2	6	195728	195733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5040	NC_008726	CGG	2	6	195745	195750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5041	NC_008726	GCT	2	6	195753	195758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5042	NC_008726	CGAC	2	8	195804	195811	25 %	0 %	25 %	50 %	120401215
5043	NC_008726	CCG	2	6	195816	195821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
5044	NC_008726	CAG	2	6	195823	195828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5045	NC_008726	TCT	2	6	195894	195899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401215
5046	NC_008726	AGC	2	6	195914	195919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5047	NC_008726	CGT	2	6	195939	195944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5048	NC_008726	CGG	2	6	196002	196007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5049	NC_008726	GGGTC	2	10	196035	196044	0 %	20 %	60 %	20 %	120401215
5050	NC_008726	CAT	2	6	196072	196077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401215
5051	NC_008726	GCG	2	6	196091	196096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5052	NC_008726	CAG	2	6	196102	196107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5053	NC_008726	GCC	2	6	196112	196117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
5054	NC_008726	ACG	2	6	196218	196223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5055	NC_008726	CGC	2	6	196231	196236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
5056	NC_008726	CGT	2	6	196273	196278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5057	NC_008726	CGACGG	2	12	196293	196304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	120401215
5058	NC_008726	GCA	2	6	196332	196337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5059	NC_008726	CAG	2	6	196393	196398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5060	NC_008726	CGG	2	6	196431	196436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5061	NC_008726	CGGC	2	8	196451	196458	0 %	0 %	50 %	50 %	120401215
5062	NC_008726	GC	3	6	196457	196462	0 %	0 %	50 %	50 %	120401215
5063	NC_008726	TCG	2	6	196557	196562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5064	NC_008726	CAG	2	6	196573	196578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5065	NC_008726	CAC	2	6	196597	196602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401215
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5067	NC_008726	CGG	3	9	196635	196643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5068	NC_008726	TGG	2	6	196722	196727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401215
5069	NC_008726	GGC	2	6	196735	196740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401215
5070	NC_008726	TTC	2	6	196804	196809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401215
5071	NC_008726	GCT	2	6	196836	196841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
5072	NC_008726	TGA	2	6	196887	196892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401215
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5074	NC_008726	GAC	2	6	196936	196941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401215
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5077	NC_008726	GTC	2	6	196999	197004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401215
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5079	NC_008726	GCGCG	2	10	197020	197029	0 %	0 %	60 %	40 %	120401215
5080	NC_008726	GCC	3	9	197122	197130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401215
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5086	NC_008726	GCG	2	6	197604	197609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401216
5087	NC_008726	CAC	2	6	197711	197716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401216
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5090	NC_008726	GGC	2	6	197750	197755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401216
5091	NC_008726	CGC	2	6	197789	197794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401216
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5094	NC_008726	GCC	2	6	197886	197891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401216
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5099	NC_008726	GGCGCG	2	12	198131	198142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401217
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5101	NC_008726	TGCCC	2	10	198166	198175	0 %	20 %	20 %	60 %	120401217
5102	NC_008726	CCG	3	9	198200	198208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401217
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5107	NC_008726	TCCG	2	8	198501	198508	0 %	25 %	25 %	50 %	120401218
5108	NC_008726	G	7	7	198514	198520	0 %	0 %	100 %	0 %	120401218
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5115	NC_008726	CGA	2	6	198831	198836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401218
5116	NC_008726	CG	3	6	198873	198878	0 %	0 %	50 %	50 %	120401218
5117	NC_008726	TGC	2	6	198890	198895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401218
5118	NC_008726	CG	3	6	198898	198903	0 %	0 %	50 %	50 %	120401218
5119	NC_008726	CG	3	6	198960	198965	0 %	0 %	50 %	50 %	120401218
5120	NC_008726	TCG	2	6	198977	198982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401218
5121	NC_008726	CTG	2	6	199021	199026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401218
5122	NC_008726	GTG	2	6	199051	199056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401218
5123	NC_008726	GCAG	2	8	199061	199068	25 %	0 %	50 %	25 %	120401218
5124	NC_008726	GAGG	2	8	199158	199165	25 %	0 %	75 %	0 %	120401218
5125	NC_008726	TGC	2	6	199208	199213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401218
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5133	NC_008726	TGC	2	6	199461	199466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401219
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5240	NC_008726	CTG	2	6	202799	202804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401222
5241	NC_008726	CGG	2	6	202807	202812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401222
5242	NC_008726	GCCG	2	8	202877	202884	0 %	0 %	50 %	50 %	120401222
5243	NC_008726	CG	3	6	202883	202888	0 %	0 %	50 %	50 %	120401222
5244	NC_008726	TCG	2	6	202929	202934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401222
5245	NC_008726	TCG	2	6	202938	202943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401222
5246	NC_008726	CAT	2	6	202972	202977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401222
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5249	NC_008726	ATC	2	6	203126	203131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401222
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5251	NC_008726	TGC	2	6	203157	203162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401222
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5253	NC_008726	CGG	3	9	203224	203232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401222
5254	NC_008726	CTG	2	6	203258	203263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401222
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5271	NC_008726	GGCGG	2	10	203798	203807	0 %	0 %	80 %	20 %	120401223
5272	NC_008726	CGG	2	6	203815	203820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401223
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5322	NC_008726	GCT	2	6	205038	205043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401223
5323	NC_008726	TCC	2	6	205127	205132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401223
5324	NC_008726	CGG	2	6	205156	205161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401223
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5326	NC_008726	ATC	2	6	205220	205225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401223
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5328	NC_008726	TCA	2	6	205263	205268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401223
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5331	NC_008726	TCT	2	6	205332	205337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401223
5332	NC_008726	GAA	2	6	205381	205386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401223
5333	NC_008726	GCA	2	6	205395	205400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401223
5334	NC_008726	CGC	2	6	205477	205482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401223
5335	NC_008726	GACG	2	8	205489	205496	25 %	0 %	50 %	25 %	120401223
5336	NC_008726	GAT	2	6	205498	205503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401223
5337	NC_008726	CAG	3	9	205540	205548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401223
5338	NC_008726	GAG	2	6	205556	205561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401223
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5340	NC_008726	TCA	2	6	205605	205610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401223
5341	NC_008726	GCG	2	6	205615	205620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401223
5342	NC_008726	CGG	2	6	205623	205628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401223
5343	NC_008726	ACC	2	6	205721	205726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401223
5344	NC_008726	GAA	2	6	205735	205740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401223
5345	NC_008726	ATG	2	6	205772	205777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401223
5346	NC_008726	GC	3	6	205782	205787	0 %	0 %	50 %	50 %	120401223
5347	NC_008726	GCC	2	6	205801	205806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401223
5348	NC_008726	GAT	2	6	205807	205812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401223
5349	NC_008726	CGC	2	6	205836	205841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401223
5350	NC_008726	CGAAGA	2	12	205842	205853	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	120401223
5351	NC_008726	CAC	2	6	205858	205863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401223
5352	NC_008726	CCA	2	6	205866	205871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401223
5353	NC_008726	CG	3	6	205891	205896	0 %	0 %	50 %	50 %	120401223
5354	NC_008726	CGT	2	6	205968	205973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401223
5355	NC_008726	TCG	5	15	206021	206035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401223
5356	NC_008726	CTG	2	6	206086	206091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401223
5357	NC_008726	CGG	2	6	206100	206105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401223
5358	NC_008726	GC	3	6	206117	206122	0 %	0 %	50 %	50 %	120401223
5359	NC_008726	AGCC	2	8	206123	206130	25 %	0 %	25 %	50 %	120401223
5360	NC_008726	CGATC	2	10	206142	206151	20 %	20 %	20 %	40 %	120401223
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5363	NC_008726	TCCA	2	8	206195	206202	25 %	25 %	0 %	50 %	120401223
5364	NC_008726	CGG	2	6	206230	206235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401223
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5481	NC_008726	GCC	2	6	210258	210263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401227
5482	NC_008726	CGC	2	6	210275	210280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401227
5483	NC_008726	CGC	2	6	210293	210298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401227
5484	NC_008726	GCC	2	6	210300	210305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401227
5485	NC_008726	CGG	2	6	210324	210329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401227
5486	NC_008726	CGC	2	6	210332	210337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401227
5487	NC_008726	CTC	2	6	210378	210383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401227
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5489	NC_008726	GGC	2	6	210426	210431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401227
5490	NC_008726	GC	3	6	210748	210753	0 %	0 %	50 %	50 %	120401228
5491	NC_008726	TCG	2	6	210757	210762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401228
5492	NC_008726	AAG	2	6	210777	210782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401228
5493	NC_008726	AGC	2	6	210796	210801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401228
5494	NC_008726	TCCG	2	8	210827	210834	0 %	25 %	25 %	50 %	120401228
5495	NC_008726	CG	4	8	210839	210846	0 %	0 %	50 %	50 %	120401228
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5497	NC_008726	TGGA	2	8	210906	210913	25 %	25 %	50 %	0 %	120401228
5498	NC_008726	GACC	2	8	210938	210945	25 %	0 %	25 %	50 %	120401228
5499	NC_008726	ATGC	2	8	210956	210963	25 %	25 %	25 %	25 %	120401228
5500	NC_008726	GTG	2	6	210981	210986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401228

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