MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 62730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	TA	3	6	41	46	50 %	50 %	0 %	0 %	88601323
2	NC_007796	GAA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601323
3	NC_007796	GTTT	2	8	185	192	0 %	75 %	25 %	0 %	88601323
4	NC_007796	TAC	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601323
5	NC_007796	G	6	6	519	524	0 %	0 %	100 %	0 %	88601324
6	NC_007796	ACCAG	2	10	663	672	40 %	0 %	20 %	40 %	88601324
7	NC_007796	GCCC	2	8	725	732	0 %	0 %	25 %	75 %	88601324
8	NC_007796	ATT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601324
9	NC_007796	AAT	2	6	751	756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601324
10	NC_007796	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601324
11	NC_007796	GCA	2	6	812	817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601324
12	NC_007796	A	6	6	819	824	100 %	0 %	0 %	0 %	88601324
13	NC_007796	TCAA	2	8	830	837	50 %	25 %	0 %	25 %	88601324
14	NC_007796	GCG	2	6	1267	1272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88601325
15	NC_007796	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	88601325
16	NC_007796	GTT	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601325
17	NC_007796	TCT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601325
18	NC_007796	TGA	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
19	NC_007796	TCT	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601325
20	NC_007796	GAT	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
21	NC_007796	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601325
22	NC_007796	CAT	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601325
23	NC_007796	GAT	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
24	NC_007796	T	6	6	1509	1514	0 %	100 %	0 %	0 %	88601325
25	NC_007796	GAT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
26	NC_007796	GGT	2	6	1530	1535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601325
27	NC_007796	ATG	2	6	1561	1566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
28	NC_007796	AGG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601325
29	NC_007796	TCCT	2	8	1779	1786	0 %	50 %	0 %	50 %	88601325
30	NC_007796	AT	3	6	1828	1833	50 %	50 %	0 %	0 %	88601325
31	NC_007796	ATTC	2	8	1854	1861	25 %	50 %	0 %	25 %	88601325
32	NC_007796	AT	3	6	2052	2057	50 %	50 %	0 %	0 %	88601326
33	NC_007796	CCT	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601326
34	NC_007796	TCA	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
35	NC_007796	TTG	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
36	NC_007796	TCC	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601326
37	NC_007796	CAT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
38	NC_007796	GAT	2	6	2302	2307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
39	NC_007796	TAT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601326
40	NC_007796	GAGG	2	8	2337	2344	25 %	0 %	75 %	0 %	88601326
41	NC_007796	GTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
42	NC_007796	ATC	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
43	NC_007796	GCA	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
44	NC_007796	AGC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
45	NC_007796	GAT	3	9	2755	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
46	NC_007796	CCTT	2	8	2909	2916	0 %	50 %	0 %	50 %	88601326
47	NC_007796	TGA	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
48	NC_007796	CCAT	2	8	3044	3051	25 %	25 %	0 %	50 %	88601326
49	NC_007796	AGA	3	9	3095	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601326
50	NC_007796	G	6	6	3131	3136	0 %	0 %	100 %	0 %	88601326
51	NC_007796	A	7	7	3196	3202	100 %	0 %	0 %	0 %	88601326
52	NC_007796	GAC	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
53	NC_007796	AG	3	6	3373	3378	50 %	0 %	50 %	0 %	88601326
54	NC_007796	ATC	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
55	NC_007796	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	88601326
56	NC_007796	ATC	3	9	3500	3508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
57	NC_007796	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601326
58	NC_007796	GA	3	6	3608	3613	50 %	0 %	50 %	0 %	88601326
59	NC_007796	A	7	7	3730	3736	100 %	0 %	0 %	0 %	88601326
60	NC_007796	ATA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601326
61	NC_007796	TAA	2	6	3843	3848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601326
62	NC_007796	GAAA	2	8	3893	3900	75 %	0 %	25 %	0 %	88601326
63	NC_007796	TA	3	6	3974	3979	50 %	50 %	0 %	0 %	88601326
64	NC_007796	ATCCT	2	10	4031	4040	20 %	40 %	0 %	40 %	88601326
65	NC_007796	TTG	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
66	NC_007796	CAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601326
67	NC_007796	TCC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601326
68	NC_007796	ATG	2	6	4190	4195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
69	NC_007796	ATG	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
70	NC_007796	GCT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601326
71	NC_007796	GGT	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601326
72	NC_007796	AACGGA	2	12	4478	4489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88601326
73	NC_007796	AAT	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601326
74	NC_007796	TCT	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601326
75	NC_007796	TC	3	6	4611	4616	0 %	50 %	0 %	50 %	88601326
76	NC_007796	TGT	2	6	4620	4625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
77	NC_007796	GGA	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601326
78	NC_007796	GAA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601326
79	NC_007796	TGAT	2	8	4856	4863	25 %	50 %	25 %	0 %	88601326
80	NC_007796	TGG	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601326
81	NC_007796	ACGG	2	8	4918	4925	25 %	0 %	50 %	25 %	88601326
82	NC_007796	ATT	2	6	4942	4947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601326
83	NC_007796	AGATC	2	10	4983	4992	40 %	20 %	20 %	20 %	88601326
84	NC_007796	GA	3	6	4996	5001	50 %	0 %	50 %	0 %	88601326
85	NC_007796	CTTT	2	8	5031	5038	0 %	75 %	0 %	25 %	88601326
86	NC_007796	CAG	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
87	NC_007796	GGA	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601326
88	NC_007796	GA	3	6	5164	5169	50 %	0 %	50 %	0 %	88601326
89	NC_007796	GAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601327
90	NC_007796	T	8	8	5231	5238	0 %	100 %	0 %	0 %	88601327
91	NC_007796	CGA	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
92	NC_007796	ATG	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
93	NC_007796	CTGC	2	8	5302	5309	0 %	25 %	25 %	50 %	88601327
94	NC_007796	A	6	6	5345	5350	100 %	0 %	0 %	0 %	88601327
95	NC_007796	TGA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
96	NC_007796	A	6	6	5541	5546	100 %	0 %	0 %	0 %	88601327
97	NC_007796	GAA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
98	NC_007796	GAA	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
99	NC_007796	TCA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
100	NC_007796	AGC	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
101	NC_007796	GAA	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
102	NC_007796	GAA	2	6	5748	5753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
103	NC_007796	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
104	NC_007796	GAA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
105	NC_007796	TTA	2	6	6076	6081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601327
106	NC_007796	ATT	2	6	6099	6104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601327
107	NC_007796	CTT	2	6	6153	6158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601327
108	NC_007796	A	6	6	6188	6193	100 %	0 %	0 %	0 %	88601327
109	NC_007796	TGA	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
110	NC_007796	TAAA	2	8	6295	6302	75 %	25 %	0 %	0 %	88601327
111	NC_007796	CAGGG	2	10	6384	6393	20 %	0 %	60 %	20 %	88601327
112	NC_007796	GCT	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601327
113	NC_007796	CAT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
114	NC_007796	AGATG	2	10	6581	6590	40 %	20 %	40 %	0 %	88601327
115	NC_007796	GAA	2	6	6644	6649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
116	NC_007796	CAA	2	6	6680	6685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601327
117	NC_007796	TA	3	6	6876	6881	50 %	50 %	0 %	0 %	88601327
118	NC_007796	AAT	2	6	6924	6929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601327
119	NC_007796	TGA	2	6	6971	6976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
120	NC_007796	GT	3	6	6991	6996	0 %	50 %	50 %	0 %	88601327
121	NC_007796	GGT	2	6	7030	7035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601327
122	NC_007796	GGAC	2	8	7063	7070	25 %	0 %	50 %	25 %	88601327
123	NC_007796	AGA	2	6	7111	7116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
124	NC_007796	AGA	3	9	7124	7132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
125	NC_007796	AAAG	2	8	7137	7144	75 %	0 %	25 %	0 %	88601327
126	NC_007796	TGTC	2	8	7189	7196	0 %	50 %	25 %	25 %	88601327
127	NC_007796	CGGGA	2	10	7203	7212	20 %	0 %	60 %	20 %	88601327
128	NC_007796	GCA	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
129	NC_007796	AGA	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
130	NC_007796	ATG	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
131	NC_007796	GCAG	2	8	7454	7461	25 %	0 %	50 %	25 %	88601327
132	NC_007796	AGC	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
133	NC_007796	GAG	2	6	7524	7529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601327
134	NC_007796	AGA	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
135	NC_007796	CAT	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
136	NC_007796	CCA	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601327
137	NC_007796	ATC	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
138	NC_007796	GAT	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
139	NC_007796	GA	3	6	7729	7734	50 %	0 %	50 %	0 %	88601327
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143	NC_007796	ATT	2	6	8037	8042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601327
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162	NC_007796	GA	3	6	8838	8843	50 %	0 %	50 %	0 %	88601327
163	NC_007796	CCT	2	6	8878	8883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601327
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166	NC_007796	GAT	2	6	9002	9007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
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169	NC_007796	TGGAA	2	10	9251	9260	40 %	20 %	40 %	0 %	88601327
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172	NC_007796	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	88601327
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175	NC_007796	TCCA	2	8	9762	9769	25 %	25 %	0 %	50 %	88601328
176	NC_007796	ATCT	2	8	9797	9804	25 %	50 %	0 %	25 %	88601328
177	NC_007796	TCT	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601328
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182	NC_007796	CTG	2	6	9943	9948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601328
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264	NC_007796	A	6	6	14061	14066	100 %	0 %	0 %	0 %	88601331
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267	NC_007796	A	6	6	14148	14153	100 %	0 %	0 %	0 %	88601331
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269	NC_007796	A	6	6	14307	14312	100 %	0 %	0 %	0 %	88601331
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398	NC_007796	A	7	7	22236	22242	100 %	0 %	0 %	0 %	88601334
399	NC_007796	ACA	2	6	22315	22320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601334
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401	NC_007796	A	6	6	22512	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	88601334
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