MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Moorella thermoacetica ATCC 39073 chromosome

Total Repeats: 48171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007644	TGA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588875
2	NC_007644	CCCG	2	8	140	147	0 %	0 %	25 %	75 %	83588875
3	NC_007644	A	6	6	169	174	100 %	0 %	0 %	0 %	83588875
4	NC_007644	GCC	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588875
5	NC_007644	CTGGC	2	10	471	480	0 %	20 %	40 %	40 %	83588876
6	NC_007644	CCCTG	2	10	518	527	0 %	20 %	20 %	60 %	83588876
7	NC_007644	CCGG	2	8	548	555	0 %	0 %	50 %	50 %	83588876
8	NC_007644	TAT	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588876
9	NC_007644	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	83588876
10	NC_007644	GGA	2	6	740	745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588876
11	NC_007644	C	8	8	755	762	0 %	0 %	0 %	100 %	83588876
12	NC_007644	TGT	2	6	791	796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588876
13	NC_007644	GCCT	2	8	825	832	0 %	25 %	25 %	50 %	83588876
14	NC_007644	GCCA	2	8	848	855	25 %	0 %	25 %	50 %	83588876
15	NC_007644	ACGA	2	8	987	994	50 %	0 %	25 %	25 %	83588876
16	NC_007644	TGA	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588876
17	NC_007644	A	7	7	1091	1097	100 %	0 %	0 %	0 %	83588876
18	NC_007644	TTC	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83588876
19	NC_007644	ATC	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83588876
20	NC_007644	GCC	2	6	1178	1183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588876
21	NC_007644	A	6	6	1290	1295	100 %	0 %	0 %	0 %	83588876
22	NC_007644	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	83588876
23	NC_007644	TGC	2	6	1397	1402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588876
24	NC_007644	A	6	6	1419	1424	100 %	0 %	0 %	0 %	83588876
25	NC_007644	AGA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588876
26	NC_007644	AGA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588876
27	NC_007644	AAG	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588876
28	NC_007644	TCC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83588876
29	NC_007644	GGC	2	6	1659	1664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83588876
30	NC_007644	TAC	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83588876
31	NC_007644	CGA	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588876
32	NC_007644	CCTTC	2	10	1725	1734	0 %	40 %	0 %	60 %	83588876
33	NC_007644	ATT	2	6	2050	2055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588877
34	NC_007644	GAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588877
35	NC_007644	GCC	2	6	2136	2141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588877
36	NC_007644	CTTT	2	8	2149	2156	0 %	75 %	0 %	25 %	83588877
37	NC_007644	CAG	2	6	2194	2199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588877
38	NC_007644	GCCA	2	8	2227	2234	25 %	0 %	25 %	50 %	83588877
39	NC_007644	GCC	2	6	2247	2252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588877
40	NC_007644	GCC	2	6	2323	2328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588877
41	NC_007644	GAC	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588877
42	NC_007644	GCA	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588877
43	NC_007644	TGG	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588877
44	NC_007644	AGA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588877
45	NC_007644	ATGA	2	8	2500	2507	50 %	25 %	25 %	0 %	83588877
46	NC_007644	ATT	2	6	2607	2612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588877
47	NC_007644	ATT	3	9	2752	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588877
48	NC_007644	CTG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588877
49	NC_007644	GTT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588877
50	NC_007644	GGCC	3	12	2963	2974	0 %	0 %	50 %	50 %	83588877
51	NC_007644	ACT	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83588877
52	NC_007644	TAA	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83588877
53	NC_007644	TGC	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588878
54	NC_007644	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83588878
55	NC_007644	TAA	2	6	3139	3144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83588878
56	NC_007644	GGC	2	6	3181	3186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83588878
57	NC_007644	ACA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83588878
58	NC_007644	ATT	2	6	3316	3321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588879
59	NC_007644	TGC	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588879
60	NC_007644	GCA	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588879
61	NC_007644	TTG	2	6	3415	3420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588879
62	NC_007644	A	6	6	3473	3478	100 %	0 %	0 %	0 %	83588879
63	NC_007644	CAG	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588879
64	NC_007644	GCAACC	2	12	3530	3541	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	83588879
65	NC_007644	TGA	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588879
66	NC_007644	CCT	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83588879
67	NC_007644	CGGCC	2	10	3612	3621	0 %	0 %	40 %	60 %	83588879
68	NC_007644	TTG	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588879
69	NC_007644	GGCC	2	8	3738	3745	0 %	0 %	50 %	50 %	83588879
70	NC_007644	AGG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588879
71	NC_007644	TTA	2	6	3784	3789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588879
72	NC_007644	T	6	6	3825	3830	0 %	100 %	0 %	0 %	83588879
73	NC_007644	CTAC	2	8	3857	3864	25 %	25 %	0 %	50 %	83588879
74	NC_007644	G	7	7	3877	3883	0 %	0 %	100 %	0 %	83588879
75	NC_007644	GCCA	2	8	3916	3923	25 %	0 %	25 %	50 %	83588879
76	NC_007644	CTTTAC	2	12	4008	4019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	83588879
77	NC_007644	T	6	6	4154	4159	0 %	100 %	0 %	0 %	83588879
78	NC_007644	TGA	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588879
79	NC_007644	T	6	6	4221	4226	0 %	100 %	0 %	0 %	83588879
80	NC_007644	TTA	2	6	4246	4251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588879
81	NC_007644	CCAG	2	8	4252	4259	25 %	0 %	25 %	50 %	83588879
82	NC_007644	GGGAA	2	10	4296	4305	40 %	0 %	60 %	0 %	83588879
83	NC_007644	AGTA	2	8	4337	4344	50 %	25 %	25 %	0 %	83588879
84	NC_007644	CCA	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588880
85	NC_007644	TCC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83588880
86	NC_007644	TGA	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588880
87	NC_007644	ATG	2	6	4850	4855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588881
88	NC_007644	ACA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83588881
89	NC_007644	CGA	2	6	4977	4982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588881
90	NC_007644	CGG	2	6	5099	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83588881
91	NC_007644	TCC	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83588881
92	NC_007644	ATC	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83588881
93	NC_007644	GCC	2	6	5393	5398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588881
94	NC_007644	TCCT	2	8	5413	5420	0 %	50 %	0 %	50 %	83588881
95	NC_007644	CGA	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588881
96	NC_007644	ACC	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588881
97	NC_007644	GGT	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588881
98	NC_007644	TAAA	2	8	5516	5523	75 %	25 %	0 %	0 %	83588881
99	NC_007644	CAA	2	6	5541	5546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83588881
100	NC_007644	CGC	2	6	5722	5727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588881
101	NC_007644	AGACCA	2	12	5834	5845	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	83588881
102	NC_007644	GGA	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588881
103	NC_007644	CCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588881
104	NC_007644	GGA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588881
105	NC_007644	TTG	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588881
106	NC_007644	AGC	2	6	5979	5984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588881
107	NC_007644	CCG	2	6	6110	6115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588881
108	NC_007644	CAA	2	6	6216	6221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83588881
109	NC_007644	CAT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83588881
110	NC_007644	GCCGAT	2	12	6316	6327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83588881
111	NC_007644	T	7	7	6364	6370	0 %	100 %	0 %	0 %	83588881
112	NC_007644	GCC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588881
113	NC_007644	AAC	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83588881
114	NC_007644	ACC	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588881
115	NC_007644	CCT	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83588881
116	NC_007644	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588881
117	NC_007644	GAAG	2	8	6845	6852	50 %	0 %	50 %	0 %	83588882
118	NC_007644	GAA	3	9	6906	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588882
119	NC_007644	AGGA	2	8	7027	7034	50 %	0 %	50 %	0 %	83588882
120	NC_007644	TGT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588882
121	NC_007644	ACC	2	6	7096	7101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588882
122	NC_007644	CGC	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588882
123	NC_007644	TGCC	2	8	7154	7161	0 %	25 %	25 %	50 %	83588882
124	NC_007644	ACG	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588882
125	NC_007644	GGT	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588882
126	NC_007644	CGGC	2	8	7378	7385	0 %	0 %	50 %	50 %	83588882
127	NC_007644	CCA	2	6	7402	7407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588882
128	NC_007644	ATT	2	6	7497	7502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588882
129	NC_007644	GTC	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588882
130	NC_007644	GACCG	2	10	7752	7761	20 %	0 %	40 %	40 %	83588882
131	NC_007644	TGG	2	6	7873	7878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588882
132	NC_007644	CGGC	2	8	7880	7887	0 %	0 %	50 %	50 %	83588882
133	NC_007644	AGG	2	6	7939	7944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588882
134	NC_007644	CTG	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588882
135	NC_007644	TTG	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83588882
136	NC_007644	TCG	2	6	8134	8139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588882
137	NC_007644	AGA	3	9	8183	8191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588882
138	NC_007644	AAG	2	6	8227	8232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83588882
139	NC_007644	GGA	2	6	8330	8335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588882
140	NC_007644	GTG	2	6	8379	8384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588882
141	NC_007644	TACC	2	8	8426	8433	25 %	25 %	0 %	50 %	83588882
142	NC_007644	GGC	2	6	8448	8453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83588882
143	NC_007644	ACC	2	6	8514	8519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588882
144	NC_007644	CTT	2	6	8529	8534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83588882
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146	NC_007644	GTC	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588882
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150	NC_007644	CTG	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588882
151	NC_007644	GAT	3	9	8796	8804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588882
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154	NC_007644	GAT	2	6	8946	8951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588882
155	NC_007644	TGG	2	6	8992	8997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588882
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159	NC_007644	GGA	2	6	9134	9139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588882
160	NC_007644	TGGCCA	2	12	9262	9273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83588882
161	NC_007644	AAT	2	6	9280	9285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83588882
162	NC_007644	GCA	3	9	9453	9461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588883
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164	NC_007644	ACC	2	6	9531	9536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83588883
165	NC_007644	GAG	2	6	9558	9563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83588883
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167	NC_007644	GCC	2	6	9615	9620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83588883
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172	NC_007644	GGT	2	6	10073	10078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83588883
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253	NC_007644	GCA	3	9	14259	14267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83588887
254	NC_007644	TTA	2	6	14284	14289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83588887
255	NC_007644	TGC	2	6	14309	14314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83588887
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257	NC_007644	TA	3	6	14461	14466	50 %	50 %	0 %	0 %	83588887
258	NC_007644	CAA	2	6	14525	14530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83588887
259	NC_007644	AAATA	2	10	14533	14542	80 %	20 %	0 %	0 %	83588887
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261	NC_007644	CTGG	2	8	14643	14650	0 %	25 %	50 %	25 %	83588888
262	NC_007644	TTC	2	6	14692	14697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83588888
263	NC_007644	GGTAT	2	10	14740	14749	20 %	40 %	40 %	0 %	83588888
264	NC_007644	A	6	6	14781	14786	100 %	0 %	0 %	0 %	83588888
265	NC_007644	AGT	2	6	14792	14797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83588888
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