MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 21323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	CAAA	2	8	4	11	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
2	NC_006360	AAT	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
3	NC_006360	CAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
4	NC_006360	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019970
5	NC_006360	TGT	2	6	80	85	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019970
6	NC_006360	AAC	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
7	NC_006360	T	6	6	94	99	0 %	100 %	0 %	0 %	54019970
8	NC_006360	ATT	2	6	136	141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019970
9	NC_006360	AAT	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
10	NC_006360	AAAG	2	8	277	284	75 %	0 %	25 %	0 %	54019970
11	NC_006360	A	6	6	300	305	100 %	0 %	0 %	0 %	54019970
12	NC_006360	TTA	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019970
13	NC_006360	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
14	NC_006360	TTC	2	6	564	569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019970
15	NC_006360	A	6	6	593	598	100 %	0 %	0 %	0 %	54019970
16	NC_006360	CTTTT	2	10	635	644	0 %	80 %	0 %	20 %	54019970
17	NC_006360	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019970
18	NC_006360	AACA	2	8	667	674	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
19	NC_006360	TTG	2	6	686	691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019970
20	NC_006360	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
21	NC_006360	CTT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019970
22	NC_006360	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019970
23	NC_006360	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
24	NC_006360	ATTAA	2	10	817	826	60 %	40 %	0 %	0 %	54019970
25	NC_006360	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	54019970
26	NC_006360	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
27	NC_006360	ATG	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019970
28	NC_006360	ATTCG	2	10	944	953	20 %	40 %	20 %	20 %	54019970
29	NC_006360	T	6	6	983	988	0 %	100 %	0 %	0 %	54019970
30	NC_006360	CAAA	2	8	994	1001	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
31	NC_006360	AAAT	2	8	1005	1012	75 %	25 %	0 %	0 %	54019970
32	NC_006360	ATTT	2	8	1024	1031	25 %	75 %	0 %	0 %	54019970
33	NC_006360	A	7	7	1039	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	54019970
34	NC_006360	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019970
35	NC_006360	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
36	NC_006360	A	6	6	1157	1162	100 %	0 %	0 %	0 %	54019970
37	NC_006360	ATTA	2	8	1203	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	54019970
38	NC_006360	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
39	NC_006360	T	7	7	1248	1254	0 %	100 %	0 %	0 %	54019970
40	NC_006360	AAC	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
41	NC_006360	AGA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
42	NC_006360	CAA	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
43	NC_006360	A	7	7	1291	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	54019970
44	NC_006360	CAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
45	NC_006360	AAAATA	2	12	1386	1397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54019970
46	NC_006360	A	9	9	1553	1561	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
47	NC_006360	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019971
48	NC_006360	T	8	8	1630	1637	0 %	100 %	0 %	0 %	54019971
49	NC_006360	AAG	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019971
50	NC_006360	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019971
51	NC_006360	CAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
52	NC_006360	TAA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019971
53	NC_006360	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
54	NC_006360	ATG	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019971
55	NC_006360	T	7	7	1760	1766	0 %	100 %	0 %	0 %	54019971
56	NC_006360	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019971
57	NC_006360	T	6	6	1832	1837	0 %	100 %	0 %	0 %	54019971
58	NC_006360	T	6	6	1850	1855	0 %	100 %	0 %	0 %	54019971
59	NC_006360	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019971
60	NC_006360	T	7	7	1878	1884	0 %	100 %	0 %	0 %	54019971
61	NC_006360	AATTA	2	10	1911	1920	60 %	40 %	0 %	0 %	54019971
62	NC_006360	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
63	NC_006360	CAA	3	9	1970	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
64	NC_006360	A	6	6	2075	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
65	NC_006360	AATA	2	8	2103	2110	75 %	25 %	0 %	0 %	54019971
66	NC_006360	CAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
67	NC_006360	TGAT	2	8	2330	2337	25 %	50 %	25 %	0 %	54019971
68	NC_006360	ACA	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
69	NC_006360	A	6	6	2391	2396	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
70	NC_006360	A	6	6	2451	2456	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
71	NC_006360	TTCGA	2	10	2498	2507	20 %	40 %	20 %	20 %	54019971
72	NC_006360	A	6	6	2597	2602	100 %	0 %	0 %	0 %	54019971
73	NC_006360	A	7	7	2780	2786	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
74	NC_006360	TTG	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019972
75	NC_006360	GGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54019972
76	NC_006360	ATT	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019972
77	NC_006360	A	9	9	2867	2875	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
78	NC_006360	GTT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019972
79	NC_006360	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019972
80	NC_006360	A	6	6	2907	2912	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
81	NC_006360	TGG	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019972
82	NC_006360	GGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54019972
83	NC_006360	A	6	6	3126	3131	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
84	NC_006360	ATTA	2	8	3143	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	54019972
85	NC_006360	A	7	7	3181	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
86	NC_006360	A	6	6	3213	3218	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
87	NC_006360	T	7	7	3225	3231	0 %	100 %	0 %	0 %	54019972
88	NC_006360	ATT	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019972
89	NC_006360	ACA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019972
90	NC_006360	TTC	2	6	3277	3282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019972
91	NC_006360	CAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019972
92	NC_006360	AAT	2	6	3342	3347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019972
93	NC_006360	CTT	2	6	3409	3414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019972
94	NC_006360	TATAA	2	10	3456	3465	60 %	40 %	0 %	0 %	54019972
95	NC_006360	TTTC	2	8	3469	3476	0 %	75 %	0 %	25 %	54019972
96	NC_006360	A	7	7	3494	3500	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
97	NC_006360	ACA	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019972
98	NC_006360	CCA	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54019972
99	NC_006360	A	7	7	3689	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
100	NC_006360	ATG	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
101	NC_006360	TTGAA	2	10	3838	3847	40 %	40 %	20 %	0 %	54019972
102	NC_006360	A	7	7	3846	3852	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
103	NC_006360	A	6	6	3978	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
104	NC_006360	ATG	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
105	NC_006360	TGA	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
106	NC_006360	A	6	6	4164	4169	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
107	NC_006360	CAAAG	2	10	4184	4193	60 %	0 %	20 %	20 %	54019972
108	NC_006360	A	7	7	4262	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	54019972
109	NC_006360	AATT	2	8	4300	4307	50 %	50 %	0 %	0 %	54019972
110	NC_006360	GAT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
111	NC_006360	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019972
112	NC_006360	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019972
113	NC_006360	CTG	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019972
114	NC_006360	AAT	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019973
115	NC_006360	A	6	6	4691	4696	100 %	0 %	0 %	0 %	54019973
116	NC_006360	TAA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019973
117	NC_006360	A	7	7	4778	4784	100 %	0 %	0 %	0 %	54019973
118	NC_006360	A	6	6	4809	4814	100 %	0 %	0 %	0 %	54019973
119	NC_006360	TGA	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019973
120	NC_006360	AATT	2	8	4944	4951	50 %	50 %	0 %	0 %	54019973
121	NC_006360	T	6	6	4975	4980	0 %	100 %	0 %	0 %	54019973
122	NC_006360	ACC	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54019973
123	NC_006360	A	7	7	5091	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	54019973
124	NC_006360	GAAAA	2	10	5108	5117	80 %	0 %	20 %	0 %	54019974
125	NC_006360	A	6	6	5114	5119	100 %	0 %	0 %	0 %	54019974
126	NC_006360	A	6	6	5125	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	54019974
127	NC_006360	ATA	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019974
128	NC_006360	TCA	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019974
129	NC_006360	CAA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019974
130	NC_006360	T	8	8	5257	5264	0 %	100 %	0 %	0 %	54019974
131	NC_006360	T	6	6	5291	5296	0 %	100 %	0 %	0 %	54019974
132	NC_006360	T	6	6	5337	5342	0 %	100 %	0 %	0 %	54019974
133	NC_006360	CTG	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019974
134	NC_006360	A	6	6	5391	5396	100 %	0 %	0 %	0 %	54019974
135	NC_006360	T	7	7	5402	5408	0 %	100 %	0 %	0 %	54019974
136	NC_006360	GCT	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019974
137	NC_006360	GAT	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019974
138	NC_006360	CTA	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019974
139	NC_006360	GAA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019974
140	NC_006360	TA	3	6	5576	5581	50 %	50 %	0 %	0 %	54019974
141	NC_006360	T	6	6	5609	5614	0 %	100 %	0 %	0 %	54019974
142	NC_006360	CAA	2	6	5623	5628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019974
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274	NC_006360	A	7	7	11108	11114	100 %	0 %	0 %	0 %	54019979
275	NC_006360	CTTAA	2	10	11175	11184	40 %	40 %	0 %	20 %	54019979
276	NC_006360	A	6	6	11202	11207	100 %	0 %	0 %	0 %	54019979
277	NC_006360	AGGA	2	8	11248	11255	50 %	0 %	50 %	0 %	54019979
278	NC_006360	GAAAAT	2	12	11340	11351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54019979
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