MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 4761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008147	GCCA	2	8	51111	51118	25 %	0 %	25 %	50 %	108802432
1002	NC_008147	CTG	2	6	51120	51125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802432
1003	NC_008147	CCG	2	6	51146	51151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802432
1004	NC_008147	GCTG	2	8	51157	51164	0 %	25 %	50 %	25 %	108802432
1005	NC_008147	CGC	2	6	51329	51334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802432
1006	NC_008147	CGC	2	6	51373	51378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802433
1007	NC_008147	CAG	2	6	51388	51393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1008	NC_008147	ACC	2	6	51399	51404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802433
1009	NC_008147	GC	3	6	51432	51437	0 %	0 %	50 %	50 %	108802433
1010	NC_008147	CGG	2	6	51438	51443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802433
1011	NC_008147	CACCGC	2	12	51517	51528	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	108802433
1012	NC_008147	GCC	2	6	51529	51534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802433
1013	NC_008147	GGCCCG	2	12	51571	51582	0 %	0 %	50 %	50 %	108802433
1014	NC_008147	CGT	2	6	51621	51626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1015	NC_008147	CGG	3	9	51630	51638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802433
1016	NC_008147	CGT	2	6	51654	51659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1017	NC_008147	TGG	2	6	51705	51710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802433
1018	NC_008147	TCG	2	6	51773	51778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1019	NC_008147	TCG	2	6	51806	51811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1020	NC_008147	CAG	2	6	51894	51899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1021	NC_008147	GCA	2	6	51924	51929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802433
1022	NC_008147	CAC	2	6	51961	51966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802433
1023	NC_008147	GC	3	6	52028	52033	0 %	0 %	50 %	50 %	108802434
1024	NC_008147	CGG	2	6	52092	52097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802434
1025	NC_008147	TTG	2	6	52101	52106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802434
1026	NC_008147	CGG	2	6	52141	52146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802434
1027	NC_008147	CAC	2	6	52199	52204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802434
1028	NC_008147	GC	3	6	52305	52310	0 %	0 %	50 %	50 %	108802434
1029	NC_008147	GCC	2	6	52361	52366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802434
1030	NC_008147	GCG	2	6	52371	52376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802434
1031	NC_008147	CGG	2	6	52453	52458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802434
1032	NC_008147	GGT	2	6	52475	52480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802434
1033	NC_008147	CGC	2	6	52483	52488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802434
1034	NC_008147	CGC	2	6	52530	52535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802434
1035	NC_008147	TCG	2	6	52566	52571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802434
1036	NC_008147	TGG	2	6	52594	52599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802434
1037	NC_008147	CCA	2	6	52600	52605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802434
1038	NC_008147	GCT	3	9	52675	52683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802434
1039	NC_008147	CGC	2	6	52687	52692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802434
1040	NC_008147	GGGCGC	2	12	52744	52755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802434
1041	NC_008147	TCG	2	6	52800	52805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802434
1042	NC_008147	GCC	2	6	52845	52850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802434
1043	NC_008147	GCT	2	6	52871	52876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802434
1044	NC_008147	GCC	2	6	52880	52885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802435
1045	NC_008147	CCA	2	6	52902	52907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802435
1046	NC_008147	CGC	2	6	52989	52994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802435
1047	NC_008147	TCG	2	6	52997	53002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802435
1048	NC_008147	GC	3	6	53052	53057	0 %	0 %	50 %	50 %	108802435
1049	NC_008147	TGC	2	6	53088	53093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802435
1050	NC_008147	GGC	3	9	53174	53182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802435
1051	NC_008147	ACCG	2	8	53213	53220	25 %	0 %	25 %	50 %	108802435
1052	NC_008147	TC	3	6	53363	53368	0 %	50 %	0 %	50 %	108802436
1053	NC_008147	GCG	2	6	53419	53424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802436
1054	NC_008147	CCG	2	6	53432	53437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802436
1055	NC_008147	GC	3	6	53449	53454	0 %	0 %	50 %	50 %	108802436
1056	NC_008147	CAA	2	6	53514	53519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802436
1057	NC_008147	GCG	2	6	53572	53577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802436
1058	NC_008147	CCGC	2	8	53634	53641	0 %	0 %	25 %	75 %	108802436
1059	NC_008147	GAC	2	6	53654	53659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802436
1060	NC_008147	CCTCA	2	10	53679	53688	20 %	20 %	0 %	60 %	108802436
1061	NC_008147	GCC	2	6	53694	53699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802436
1062	NC_008147	CGG	2	6	53858	53863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802436
1063	NC_008147	TCG	2	6	53869	53874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802436
1064	NC_008147	CGC	2	6	53952	53957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802436
1065	NC_008147	CCGG	2	8	53994	54001	0 %	0 %	50 %	50 %	108802437
1066	NC_008147	CGC	2	6	54035	54040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802437
1067	NC_008147	GC	3	6	54042	54047	0 %	0 %	50 %	50 %	108802437
1068	NC_008147	TCG	2	6	54108	54113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802437
1069	NC_008147	CCG	2	6	54137	54142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802437
1070	NC_008147	CAA	2	6	54185	54190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802437
1071	NC_008147	CGGC	2	8	54197	54204	0 %	0 %	50 %	50 %	108802437
1072	NC_008147	CCGC	2	8	54253	54260	0 %	0 %	25 %	75 %	108802437
1073	NC_008147	GCC	2	6	54279	54284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802437
1074	NC_008147	GCC	2	6	54296	54301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802438
1075	NC_008147	TGC	2	6	54316	54321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802438
1076	NC_008147	GCTG	2	8	54322	54329	0 %	25 %	50 %	25 %	108802438
1077	NC_008147	GCA	2	6	54356	54361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802438
1078	NC_008147	CGC	3	9	54367	54375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802438
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1080	NC_008147	ACCG	2	8	54464	54471	25 %	0 %	25 %	50 %	108802438
1081	NC_008147	CCG	2	6	54486	54491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802438
1082	NC_008147	CGT	2	6	54498	54503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802438
1083	NC_008147	GCT	2	6	54504	54509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802438
1084	NC_008147	CGG	2	6	54510	54515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802438
1085	NC_008147	GCC	2	6	54539	54544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802438
1086	NC_008147	GC	4	8	54608	54615	0 %	0 %	50 %	50 %	108802438
1087	NC_008147	TCG	2	6	54653	54658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802438
1088	NC_008147	TGG	2	6	54786	54791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802438
1089	NC_008147	CAG	2	6	54805	54810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802438
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1091	NC_008147	TCA	2	6	54880	54885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802439
1092	NC_008147	GCAC	2	8	54890	54897	25 %	0 %	25 %	50 %	108802439
1093	NC_008147	CGG	2	6	55052	55057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802439
1094	NC_008147	CCG	2	6	55423	55428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802440
1095	NC_008147	CCG	2	6	55433	55438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802440
1096	NC_008147	CG	3	6	55445	55450	0 %	0 %	50 %	50 %	108802440
1097	NC_008147	CGC	2	6	55582	55587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802440
1098	NC_008147	CAC	2	6	55622	55627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802440
1099	NC_008147	AAC	2	6	55639	55644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802440
1100	NC_008147	GCT	2	6	55653	55658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1101	NC_008147	CACC	2	8	55660	55667	25 %	0 %	0 %	75 %	108802440
1102	NC_008147	GCGG	2	8	55690	55697	0 %	0 %	75 %	25 %	108802440
1103	NC_008147	GCA	2	6	55728	55733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1104	NC_008147	CGA	2	6	55737	55742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1105	NC_008147	GCC	2	6	55779	55784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802440
1106	NC_008147	AGC	2	6	55799	55804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1107	NC_008147	GCC	2	6	55821	55826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802440
1108	NC_008147	CAC	2	6	55849	55854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802440
1109	NC_008147	TGA	2	6	55857	55862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802440
1110	NC_008147	GAC	2	6	55868	55873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1111	NC_008147	CGAAG	2	10	55914	55923	40 %	0 %	40 %	20 %	108802440
1112	NC_008147	CCA	2	6	55963	55968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802440
1113	NC_008147	TCG	2	6	55988	55993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1114	NC_008147	GCC	2	6	56002	56007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802440
1115	NC_008147	AGC	2	6	56048	56053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802440
1116	NC_008147	GACGC	2	10	56238	56247	20 %	0 %	40 %	40 %	108802441
1117	NC_008147	CCG	2	6	56286	56291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802441
1118	NC_008147	TCAGCG	2	12	56303	56314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108802441
1119	NC_008147	CG	3	6	56319	56324	0 %	0 %	50 %	50 %	108802441
1120	NC_008147	GCA	2	6	56366	56371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802441
1121	NC_008147	GATC	2	8	56385	56392	25 %	25 %	25 %	25 %	108802441
1122	NC_008147	GTC	2	6	56437	56442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802441
1123	NC_008147	TCA	2	6	56483	56488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802441
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1125	NC_008147	ACC	2	6	56533	56538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802441
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1251	NC_008147	TCCG	2	8	61682	61689	0 %	25 %	25 %	50 %	108802448
1252	NC_008147	GC	3	6	61701	61706	0 %	0 %	50 %	50 %	108802448
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1377	NC_008147	CGC	3	9	66569	66577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802451
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1483	NC_008147	CG	5	10	70320	70329	0 %	0 %	50 %	50 %	108802453
1484	NC_008147	CA	3	6	70363	70368	50 %	0 %	0 %	50 %	108802453
1485	NC_008147	GC	3	6	70372	70377	0 %	0 %	50 %	50 %	108802453
1486	NC_008147	TGG	2	6	70397	70402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802453
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1491	NC_008147	CCAG	2	8	70645	70652	25 %	0 %	25 %	50 %	108802453
1492	NC_008147	CTGC	2	8	70691	70698	0 %	25 %	25 %	50 %	108802453
1493	NC_008147	CGC	2	6	70707	70712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802453
1494	NC_008147	GCA	2	6	70775	70780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802453
1495	NC_008147	CGTT	2	8	70822	70829	0 %	50 %	25 %	25 %	108802453
1496	NC_008147	GCGA	2	8	70842	70849	25 %	0 %	50 %	25 %	108802453
1497	NC_008147	GCG	2	6	70882	70887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802453
1498	NC_008147	CTT	2	6	70902	70907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802453
1499	NC_008147	CAGC	2	8	70935	70942	25 %	0 %	25 %	50 %	108802453
1500	NC_008147	CCG	2	6	70973	70978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802453

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