MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 62730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007796	CAA	2	6	192332	192337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601489
3502	NC_007796	TGA	2	6	192597	192602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601489
3503	NC_007796	TAT	2	6	192625	192630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601489
3504	NC_007796	AAG	2	6	192967	192972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601490
3505	NC_007796	GAA	2	6	192989	192994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601490
3506	NC_007796	ACT	2	6	192995	193000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601490
3507	NC_007796	ATT	2	6	193015	193020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601490
3508	NC_007796	CAT	2	6	193029	193034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601490
3509	NC_007796	ATG	2	6	193138	193143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601490
3510	NC_007796	CAT	2	6	193149	193154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601490
3511	NC_007796	TCC	2	6	193192	193197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601490
3512	NC_007796	ACA	2	6	193225	193230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601490
3513	NC_007796	TCCA	2	8	193321	193328	25 %	25 %	0 %	50 %	88601490
3514	NC_007796	TCC	2	6	193390	193395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601490
3515	NC_007796	CGG	2	6	193456	193461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88601490
3516	NC_007796	ATC	2	6	193557	193562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601490
3517	NC_007796	TGA	2	6	193622	193627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601490
3518	NC_007796	GAA	2	6	193686	193691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601490
3519	NC_007796	TGA	2	6	193748	193753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601490
3520	NC_007796	TGC	2	6	193784	193789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601490
3521	NC_007796	CTC	2	6	193819	193824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601490
3522	NC_007796	TTA	2	6	193825	193830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601490
3523	NC_007796	GGC	2	6	193838	193843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88601490
3524	NC_007796	AT	3	6	193844	193849	50 %	50 %	0 %	0 %	88601490
3525	NC_007796	GTG	2	6	193909	193914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601490
3526	NC_007796	ACTG	2	8	193994	194001	25 %	25 %	25 %	25 %	88601490
3527	NC_007796	ATGC	2	8	194059	194066	25 %	25 %	25 %	25 %	88601490
3528	NC_007796	AAG	2	6	194109	194114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601490
3529	NC_007796	TCC	2	6	194116	194121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601490
3530	NC_007796	GATTGA	2	12	194129	194140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601490
3531	NC_007796	CT	3	6	194163	194168	0 %	50 %	0 %	50 %	88601490
3532	NC_007796	AGAT	2	8	194200	194207	50 %	25 %	25 %	0 %	88601490
3533	NC_007796	ATC	2	6	194223	194228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601490
3534	NC_007796	T	8	8	194741	194748	0 %	100 %	0 %	0 %	88601491
3535	NC_007796	TCC	2	6	194783	194788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601491
3536	NC_007796	TCT	2	6	194809	194814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601491
3537	NC_007796	T	6	6	194817	194822	0 %	100 %	0 %	0 %	88601491
3538	NC_007796	ATC	2	6	194878	194883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601491
3539	NC_007796	TCTTCA	2	12	194887	194898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88601491
3540	NC_007796	CCA	2	6	194934	194939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601491
3541	NC_007796	TG	3	6	194963	194968	0 %	50 %	50 %	0 %	88601491
3542	NC_007796	TGA	2	6	194987	194992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601491
3543	NC_007796	AG	3	6	195029	195034	50 %	0 %	50 %	0 %	88601491
3544	NC_007796	TTC	2	6	195040	195045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601491
3545	NC_007796	GA	3	6	195124	195129	50 %	0 %	50 %	0 %	88601491
3546	NC_007796	TCG	2	6	195150	195155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601491
3547	NC_007796	TTC	2	6	195189	195194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601491
3548	NC_007796	TCA	2	6	195212	195217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601491
3549	NC_007796	CTG	2	6	195261	195266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601491
3550	NC_007796	TAA	2	6	195354	195359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601491
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3552	NC_007796	GTG	2	6	195427	195432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601491
3553	NC_007796	GGAA	2	8	195508	195515	50 %	0 %	50 %	0 %	88601491
3554	NC_007796	GAA	2	6	195527	195532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601491
3555	NC_007796	TTC	2	6	195563	195568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601491
3556	NC_007796	CCT	2	6	195599	195604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601491
3557	NC_007796	TC	4	8	195706	195713	0 %	50 %	0 %	50 %	88601491
3558	NC_007796	TCA	2	6	195730	195735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601491
3559	NC_007796	TGT	2	6	195754	195759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601491
3560	NC_007796	GATAC	2	10	195824	195833	40 %	20 %	20 %	20 %	88601491
3561	NC_007796	TGT	2	6	195909	195914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601491
3562	NC_007796	TG	3	6	196013	196018	0 %	50 %	50 %	0 %	88601491
3563	NC_007796	TGA	2	6	196061	196066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601491
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3565	NC_007796	ATA	2	6	196245	196250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601492
3566	NC_007796	CAT	2	6	196359	196364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601492
3567	NC_007796	CAT	2	6	196369	196374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601492
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3569	NC_007796	TGC	3	9	196417	196425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601492
3570	NC_007796	ATC	2	6	196438	196443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601492
3571	NC_007796	AGAT	2	8	196445	196452	50 %	25 %	25 %	0 %	88601492
3572	NC_007796	TTG	3	9	196458	196466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601492
3573	NC_007796	GAG	2	6	196477	196482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601492
3574	NC_007796	AAT	2	6	196501	196506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601492
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3579	NC_007796	AG	3	6	196720	196725	50 %	0 %	50 %	0 %	88601492
3580	NC_007796	AATGT	2	10	196762	196771	40 %	40 %	20 %	0 %	88601492
3581	NC_007796	TGC	2	6	196834	196839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601492
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3587	NC_007796	CTGA	2	8	197008	197015	25 %	25 %	25 %	25 %	88601493
3588	NC_007796	TGC	3	9	197070	197078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601493
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3590	NC_007796	TGATA	2	10	197175	197184	40 %	40 %	20 %	0 %	88601493
3591	NC_007796	ATG	2	6	197248	197253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601493
3592	NC_007796	CAT	2	6	197318	197323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601493
3593	NC_007796	GCA	2	6	197362	197367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601493
3594	NC_007796	GGTT	2	8	197382	197389	0 %	50 %	50 %	0 %	88601493
3595	NC_007796	TCT	2	6	197445	197450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601493
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3599	NC_007796	AAG	2	6	197703	197708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601493
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3603	NC_007796	AT	3	6	198143	198148	50 %	50 %	0 %	0 %	88601494
3604	NC_007796	T	8	8	198166	198173	0 %	100 %	0 %	0 %	88601494
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3607	NC_007796	CAT	2	6	198196	198201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601494
3608	NC_007796	TCT	2	6	198222	198227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601494
3609	NC_007796	ATCAT	2	10	198234	198243	40 %	40 %	0 %	20 %	88601494
3610	NC_007796	TCT	2	6	198247	198252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601494
3611	NC_007796	ATG	2	6	198263	198268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601494
3612	NC_007796	AT	3	6	198279	198284	50 %	50 %	0 %	0 %	88601494
3613	NC_007796	GAA	2	6	198367	198372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601494
3614	NC_007796	G	7	7	198449	198455	0 %	0 %	100 %	0 %	88601494
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3617	NC_007796	TGAA	2	8	198639	198646	50 %	25 %	25 %	0 %	88601494
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3622	NC_007796	TCA	2	6	198885	198890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601494
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3998	NC_007796	TTA	2	6	220342	220347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601509
3999	NC_007796	A	8	8	220413	220420	100 %	0 %	0 %	0 %	88601510
4000	NC_007796	TCC	2	6	220445	220450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601510

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