MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 20646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	CAAA	2	8	210	217	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
2	NC_007295	AAT	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
3	NC_007295	ACA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
4	NC_007295	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893360
5	NC_007295	TGT	2	6	286	291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893360
6	NC_007295	AAC	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
7	NC_007295	T	6	6	300	305	0 %	100 %	0 %	0 %	71893360
8	NC_007295	ATT	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893360
9	NC_007295	AAT	2	6	462	467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
10	NC_007295	AAAG	2	8	483	490	75 %	0 %	25 %	0 %	71893360
11	NC_007295	A	6	6	506	511	100 %	0 %	0 %	0 %	71893360
12	NC_007295	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893360
13	NC_007295	AGA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
14	NC_007295	TTC	2	6	770	775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893360
15	NC_007295	A	6	6	799	804	100 %	0 %	0 %	0 %	71893360
16	NC_007295	CTTTT	2	10	841	850	0 %	80 %	0 %	20 %	71893360
17	NC_007295	TGA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893360
18	NC_007295	AACA	2	8	873	880	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
19	NC_007295	TTG	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893360
20	NC_007295	ATA	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
21	NC_007295	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893360
22	NC_007295	TGG	2	6	974	979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893360
23	NC_007295	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
24	NC_007295	ATTAA	2	10	1023	1032	60 %	40 %	0 %	0 %	71893360
25	NC_007295	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	71893360
26	NC_007295	GAA	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
27	NC_007295	ATG	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893360
28	NC_007295	ATTCG	2	10	1150	1159	20 %	40 %	20 %	20 %	71893360
29	NC_007295	T	6	6	1189	1194	0 %	100 %	0 %	0 %	71893360
30	NC_007295	CAAA	2	8	1200	1207	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
31	NC_007295	AAAT	2	8	1211	1218	75 %	25 %	0 %	0 %	71893360
32	NC_007295	ATTT	2	8	1230	1237	25 %	75 %	0 %	0 %	71893360
33	NC_007295	A	7	7	1245	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	71893360
34	NC_007295	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893360
35	NC_007295	AACA	2	8	1285	1292	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
36	NC_007295	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	71893360
37	NC_007295	ATTA	2	8	1409	1416	50 %	50 %	0 %	0 %	71893360
38	NC_007295	ATA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
39	NC_007295	T	7	7	1454	1460	0 %	100 %	0 %	0 %	71893360
40	NC_007295	AAC	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
41	NC_007295	AGA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
42	NC_007295	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
43	NC_007295	A	7	7	1497	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	71893360
44	NC_007295	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
45	NC_007295	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893360
46	NC_007295	A	9	9	1759	1767	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
47	NC_007295	ATA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893361
48	NC_007295	T	8	8	1836	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	71893361
49	NC_007295	AAG	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893361
50	NC_007295	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893361
51	NC_007295	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
52	NC_007295	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893361
53	NC_007295	A	6	6	1914	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
54	NC_007295	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893361
55	NC_007295	T	7	7	1966	1972	0 %	100 %	0 %	0 %	71893361
56	NC_007295	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893361
57	NC_007295	T	6	6	2038	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	71893361
58	NC_007295	T	6	6	2056	2061	0 %	100 %	0 %	0 %	71893361
59	NC_007295	TTC	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893361
60	NC_007295	T	7	7	2084	2090	0 %	100 %	0 %	0 %	71893361
61	NC_007295	AATTA	2	10	2117	2126	60 %	40 %	0 %	0 %	71893361
62	NC_007295	A	6	6	2159	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
63	NC_007295	CAA	3	9	2176	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
64	NC_007295	A	6	6	2281	2286	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
65	NC_007295	AATA	2	8	2309	2316	75 %	25 %	0 %	0 %	71893361
66	NC_007295	CAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
67	NC_007295	TGAT	2	8	2536	2543	25 %	50 %	25 %	0 %	71893361
68	NC_007295	ACA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
69	NC_007295	TTA	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893361
70	NC_007295	A	6	6	2597	2602	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
71	NC_007295	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
72	NC_007295	TTCGA	2	10	2704	2713	20 %	40 %	20 %	20 %	71893361
73	NC_007295	A	6	6	2803	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	71893361
74	NC_007295	TTG	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893362
75	NC_007295	GGC	2	6	3037	3042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71893362
76	NC_007295	ATT	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893362
77	NC_007295	A	9	9	3075	3083	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
78	NC_007295	GTT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893362
79	NC_007295	TAA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893362
80	NC_007295	A	6	6	3115	3120	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
81	NC_007295	TGG	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893362
82	NC_007295	GGA	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71893362
83	NC_007295	A	6	6	3334	3339	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
84	NC_007295	ATTA	2	8	3351	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	71893362
85	NC_007295	A	7	7	3389	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
86	NC_007295	A	6	6	3421	3426	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
87	NC_007295	T	7	7	3433	3439	0 %	100 %	0 %	0 %	71893362
88	NC_007295	ATT	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893362
89	NC_007295	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893362
90	NC_007295	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893362
91	NC_007295	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893362
92	NC_007295	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893362
93	NC_007295	CTT	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893362
94	NC_007295	TATAA	2	10	3664	3673	60 %	40 %	0 %	0 %	71893362
95	NC_007295	TTTC	2	8	3677	3684	0 %	75 %	0 %	25 %	71893362
96	NC_007295	A	7	7	3702	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
97	NC_007295	ACA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893362
98	NC_007295	CCA	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893362
99	NC_007295	A	7	7	3897	3903	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
100	NC_007295	ATG	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
101	NC_007295	TTGAA	2	10	4046	4055	40 %	40 %	20 %	0 %	71893362
102	NC_007295	A	7	7	4054	4060	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
103	NC_007295	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
104	NC_007295	GAA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893362
105	NC_007295	A	6	6	4186	4191	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
106	NC_007295	ATG	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
107	NC_007295	TGA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
108	NC_007295	A	6	6	4372	4377	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
109	NC_007295	CAAAG	2	10	4392	4401	60 %	0 %	20 %	20 %	71893362
110	NC_007295	A	7	7	4470	4476	100 %	0 %	0 %	0 %	71893362
111	NC_007295	AATT	2	8	4508	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	71893362
112	NC_007295	GAT	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
113	NC_007295	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893362
114	NC_007295	GTG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893362
115	NC_007295	CTG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893362
116	NC_007295	AAT	2	6	4853	4858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893363
117	NC_007295	A	6	6	4899	4904	100 %	0 %	0 %	0 %	71893363
118	NC_007295	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893363
119	NC_007295	A	7	7	4986	4992	100 %	0 %	0 %	0 %	71893363
120	NC_007295	A	6	6	5017	5022	100 %	0 %	0 %	0 %	71893363
121	NC_007295	TGA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893363
122	NC_007295	AATT	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	71893363
123	NC_007295	T	6	6	5183	5188	0 %	100 %	0 %	0 %	71893363
124	NC_007295	ACC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893363
125	NC_007295	A	7	7	5299	5305	100 %	0 %	0 %	0 %	71893363
126	NC_007295	GAAAA	2	10	5316	5325	80 %	0 %	20 %	0 %	71893364
127	NC_007295	A	6	6	5322	5327	100 %	0 %	0 %	0 %	71893364
128	NC_007295	A	6	6	5333	5338	100 %	0 %	0 %	0 %	71893364
129	NC_007295	ATA	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893364
130	NC_007295	TCA	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893364
131	NC_007295	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893364
132	NC_007295	T	8	8	5465	5472	0 %	100 %	0 %	0 %	71893364
133	NC_007295	T	6	6	5499	5504	0 %	100 %	0 %	0 %	71893364
134	NC_007295	T	6	6	5545	5550	0 %	100 %	0 %	0 %	71893364
135	NC_007295	CTG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893364
136	NC_007295	A	6	6	5599	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	71893364
137	NC_007295	T	7	7	5610	5616	0 %	100 %	0 %	0 %	71893364
138	NC_007295	GCT	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893364
139	NC_007295	GAT	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893364
140	NC_007295	CTA	2	6	5737	5742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893364
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142	NC_007295	TA	3	6	5784	5789	50 %	50 %	0 %	0 %	71893364
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