MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 41657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_006300	CTT	2	6	548228	548233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424641
10002	NC_006300	CCTTTC	2	12	548255	548266	0 %	50 %	0 %	50 %	52424641
10003	NC_006300	CGG	2	6	548272	548277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10004	NC_006300	CGG	2	6	548288	548293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10005	NC_006300	GCCA	2	8	548316	548323	25 %	0 %	25 %	50 %	52424641
10006	NC_006300	TGG	2	6	548338	548343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424641
10007	NC_006300	TCG	2	6	548449	548454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424641
10008	NC_006300	ATG	2	6	548461	548466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424641
10009	NC_006300	ATT	2	6	548493	548498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424641
10010	NC_006300	CGG	2	6	548525	548530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10011	NC_006300	CGG	2	6	548551	548556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10012	NC_006300	CAA	2	6	548684	548689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424641
10013	NC_006300	CGGT	2	8	548716	548723	0 %	25 %	50 %	25 %	52424641
10014	NC_006300	ATA	2	6	548821	548826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424641
10015	NC_006300	ATT	2	6	548963	548968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424641
10016	NC_006300	CGG	2	6	549032	549037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10017	NC_006300	GT	3	6	549064	549069	0 %	50 %	50 %	0 %	52424641
10018	NC_006300	TCA	2	6	549179	549184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424641
10019	NC_006300	T	6	6	549219	549224	0 %	100 %	0 %	0 %	52424641
10020	NC_006300	TGT	2	6	549227	549232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424641
10021	NC_006300	GAT	2	6	549236	549241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424641
10022	NC_006300	TTGA	2	8	549261	549268	25 %	50 %	25 %	0 %	52424641
10023	NC_006300	CAA	2	6	549304	549309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424641
10024	NC_006300	CGG	2	6	549317	549322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10025	NC_006300	TTA	2	6	549505	549510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424641
10026	NC_006300	CCG	2	6	549514	549519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424641
10027	NC_006300	GGC	2	6	549555	549560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424641
10028	NC_006300	GAA	2	6	549588	549593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424641
10029	NC_006300	A	6	6	549648	549653	100 %	0 %	0 %	0 %	52424641
10030	NC_006300	A	7	7	549903	549909	100 %	0 %	0 %	0 %	52424642
10031	NC_006300	TTATTG	2	12	549951	549962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	52424642
10032	NC_006300	GAA	2	6	550038	550043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424642
10033	NC_006300	TAA	2	6	550178	550183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424642
10034	NC_006300	GAA	2	6	550206	550211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424642
10035	NC_006300	ATGAA	2	10	550243	550252	60 %	20 %	20 %	0 %	52424642
10036	NC_006300	A	6	6	550330	550335	100 %	0 %	0 %	0 %	52424642
10037	NC_006300	ATTG	2	8	550371	550378	25 %	50 %	25 %	0 %	52424642
10038	NC_006300	CGG	2	6	550517	550522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424642
10039	NC_006300	AGA	3	9	550565	550573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424642
10040	NC_006300	CAA	2	6	550605	550610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424642
10041	NC_006300	ATG	2	6	550714	550719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424642
10042	NC_006300	A	6	6	550740	550745	100 %	0 %	0 %	0 %	52424642
10043	NC_006300	GCG	2	6	550851	550856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424642
10044	NC_006300	CCAA	2	8	550879	550886	50 %	0 %	0 %	50 %	52424642
10045	NC_006300	TCAAT	2	10	550900	550909	40 %	40 %	0 %	20 %	52424642
10046	NC_006300	AATA	2	8	551012	551019	75 %	25 %	0 %	0 %	52424643
10047	NC_006300	A	6	6	551022	551027	100 %	0 %	0 %	0 %	52424643
10048	NC_006300	GTC	2	6	551038	551043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424643
10049	NC_006300	CGG	2	6	551105	551110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424643
10050	NC_006300	GCG	2	6	551142	551147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424643
10051	NC_006300	AAAC	2	8	551149	551156	75 %	0 %	0 %	25 %	52424643
10052	NC_006300	AGT	2	6	551165	551170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424643
10053	NC_006300	GTG	2	6	551199	551204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424643
10054	NC_006300	AGT	2	6	551219	551224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424643
10055	NC_006300	TTG	2	6	551413	551418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424643
10056	NC_006300	GCC	2	6	551508	551513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424643
10057	NC_006300	CGG	2	6	551546	551551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424643
10058	NC_006300	ATT	2	6	551572	551577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424643
10059	NC_006300	AAC	2	6	551635	551640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424643
10060	NC_006300	CGA	2	6	551707	551712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424643
10061	NC_006300	A	6	6	551760	551765	100 %	0 %	0 %	0 %	52424643
10062	NC_006300	TAT	2	6	551786	551791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424643
10063	NC_006300	TAC	2	6	551942	551947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424643
10064	NC_006300	GAA	2	6	551964	551969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424643
10065	NC_006300	A	6	6	552019	552024	100 %	0 %	0 %	0 %	52424643
10066	NC_006300	GAT	2	6	552143	552148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424643
10067	NC_006300	GCG	2	6	552190	552195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424643
10068	NC_006300	CGG	2	6	552224	552229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424643
10069	NC_006300	GAC	2	6	552309	552314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424643
10070	NC_006300	TTA	2	6	552357	552362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424643
10071	NC_006300	ATTAA	2	10	552414	552423	60 %	40 %	0 %	0 %	52424643
10072	NC_006300	GGGC	2	8	552430	552437	0 %	0 %	75 %	25 %	52424643
10073	NC_006300	TCA	3	9	552452	552460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424643
10074	NC_006300	TAT	2	6	552503	552508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424643
10075	NC_006300	TTC	2	6	552556	552561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424643
10076	NC_006300	ATT	2	6	552607	552612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424643
10077	NC_006300	ATG	2	6	552615	552620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424643
10078	NC_006300	GTG	2	6	552642	552647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424643
10079	NC_006300	GAA	2	6	552714	552719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424643
10080	NC_006300	GCC	2	6	552783	552788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424643
10081	NC_006300	GAT	2	6	552819	552824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424643
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10083	NC_006300	A	6	6	552873	552878	100 %	0 %	0 %	0 %	52424643
10084	NC_006300	ACG	2	6	552982	552987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424643
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10086	NC_006300	GAA	2	6	553020	553025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424643
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10088	NC_006300	TTA	2	6	553079	553084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424643
10089	NC_006300	GAT	2	6	553167	553172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424643
10090	NC_006300	GCG	3	9	553173	553181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424643
10091	NC_006300	CG	3	6	553180	553185	0 %	0 %	50 %	50 %	52424643
10092	NC_006300	TAA	2	6	553217	553222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424643
10093	NC_006300	CGGTG	2	10	553241	553250	0 %	20 %	60 %	20 %	52424643
10094	NC_006300	TGAC	2	8	553252	553259	25 %	25 %	25 %	25 %	52424643
10095	NC_006300	ATT	2	6	553587	553592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424644
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10097	NC_006300	T	6	6	553639	553644	0 %	100 %	0 %	0 %	52424644
10098	NC_006300	T	6	6	553661	553666	0 %	100 %	0 %	0 %	52424644
10099	NC_006300	A	7	7	553727	553733	100 %	0 %	0 %	0 %	52424645
10100	NC_006300	TATC	2	8	553758	553765	25 %	50 %	0 %	25 %	52424645
10101	NC_006300	TGA	2	6	553819	553824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424645
10102	NC_006300	GTG	2	6	553832	553837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424645
10103	NC_006300	ATG	2	6	553901	553906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424645
10104	NC_006300	AAC	2	6	553922	553927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424645
10105	NC_006300	T	6	6	553969	553974	0 %	100 %	0 %	0 %	52424645
10106	NC_006300	A	6	6	553983	553988	100 %	0 %	0 %	0 %	52424645
10107	NC_006300	GCA	2	6	553993	553998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424645
10108	NC_006300	TG	3	6	554057	554062	0 %	50 %	50 %	0 %	52424645
10109	NC_006300	CGC	2	6	554087	554092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424645
10110	NC_006300	CGG	3	9	554218	554226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424645
10111	NC_006300	TTC	2	6	554269	554274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424645
10112	NC_006300	GGT	2	6	554288	554293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424645
10113	NC_006300	TGA	2	6	554302	554307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424645
10114	NC_006300	TAT	2	6	554344	554349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424645
10115	NC_006300	CAG	2	6	554361	554366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424645
10116	NC_006300	CGTTT	2	10	554469	554478	0 %	60 %	20 %	20 %	52424645
10117	NC_006300	ATG	2	6	554487	554492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424645
10118	NC_006300	GAA	2	6	554552	554557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424645
10119	NC_006300	GCG	2	6	554573	554578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424645
10120	NC_006300	CGG	3	9	554608	554616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424645
10121	NC_006300	ATT	2	6	554620	554625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424645
10122	NC_006300	GGC	2	6	554711	554716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424645
10123	NC_006300	GGC	2	6	554744	554749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424645
10124	NC_006300	TTAA	2	8	554773	554780	50 %	50 %	0 %	0 %	52424646
10125	NC_006300	A	8	8	554801	554808	100 %	0 %	0 %	0 %	52424646
10126	NC_006300	TGT	2	6	554922	554927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424647
10127	NC_006300	GGC	2	6	555002	555007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424647
10128	NC_006300	ACA	2	6	555106	555111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424647
10129	NC_006300	TCT	2	6	555133	555138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424647
10130	NC_006300	TTG	2	6	555140	555145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424647
10131	NC_006300	CCT	2	6	555178	555183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	52424647
10132	NC_006300	A	7	7	555215	555221	100 %	0 %	0 %	0 %	52424647
10133	NC_006300	CAA	2	6	555260	555265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424647
10134	NC_006300	TTA	2	6	555270	555275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424647
10135	NC_006300	TGA	2	6	555319	555324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424647
10136	NC_006300	ATT	2	6	555344	555349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424647
10137	NC_006300	GCC	2	6	555362	555367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424647
10138	NC_006300	CTG	2	6	555380	555385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424647
10139	NC_006300	CATTC	2	10	555398	555407	20 %	40 %	0 %	40 %	52424647
10140	NC_006300	TGC	2	6	555417	555422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424647
10141	NC_006300	ATG	2	6	555426	555431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424647
10142	NC_006300	GGT	2	6	555571	555576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424647
10143	NC_006300	ATT	2	6	555603	555608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424647
10144	NC_006300	CTT	2	6	555636	555641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424647
10145	NC_006300	GTTAC	2	10	555649	555658	20 %	40 %	20 %	20 %	52424647
10146	NC_006300	CGA	2	6	555682	555687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424647
10147	NC_006300	AAC	2	6	555738	555743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424647
10148	NC_006300	GAT	2	6	555791	555796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424647
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10151	NC_006300	AG	3	6	555911	555916	50 %	0 %	50 %	0 %	52424647
10152	NC_006300	ATT	2	6	555948	555953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424648
10153	NC_006300	ATT	2	6	555957	555962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424648
10154	NC_006300	CCTG	2	8	556030	556037	0 %	25 %	25 %	50 %	52424648
10155	NC_006300	CGGCA	2	10	556092	556101	20 %	0 %	40 %	40 %	52424648
10156	NC_006300	GTT	2	6	556114	556119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424648
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10158	NC_006300	TTG	2	6	556237	556242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424648
10159	NC_006300	GAAA	2	8	556320	556327	75 %	0 %	25 %	0 %	52424648
10160	NC_006300	ATT	2	6	556350	556355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424648
10161	NC_006300	TAT	2	6	556373	556378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424648
10162	NC_006300	CCG	2	6	556389	556394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424648
10163	NC_006300	CAA	2	6	556475	556480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424649
10164	NC_006300	GC	3	6	556500	556505	0 %	0 %	50 %	50 %	52424649
10165	NC_006300	AC	3	6	556518	556523	50 %	0 %	0 %	50 %	52424649
10166	NC_006300	TTG	2	6	556553	556558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424649
10167	NC_006300	GGTT	2	8	556651	556658	0 %	50 %	50 %	0 %	52424649
10168	NC_006300	TGC	2	6	556674	556679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424649
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10174	NC_006300	GAT	2	6	556849	556854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424649
10175	NC_006300	GTA	2	6	556936	556941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424649
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10195	NC_006300	GACT	2	8	558098	558105	25 %	25 %	25 %	25 %	52424651
10196	NC_006300	GGC	2	6	558131	558136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424651
10197	NC_006300	GTC	2	6	558189	558194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424651
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10204	NC_006300	CCG	2	6	558515	558520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424651
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10211	NC_006300	ACA	2	6	559396	559401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424651
10212	NC_006300	AAT	2	6	559411	559416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424651
10213	NC_006300	CAA	2	6	559534	559539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424652
10214	NC_006300	ATA	2	6	559580	559585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424652
10215	NC_006300	TGA	2	6	559612	559617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424652
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10218	NC_006300	AAT	2	6	559730	559735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424652
10219	NC_006300	ATT	2	6	559749	559754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424652
10220	NC_006300	AGCG	2	8	559759	559766	25 %	0 %	50 %	25 %	52424652
10221	NC_006300	A	6	6	559853	559858	100 %	0 %	0 %	0 %	52424652
10222	NC_006300	TGCTTT	2	12	559859	559870	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52424652
10223	NC_006300	AT	3	6	559886	559891	50 %	50 %	0 %	0 %	52424652
10224	NC_006300	CAT	2	6	560089	560094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424653
10225	NC_006300	GGC	2	6	560095	560100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424653
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10227	NC_006300	ATC	2	6	560234	560239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424653
10228	NC_006300	ATA	2	6	560255	560260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424653
10229	NC_006300	TGG	2	6	560322	560327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424653
10230	NC_006300	GCG	2	6	560477	560482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424653
10231	NC_006300	AAAT	2	8	560576	560583	75 %	25 %	0 %	0 %	52424653
10232	NC_006300	GCC	2	6	560584	560589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424653
10233	NC_006300	ACC	3	9	560603	560611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424653
10234	NC_006300	AAT	2	6	560699	560704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424653
10235	NC_006300	CGG	2	6	560755	560760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424653
10236	NC_006300	GCC	2	6	560779	560784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424653
10237	NC_006300	CCG	2	6	560835	560840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424653
10238	NC_006300	T	6	6	561067	561072	0 %	100 %	0 %	0 %	52424654
10239	NC_006300	T	6	6	561098	561103	0 %	100 %	0 %	0 %	52424654
10240	NC_006300	TA	3	6	561328	561333	50 %	50 %	0 %	0 %	52424654
10241	NC_006300	CCG	2	6	561354	561359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424654
10242	NC_006300	TTA	2	6	561369	561374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424654
10243	NC_006300	TCA	2	6	561468	561473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424654
10244	NC_006300	CTG	2	6	561476	561481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424654
10245	NC_006300	AAGC	2	8	561493	561500	50 %	0 %	25 %	25 %	52424654
10246	NC_006300	T	6	6	561530	561535	0 %	100 %	0 %	0 %	52424654
10247	NC_006300	AAG	2	6	561549	561554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424654
10248	NC_006300	CCG	2	6	561622	561627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424654
10249	NC_006300	TCTT	2	8	561660	561667	0 %	75 %	0 %	25 %	52424654
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10254	NC_006300	GC	4	8	561962	561969	0 %	0 %	50 %	50 %	52424654
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10258	NC_006300	CAGA	2	8	562103	562110	50 %	0 %	25 %	25 %	52424654
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10267	NC_006300	CGG	2	6	562474	562479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424654
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10355	NC_006300	TGA	2	6	567495	567500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424661
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10364	NC_006300	G	7	7	568088	568094	0 %	0 %	100 %	0 %	52424661
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10492	NC_006300	ATAA	2	8	573636	573643	75 %	25 %	0 %	0 %	52424671
10493	NC_006300	GCA	2	6	573676	573681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424671
10494	NC_006300	CCG	2	6	573684	573689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424671
10495	NC_006300	TAC	2	6	573701	573706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424671
10496	NC_006300	T	6	6	573716	573721	0 %	100 %	0 %	0 %	52424671
10497	NC_006300	GTA	2	6	573740	573745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424671
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10499	NC_006300	TGC	2	6	573802	573807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424671
10500	NC_006300	ATTG	2	8	573917	573924	25 %	50 %	25 %	0 %	52424671

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