MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 41657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006300	CCCCG	2	10	30062	30071	0 %	0 %	20 %	80 %	52424086
502	NC_006300	CGG	2	6	30075	30080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424086
503	NC_006300	ACC	2	6	30098	30103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424086
504	NC_006300	AAT	2	6	30104	30109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424086
505	NC_006300	TGT	2	6	30122	30127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424086
506	NC_006300	TCT	2	6	30215	30220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424086
507	NC_006300	CCA	2	6	30251	30256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424086
508	NC_006300	T	6	6	30329	30334	0 %	100 %	0 %	0 %	52424087
509	NC_006300	CGG	2	6	30392	30397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424087
510	NC_006300	ATA	2	6	30443	30448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
511	NC_006300	AAG	2	6	30491	30496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424087
512	NC_006300	T	6	6	30525	30530	0 %	100 %	0 %	0 %	52424087
513	NC_006300	A	6	6	30540	30545	100 %	0 %	0 %	0 %	52424087
514	NC_006300	GCG	2	6	30550	30555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424087
515	NC_006300	TAA	2	6	30660	30665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
516	NC_006300	ATA	2	6	30706	30711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
517	NC_006300	AGC	2	6	30769	30774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424087
518	NC_006300	A	6	6	30794	30799	100 %	0 %	0 %	0 %	52424087
519	NC_006300	ATA	2	6	30886	30891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
520	NC_006300	TCA	2	6	30928	30933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424087
521	NC_006300	AT	3	6	30934	30939	50 %	50 %	0 %	0 %	52424087
522	NC_006300	GCC	2	6	31003	31008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424087
523	NC_006300	A	6	6	31031	31036	100 %	0 %	0 %	0 %	52424087
524	NC_006300	ACC	2	6	31045	31050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424087
525	NC_006300	GC	3	6	31091	31096	0 %	0 %	50 %	50 %	52424087
526	NC_006300	GCC	2	6	31099	31104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424087
527	NC_006300	ATA	2	6	31148	31153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
528	NC_006300	AAC	2	6	31170	31175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424087
529	NC_006300	TTTC	2	8	31196	31203	0 %	75 %	0 %	25 %	52424088
530	NC_006300	CAA	2	6	31255	31260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424088
531	NC_006300	A	7	7	31331	31337	100 %	0 %	0 %	0 %	52424088
532	NC_006300	CCAAT	2	10	31401	31410	40 %	20 %	0 %	40 %	52424088
533	NC_006300	TTG	2	6	31427	31432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424088
534	NC_006300	GCT	3	9	31453	31461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424088
535	NC_006300	GTT	2	6	31473	31478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424088
536	NC_006300	AATC	2	8	31489	31496	50 %	25 %	0 %	25 %	52424088
537	NC_006300	CGGT	2	8	31636	31643	0 %	25 %	50 %	25 %	52424088
538	NC_006300	TTA	2	6	31726	31731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424089
539	NC_006300	A	6	6	31756	31761	100 %	0 %	0 %	0 %	52424089
540	NC_006300	AT	3	6	31799	31804	50 %	50 %	0 %	0 %	52424089
541	NC_006300	CAAA	2	8	31812	31819	75 %	0 %	0 %	25 %	52424089
542	NC_006300	TGA	2	6	31934	31939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424089
543	NC_006300	T	7	7	31951	31957	0 %	100 %	0 %	0 %	52424089
544	NC_006300	GGC	2	6	32046	32051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424089
545	NC_006300	TTA	2	6	32160	32165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424089
546	NC_006300	AGGA	2	8	32182	32189	50 %	0 %	50 %	0 %	52424089
547	NC_006300	GAT	2	6	32217	32222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424089
548	NC_006300	GC	3	6	32255	32260	0 %	0 %	50 %	50 %	52424089
549	NC_006300	CGG	2	6	32320	32325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424089
550	NC_006300	TTA	2	6	32352	32357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424089
551	NC_006300	TAAT	2	8	32446	32453	50 %	50 %	0 %	0 %	52424089
552	NC_006300	TAAT	2	8	32473	32480	50 %	50 %	0 %	0 %	52424089
553	NC_006300	CGC	2	6	32482	32487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424089
554	NC_006300	GTAT	2	8	32488	32495	25 %	50 %	25 %	0 %	52424089
555	NC_006300	ATT	2	6	32525	32530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424089
556	NC_006300	T	6	6	32580	32585	0 %	100 %	0 %	0 %	52424089
557	NC_006300	ATTT	2	8	32679	32686	25 %	75 %	0 %	0 %	52424089
558	NC_006300	CTG	2	6	32797	32802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424089
559	NC_006300	CCG	2	6	32934	32939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424089
560	NC_006300	ACA	3	9	33080	33088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424089
561	NC_006300	GAA	2	6	33099	33104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424089
562	NC_006300	TCT	2	6	33132	33137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424089
563	NC_006300	AAAAG	2	10	33151	33160	80 %	0 %	20 %	0 %	52424089
564	NC_006300	GAA	2	6	33272	33277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424089
565	NC_006300	A	6	6	33280	33285	100 %	0 %	0 %	0 %	52424089
566	NC_006300	TCAA	2	8	33423	33430	50 %	25 %	0 %	25 %	52424090
567	NC_006300	TTG	2	6	33439	33444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424090
568	NC_006300	TAA	2	6	33487	33492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424090
569	NC_006300	AGT	2	6	33499	33504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424090
570	NC_006300	TAA	2	6	33516	33521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424090
571	NC_006300	TCA	2	6	33534	33539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424090
572	NC_006300	ACA	2	6	33605	33610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424090
573	NC_006300	AAT	2	6	33659	33664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424090
574	NC_006300	T	6	6	33679	33684	0 %	100 %	0 %	0 %	52424090
575	NC_006300	A	6	6	33990	33995	100 %	0 %	0 %	0 %	52424091
576	NC_006300	TCAT	2	8	33996	34003	25 %	50 %	0 %	25 %	52424091
577	NC_006300	CAG	2	6	34008	34013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424091
578	NC_006300	TCCTA	2	10	34088	34097	20 %	40 %	0 %	40 %	52424091
579	NC_006300	GAT	2	6	34166	34171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424091
580	NC_006300	CGC	2	6	34365	34370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424091
581	NC_006300	ATT	2	6	34378	34383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424091
582	NC_006300	CGTG	2	8	34394	34401	0 %	25 %	50 %	25 %	52424091
583	NC_006300	GCG	2	6	34410	34415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424091
584	NC_006300	GCG	2	6	34431	34436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424091
585	NC_006300	A	6	6	34443	34448	100 %	0 %	0 %	0 %	52424091
586	NC_006300	ATTC	2	8	34488	34495	25 %	50 %	0 %	25 %	52424091
587	NC_006300	A	6	6	34557	34562	100 %	0 %	0 %	0 %	52424091
588	NC_006300	T	7	7	34573	34579	0 %	100 %	0 %	0 %	52424091
589	NC_006300	CGG	2	6	34589	34594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424091
590	NC_006300	CG	3	6	34626	34631	0 %	0 %	50 %	50 %	52424091
591	NC_006300	ATG	2	6	34639	34644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424091
592	NC_006300	TTC	2	6	34733	34738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424091
593	NC_006300	TGA	2	6	34793	34798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424091
594	NC_006300	TTAA	2	8	34830	34837	50 %	50 %	0 %	0 %	52424091
595	NC_006300	GGC	2	6	34863	34868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424091
596	NC_006300	TTA	3	9	34893	34901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424091
597	NC_006300	GTT	2	6	35054	35059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424092
598	NC_006300	AAT	2	6	35079	35084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424092
599	NC_006300	TAT	2	6	35143	35148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424092
600	NC_006300	ATC	2	6	35244	35249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424093
601	NC_006300	CGG	2	6	35275	35280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424093
602	NC_006300	TGCA	2	8	35321	35328	25 %	25 %	25 %	25 %	52424093
603	NC_006300	CG	3	6	35377	35382	0 %	0 %	50 %	50 %	52424093
604	NC_006300	TCA	2	6	35452	35457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424093
605	NC_006300	AC	3	6	35470	35475	50 %	0 %	0 %	50 %	52424093
606	NC_006300	AAT	2	6	35585	35590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
607	NC_006300	ATTA	2	8	35600	35607	50 %	50 %	0 %	0 %	52424093
608	NC_006300	TG	3	6	35616	35621	0 %	50 %	50 %	0 %	52424093
609	NC_006300	CGC	2	6	35644	35649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424093
610	NC_006300	TCA	2	6	35656	35661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424093
611	NC_006300	AAT	2	6	35744	35749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
612	NC_006300	CGTA	2	8	35768	35775	25 %	25 %	25 %	25 %	52424093
613	NC_006300	CGG	2	6	35828	35833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424093
614	NC_006300	TAA	2	6	35888	35893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
615	NC_006300	CCG	2	6	35943	35948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424093
616	NC_006300	ATA	2	6	35949	35954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
617	NC_006300	GCC	2	6	36048	36053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424093
618	NC_006300	TAA	2	6	36059	36064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
619	NC_006300	AGTC	2	8	36097	36104	25 %	25 %	25 %	25 %	52424093
620	NC_006300	ATG	2	6	36126	36131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424093
621	NC_006300	AAT	2	6	36168	36173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
622	NC_006300	CCG	2	6	36253	36258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424093
623	NC_006300	GGC	2	6	36266	36271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424093
624	NC_006300	TAA	2	6	36335	36340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
625	NC_006300	AAC	2	6	36456	36461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424093
626	NC_006300	TGA	2	6	36466	36471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424093
627	NC_006300	ATC	2	6	36474	36479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424093
628	NC_006300	AAT	2	6	36530	36535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424093
629	NC_006300	TAC	2	6	36544	36549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424093
630	NC_006300	ACC	2	6	36552	36557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424093
631	NC_006300	GTACC	2	10	36626	36635	20 %	20 %	20 %	40 %	52424094
632	NC_006300	GCC	2	6	36771	36776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424094
633	NC_006300	CGC	2	6	36857	36862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424094
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636	NC_006300	CCG	2	6	37103	37108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424094
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640	NC_006300	CCG	2	6	37418	37423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424094
641	NC_006300	TGT	2	6	37429	37434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424094
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648	NC_006300	TTG	2	6	37925	37930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424094
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650	NC_006300	T	6	6	37965	37970	0 %	100 %	0 %	0 %	52424094
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659	NC_006300	TAAT	2	8	38388	38395	50 %	50 %	0 %	0 %	52424095
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662	NC_006300	ATC	2	6	38460	38465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424095
663	NC_006300	TTGGG	2	10	38478	38487	0 %	40 %	60 %	0 %	52424095
664	NC_006300	T	7	7	38495	38501	0 %	100 %	0 %	0 %	52424095
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666	NC_006300	ATCCC	2	10	38600	38609	20 %	20 %	0 %	60 %	52424095
667	NC_006300	CTT	2	6	38630	38635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424095
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750	NC_006300	CTT	2	6	43667	43672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424102
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753	NC_006300	TTC	2	6	43887	43892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424102
754	NC_006300	CGT	2	6	43901	43906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424102
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758	NC_006300	TCA	2	6	44137	44142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424102
759	NC_006300	GATA	2	8	44181	44188	50 %	25 %	25 %	0 %	52424102
760	NC_006300	TGC	2	6	44322	44327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424103
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762	NC_006300	ACGA	2	8	44388	44395	50 %	0 %	25 %	25 %	52424103
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889	NC_006300	GGTTA	2	10	51071	51080	20 %	40 %	40 %	0 %	52424109
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